*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2402120101302425383.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2402120101302425383.atom to be opened.
Openam> File opened: 2402120101302425383.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 1
Last residue number = 159
Number of atoms found = 154
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.845396 +/- 8.130199 From: -10.426000 To: 24.919000
= 29.990195 +/- 9.304304 From: 12.846000 To: 54.771000
= 20.868773 +/- 8.740968 From: 4.568000 To: 38.351000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 11.0750 % Filled.
Pdbmat> 11845 non-zero elements.
Pdbmat> 1214 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 15.77 +/- 4.82
Maximum number = 29
Minimum number = 6
Pdbmat> Matrix trace = 24280.0
Pdbmat> Larger element = 118.192
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 154 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 462
Diagstd> Number of non-zero elements 11845
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 24280.0000005
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 462
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 462 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 24280.0000005
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3689767 0.5511285 0.6962005 0.8130361
1.1711640 1.3343715 1.6296886 1.7946747 2.0890061
2.3510052 2.4731709 2.6801667 2.7979121 3.0418914
3.3754878 3.5902025 3.8079470 4.2737118 4.3216475
4.4593768 4.8371644 4.8782869 5.0601487 5.2807956
5.4670722 5.8166026 6.0016612 6.1283756 6.3076837
6.5340284 6.7710855 7.0411584 7.1274403 7.3764761
7.6524682 7.7713709 8.1827999 8.3350325 8.4276712
8.7389581 8.7886644 8.9139624 9.3273256 9.6176155
9.7275631 9.8827615 10.2844925 10.4885368 10.6043806
10.8236923 11.0856358 11.2541683 11.4572355 11.5909198
11.8047811 11.9321962 12.1901763 12.2726509 12.5994916
13.0800722 13.2260913 13.3365650 13.6111799 13.7494189
14.0341829 14.3047865 14.7248791 14.7904048 14.9642020
15.1159747 15.4656698 15.5150865 15.8270625 15.9845045
16.1530863 16.2451720 16.5384357 16.5761259 16.7723585
17.3254277 17.6255319 17.8533103 17.9182372 18.0936819
18.4306424 18.7842661 18.9206130 19.3433200 19.5310443
19.7600398 19.7876206 20.3545667 20.5566344 20.7237446
21.1844877 21.4814280 21.7091023 22.2783441 22.3918510
22.7123749 23.1080089 23.1904663 23.2346097 23.5849689
23.7483810 23.9372349 24.1064664 24.4149621 24.5499291
24.8797625 24.9841345 25.2392876 25.5783171 25.9075861
25.9883614 26.1594872 26.3983744 26.4777875 26.6849978
26.7910289 27.0043050 27.3878659 27.6812848 27.9765022
28.1933299 28.3616241 28.5509009 28.7727581 28.9720037
29.0745599 29.2763118 29.6320015 29.8484799 30.0438338
30.1343818 30.2884520 30.6863310 30.7565334 30.9794074
31.1038261 31.3806546 31.6771198 31.6864342 31.9521002
32.0248114 32.2619438 32.5018083 32.9144541 33.1413373
33.2758552 33.3703249 33.7022988 33.8258417 34.0665242
34.2854600 34.4791139 34.7882546 34.8755738 35.0541687
35.3075713 35.5213398 35.7361770 35.7542825 36.0660354
36.1927714 36.2285165 36.6152276 36.9724636 37.1474482
37.1919593 37.5325409 37.5983074 37.9866499 38.2513297
38.3651778 38.5161368 38.7874185 38.9087603 39.1809631
39.4314588 39.5223525 39.5641398 39.9931975 40.1864566
40.4128110 40.6343052 40.9211687 41.2259059 41.2903381
41.3820933 41.5252173 41.8366758 41.9130886 42.1505052
42.3748361 42.5373050 42.7003708 42.8960006 43.2692976
43.2967412 43.5592614 43.7014911 43.9076784 44.2145171
44.4545519 44.5788097 44.7419400 45.1138355 45.2361245
45.4294990 45.5563258 45.7452542 45.9423087 46.1310878
46.3074892 46.5522391 46.9234062 47.0803950 47.4021233
47.6741171 47.8171452 48.0470761 48.2358056 48.4464611
48.7104019 49.2494178 49.3090424 49.5212930 49.7190345
49.8965459 49.9156241 49.9925328 50.2232881 50.6296582
50.8649653 50.9259839 51.0857054 51.4256191 51.5683318
51.6047646 51.8996023 52.2678057 52.6875149 52.7944667
52.9077826 53.1978554 53.2229614 53.5388799 53.8266288
54.0188361 54.2439207 54.4651969 54.6135674 54.8957252
54.9607673 55.2499882 55.4816903 55.7599352 55.8882094
55.9740134 56.2638331 56.5613163 56.9164142 57.2375573
57.3746255 57.5174179 57.6810401 58.0347631 58.3060008
58.4037953 58.6525930 58.7313725 58.7414842 58.8607436
59.0804639 59.4833457 59.6524992 59.9158363 60.2004659
60.6029465 60.6350463 60.8149501 61.0774532 61.1519863
61.5116719 61.7545483 61.8133259 62.0865615 62.4267278
62.5287705 62.9314491 63.1670252 63.5522952 63.8497794
64.2275692 64.4017020 64.5618442 64.6984191 64.8569928
65.0690319 65.4410050 65.5386001 65.6746835 65.8363894
66.0599178 66.2424287 66.6053036 66.8352189 67.3225319
67.3579023 67.7283998 67.9240860 68.2624268 68.4507310
68.8625527 69.2467076 69.4724151 69.4857491 69.8992368
70.0247273 70.5968024 70.7885979 71.0981745 71.3713072
71.7240751 71.9800655 72.2113537 72.4041466 73.1361210
73.2503198 73.6909920 73.8452906 74.2409124 74.5785468
74.8711683 75.3687420 75.5872998 75.7180374 76.0995609
76.1463119 76.3694330 76.4914050 76.8846914 77.0566865
77.5152700 77.7621476 78.0083115 78.4065236 78.4859139
78.6592967 79.0879541 79.2449257 79.4703603 79.8635291
80.0429931 80.4361824 81.0604927 81.2107847 81.4797692
81.8153605 81.8509982 82.3579205 83.1457351 83.3291528
83.6214213 84.3990439 84.6455189 85.1382186 85.2895993
85.3451797 85.6661085 85.9208765 86.1551787 86.8176694
86.9352799 87.4070033 87.8980757 88.1117657 88.4389433
88.8225858 89.1680800 89.4087331 89.7920858 90.4425200
90.8214552 91.0340889 91.4549512 91.8585691 92.1230251
92.6582015 92.9623345 93.1465169 93.9232174 94.1356291
94.6891231 94.9359921 95.2813552 95.6752288 96.0434787
96.5000237 97.3944244 97.8417899 97.9538064 98.1314080
98.8424891 99.1681674 99.6072368 100.0010747 100.4164302
101.0804980 101.5223864 102.4557044 102.5216152 103.1718785
103.9538562 104.4932439 105.3638708 105.9822403 106.5707319
107.2741448 108.0788161 108.6802393 109.5928594 109.8463655
110.9707697 111.1121925 111.8029137 112.4450604 113.1623848
113.4633180 114.0923062 114.8062551 115.4002648 116.6564784
117.2864866 118.8089296 119.1079987 120.2590064 120.8316774
121.6838010 121.9729514 123.2455485 125.8945007 126.6658854
127.9087537 129.4866293 130.5341671 132.2519587 133.3039560
135.9541113 137.5838461 138.4183607 140.7902770 143.1572143
145.6568777 152.3228311
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the matrix is a hessien in CHARMM units):
0.0034275 0.0034294 0.0034347 0.0034376 0.0034445
0.0034532 65.9621383 80.6160860 90.6071465 97.9152178
117.5179319 125.4393112 138.6269244 145.4749288 156.9513797
166.5030061 170.7742337 177.7772500 181.6403441 189.3944001
199.5094871 205.7570623 211.9047672 224.4904628 225.7459403
229.3149471 238.8310033 239.8440509 244.2738186 249.5427526
253.9058365 261.8966711 266.0302469 268.8239549 272.7283171
277.5784768 282.5689447 288.1491468 289.9092512 294.9305418
300.3973153 302.7220800 310.6320388 313.5082183 315.2456271
321.0148387 321.9264944 324.2131891 331.6453008 336.7665787
338.6860499 341.3771419 348.2464615 351.6840999 353.6209062
357.2588519 361.5560084 364.2939700 367.5658882 369.7040686
373.0991411 375.1072624 379.1405829 380.4209889 385.4533201
392.7356726 394.9217364 396.5676397 400.6297236 402.6590380
406.8074012 410.7106561 416.6977443 417.6238670 420.0703822
422.1952656 427.0509059 427.7326285 432.0116310 434.1550630
436.4384819 437.6807416 441.6136559 442.1165763 444.7258244
451.9987804 455.8966447 458.8330118 459.6665704 461.9114799
466.1927521 470.6438594 472.3488708 477.5961180 479.9080260
482.7132146 483.0499794 489.9211760 492.3469895 494.3441466
499.8092197 503.2999117 505.9600337 512.5505860 513.8546353
517.5193040 522.0072603 522.9377824 523.4352559 527.3669806
529.1907981 531.2907700 533.1655224 536.5661948 538.0472318
541.6495605 542.7844971 545.5490790 549.2009297 552.7245506
553.5855292 555.4051382 557.9353418 558.7739180 560.9560884
562.0694445 564.3022504 568.2957084 571.3318059 574.3703169
576.5918063 578.3101684 580.2366924 582.4867193 584.5000411
585.5336453 587.5616779 591.1201632 593.2754666 595.2137506
596.1100225 597.6319668 601.5445034 602.2321999 604.4102678
605.6227598 608.3118542 611.1785779 611.2684277 613.8255832
614.5236065 616.7945753 619.0832335 623.0008059 625.1443271
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1034.8788432 1036.0895781 1038.4818044 1040.7708460 1042.2679313
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1056.6844773 1058.0610493 1059.9838371 1062.1724554 1064.2146206
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1079.6105430 1081.3876967 1083.7789874 1085.9194549 1088.1723072
1091.7644954 1094.1482982 1099.1661670 1099.5196625 1103.0011096
1107.1732451 1110.0419360 1114.6567204 1117.9228372 1121.0223069
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1143.9303416 1144.6590305 1148.2113652 1151.5040541 1155.1711282
1156.7060843 1159.9077750 1163.5312599 1166.5374425 1172.8695498
1176.0323509 1183.6405139 1185.1293237 1190.8418422 1193.6738572
1197.8754487 1199.2978266 1205.5379913 1218.4246035 1222.1516879
1228.1330365 1235.6849098 1240.6731439 1248.8099106 1253.7668974
1266.1683488 1273.7347668 1277.5918450 1288.4916602 1299.2774463
1310.5716780 1340.2252065
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2402120101302425383.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2402120101302425383.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2402120101302425383.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2402120101302425383.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 1
Last residue number = 159
Number of atoms found = 154
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.71
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 462 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.369000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.581 for 154 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.132 +/- 2.01
Bfactors> = 31.084 +/- 12.38
Bfactors> Shiftng-fct= 28.952
Bfactors> Scaling-fct= 6.147
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2402120101302425383 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
making animated gifs
11 models are in 2402120101302425383.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2402120101302425383 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
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2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
making animated gifs
11 models are in 2402120101302425383.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2402120101302425383 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2402120101302425383.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
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2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2402120101302425383 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2402120101302425383.eigenfacs
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2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
making animated gifs
11 models are in 2402120101302425383.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2402120101302425383 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2402120101302425383.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
2402120101302425383.eigenfacs
2402120101302425383.atom
making animated gifs
11 models are in 2402120101302425383.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2402120101302425383.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2402120101302425383.10.pdb
2402120101302425383.11.pdb
2402120101302425383.7.pdb
2402120101302425383.8.pdb
2402120101302425383.9.pdb
STDERR:
real 0m1.571s
user 0m1.533s
sys 0m0.012s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2402120101302425383.Chkmod.res: No such file or directory
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