*** EXP_1F0N_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912142413056.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912142413056.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912142413056.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.572866 +/- 10.352475 From: -24.828000 To: 26.188000
= -0.895022 +/- 10.183392 From: -26.297000 To: 21.219000
= -0.721429 +/- 9.493875 From: -25.562000 To: 19.375000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.0818 % Filled.
Pdbmat> 851572 non-zero elements.
Pdbmat> 93266 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.64 +/- 23.31
Maximum number = 135
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.865320E+06
Pdbmat> Larger element = 495.436
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
284 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912142413056.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912142413056.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912142413056.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2153 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 284 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 96
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 109
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 122
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 134
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 153
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 186
Blocpdb> 10 atoms in block 14
Block first atom: 206
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 216
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 228
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 242
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 273
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 289
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 301
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 320
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 334
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 350
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 370
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 388
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 404
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 419
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 431
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 451
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 522
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 537
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 563
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 576
Blocpdb> 23 atoms in block 39
Block first atom: 588
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 611
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 625
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 651
Blocpdb> 11 atoms in block 43
Block first atom: 664
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 675
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 688
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 712
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 731
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 754
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 770
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 789
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 802
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 819
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 835
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 868
Blocpdb> 12 atoms in block 57
Block first atom: 887
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 899
Blocpdb> 11 atoms in block 59
Block first atom: 915
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 926
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 937
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 950
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 962
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 976
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 985
Blocpdb> 13 atoms in block 66
Block first atom: 997
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1010
Blocpdb> 10 atoms in block 68
Block first atom: 1026
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1036
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1058
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1074
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1094
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 1114
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1123
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1137
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 12 atoms in block 79
Block first atom: 1194
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1206
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1217
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1231
Blocpdb> 13 atoms in block 83
Block first atom: 1243
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1256
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1268
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 1281
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 1289
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1310
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1320
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1336
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1354
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1367
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1381
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 1393
Blocpdb> 19 atoms in block 95
Block first atom: 1416
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1435
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1450
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1466
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1483
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1499
Blocpdb> 13 atoms in block 101
Block first atom: 1514
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1527
Blocpdb> 19 atoms in block 103
Block first atom: 1542
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 1561
Blocpdb> 18 atoms in block 105
Block first atom: 1582
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1600
Blocpdb> 11 atoms in block 107
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 108
Block first atom: 1623
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1638
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 1655
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1663
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1676
Blocpdb> 14 atoms in block 113
Block first atom: 1691
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1705
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1724
Blocpdb> 18 atoms in block 116
Block first atom: 1741
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1759
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1776
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1790
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 1807
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1827
Blocpdb> 20 atoms in block 122
Block first atom: 1840
Blocpdb> 10 atoms in block 123
Block first atom: 1860
Blocpdb> 8 atoms in block 124
Block first atom: 1870
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 1878
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 1896
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 1908
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 1927
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 1945
Blocpdb> 11 atoms in block 130
Block first atom: 1960
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1971
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 1987
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 2010
Blocpdb> 9 atoms in block 134
Block first atom: 2036
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 2045
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2062
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2075
Blocpdb> 12 atoms in block 138
Block first atom: 2092
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2104
Blocpdb> 12 atoms in block 140
Block first atom: 2121
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2133
Blocpdb> 9 atoms in block 142
Block first atom: 2144
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 851714 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6459
Prepmat> Matrix trace = 1865320.0000
Prepmat> Last element read: 6459 6459 17.8341
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8516 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2153
RTB> Total mass = 2153.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2153
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 210774.9259
RTB> 56802 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56802
Diagstd> Projected matrix trace = 210774.9259
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 210774.9259
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 5.0372159 6.4695578 9.2249818 9.4367796
10.9738216 13.2658245 13.7006654 15.7842290 16.6863361
18.7500174 19.0472192 19.8073935 20.0195656 23.1292182
24.2405800 24.6768269 25.3156468 25.5513083 26.8738445
27.4259791 28.5552432 29.2974951 31.2098475 31.6898498
32.1836860 33.3683654 34.1676296 34.6024187 35.0598466
36.8511783 37.5775614 39.3523129 39.6165089 40.9352402
41.7853720 43.8687975 44.2863945 44.6897187 45.0610124
46.2367311 47.0032309 47.2880427 48.3685409 49.4155170
50.0014364 50.6388106 51.3590880 52.8901844 54.5460236
55.4006020 55.6051752 56.8578532 57.9982273 59.4171924
59.7799043 60.9111706 62.7738380 63.0313101 63.7800009
64.6145358 65.0200550 65.8213880 66.7294723 67.2293025
67.8729454 68.9102611 69.1774512 69.6580057 70.6980113
71.4782989 72.2507532 73.2752594 73.5218343 75.2039632
75.4960221 76.3883602 76.8445470 77.6878069 78.0903921
78.8827628 79.6972659 81.3401171 82.2424170 82.4381091
83.2732854 84.2249044 84.8204085 85.2233664 86.1688635
87.0397079 87.3659419 87.7216153 88.3713798 89.8930706
91.1084948 91.2840274 93.0535058 93.1297346 93.3805487
95.5145996
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034329 0.0034339 0.0034341 0.0034343
0.0034348 243.7196608 276.2056632 329.8207992 333.5855169
359.7279878 395.5144951 401.9445184 431.4266476 443.5838985
470.2146093 473.9265843 483.2912643 485.8728194 522.2467636
534.6465680 539.4360143 546.3737099 548.9108955 562.9374998
568.6909938 580.2808145 587.7742086 606.6540530 611.3013721
616.0460416 627.2818861 634.7499944 638.7758800 642.9841775
659.2057238 665.6709071 681.2090545 683.4919138 694.7746303
701.9520011 719.2388625 722.6540522 725.9372652 728.9466638
738.3951599 744.4904582 746.7426380 755.2257229 763.3556988
767.8679139 772.7464679 778.2227670 789.7376099 802.0045428
808.2626719 809.7535994 818.8238976 826.9945357 837.0498899
839.6008858 847.5078965 860.3687376 862.1313690 867.2364855
872.8917618 875.6266010 881.0058623 887.0623071 890.3783329
894.6303517 901.4408360 903.1867521 906.3184030 913.0590783
918.0839272 923.0313879 929.5525841 931.1152659 941.7066657
943.5334796 949.0932263 951.9229725 957.1317242 959.6084906
964.4646999 969.4311973 979.3719849 984.7890542 985.9599887
990.9417583 996.5877479 1000.1046810 1002.4774747 1008.0230492
1013.1039128 1015.0007471 1017.0647213 1020.8245321 1029.5759471
1036.5129111 1037.5109206 1047.5183759 1047.9473481 1049.3575485
1061.2804399
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2153
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.51
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998
1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
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0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 0.99997
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
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1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 38754 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00004 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998
1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 1.00005 0.99999
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 0.99997
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912142413056.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912142413056.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912142413056.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912142413056.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 284
First residue number = 1
Last residue number = 284
Number of atoms found = 2153
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.037
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.225
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.51
Bfactors> 106 vectors, 6459 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.037000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.677 for 284 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.019 +/- 0.02
Bfactors> = 97.586 +/- 2.61
Bfactors> Shiftng-fct= 97.568
Bfactors> Scaling-fct= 126.714
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912142413056 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912142413056.eigenfacs
24021912142413056.atom
24021912142413056.10.pdb
24021912142413056.11.pdb
24021912142413056.12.pdb
24021912142413056.13.pdb
24021912142413056.14.pdb
24021912142413056.15.pdb
24021912142413056.16.pdb
24021912142413056.7.pdb
24021912142413056.8.pdb
24021912142413056.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m10.433s
user 0m10.385s
sys 0m0.036s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912142413056.Chkmod.res: No such file or directory
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