Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* AF-1A0L_recycle_9 *

LOGs for ID: 2402070223221789221

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2402070223221789221.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2402070223221789221.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2402070223221789221.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    228
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    228
            Number of atoms found    =   1786
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     0.467805 +/-    11.997162 From:   -29.906000 To:    34.125000
 =     0.915160 +/-     6.939489 From:   -18.359000 To:    20.484000
 =    -0.416588 +/-    12.029865 From:   -21.688000 To:    41.438000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.5901 % Filled.
 Pdbmat>       658991  non-zero elements.
 Pdbmat>        72095 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     80.73 +/-     25.54
         Maximum number =    135
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.441900E+06
 Pdbmat> Larger element =  494.685    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
228 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2402070223221789221.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2402070223221789221.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2402070223221789221.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1786 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   228 residues.
 Blocpdb>    16 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    14 atoms in block      5
 Block first atom:     75
 Blocpdb>    12 atoms in block      6
 Block first atom:     89
 Blocpdb>    19 atoms in block      7
 Block first atom:    101
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:    120
 Blocpdb>    21 atoms in block      9
 Block first atom:    136
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    157
 Blocpdb>    10 atoms in block     11
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    18 atoms in block     12
 Block first atom:    180
 Blocpdb>    15 atoms in block     13
 Block first atom:    198
 Blocpdb>    21 atoms in block     14
 Block first atom:    213
 Blocpdb>    28 atoms in block     15
 Block first atom:    234
 Blocpdb>    14 atoms in block     16
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    15 atoms in block     18
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    320
 Blocpdb>    13 atoms in block     21
 Block first atom:    336
 Blocpdb>    10 atoms in block     22
 Block first atom:    349
 Blocpdb>    14 atoms in block     23
 Block first atom:    359
 Blocpdb>    24 atoms in block     24
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    12 atoms in block     25
 Block first atom:    397
 Blocpdb>    21 atoms in block     26
 Block first atom:    409
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    19 atoms in block     28
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    12 atoms in block     29
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    14 atoms in block     30
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    11 atoms in block     31
 Block first atom:    489
 Blocpdb>    13 atoms in block     32
 Block first atom:    500
 Blocpdb>    12 atoms in block     33
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    10 atoms in block     34
 Block first atom:    525
 Blocpdb>    10 atoms in block     35
 Block first atom:    535
 Blocpdb>    12 atoms in block     36
 Block first atom:    545
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    557
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    566
 Blocpdb>    19 atoms in block     39
 Block first atom:    578
 Blocpdb>    14 atoms in block     40
 Block first atom:    597
 Blocpdb>    16 atoms in block     41
 Block first atom:    611
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    627
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    642
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    656
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    670
 Blocpdb>    15 atoms in block     46
 Block first atom:    687
 Blocpdb>    19 atoms in block     47
 Block first atom:    702
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    721
 Blocpdb>    17 atoms in block     49
 Block first atom:    740
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    757
 Blocpdb>    16 atoms in block     51
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    17 atoms in block     52
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:    806
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    821
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    836
 Blocpdb>    19 atoms in block     56
 Block first atom:    851
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    870
 Blocpdb>    10 atoms in block     58
 Block first atom:    883
 Blocpdb>    21 atoms in block     59
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    18 atoms in block     60
 Block first atom:    914
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    932
 Blocpdb>    15 atoms in block     62
 Block first atom:    946
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    961
 Blocpdb>    11 atoms in block     64
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    14 atoms in block     65
 Block first atom:    982
 Blocpdb>    23 atoms in block     66
 Block first atom:    996
 Blocpdb>    11 atoms in block     67
 Block first atom:   1019
 Blocpdb>    20 atoms in block     68
 Block first atom:   1030
 Blocpdb>    10 atoms in block     69
 Block first atom:   1050
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1060
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:   1076
 Blocpdb>    18 atoms in block     72
 Block first atom:   1087
 Blocpdb>    26 atoms in block     73
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>    12 atoms in block     75
 Block first atom:   1147
 Blocpdb>    20 atoms in block     76
 Block first atom:   1159
 Blocpdb>    20 atoms in block     77
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1199
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1214
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1229
 Blocpdb>    15 atoms in block     81
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1260
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1273
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:   1287
 Blocpdb>    13 atoms in block     85
 Block first atom:   1303
 Blocpdb>    17 atoms in block     86
 Block first atom:   1316
 Blocpdb>    17 atoms in block     87
 Block first atom:   1333
 Blocpdb>    20 atoms in block     88
 Block first atom:   1350
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    17 atoms in block     91
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    18 atoms in block     92
 Block first atom:   1415
 Blocpdb>    13 atoms in block     93
 Block first atom:   1433
 Blocpdb>    13 atoms in block     94
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    16 atoms in block     95
 Block first atom:   1459
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1475
 Blocpdb>    21 atoms in block     97
 Block first atom:   1488
 Blocpdb>    11 atoms in block     98
 Block first atom:   1509
 Blocpdb>    22 atoms in block     99
 Block first atom:   1520
 Blocpdb>    18 atoms in block    100
 Block first atom:   1542
 Blocpdb>    19 atoms in block    101
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    20 atoms in block    102
 Block first atom:   1579
 Blocpdb>    13 atoms in block    103
 Block first atom:   1599
 Blocpdb>    15 atoms in block    104
 Block first atom:   1612
 Blocpdb>    15 atoms in block    105
 Block first atom:   1627
 Blocpdb>    12 atoms in block    106
 Block first atom:   1642
 Blocpdb>    18 atoms in block    107
 Block first atom:   1654
 Blocpdb>    12 atoms in block    108
 Block first atom:   1672
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1684
 Blocpdb>    23 atoms in block    110
 Block first atom:   1703
 Blocpdb>    17 atoms in block    111
 Block first atom:   1726
 Blocpdb>    12 atoms in block    112
 Block first atom:   1743
 Blocpdb>    18 atoms in block    113
 Block first atom:   1755
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1772

 Blocpdb>   114 blocks.

 Blocpdb> At most,     28 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       659105 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5358

 Prepmat> Matrix trace    =    1441900.0000
 Prepmat> Last element read:    5358   5358       119.6599
 Prepmat>         6556 lines saved.
 Prepmat>         5362 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1786
 RTB> Total mass =        1786.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1786
 RTB> Number of blocks =   114
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  153935.8844
 RTB>     41227 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      684
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    41227
 Diagstd> Projected matrix trace =  153935.8844

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    684 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 153935.8844
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.5984451      1.8215908      2.6145380      3.0918643
      3.8735193      4.3487469      5.3003294      6.5015747      6.7747324
      8.2737548      9.9734717     10.7828874     12.0536004     12.2417704
     12.8400288     14.9340704     16.0598843     16.8648571     17.8059712
     19.6001892     19.7306878     20.9042525     21.5826323     21.9936966
     22.9371339     23.1642939     24.7779779     26.7021754     27.3299520
     27.7479989     28.9923602     29.7472692     30.6831779     31.0814049
     32.6780133     33.3729052     34.9718975     35.6579456     36.7568782
     37.7774086     38.9104981     40.0532832     40.7249924     40.9301406
     41.7016110     43.4182386     44.1494794     44.7411210     44.7949703
     45.9269648     46.7389820     47.2740363     49.0779943     49.4923451
     51.4012002     51.5694778     51.8070463     53.3674177     53.5834072
     54.7167199     55.7635229     56.4320436     57.3280949     57.9506468
     59.4073940     60.4432907     60.6747857     61.2427957     62.1666350
     62.5860516     62.9517525     65.8292645     66.8139243     67.8482112
     68.1753324     68.6775893     69.3450950     71.1119130     71.2135156
     72.3844543     72.9994195     74.4836521     74.8859524     75.9087641
     76.4993778     76.8538079     77.9101113     78.3760184     78.5229171
     79.1661532     79.9654140     80.6517708     80.8761541     82.1372512
     83.6441958     84.6138650     84.6997537     85.2979784     85.9286799
     86.6608431

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034331      0.0034338      0.0034341      0.0034344
      0.0034354     84.0054440    146.5617681    175.5871631    190.9437710
    213.7214646    226.4526188    250.0038580    276.8882698    282.6450299
    312.3536624    342.9402504    356.5847908    377.0106996    379.9420789
    389.1152747    419.6472465    435.1775540    445.9504565    458.2242971
    480.7567734    482.3545645    496.4923960    504.4841031    509.2656633
    520.0736560    522.6426089    540.5404653    561.1366078    567.6945368
    572.0198698    584.7053483    592.2687687    601.5135977    605.4044389
    620.7591118    627.3245557    642.1771947    648.4454381    658.3617482
    667.4386649    677.3742377    687.2493546    692.9881146    694.7313521
    701.2480988    715.5358215    721.5361148    726.3546325    726.7916125
    735.9175377    742.3947719    746.6320392    760.7442583    763.9488765
    778.5417557    779.8151121    781.6092611    793.2925485    794.8962407
    803.2584586    810.9057534    815.7520413    822.2029582    826.6552421
    836.9808688    844.2466199    845.8617875    849.8118527    856.1975097
    859.0808874    861.5871092    881.0585739    887.6234566    894.4673267
    896.6210122    899.9177160    904.2804755    915.7279313    916.3818805
    923.8850350    927.8013146    937.1859342    939.7134851    946.1091453
    949.7826497    951.9803313    958.5001664    961.3618386    962.2623479
    966.1955914    971.0606938    975.2191795    976.5748280    984.1592133
    993.1461999    998.8862774    999.3931167   1002.9162068   1006.6172076
   1010.8965982

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1786
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    114

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9915E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5984    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.822    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.615    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.092    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.874    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.349    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.300    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.502    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.775    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.274    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.973    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.66    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    684 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99998 1.00004 0.99999 0.99997 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00006
 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
 0.99997 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    32148 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99998 1.00004 0.99999 0.99997 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00006
 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
 0.99997 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2402070223221789221.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2402070223221789221.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2402070223221789221.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2402070223221789221.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    228
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    228
            Number of atoms found    =   1786
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9915E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5984    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.822    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.615    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.092    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.874    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.349    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.300    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.502    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.775    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.274    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.973    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.66    

 Bfactors>  106 vectors,   5358 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.598400
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.490 for    228 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.054 +/-   0.21
 Bfactors> =     88.872 +/-  11.67
 Bfactors> Shiftng-fct=     88.818
 Bfactors> Scaling-fct=     55.557

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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getting mode 12
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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getting mode 13
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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2402070223221789221.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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2402070223221789221.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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2402070223221789221.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070223221789221 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2402070223221789221.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2402070223221789221.eigenfacs
2402070223221789221.atom
2402070223221789221.10.pdb
2402070223221789221.11.pdb
2402070223221789221.12.pdb
2402070223221789221.13.pdb
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2402070223221789221.16.pdb
2402070223221789221.7.pdb
2402070223221789221.8.pdb
2402070223221789221.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m6.200s
user	0m6.183s
sys	0m0.016s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402070223221789221.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know.

*** AF-1A0L_recycle_9 ***

LOGs for ID: 2402070223221789221

output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* AF-1A0L_recycle_9 *
