CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

B-factor analysis for ID 2401061409154099150

Overall B-factor prediction

%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !

B-factors for all residues

Residue-by-residue B-factor prediction for CA atoms

B-factors are computed based on the first 100 normal modes (B-PREDICT) and are scaled to match the overall B-factors in the submitted model (B-SCALED). A high correlation with the observations is an indicator that the normal modes capture well the overall flexibility features of the model. Comparison of the observed (B-OBS, blue) and the computed (B-SCALED, red) B-factors for all C-alpha atoms is presented below. Differences between B-factors from normal mode analysis and from X-ray crystallographic data may for example indicate regions where the protein flexibility is modified due to external factors such as tight crystall-packing.

  ATOM TYP  RES  RESID   B-PREDICT    B-SCALED      B-OBS
B-SCALEDB-OBS
     5 CA   MET      0     14.0652      0.0000      0.0000
    14 CA   GLY      1      8.8518      0.0000      0.0000
    18 CA   PRO      2      5.4388      0.0000      0.0000
    26 CA   LEU      3      4.0172      0.0000      0.0000
    35 CA   ILE      4      2.1832      0.0000      0.0000
    44 CA   ASN      5      1.8062      0.0000      0.0000
    55 CA   ARG      6      1.1461      0.0000      0.0000
    72 CA   CYS      7      1.2287      0.0000      0.0000
    79 CA   LYS      8      1.2991      0.0000      0.0000
    92 CA   LYS      9      1.2212      0.0000      0.0000
   105 CA   ILE     10      1.5914      0.0000      0.0000
   114 CA   LEU     11      1.6253      0.0000      0.0000
   123 CA   LEU     12      1.9613      0.0000      0.0000
   131 CA   PRO     13      2.6276      0.0000      0.0000
   139 CA   THR     14      2.5866      0.0000      0.0000
   148 CA   THR     15      3.1733      0.0000      0.0000
   157 CA   VAL     16      3.6780      0.0000      0.0000
   164 CA   PRO     17      4.9346      0.0000      0.0000
   171 CA   PRO     18      5.6682      0.0000      0.0000
   179 CA   ALA     19      6.1339      0.0000      0.0000
   185 CA   THR     20      6.5345      0.0000      0.0000
   194 CA   MET     21      5.5448      0.0000      0.0000
   203 CA   ARG     22      6.1355      0.0000      0.0000
   220 CA   ILE     23      7.8863      0.0000      0.0000
   229 CA   TRP     24      7.0248      0.0000      0.0000
   245 CA   LEU     25      5.6377      0.0000      0.0000
   254 CA   LEU     26      7.1825      0.0000      0.0000
   263 CA   GLY     27      8.3457      0.0000      0.0000
   268 CA   GLY     28      6.7797      0.0000      0.0000
   273 CA   LEU     29      5.7439      0.0000      0.0000
   282 CA   LEU     30      7.2468      0.0000      0.0000
   290 CA   PRO     31      6.9509      0.0000      0.0000
   298 CA   PHE     32      4.9344      0.0000      0.0000
   310 CA   LEU     33      5.1811      0.0000      0.0000
   319 CA   LEU     34      5.9599      0.0000      0.0000
   328 CA   LEU     35      4.5729      0.0000      0.0000
   337 CA   LEU     36      3.8641      0.0000      0.0000
   346 CA   SER     37      4.9141      0.0000      0.0000
   354 CA   GLY     38      4.3857      0.0000      0.0000
   359 CA   LEU     39      3.2006      0.0000      0.0000
   368 CA   GLN     40      2.7628      0.0000      0.0000
   380 CA   ARG     41      2.5744      0.0000      0.0000
   396 CA   PRO     42      1.4810      0.0000      0.0000
   404 CA   THR     43      1.4429      0.0000      0.0000
   413 CA   GLU     44      1.5355      0.0000      0.0000
   423 CA   GLY     45      1.2521      0.0000      0.0000
   428 CA   SER     46      1.0554      0.0000      0.0000
   436 CA   GLU     47      0.8778      0.0000      0.0000
   446 CA   VAL     48      0.8767      0.0000      0.0000
   454 CA   ALA     49      0.6537      0.0000      0.0000
   460 CA   ILE     50      0.5629      0.0000      0.0000
   469 CA   LYS     51      0.5524      0.0000      0.0000
   482 CA   ILE     52      0.4158      0.0000      0.0000
   491 CA   ASP     53      0.4492      0.0000      0.0000
   500 CA   PHE     54      0.3951      0.0000      0.0000
   512 CA   ASP     55      0.3184      0.0000      0.0000
   521 CA   PHE     56      0.2444      0.0000      0.0000
   533 CA   ALA     57      0.2765      0.0000      0.0000
   538 CA   PRO     58      0.3542      0.0000      0.0000
   546 CA   GLY     59      0.3703      0.0000      0.0000
   551 CA   SER     60      0.2378      0.0000      0.0000
   559 CA   PHE     61      0.2065      0.0000      0.0000
   571 CA   ASP     62      0.1518      0.0000      0.0000
   580 CA   ASP     63      0.1678      0.0000      0.0000
   589 CA   GLN     64      0.1688      0.0000      0.0000
   601 CA   TYR     65      0.2276      0.0000      0.0000
   615 CA   GLN     66      0.2991      0.0000      0.0000
   627 CA   GLY     67      0.4232      0.0000      0.0000
   632 CA   CYS     68      0.3890      0.0000      0.0000
   639 CA   SER     69      0.3207      0.0000      0.0000
   647 CA   LYS     70      0.4496      0.0000      0.0000
   660 CA   GLN     71      0.4695      0.0000      0.0000
   672 CA   VAL     72      0.3523      0.0000      0.0000
   680 CA   MET     73      0.3740      0.0000      0.0000
   689 CA   GLU     74      0.5027      0.0000      0.0000
   699 CA   LYS     75      0.4771      0.0000      0.0000
   712 CA   LEU     76      0.4138      0.0000      0.0000
   721 CA   THR     77      0.5283      0.0000      0.0000
   730 CA   GLN     78      0.6488      0.0000      0.0000
   742 CA   GLY     79      0.5955      0.0000      0.0000
   747 CA   ASP     80      0.6019      0.0000      0.0000
   756 CA   TYR     81      0.4712      0.0000      0.0000
   770 CA   PHE     82      0.4784      0.0000      0.0000
   782 CA   THR     83      0.6501      0.0000      0.0000
   791 CA   LYS     84      0.6136      0.0000      0.0000
   804 CA   ASP     85      0.4963      0.0000      0.0000
   813 CA   ILE     86      0.6331      0.0000      0.0000
   822 CA   GLU     87      0.7911      0.0000      0.0000
   832 CA   ALA     88      0.6990      0.0000      0.0000
   838 CA   GLN     89      0.6541      0.0000      0.0000
   850 CA   LYS     90      0.8427      0.0000      0.0000
   863 CA   ASN     91      0.8318      0.0000      0.0000
   874 CA   TYR     92      0.6147      0.0000      0.0000
   888 CA   PHE     93      0.7158      0.0000      0.0000
   900 CA   ARG     94      0.8593      0.0000      0.0000
   917 CA   MET     95      0.6631      0.0000      0.0000
   926 CA   TRP     96      0.5702      0.0000      0.0000
   942 CA   GLN     97      0.7786      0.0000      0.0000
   954 CA   LYS     98      0.7814      0.0000      0.0000
   967 CA   ALA     99      0.5775      0.0000      0.0000
   973 CA   HIS    100      0.6705      0.0000      0.0000
   984 CA   LEU    101      0.8859      0.0000      0.0000
   993 CA   ALA    102      0.7656      0.0000      0.0000
   999 CA   TRP    103      0.6729      0.0000      0.0000
  1015 CA   LEU    104      0.9144      0.0000      0.0000
  1024 CA   ASN    105      1.0427      0.0000      0.0000
  1035 CA   GLN    106      0.8768      0.0000      0.0000
  1047 CA   GLY    107      1.0137      0.0000      0.0000
  1052 CA   LYS    108      0.8243      0.0000      0.0000
  1065 CA   VAL    109      0.8202      0.0000      0.0000
  1073 CA   LEU    110      0.6113      0.0000      0.0000
  1081 CA   PRO    111      0.5321      0.0000      0.0000
  1089 CA   GLN    112      0.5849      0.0000      0.0000
  1101 CA   ASN    113      0.5170      0.0000      0.0000
  1112 CA   MET    114      0.4102      0.0000      0.0000
  1121 CA   THR    115      0.4582      0.0000      0.0000
  1130 CA   THR    116      0.5181      0.0000      0.0000
  1139 CA   THR    117      0.4046      0.0000      0.0000
  1148 CA   HIS    118      0.2875      0.0000      0.0000
  1159 CA   ALA    119      0.3576      0.0000      0.0000
  1165 CA   VAL    120      0.4034      0.0000      0.0000
  1173 CA   ALA    121      0.2654      0.0000      0.0000
  1179 CA   ILE    122      0.2195      0.0000      0.0000
  1188 CA   LEU    123      0.3431      0.0000      0.0000
  1197 CA   PHE    124      0.3508      0.0000      0.0000
  1209 CA   TYR    125      0.2278      0.0000      0.0000
  1223 CA   THR    126      0.2521      0.0000      0.0000
  1232 CA   LEU    127      0.4130      0.0000      0.0000
  1241 CA   ASN    128      0.4416      0.0000      0.0000
  1252 CA   SER    129      0.4307      0.0000      0.0000
  1260 CA   ASN    130      0.5079      0.0000      0.0000
  1271 CA   VAL    131      0.3781      0.0000      0.0000
  1279 CA   HIS    132      0.2606      0.0000      0.0000
  1290 CA   SER    133      0.3405      0.0000      0.0000
  1298 CA   ASP    134      0.3800      0.0000      0.0000
  1307 CA   PHE    135      0.2424      0.0000      0.0000
  1319 CA   THR    136      0.2062      0.0000      0.0000
  1328 CA   ARG    137      0.3262      0.0000      0.0000
  1345 CA   ALA    138      0.3127      0.0000      0.0000
  1351 CA   MET    139      0.2079      0.0000      0.0000
  1360 CA   ALA    140      0.2699      0.0000      0.0000
  1366 CA   SER    141      0.4025      0.0000      0.0000
  1374 CA   VAL    142      0.4193      0.0000      0.0000
  1382 CA   ALA    143      0.3507      0.0000      0.0000
  1388 CA   ARG    144      0.4215      0.0000      0.0000
  1405 CA   THR    145      0.4969      0.0000      0.0000
  1413 CA   PRO    146      0.4564      0.0000      0.0000
  1421 CA   GLN    147      0.5738      0.0000      0.0000
  1433 CA   GLN    148      0.5220      0.0000      0.0000
  1445 CA   TYR    149      0.3842      0.0000      0.0000
  1459 CA   GLU    150      0.4646      0.0000      0.0000
  1469 CA   ARG    151      0.5692      0.0000      0.0000
  1486 CA   SER    152      0.5110      0.0000      0.0000
  1494 CA   PHE    153      0.3615      0.0000      0.0000
  1506 CA   HIS    154      0.3941      0.0000      0.0000
  1517 CA   PHE    155      0.2783      0.0000      0.0000
  1529 CA   LYS    156      0.2576      0.0000      0.0000
  1542 CA   TYR    157      0.2746      0.0000      0.0000
  1556 CA   LEU    158      0.2144      0.0000      0.0000
  1565 CA   HIS    159      0.1423      0.0000      0.0000
  1576 CA   TYR    160      0.1679      0.0000      0.0000
  1590 CA   TYR    161      0.1855      0.0000      0.0000
  1604 CA   LEU    162      0.1170      0.0000      0.0000
  1613 CA   THR    163      0.0945      0.0000      0.0000
  1622 CA   SER    164      0.1596      0.0000      0.0000
  1630 CA   ALA    165      0.1669      0.0000      0.0000
  1636 CA   ILE    166      0.1083      0.0000      0.0000
  1645 CA   GLN    167      0.1602      0.0000      0.0000
  1657 CA   LEU    168      0.2451      0.0000      0.0000
  1666 CA   LEU    169      0.2268      0.0000      0.0000
  1675 CA   ARG    170      0.2059      0.0000      0.0000
  1692 CA   LYS    171      0.3227      0.0000      0.0000
  1705 CA   ASP    172      0.3929      0.0000      0.0000
  1714 CA   SER    173      0.3527      0.0000      0.0000
  1722 CA   ILE    174      0.4233      0.0000      0.0000
  1731 CA   MET    175      0.5820      0.0000      0.0000
  1740 CA   GLU    176      0.6170      0.0000      0.0000
  1750 CA   ASN    177      0.5931      0.0000      0.0000
  1761 CA   GLY    178      0.5500      0.0000      0.0000
  1766 CA   THR    179      0.3925      0.0000      0.0000
  1775 CA   LEU    180      0.2943      0.0000      0.0000
  1784 CA   CYS    181      0.2230      0.0000      0.0000
  1791 CA   TYR    182      0.1678      0.0000      0.0000
  1805 CA   GLU    183      0.1680      0.0000      0.0000
  1815 CA   VAL    184      0.1170      0.0000      0.0000
  1823 CA   HIS    185      0.1316      0.0000      0.0000
  1834 CA   TYR    186      0.1216      0.0000      0.0000
  1848 CA   ARG    187      0.2028      0.0000      0.0000
  1865 CA   THR    188      0.2581      0.0000      0.0000
  1874 CA   LYS    189      0.3847      0.0000      0.0000
  1887 CA   ASP    190      0.4410      0.0000      0.0000
  1896 CA   VAL    191      0.3742      0.0000      0.0000
  1904 CA   HIS    192      0.4402      0.0000      0.0000
  1915 CA   PHE    193      0.3899      0.0000      0.0000
  1927 CA   ASN    194      0.5252      0.0000      0.0000
  1938 CA   ALA    195      0.4533      0.0000      0.0000
  1944 CA   TYR    196      0.5434      0.0000      0.0000
  1958 CA   THR    197      0.5279      0.0000      0.0000
  1967 CA   GLY    198      0.5339      0.0000      0.0000
  1972 CA   ALA    199      0.4639      0.0000      0.0000
  1978 CA   THR    200      0.3560      0.0000      0.0000
  1987 CA   ILE    201      0.2442      0.0000      0.0000
  1996 CA   ARG    202      0.1680      0.0000      0.0000
  2013 CA   PHE    203      0.1064      0.0000      0.0000
  2025 CA   GLY    204      0.1324      0.0000      0.0000
  2030 CA   GLN    205      0.0876      0.0000      0.0000
  2042 CA   PHE    206      0.0475      0.0000      0.0000
  2054 CA   LEU    207      0.0465      0.0000      0.0000
  2063 CA   SER    208      0.0852      0.0000      0.0000
  2071 CA   THR    209      0.0906      0.0000      0.0000
  2080 CA   SER    210      0.1595      0.0000      0.0000
  2088 CA   LEU    211      0.1984      0.0000      0.0000
  2097 CA   LEU    212      0.2840      0.0000      0.0000
  2106 CA   LYS    213      0.2747      0.0000      0.0000
  2119 CA   GLU    214      0.3945      0.0000      0.0000
  2129 CA   GLU    215      0.3418      0.0000      0.0000
  2139 CA   ALA    216      0.2409      0.0000      0.0000
  2145 CA   GLN    217      0.3591      0.0000      0.0000
  2157 CA   GLU    218      0.3967      0.0000      0.0000
  2167 CA   PHE    219      0.2927      0.0000      0.0000
  2179 CA   GLY    220      0.3535      0.0000      0.0000
  2184 CA   ASN    221      0.4106      0.0000      0.0000
  2195 CA   GLN    222      0.3969      0.0000      0.0000
  2207 CA   THR    223      0.2827      0.0000      0.0000
  2216 CA   LEU    224      0.2213      0.0000      0.0000
  2225 CA   PHE    225      0.1489      0.0000      0.0000
  2237 CA   THR    226      0.1515      0.0000      0.0000
  2246 CA   ILE    227      0.1098      0.0000      0.0000
  2255 CA   PHE    228      0.1489      0.0000      0.0000
  2267 CA   THR    229      0.1044      0.0000      0.0000
  2276 CA   CYS    230      0.1585      0.0000      0.0000
  2283 CA   LEU    231      0.1087      0.0000      0.0000
  2292 CA   GLY    232      0.0683      0.0000      0.0000
  2297 CA   ALA    233      0.1098      0.0000      0.0000
  2302 CA   PRO    234      0.1662      0.0000      0.0000
  2310 CA   VAL    235      0.2038      0.0000      0.0000
  2318 CA   GLN    236      0.3159      0.0000      0.0000
  2330 CA   TYR    237      0.4100      0.0000      0.0000
  2344 CA   PHE    238      0.3981      0.0000      0.0000
  2356 CA   SER    239      0.3684      0.0000      0.0000
  2364 CA   LEU    240      0.4987      0.0000      0.0000
  2373 CA   LYS    241      0.3732      0.0000      0.0000
  2386 CA   LYS    242      0.2842      0.0000      0.0000
  2399 CA   GLU    243      0.1776      0.0000      0.0000
  2409 CA   VAL    244      0.0995      0.0000      0.0000
  2417 CA   LEU    245      0.0562      0.0000      0.0000
  2426 CA   ILE    246      0.0290      0.0000      0.0000
  2434 CA   PRO    247      0.0371      0.0000      0.0000
  2441 CA   PRO    248      0.0633      0.0000      0.0000
  2449 CA   TYR    249      0.1097      0.0000      0.0000
  2463 CA   GLU    250      0.1117      0.0000      0.0000
  2473 CA   LEU    251      0.1803      0.0000      0.0000
  2482 CA   PHE    252      0.1832      0.0000      0.0000
  2494 CA   LYS    253      0.2940      0.0000      0.0000
  2507 CA   VAL    254      0.3047      0.0000      0.0000
  2515 CA   ILE    255      0.3664      0.0000      0.0000
  2524 CA   ASN    256      0.3908      0.0000      0.0000
  2535 CA   MET    257      0.3850      0.0000      0.0000
  2544 CA   SER    258      0.4575      0.0000      0.0000
  2552 CA   TYR    259      0.5076      0.0000      0.0000
  2566 CA   HIS    260      0.5969      0.0000      0.0000
  2576 CA   PRO    261      0.7099      0.0000      0.0000
  2584 CA   ARG    262      0.6408      0.0000      0.0000
  2601 CA   GLY    263      0.4577      0.0000      0.0000
  2606 CA   ASN    264      0.3676      0.0000      0.0000
  2617 CA   TRP    265      0.2958      0.0000      0.0000
  2633 CA   LEU    266      0.2374      0.0000      0.0000
  2642 CA   GLN    267      0.2223      0.0000      0.0000
  2654 CA   LEU    268      0.1802      0.0000      0.0000
  2663 CA   ARG    269      0.2092      0.0000      0.0000
  2680 CA   SER    270      0.1905      0.0000      0.0000
  2688 CA   THR    271      0.3051      0.0000      0.0000
  2697 CA   GLY    272      0.2990      0.0000      0.0000
  2702 CA   ASN    273      0.3156      0.0000      0.0000
  2713 CA   LEU    274      0.2493      0.0000      0.0000
  2722 CA   SER    275      0.2465      0.0000      0.0000
  2730 CA   THR    276      0.3612      0.0000      0.0000
  2739 CA   TYR    277      0.2901      0.0000      0.0000
  2753 CA   ASN    278      0.3027      0.0000      0.0000
  2764 CA   CYS    279      0.3310      0.0000      0.0000
  2771 CA   GLN    280      0.3391      0.0000      0.0000
  2783 CA   LEU    281      0.3530      0.0000      0.0000
  2792 CA   LEU    282      0.4554      0.0000      0.0000
  2801 CA   LYS    283      0.5274      0.0000      0.0000
  2814 CA   ALA    284      0.5415      0.0000      0.0000
  2820 CA   SER    285      0.6182      0.0000      0.0000
  2828 CA   SER    286      0.7160      0.0000      0.0000
  2836 CA   LYS    287      0.8046      0.0000      0.0000
  2849 CA   LYS    288      0.8721      0.0000      0.0000
  2862 CA   CYS    289      0.9014      0.0000      0.0000
  2869 CA   ILE    290      0.9961      0.0000      0.0000
  2877 CA   PRO    291      1.0452      0.0000      0.0000
  2885 CA   ASP    292      2.0729      0.0000      0.0000
  2893 CA   PRO    293      2.1675      0.0000      0.0000
  2901 CA   ILE    294      2.9941      0.0000      0.0000
  2910 CA   ALA    295      2.0233      0.0000      0.0000
  2916 CA   ILE    296      1.1227      0.0000      0.0000
  2925 CA   ALA    297      2.0744      0.0000      0.0000
  2931 CA   SER    298      2.6718      0.0000      0.0000
  2939 CA   LEU    299      2.3710      0.0000      0.0000
  2948 CA   SER    300      2.6718      0.0000      0.0000
  2956 CA   PHE    301      3.7966      0.0000      0.0000
  2968 CA   LEU    302      4.8110      0.0000      0.0000
  2977 CA   THR    303      5.4871      0.0000      0.0000
  2986 CA   SER    304      6.4799      0.0000      0.0000
  2994 CA   VAL    305      7.9496      0.0000      0.0000
  3002 CA   ILE    306      9.9451      0.0000      0.0000
  3011 CA   ILE    307     11.3479      0.0000      0.0000
  3020 CA   PHE    308     12.5177      0.0000      0.0000
  3032 CA   SER    309     14.9250      0.0000      0.0000
  3040 CA   LYS    310     17.9584      0.0000      0.0000
  3053 CA   SER    311     19.6798      0.0000      0.0000
  3061 CA   ARG    312     21.6509      0.0000      0.0000
  3078 CA   VAL    313     25.9140      0.0000      0.0000

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.