*** COMPLEX (BINDING PROTEIN/PEPTIDE) 17-MAY-97 1WDN ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402060933351647297.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402060933351647297.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402060933351647297.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 223
First residue number = 4
Last residue number = 226
Number of atoms found = 1740
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 4.139053 +/- 8.498083 From: -16.967000 To: 24.269000
= 14.289459 +/- 11.619670 From: -13.236000 To: 40.266000
= 15.593694 +/- 10.293539 From: -7.963000 To: 41.508000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7193 % Filled.
Pdbmat> 643093 non-zero elements.
Pdbmat> 70312 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.82 +/- 23.00
Maximum number = 132
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.406240E+06
Pdbmat> Larger element = 489.300
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
223 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2402060933351647297.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2402060933351647297.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2402060933351647297.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1740 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 223 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 59
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 75
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 89
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 109
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 129
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 142
Blocpdb> 19 atoms in block 11
Block first atom: 158
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 177
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 192
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 207
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 223
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 242
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 255
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 269
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 286
Blocpdb> 20 atoms in block 20
Block first atom: 303
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 323
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 340
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 356
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 372
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 389
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 401
Blocpdb> 13 atoms in block 27
Block first atom: 416
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 429
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 445
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 462
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 490
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 503
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 515
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 530
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 545
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 565
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 583
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 596
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 615
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 629
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 645
Blocpdb> 10 atoms in block 43
Block first atom: 666
Blocpdb> 16 atoms in block 44
Block first atom: 676
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 692
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 707
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 723
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 736
Blocpdb> 15 atoms in block 49
Block first atom: 752
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 767
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 782
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 798
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 814
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 826
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 842
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 854
Blocpdb> 10 atoms in block 57
Block first atom: 870
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 880
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 891
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 904
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 924
Blocpdb> 13 atoms in block 62
Block first atom: 938
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 951
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 968
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 984
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1000
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1020
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1038
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1054
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1070
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1087
Blocpdb> 12 atoms in block 72
Block first atom: 1104
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1116
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1131
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1147
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1160
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1175
Blocpdb> 14 atoms in block 78
Block first atom: 1193
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1207
Blocpdb> 20 atoms in block 80
Block first atom: 1223
Blocpdb> 19 atoms in block 81
Block first atom: 1243
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1262
Blocpdb> 9 atoms in block 83
Block first atom: 1278
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1287
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1299
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1319
Blocpdb> 11 atoms in block 87
Block first atom: 1333
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1344
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1358
Blocpdb> 14 atoms in block 90
Block first atom: 1375
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1389
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1410
Blocpdb> 16 atoms in block 93
Block first atom: 1422
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1438
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 1454
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1464
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 1481
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1500
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1517
Blocpdb> 9 atoms in block 100
Block first atom: 1532
Blocpdb> 17 atoms in block 101
Block first atom: 1541
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1558
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1573
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1593
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1605
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1624
Blocpdb> 20 atoms in block 107
Block first atom: 1641
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1661
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 1679
Blocpdb> 11 atoms in block 110
Block first atom: 1704
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1715
Blocpdb> 10 atoms in block 112
Block first atom: 1730
Blocpdb> 112 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 643205 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5220
Prepmat> Matrix trace = 1406240.0000
Prepmat> Last element read: 5220 5220 63.1693
Prepmat> 6329 lines saved.
Prepmat> 5142 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1740
RTB> Total mass = 1740.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1740
RTB> Number of blocks = 112
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 152761.4703
RTB> 41016 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 672
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41016
Diagstd> Projected matrix trace = 152761.4703
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 672 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 152761.4703
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.2351461 3.9410491 4.1821139 7.7695782
9.2730448 10.6183390 11.5436673 12.4321811 13.8626397
14.8261890 16.5398676 17.4236622 18.2004298 18.6492535
19.6161015 20.2656196 20.6868547 23.2739364 24.3268158
25.6564544 26.5952743 27.0922683 27.9829386 28.9097272
30.3240558 30.5334542 32.3917547 32.5555201 33.4554185
34.4441831 35.1865112 35.4459183 36.1343573 36.5373834
37.5256799 38.1719619 38.7781263 39.3087070 40.6145012
41.4420439 42.2627334 42.7188348 44.5722627 45.9282026
46.1856257 47.1504272 47.9708999 49.4677973 49.5100770
50.6650828 51.0614541 51.5481341 52.6536836 54.0735057
54.5384950 55.1066157 55.9720927 57.9289132 58.5224643
60.3906518 61.4329039 61.6970323 63.3797742 63.8381498
65.1433147 65.7821056 66.9357271 67.5168514 69.4749976
69.9899300 70.8434910 71.1712771 72.4603224 73.0651569
74.0721019 74.2009988 75.0674485 76.7187916 77.2205250
77.5387608 77.9454093 78.7387204 80.0398249 81.4373180
82.0572494 83.4406778 83.8658576 84.1536854 85.7087128
86.8972608 87.2776841 88.9468379 89.7922410 90.7814159
91.2281219 91.7980411 92.9250657 93.7349895 94.3568532
94.7196160
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034318 0.0034325 0.0034330 0.0034336 0.0034338
0.0034340 195.3179835 215.5763949 222.0716961 302.6871614
330.6788817 353.8535631 368.9497163 382.8855209 404.3135057
418.1287660 441.6327731 453.2783760 463.2720532 468.9494238
480.9518839 488.8495538 493.9039652 523.8780492 535.5967262
550.0391471 560.0122371 565.2205770 574.4363842 583.8714999
597.9831188 600.0442101 618.0342132 619.5945651 628.0995956
637.3136563 644.1446206 646.5146890 652.7628770 656.3930915
665.2112186 670.9150298 676.2210578 680.8315286 692.0474017
699.0622706 705.9502090 709.7493106 724.9826632 735.9274550
737.9869738 745.6552780 752.1149356 763.7593968 764.0857167
772.9468983 775.9645293 779.6537195 787.9699578 798.5232096
801.9491938 806.1152748 812.4208347 826.5002147 830.7236661
843.8789206 851.1298119 852.9575496 864.5111997 867.6317296
876.4561784 880.7429297 888.4321639 892.2804357 905.1270635
908.4751659 913.9980253 916.1100756 924.3690829 928.2189720
934.5931952 935.4060100 940.8515562 951.1437469 954.2488723
956.2131418 958.7172715 963.5837262 971.5123933 979.9569823
983.6798103 991.9372326 994.4612759 996.1663106 1005.3279726
1012.2745626 1014.4879368 1024.1428488 1028.9983671 1034.6507011
1037.1931680 1040.4278941 1046.7951907 1051.3471647 1054.8288627
1056.8546063
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1740
Rtb_to_modes> Number of blocs = 112
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.235
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.941
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.770
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.273
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.91
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.72
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 672 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999
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1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999
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1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 31320 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997
0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00004
1.00002 0.99996 0.99996 0.99999 1.00003
1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997
1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402060933351647297.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402060933351647297.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402060933351647297.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402060933351647297.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 223
First residue number = 4
Last residue number = 226
Number of atoms found = 1740
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.941
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.770
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.273
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.72
Bfactors> 106 vectors, 5220 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.235000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.627 for 223 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.026 +/- 0.02
Bfactors> = 21.900 +/- 7.29
Bfactors> Shiftng-fct= 21.874
Bfactors> Scaling-fct= 313.146
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2402060933351647297.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402060933351647297.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2402060933351647297.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402060933351647297.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2402060933351647297.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2402060933351647297.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Projmod> 106 vectors, 5220 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 223
First residue number = 4
Last residue number = 226
Number of atoms found = 1740
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 440
First residue number = 5
Last residue number = 224
Number of atoms found = 3428
Mean number per residue = 7.8
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 1 of first conformer: LYS 4 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402060933351647297 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
making animated gifs
11 models are in 2402060933351647297.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 220 4.966 130 1.013
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 220 4.960 133 1.098
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 220 4.996 134 1.089
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 220 5.072 133 0.914
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 220 5.187 133 0.896
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 220 5.523 132 0.995
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 220 5.737 37 2.203
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 220 5.979 34 2.164
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 220 6.244 30 2.172
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 220 6.530 126 0.896
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402060933351647297 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
making animated gifs
11 models are in 2402060933351647297.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 220 6.310 27 2.071
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 220 6.064 27 2.003
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 220 5.841 30 2.089
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 220 5.643 131 0.990
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 220 5.475 44 2.181
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 220 5.235 131 0.864
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 220 5.168 131 0.898
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 220 5.139 131 0.975
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 220 5.149 56 1.993
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 220 5.196 59 2.042
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402060933351647297 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402060933351647297.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
making animated gifs
11 models are in 2402060933351647297.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 220 4.172 139 1.253
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 220 4.332 139 1.097
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 220 4.534 137 1.123
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 220 4.772 135 1.147
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 220 5.042 133 0.962
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 220 5.657 131 0.930
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 220 5.994 131 1.003
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 220 6.347 26 2.014
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 220 6.713 30 2.079
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 220 7.091 23 2.089
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402060933351647297 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
making animated gifs
11 models are in 2402060933351647297.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 220 5.767 59 2.104
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 220 5.615 55 2.016
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 220 5.495 124 1.155
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 220 5.407 51 2.072
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 220 5.355 134 1.067
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 220 5.358 129 0.981
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 220 5.413 126 1.330
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 220 5.503 122 1.431
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 220 5.627 116 1.471
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 220 5.781 114 1.489
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402060933351647297 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402060933351647297.eigenfacs
2402060933351647297.atom
making animated gifs
11 models are in 2402060933351647297.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402060933351647297.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 220 5.400 115 1.220
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 220 5.314 118 1.212
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 220 5.264 123 1.170
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 220 5.251 126 1.074
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 220 5.276 131 0.994
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 220 5.436 130 1.050
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 220 5.568 130 1.028
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 220 5.731 126 1.249
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 220 5.923 125 1.143
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 220 6.142 117 1.222
2402060933351647297.10.pdb
2402060933351647297.11.pdb
2402060933351647297.7.pdb
2402060933351647297.8.pdb
2402060933351647297.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m5.730s
user 0m5.709s
sys 0m0.020s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402060933351647297.Chkmod.res: No such file or directory
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