*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402032328521404296.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402032328521404296.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402032328521404296.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 195
First residue number = 96
Last residue number = 290
Number of atoms found = 1535
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 96.984907 +/- 7.571551 From: 78.128000 To: 116.588000
= 82.725434 +/- 9.602290 From: 56.962000 To: 102.282000
= 22.396165 +/- 10.849824 From: -1.056000 To: 47.762000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.2609 % Filled.
Pdbmat> 557935 non-zero elements.
Pdbmat> 60980 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.45 +/- 23.78
Maximum number = 132
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.219600E+06
Pdbmat> Larger element = 505.944
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
195 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2402032328521404296.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2402032328521404296.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2402032328521404296.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1535 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 195 residues.
Blocpdb> 6 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 7
Blocpdb> 7 atoms in block 3
Block first atom: 14
Blocpdb> 6 atoms in block 4
Block first atom: 21
Blocpdb> 9 atoms in block 5
Block first atom: 27
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 36
Blocpdb> 7 atoms in block 7
Block first atom: 45
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 52
Blocpdb> 9 atoms in block 9
Block first atom: 64
Blocpdb> 4 atoms in block 10
Block first atom: 73
Blocpdb> 6 atoms in block 11
Block first atom: 77
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 83
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 95
Blocpdb> 11 atoms in block 14
Block first atom: 99
Blocpdb> 11 atoms in block 15
Block first atom: 110
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 121
Blocpdb> 4 atoms in block 17
Block first atom: 129
Blocpdb> 11 atoms in block 18
Block first atom: 133
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 144
Blocpdb> 10 atoms in block 20
Block first atom: 152
Blocpdb> 6 atoms in block 21
Block first atom: 162
Blocpdb> 4 atoms in block 22
Block first atom: 168
Blocpdb> 7 atoms in block 23
Block first atom: 172
Blocpdb> 5 atoms in block 24
Block first atom: 179
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 184
Blocpdb> 6 atoms in block 26
Block first atom: 193
Blocpdb> 7 atoms in block 27
Block first atom: 199
Blocpdb> 7 atoms in block 28
Block first atom: 206
Blocpdb> 6 atoms in block 29
Block first atom: 213
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 219
Blocpdb> 12 atoms in block 31
Block first atom: 226
Blocpdb> 6 atoms in block 32
Block first atom: 238
Blocpdb> 7 atoms in block 33
Block first atom: 244
Blocpdb> 5 atoms in block 34
Block first atom: 251
Blocpdb> 8 atoms in block 35
Block first atom: 256
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 264
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 272
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 281
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 289
Blocpdb> 6 atoms in block 40
Block first atom: 300
Blocpdb> 9 atoms in block 41
Block first atom: 306
Blocpdb> 8 atoms in block 42
Block first atom: 315
Blocpdb> 5 atoms in block 43
Block first atom: 323
Blocpdb> 9 atoms in block 44
Block first atom: 328
Blocpdb> 7 atoms in block 45
Block first atom: 337
Blocpdb> 6 atoms in block 46
Block first atom: 344
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 350
Blocpdb> 7 atoms in block 48
Block first atom: 357
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 364
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 373
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 381
Blocpdb> 7 atoms in block 52
Block first atom: 395
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 402
Blocpdb> 6 atoms in block 54
Block first atom: 410
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 416
Blocpdb> 7 atoms in block 56
Block first atom: 423
Blocpdb> 7 atoms in block 57
Block first atom: 430
Blocpdb> 7 atoms in block 58
Block first atom: 437
Blocpdb> 4 atoms in block 59
Block first atom: 444
Blocpdb> 7 atoms in block 60
Block first atom: 448
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 455
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 466
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 473
Blocpdb> 5 atoms in block 64
Block first atom: 484
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 489
Blocpdb> 5 atoms in block 66
Block first atom: 497
Blocpdb> 8 atoms in block 67
Block first atom: 502
Blocpdb> 12 atoms in block 68
Block first atom: 510
Blocpdb> 9 atoms in block 69
Block first atom: 522
Blocpdb> 9 atoms in block 70
Block first atom: 531
Blocpdb> 6 atoms in block 71
Block first atom: 540
Blocpdb> 9 atoms in block 72
Block first atom: 546
Blocpdb> 10 atoms in block 73
Block first atom: 555
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 565
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 573
Blocpdb> 9 atoms in block 76
Block first atom: 580
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 589
Blocpdb> 7 atoms in block 78
Block first atom: 596
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 603
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 614
Blocpdb> 6 atoms in block 81
Block first atom: 625
Blocpdb> 7 atoms in block 82
Block first atom: 631
Blocpdb> 10 atoms in block 83
Block first atom: 638
Blocpdb> 10 atoms in block 84
Block first atom: 648
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 658
Blocpdb> 11 atoms in block 86
Block first atom: 667
Blocpdb> 6 atoms in block 87
Block first atom: 678
Blocpdb> 6 atoms in block 88
Block first atom: 684
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 690
Blocpdb> 6 atoms in block 90
Block first atom: 698
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 704
Blocpdb> 4 atoms in block 92
Block first atom: 712
Blocpdb> 8 atoms in block 93
Block first atom: 716
Blocpdb> 5 atoms in block 94
Block first atom: 724
Blocpdb> 7 atoms in block 95
Block first atom: 729
Blocpdb> 7 atoms in block 96
Block first atom: 736
Blocpdb> 9 atoms in block 97
Block first atom: 743
Blocpdb> 10 atoms in block 98
Block first atom: 752
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 762
Blocpdb> 8 atoms in block 100
Block first atom: 770
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 778
Blocpdb> 7 atoms in block 102
Block first atom: 789
Blocpdb> 9 atoms in block 103
Block first atom: 796
Blocpdb> 4 atoms in block 104
Block first atom: 805
Blocpdb> 8 atoms in block 105
Block first atom: 809
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 817
Blocpdb> 11 atoms in block 107
Block first atom: 825
Blocpdb> 5 atoms in block 108
Block first atom: 836
Blocpdb> 9 atoms in block 109
Block first atom: 841
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 850
Blocpdb> 8 atoms in block 111
Block first atom: 862
Blocpdb> 8 atoms in block 112
Block first atom: 870
Blocpdb> 8 atoms in block 113
Block first atom: 878
Blocpdb> 11 atoms in block 114
Block first atom: 886
Blocpdb> 8 atoms in block 115
Block first atom: 897
Blocpdb> 7 atoms in block 116
Block first atom: 905
Blocpdb> 11 atoms in block 117
Block first atom: 912
Blocpdb> 11 atoms in block 118
Block first atom: 923
Blocpdb> 10 atoms in block 119
Block first atom: 934
Blocpdb> 6 atoms in block 120
Block first atom: 944
Blocpdb> 7 atoms in block 121
Block first atom: 950
Blocpdb> 7 atoms in block 122
Block first atom: 957
Blocpdb> 7 atoms in block 123
Block first atom: 964
Blocpdb> 7 atoms in block 124
Block first atom: 971
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 978
Blocpdb> 9 atoms in block 126
Block first atom: 990
Blocpdb> 7 atoms in block 127
Block first atom: 999
Blocpdb> 7 atoms in block 128
Block first atom: 1006
Blocpdb> 9 atoms in block 129
Block first atom: 1013
Blocpdb> 7 atoms in block 130
Block first atom: 1022
Blocpdb> 4 atoms in block 131
Block first atom: 1029
Blocpdb> 6 atoms in block 132
Block first atom: 1033
Blocpdb> 8 atoms in block 133
Block first atom: 1039
Blocpdb> 6 atoms in block 134
Block first atom: 1047
Blocpdb> 7 atoms in block 135
Block first atom: 1053
Blocpdb> 7 atoms in block 136
Block first atom: 1060
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1067
Blocpdb> 10 atoms in block 138
Block first atom: 1075
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 1085
Blocpdb> 8 atoms in block 140
Block first atom: 1097
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 1105
Blocpdb> 8 atoms in block 142
Block first atom: 1117
Blocpdb> 6 atoms in block 143
Block first atom: 1125
Blocpdb> 12 atoms in block 144
Block first atom: 1131
Blocpdb> 6 atoms in block 145
Block first atom: 1143
Blocpdb> 6 atoms in block 146
Block first atom: 1149
Blocpdb> 6 atoms in block 147
Block first atom: 1155
Blocpdb> 8 atoms in block 148
Block first atom: 1161
Blocpdb> 4 atoms in block 149
Block first atom: 1169
Blocpdb> 4 atoms in block 150
Block first atom: 1173
Blocpdb> 8 atoms in block 151
Block first atom: 1177
Blocpdb> 8 atoms in block 152
Block first atom: 1185
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 1193
Blocpdb> 11 atoms in block 154
Block first atom: 1204
Blocpdb> 7 atoms in block 155
Block first atom: 1215
Blocpdb> 8 atoms in block 156
Block first atom: 1222
Blocpdb> 8 atoms in block 157
Block first atom: 1230
Blocpdb> 7 atoms in block 158
Block first atom: 1238
Blocpdb> 8 atoms in block 159
Block first atom: 1245
Blocpdb> 8 atoms in block 160
Block first atom: 1253
Blocpdb> 7 atoms in block 161
Block first atom: 1261
Blocpdb> 8 atoms in block 162
Block first atom: 1268
Blocpdb> 9 atoms in block 163
Block first atom: 1276
Blocpdb> 8 atoms in block 164
Block first atom: 1285
Blocpdb> 6 atoms in block 165
Block first atom: 1293
Blocpdb> 6 atoms in block 166
Block first atom: 1299
Blocpdb> 4 atoms in block 167
Block first atom: 1305
Blocpdb> 8 atoms in block 168
Block first atom: 1309
Blocpdb> 8 atoms in block 169
Block first atom: 1317
Blocpdb> 8 atoms in block 170
Block first atom: 1325
Blocpdb> 4 atoms in block 171
Block first atom: 1333
Blocpdb> 11 atoms in block 172
Block first atom: 1337
Blocpdb> 8 atoms in block 173
Block first atom: 1348
Blocpdb> 6 atoms in block 174
Block first atom: 1356
Blocpdb> 11 atoms in block 175
Block first atom: 1362
Blocpdb> 9 atoms in block 176
Block first atom: 1373
Blocpdb> 7 atoms in block 177
Block first atom: 1382
Blocpdb> 10 atoms in block 178
Block first atom: 1389
Blocpdb> 7 atoms in block 179
Block first atom: 1399
Blocpdb> 6 atoms in block 180
Block first atom: 1406
Blocpdb> 5 atoms in block 181
Block first atom: 1412
Blocpdb> 6 atoms in block 182
Block first atom: 1417
Blocpdb> 7 atoms in block 183
Block first atom: 1423
Blocpdb> 4 atoms in block 184
Block first atom: 1430
Blocpdb> 11 atoms in block 185
Block first atom: 1434
Blocpdb> 8 atoms in block 186
Block first atom: 1445
Blocpdb> 11 atoms in block 187
Block first atom: 1453
Blocpdb> 11 atoms in block 188
Block first atom: 1464
Blocpdb> 7 atoms in block 189
Block first atom: 1475
Blocpdb> 9 atoms in block 190
Block first atom: 1482
Blocpdb> 9 atoms in block 191
Block first atom: 1491
Blocpdb> 9 atoms in block 192
Block first atom: 1500
Blocpdb> 8 atoms in block 193
Block first atom: 1509
Blocpdb> 8 atoms in block 194
Block first atom: 1517
Blocpdb> 11 atoms in block 195
Block first atom: 1524
Blocpdb> 195 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 558130 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4605
Prepmat> Matrix trace = 1219600.0000
Prepmat> Last element read: 4605 4605 130.6427
Prepmat> 19111 lines saved.
Prepmat> 16658 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1535
RTB> Total mass = 1535.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1535
RTB> Number of blocks = 195
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 283510.4232
RTB> 85347 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1170
Diagstd> Nb of non-zero elements: 85347
Diagstd> Projected matrix trace = 283510.4232
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1170 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 283510.4232
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.2164395 3.3830021 4.0868284 4.6439748
5.2752150 7.0489727 7.2225949 8.2787584 8.3290789
9.6242510 10.8654141 11.2930929 11.9117601 13.4842585
14.7855139 15.7986202 16.7142053 17.7834733 18.6934514
19.2912964 20.0896707 21.2486717 22.1044088 22.5768386
23.2450658 23.8142296 24.0924652 25.6310792 26.4080842
26.5103444 26.9290113 28.1588130 28.4318498 30.8912752
31.4127678 31.7002957 32.2081169 33.6483133 33.9806653
34.7063257 35.7344918 36.3367754 36.5343219 37.4329686
38.5435412 39.2233053 39.4037902 39.8908805 41.1984679
41.5513089 42.2460350 43.2243876 44.3561452 44.4040687
45.5264336 46.7490726 47.8492787 48.6627784 49.0018193
49.3094343 50.5211840 51.4273526 51.9103844 52.6144256
53.0907945 53.7142603 53.9474384 54.5792693 55.3626925
55.9270330 56.3125000 57.3536857 57.5057926 57.8596238
59.1136749 59.9861534 60.1145088 61.2373939 62.0189357
62.3019444 63.8536095 64.5730298 65.1149450 65.8051666
66.1931347 67.2073568 67.5791623 68.5871395 69.0071369
69.9399457 70.2150237 70.6869261 71.4229619 72.1442555
72.3331351 73.4790445 73.7994604 74.6458170 75.1875919
75.2626781
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034321 0.0034325 0.0034334 0.0034342 0.0034345
0.0034346 194.7524692 199.7314309 219.5272714 234.0131204
249.4108606 288.3089965 291.8380453 312.4480972 313.3962302
336.8827318 357.9467491 364.9234160 374.7859051 398.7574539
417.5548117 431.6232784 443.9541767 457.9347219 469.5047891
476.9534421 486.7227987 500.5657999 510.5458284 515.9728429
523.5530219 529.9239507 533.0106666 549.7670744 558.0379415
559.1173455 563.5150047 576.2387401 579.0256978 603.5499225
608.6230303 611.4021157 616.2798201 629.9077183 633.0109452
639.7342452 649.1410671 654.5886526 656.3655909 664.3889719
674.1725829 680.0915433 681.6544579 685.8546563 697.0048710
699.9832290 705.8107321 713.9366951 723.2229155 723.6135040
732.7015248 742.4749059 751.1609077 757.5193501 760.1536456
762.5358916 771.8484567 778.7397879 782.3883997 787.6761524
791.2339117 795.8662354 797.5918252 802.2489155 807.9860861
812.0937543 814.8875537 822.3864505 823.4762481 826.0057735
834.9092251 841.0480094 841.9473446 849.7743742 855.1798015
857.1287859 867.7367808 872.6113600 876.2653106 880.8972960
883.4902368 890.2329974 892.6920812 899.3249153 902.0742472
908.1507075 909.9348609 912.9874937 917.7284779 922.3508629
923.5574686 930.8442716 932.8716038 938.2055940 941.6041586
942.0742087
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1535
Rtb_to_modes> Number of blocs = 195
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.31
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.81
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.26
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00004 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997
1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00005
1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 27630 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998
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1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00005
1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402032328521404296.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402032328521404296.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402032328521404296.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402032328521404296.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 195
First residue number = 96
Last residue number = 290
Number of atoms found = 1535
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.383
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.644
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.049
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.223
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.329
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.26
Bfactors> 106 vectors, 4605 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.216000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.662 for 195 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.036 +/- 0.07
Bfactors> = 16.101 +/- 7.31
Bfactors> Shiftng-fct= 16.065
Bfactors> Scaling-fct= 112.445
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2402032328521404296.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402032328521404296.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2402032328521404296.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402032328521404296.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2402032328521404296.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2402032328521404296.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.0
Projmod> 106 vectors, 4605 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 195
First residue number = 96
Last residue number = 290
Number of atoms found = 1535
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 195
First residue number = 96
Last residue number = 290
Number of atoms found = 1535
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1535 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 0.00
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 2 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 3 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 4 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 5 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 6 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 7 F= 194.73 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 8 F= 199.72 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 11 F= 249.40 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 106 F= 942.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 194.730804
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.00 for mode -1 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402032328521404296 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
making animated gifs
11 models are in 2402032328521404296.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 195 2.337 185 1.164
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 195 1.869 185 0.931
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MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 195 0.467 195 0.467
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 195 0.000 195 0.000
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 195 0.467 195 0.467
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 195 0.935 189 0.572
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 195 1.402 187 0.748
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 195 1.869 185 0.931
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 195 2.337 185 1.164
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402032328521404296 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
making animated gifs
11 models are in 2402032328521404296.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 195 2.399 185 0.883
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 195 1.919 187 0.759
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 195 1.439 187 0.569
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 195 0.960 191 0.545
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 195 0.480 193 0.340
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 195 0.000 195 0.000
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 195 0.480 193 0.340
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 195 0.960 191 0.545
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 195 1.440 187 0.569
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 195 1.919 187 0.759
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 195 2.399 186 0.909
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402032328521404296 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
making animated gifs
11 models are in 2402032328521404296.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 195 2.343 163 1.287
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 195 1.875 177 1.273
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 195 1.406 188 1.125
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 195 0.937 194 0.890
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 195 0.469 195 0.469
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 195 0.000 195 0.000
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 195 0.469 195 0.469
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 195 0.937 194 0.890
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 195 1.406 188 1.126
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 195 1.875 177 1.274
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 195 2.343 166 1.292
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402032328521404296 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
making animated gifs
11 models are in 2402032328521404296.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 195 1.524 189 0.914
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 195 1.219 192 0.806
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 195 0.915 192 0.604
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 195 0.610 193 0.433
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 195 0.305 195 0.305
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 195 0.000 195 0.000
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 195 0.305 195 0.305
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 195 0.610 193 0.433
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 195 0.915 192 0.604
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 195 1.219 192 0.805
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 195 1.524 189 0.913
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402032328521404296 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402032328521404296.eigenfacs
2402032328521404296.atom
making animated gifs
11 models are in 2402032328521404296.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402032328521404296.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 195 2.426 165 1.429
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 195 1.941 175 1.291
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 195 1.456 187 1.158
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 195 0.970 193 0.883
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 195 0.485 195 0.485
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 195 0.000 195 0.000
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 195 0.485 195 0.485
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 195 0.970 193 0.883
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 195 1.456 187 1.158
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 195 1.941 175 1.290
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 195 2.426 165 1.429
2402032328521404296.10.pdb
2402032328521404296.11.pdb
2402032328521404296.7.pdb
2402032328521404296.8.pdb
2402032328521404296.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.665s
user 0m21.641s
sys 0m0.024s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402032328521404296.Chkmod.res: No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG
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elNémo
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by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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