*** AF-1P5V_recycle_9 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402070228301791804.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402070228301791804.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402070228301791804.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 196
First residue number = 1
Last residue number = 196
Number of atoms found = 1541
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.821531 +/- 12.702296 From: -36.500000 To: 20.734000
= 1.323206 +/- 8.465674 From: -21.516000 To: 19.391000
= -0.918123 +/- 11.285687 From: -29.266000 To: 21.016000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.0402 % Filled.
Pdbmat> 538719 non-zero elements.
Pdbmat> 58882 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.42 +/- 23.93
Maximum number = 126
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 1.177640E+06
Pdbmat> Larger element = 490.373
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
196 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2402070228301791804.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2402070228301791804.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2402070228301791804.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1541 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 196 residues.
Blocpdb> 11 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 5 atoms in block 2
Block first atom: 12
Blocpdb> 6 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 9 atoms in block 5
Block first atom: 32
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 41
Blocpdb> 4 atoms in block 7
Block first atom: 53
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 57
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 64
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 71
Blocpdb> 4 atoms in block 11
Block first atom: 79
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 83
Blocpdb> 6 atoms in block 13
Block first atom: 92
Blocpdb> 11 atoms in block 14
Block first atom: 98
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 109
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 117
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 125
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 137
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 144
Blocpdb> 8 atoms in block 20
Block first atom: 152
Blocpdb> 5 atoms in block 21
Block first atom: 160
Blocpdb> 5 atoms in block 22
Block first atom: 165
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 170
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 174
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 181
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 189
Blocpdb> 6 atoms in block 27
Block first atom: 196
Blocpdb> 6 atoms in block 28
Block first atom: 202
Blocpdb> 7 atoms in block 29
Block first atom: 208
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 215
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 222
Blocpdb> 9 atoms in block 32
Block first atom: 229
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 238
Blocpdb> 7 atoms in block 34
Block first atom: 246
Blocpdb> 9 atoms in block 35
Block first atom: 253
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 262
Blocpdb> 12 atoms in block 37
Block first atom: 270
Blocpdb> 7 atoms in block 38
Block first atom: 282
Blocpdb> 7 atoms in block 39
Block first atom: 289
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 296
Blocpdb> 8 atoms in block 41
Block first atom: 304
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 312
Blocpdb> 6 atoms in block 43
Block first atom: 321
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 327
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 338
Blocpdb> 12 atoms in block 46
Block first atom: 346
Blocpdb> 8 atoms in block 47
Block first atom: 358
Blocpdb> 7 atoms in block 48
Block first atom: 366
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 373
Blocpdb> 7 atoms in block 50
Block first atom: 384
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 391
Blocpdb> 7 atoms in block 52
Block first atom: 398
Blocpdb> 7 atoms in block 53
Block first atom: 405
Blocpdb> 7 atoms in block 54
Block first atom: 412
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 419
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 426
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 434
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 445
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 456
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 464
Blocpdb> 5 atoms in block 61
Block first atom: 472
Blocpdb> 9 atoms in block 62
Block first atom: 477
Blocpdb> 9 atoms in block 63
Block first atom: 486
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 495
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 504
Blocpdb> 6 atoms in block 66
Block first atom: 512
Blocpdb> 6 atoms in block 67
Block first atom: 518
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 524
Blocpdb> 11 atoms in block 69
Block first atom: 532
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 543
Blocpdb> 5 atoms in block 71
Block first atom: 551
Blocpdb> 9 atoms in block 72
Block first atom: 556
Blocpdb> 5 atoms in block 73
Block first atom: 565
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 570
Blocpdb> 4 atoms in block 75
Block first atom: 574
Blocpdb> 7 atoms in block 76
Block first atom: 578
Blocpdb> 11 atoms in block 77
Block first atom: 585
Blocpdb> 7 atoms in block 78
Block first atom: 596
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 603
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 614
Blocpdb> 9 atoms in block 81
Block first atom: 622
Blocpdb> 9 atoms in block 82
Block first atom: 631
Blocpdb> 6 atoms in block 83
Block first atom: 640
Blocpdb> 8 atoms in block 84
Block first atom: 646
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 654
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 663
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 677
Blocpdb> 6 atoms in block 88
Block first atom: 685
Blocpdb> 7 atoms in block 89
Block first atom: 691
Blocpdb> 9 atoms in block 90
Block first atom: 698
Blocpdb> 4 atoms in block 91
Block first atom: 707
Blocpdb> 8 atoms in block 92
Block first atom: 711
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 719
Blocpdb> 9 atoms in block 94
Block first atom: 726
Blocpdb> 8 atoms in block 95
Block first atom: 735
Blocpdb> 7 atoms in block 96
Block first atom: 743
Blocpdb> 4 atoms in block 97
Block first atom: 750
Blocpdb> 7 atoms in block 98
Block first atom: 754
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 761
Blocpdb> 7 atoms in block 100
Block first atom: 772
Blocpdb> 9 atoms in block 101
Block first atom: 779
Blocpdb> 11 atoms in block 102
Block first atom: 788
Blocpdb> 5 atoms in block 103
Block first atom: 799
Blocpdb> 8 atoms in block 104
Block first atom: 804
Blocpdb> 8 atoms in block 105
Block first atom: 812
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 820
Blocpdb> 6 atoms in block 107
Block first atom: 828
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 834
Blocpdb> 9 atoms in block 109
Block first atom: 842
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 851
Blocpdb> 8 atoms in block 111
Block first atom: 859
Blocpdb> 7 atoms in block 112
Block first atom: 867
Blocpdb> 11 atoms in block 113
Block first atom: 874
Blocpdb> 7 atoms in block 114
Block first atom: 885
Blocpdb> 8 atoms in block 115
Block first atom: 892
Blocpdb> 9 atoms in block 116
Block first atom: 900
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 909
Blocpdb> 9 atoms in block 118
Block first atom: 917
Blocpdb> 4 atoms in block 119
Block first atom: 926
Blocpdb> 7 atoms in block 120
Block first atom: 930
Blocpdb> 7 atoms in block 121
Block first atom: 937
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 944
Blocpdb> 9 atoms in block 123
Block first atom: 952
Blocpdb> 11 atoms in block 124
Block first atom: 961
Blocpdb> 5 atoms in block 125
Block first atom: 972
Blocpdb> 9 atoms in block 126
Block first atom: 977
Blocpdb> 8 atoms in block 127
Block first atom: 986
Blocpdb> 8 atoms in block 128
Block first atom: 994
Blocpdb> 6 atoms in block 129
Block first atom: 1002
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 1008
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1022
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 1031
Blocpdb> 8 atoms in block 133
Block first atom: 1038
Blocpdb> 4 atoms in block 134
Block first atom: 1046
Blocpdb> 4 atoms in block 135
Block first atom: 1050
Blocpdb> 9 atoms in block 136
Block first atom: 1054
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1063
Blocpdb> 8 atoms in block 138
Block first atom: 1071
Blocpdb> 5 atoms in block 139
Block first atom: 1079
Blocpdb> 9 atoms in block 140
Block first atom: 1084
Blocpdb> 8 atoms in block 141
Block first atom: 1093
Blocpdb> 7 atoms in block 142
Block first atom: 1101
Blocpdb> 6 atoms in block 143
Block first atom: 1108
Blocpdb> 7 atoms in block 144
Block first atom: 1114
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 1121
Blocpdb> 12 atoms in block 146
Block first atom: 1132
Blocpdb> 8 atoms in block 147
Block first atom: 1144
Blocpdb> 8 atoms in block 148
Block first atom: 1152
Blocpdb> 8 atoms in block 149
Block first atom: 1160
Blocpdb> 4 atoms in block 150
Block first atom: 1168
Blocpdb> 9 atoms in block 151
Block first atom: 1172
Blocpdb> 8 atoms in block 152
Block first atom: 1181
Blocpdb> 7 atoms in block 153
Block first atom: 1189
Blocpdb> 11 atoms in block 154
Block first atom: 1196
Blocpdb> 4 atoms in block 155
Block first atom: 1207
Blocpdb> 4 atoms in block 156
Block first atom: 1211
Blocpdb> 9 atoms in block 157
Block first atom: 1215
Blocpdb> 6 atoms in block 158
Block first atom: 1224
Blocpdb> 8 atoms in block 159
Block first atom: 1230
Blocpdb> 7 atoms in block 160
Block first atom: 1238
Blocpdb> 6 atoms in block 161
Block first atom: 1245
Blocpdb> 10 atoms in block 162
Block first atom: 1251
Blocpdb> 12 atoms in block 163
Block first atom: 1261
Blocpdb> 8 atoms in block 164
Block first atom: 1273
Blocpdb> 7 atoms in block 165
Block first atom: 1281
Blocpdb> 7 atoms in block 166
Block first atom: 1288
Blocpdb> 9 atoms in block 167
Block first atom: 1295
Blocpdb> 6 atoms in block 168
Block first atom: 1304
Blocpdb> 7 atoms in block 169
Block first atom: 1310
Blocpdb> 14 atoms in block 170
Block first atom: 1317
Blocpdb> 5 atoms in block 171
Block first atom: 1331
Blocpdb> 11 atoms in block 172
Block first atom: 1336
Blocpdb> 8 atoms in block 173
Block first atom: 1347
Blocpdb> 8 atoms in block 174
Block first atom: 1355
Blocpdb> 7 atoms in block 175
Block first atom: 1363
Blocpdb> 8 atoms in block 176
Block first atom: 1370
Blocpdb> 7 atoms in block 177
Block first atom: 1378
Blocpdb> 6 atoms in block 178
Block first atom: 1385
Blocpdb> 14 atoms in block 179
Block first atom: 1391
Blocpdb> 11 atoms in block 180
Block first atom: 1405
Blocpdb> 8 atoms in block 181
Block first atom: 1416
Blocpdb> 8 atoms in block 182
Block first atom: 1424
Blocpdb> 8 atoms in block 183
Block first atom: 1432
Blocpdb> 8 atoms in block 184
Block first atom: 1440
Blocpdb> 9 atoms in block 185
Block first atom: 1448
Blocpdb> 4 atoms in block 186
Block first atom: 1457
Blocpdb> 4 atoms in block 187
Block first atom: 1461
Blocpdb> 8 atoms in block 188
Block first atom: 1465
Blocpdb> 8 atoms in block 189
Block first atom: 1473
Blocpdb> 11 atoms in block 190
Block first atom: 1481
Blocpdb> 8 atoms in block 191
Block first atom: 1492
Blocpdb> 12 atoms in block 192
Block first atom: 1500
Blocpdb> 6 atoms in block 193
Block first atom: 1512
Blocpdb> 9 atoms in block 194
Block first atom: 1518
Blocpdb> 8 atoms in block 195
Block first atom: 1527
Blocpdb> 7 atoms in block 196
Block first atom: 1534
Blocpdb> 196 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 538915 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4623
Prepmat> Matrix trace = 1177640.0000
Prepmat> Last element read: 4623 4623 283.8474
Prepmat> 19307 lines saved.
Prepmat> 16961 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1541
RTB> Total mass = 1541.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1541
RTB> Number of blocks = 196
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 272077.3632
RTB> 81480 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1176
Diagstd> Nb of non-zero elements: 81480
Diagstd> Projected matrix trace = 272077.3632
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1176 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 272077.3632
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.7260504 1.0415911 1.3191107 1.6290172
2.5738688 2.7002175 3.1909415 3.6037766 4.9311488
5.5222066 6.1995141 7.6401853 8.7200203 10.2308762
10.4074443 10.9499927 11.5320083 11.7619691 13.1877773
13.3447385 13.7746479 14.5542522 16.2545867 16.9413816
17.2915754 19.0613715 19.1881943 20.4894931 21.6686708
21.9239679 23.5634659 24.8914304 25.1402209 25.8343746
27.3779206 28.3697313 29.1281291 29.5724062 30.1988820
30.3094132 30.9031455 32.0003016 32.2801901 33.0782161
33.6843265 34.3520390 34.9650788 35.7112673 36.9622110
37.3015851 37.8825101 38.5167986 39.4493104 40.1180948
41.1509161 42.1333873 42.6557615 43.0602679 43.3424240
43.8652891 45.0069431 45.6595489 45.7908445 47.0734327
47.6162477 48.2182748 48.9340051 49.3383006 49.7817732
49.9807372 50.8014559 51.9243639 52.2830372 52.3287164
52.7153460 53.9544582 54.2715012 55.4552627 56.3992306
57.4019498 57.9824444 58.1091618 58.8365625 59.1526742
59.7785999 60.8310924 61.3345833 61.6053626 62.0063737
62.4495062 62.9411273 63.3850211 64.2274344 64.3556497
64.9759178 65.8431702 66.0149386 66.9140755 67.6463252
68.8617020
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034328 0.0034332 0.0034346 0.0034349
0.0034352 92.5291702 110.8265766 124.7199413 138.5983668
174.2161792 178.4410027 193.9789926 206.1456662 241.1400438
255.1829225 270.3797162 300.1561362 320.6668223 347.3375175
350.3219331 359.3372138 368.7633520 372.4219744 394.3493079
396.6891431 403.0282910 414.2764337 437.8075493 446.9610645
451.5569820 474.1026178 475.6771981 491.5422890 505.4886593
508.4577360 527.1265193 541.7765550 544.4773589 551.9430337
568.1925178 578.3928174 586.0728126 590.5254396 596.7476441
597.8387271 603.6658715 614.2884029 616.9689700 624.5487171
630.2447177 636.4606242 642.1145871 648.9300891 660.1980714
663.2220001 668.3664694 673.9386622 682.0480759 687.8051615
696.6025091 704.8690927 709.2251540 712.5800252 714.9108334
719.2101008 728.5091967 733.7719203 734.8261563 745.0462187
749.3295587 754.0516842 759.6274707 762.7590577 766.1793826
767.7089592 773.9864536 782.4937415 785.1916714 785.5346038
788.4312164 797.6437164 799.9838098 808.6613075 815.5148428
822.7324034 826.8820045 827.7850638 832.9499874 835.1845890
839.5917257 846.9506156 850.4484418 852.3236499 855.0931884
858.1432379 861.5143953 864.5469835 870.2731150 871.1413319
875.3293516 881.1516258 882.3002291 888.2884624 893.1355676
901.1231697
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1541
Rtb_to_modes> Number of blocs = 196
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7261
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.042
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.319
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.629
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.574
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.604
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.522
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.720
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.86
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997
1.00000 1.00005 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000
0.99998 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997
1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 1.00005 1.00000 0.99998
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 27738 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997
1.00000 1.00005 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000
0.99998 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997
1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 1.00005 1.00000 0.99998
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402070228301791804.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402070228301791804.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402070228301791804.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402070228301791804.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 196
First residue number = 1
Last residue number = 196
Number of atoms found = 1541
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.629
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.574
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.604
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.522
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.720
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.86
Bfactors> 106 vectors, 4623 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.726100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.724 for 196 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.071 +/- 0.12
Bfactors> = 82.697 +/- 13.98
Bfactors> Shiftng-fct= 82.626
Bfactors> Scaling-fct= 115.052
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070228301791804 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070228301791804.eigenfacs
2402070228301791804.atom
2402070228301791804.10.pdb
2402070228301791804.11.pdb
2402070228301791804.12.pdb
2402070228301791804.13.pdb
2402070228301791804.14.pdb
2402070228301791804.15.pdb
2402070228301791804.16.pdb
2402070228301791804.7.pdb
2402070228301791804.8.pdb
2402070228301791804.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.771s
user 0m21.739s
sys 0m0.032s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402070228301791804.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
