*** AF-1F0N_recycle_9 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402070233561794441.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402070233561794441.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402070233561794441.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.040054 +/- 10.381940 From: -24.484000 To: 25.391000
= -0.226019 +/- 8.901869 From: -20.906000 To: 21.672000
= -1.422910 +/- 10.611978 From: -24.875000 To: 21.969000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.0967 % Filled.
Pdbmat> 854687 non-zero elements.
Pdbmat> 93628 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.97 +/- 23.34
Maximum number = 136
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.872560E+06
Pdbmat> Larger element = 507.830
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
284 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2402070233561794441.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2402070233561794441.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2402070233561794441.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2153 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 284 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 96
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 109
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 122
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 134
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 153
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 186
Blocpdb> 10 atoms in block 14
Block first atom: 206
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 216
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 228
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 242
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 273
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 289
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 301
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 320
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 334
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 350
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 370
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 388
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 404
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 419
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 431
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 451
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 522
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 537
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 563
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 576
Blocpdb> 23 atoms in block 39
Block first atom: 588
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 611
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 625
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 651
Blocpdb> 11 atoms in block 43
Block first atom: 664
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 675
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 688
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 712
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 731
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 754
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 770
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 789
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 802
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 819
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 835
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 868
Blocpdb> 12 atoms in block 57
Block first atom: 887
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 899
Blocpdb> 11 atoms in block 59
Block first atom: 915
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 926
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 937
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 950
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 962
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 976
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 985
Blocpdb> 13 atoms in block 66
Block first atom: 997
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1010
Blocpdb> 10 atoms in block 68
Block first atom: 1026
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1036
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1058
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1074
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1094
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 1114
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1123
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1137
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 12 atoms in block 79
Block first atom: 1194
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1206
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1217
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1231
Blocpdb> 13 atoms in block 83
Block first atom: 1243
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1256
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1268
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 1281
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 1289
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1310
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1320
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1336
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1354
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1367
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1381
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 1393
Blocpdb> 19 atoms in block 95
Block first atom: 1416
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1435
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1450
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1466
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1483
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1499
Blocpdb> 13 atoms in block 101
Block first atom: 1514
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1527
Blocpdb> 19 atoms in block 103
Block first atom: 1542
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 1561
Blocpdb> 18 atoms in block 105
Block first atom: 1582
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1600
Blocpdb> 11 atoms in block 107
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 108
Block first atom: 1623
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1638
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 1655
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1663
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1676
Blocpdb> 14 atoms in block 113
Block first atom: 1691
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1705
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1724
Blocpdb> 18 atoms in block 116
Block first atom: 1741
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1759
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1776
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1790
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 1807
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1827
Blocpdb> 20 atoms in block 122
Block first atom: 1840
Blocpdb> 10 atoms in block 123
Block first atom: 1860
Blocpdb> 8 atoms in block 124
Block first atom: 1870
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 1878
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 1896
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 1908
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 1927
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 1945
Blocpdb> 11 atoms in block 130
Block first atom: 1960
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1971
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 1987
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 2010
Blocpdb> 9 atoms in block 134
Block first atom: 2036
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 2045
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2062
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2075
Blocpdb> 12 atoms in block 138
Block first atom: 2092
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2104
Blocpdb> 12 atoms in block 140
Block first atom: 2121
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2133
Blocpdb> 9 atoms in block 142
Block first atom: 2144
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 854829 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6459
Prepmat> Matrix trace = 1872560.0000
Prepmat> Last element read: 6459 6459 29.7617
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8502 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2153
RTB> Total mass = 2153.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2153
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 211671.5091
RTB> 57306 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 57306
Diagstd> Projected matrix trace = 211671.5091
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 211671.5091
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 5.4077889 6.8000660 9.5850818 9.6500567
11.2620465 13.3385184 14.2293305 15.7215224 17.2678972
18.9523749 19.3390273 19.8063343 20.2513854 23.3113629
24.3242739 24.7123451 25.6185396 26.0097028 27.4960494
28.5224636 29.0334839 30.6930529 31.7794068 32.3983602
32.6389515 33.9144665 35.3973110 36.2492446 36.9412275
37.6423660 38.7784771 39.4271713 39.8127167 41.7273171
42.2840271 43.5084228 44.0914295 46.1803223 46.3383056
46.8560244 48.4768032 49.0288571 49.7546606 50.6979800
51.7609507 52.7908331 54.4329398 54.7118901 55.8957544
56.5990723 56.8215609 58.0832814 58.6943518 60.2783784
60.8643538 61.4226699 62.5257257 63.3208671 64.6094972
65.6068692 66.1429647 66.6478027 67.5601902 68.0387549
68.8050118 69.1757694 70.3320495 71.3393887 71.9497951
72.3609940 72.8510024 74.4068316 75.3664069 76.0980447
76.7784914 77.2927345 78.2353431 78.7360445 79.5522962
80.2027009 80.5202049 81.1586810 82.6128200 83.4337878
84.7573336 85.1717668 85.8255235 86.6320345 87.7918668
88.2235740 88.6226415 88.9914192 89.9541005 91.7025705
91.9040063 92.2042194 93.4929122 93.6363431 95.1591594
96.3851241
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034337 0.0034339 0.0034340 0.0034352
0.0034356 252.5254455 283.1730023 336.1965040 337.3340745
364.4214548 396.5966825 409.6259990 430.5688232 451.2477068
472.7451694 477.5431207 483.2783421 488.6778445 524.2991009
535.5687434 539.8240887 549.6325756 553.8127821 569.4170016
579.9476563 585.1198836 601.6103846 612.1645457 618.0972270
620.3879871 632.3940497 646.0712504 653.7997656 660.0106468
666.2446533 676.2241162 681.8566649 685.1823811 701.4642003
706.1280303 716.2785578 721.0616035 737.9446018 739.2057815
743.3237326 756.0704532 760.3633317 765.9707125 773.1977973
781.2614631 788.9955216 801.1727612 803.2230069 811.8666306
816.9583889 818.5625288 827.6007051 831.9427389 843.0941200
847.1821330 851.0589154 858.6667592 864.1093552 872.8577268
879.5690457 883.1553594 886.5193070 892.5667656 895.7224493
900.7521701 903.1757731 910.6928289 917.1913958 921.1069537
923.7353041 926.8576660 936.7025148 942.7231799 947.2879856
951.5137477 954.6949307 960.4986881 963.5673526 968.5490959
972.5003741 974.4234251 978.2790888 987.0042069 991.8962780
999.7327585 1002.1739469 1006.0128099 1010.7285586 1017.4718960
1019.9704831 1022.2747305 1024.3994740 1029.9253858 1039.8867271
1041.0282194 1042.7271413 1049.9886975 1050.7938019 1059.3039184
1066.1057498
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2153
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.39
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 0.99997
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1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
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1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 38754 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
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1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402070233561794441.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402070233561794441.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402070233561794441.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402070233561794441.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.408
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.585
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.650
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.39
Bfactors> 106 vectors, 6459 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.408000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.626 for 284 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.018 +/- 0.02
Bfactors> = 96.213 +/- 4.45
Bfactors> Shiftng-fct= 96.195
Bfactors> Scaling-fct= 231.191
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2402070233561794441 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402070233561794441.eigenfacs
2402070233561794441.atom
2402070233561794441.10.pdb
2402070233561794441.11.pdb
2402070233561794441.12.pdb
2402070233561794441.13.pdb
2402070233561794441.14.pdb
2402070233561794441.15.pdb
2402070233561794441.16.pdb
2402070233561794441.7.pdb
2402070233561794441.8.pdb
2402070233561794441.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m10.372s
user 0m10.342s
sys 0m0.020s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402070233561794441.Chkmod.res: No such file or directory
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