*** EXP_1IKQ_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912353031383.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912353031383.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912353031383.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 422
First residue number = 1
Last residue number = 422
Number of atoms found = 3235
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.238766 +/- 14.275345 From: -43.812000 To: 24.828000
= -1.195312 +/- 10.614771 From: -27.797000 To: 26.219000
= 1.463088 +/- 12.760521 From: -28.250000 To: 30.266000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4448 % Filled.
Pdbmat> 1151446 non-zero elements.
Pdbmat> 125929 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.85 +/- 23.90
Maximum number = 131
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 2.518580E+06
Pdbmat> Larger element = 485.347
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
422 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912353031383.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912353031383.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912353031383.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3235 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 422 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 29 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 64
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 79
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 103
Blocpdb> 23 atoms in block 6
Block first atom: 125
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 148
Blocpdb> 32 atoms in block 8
Block first atom: 167
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 199
Blocpdb> 26 atoms in block 10
Block first atom: 221
Blocpdb> 24 atoms in block 11
Block first atom: 247
Blocpdb> 29 atoms in block 12
Block first atom: 271
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 300
Blocpdb> 31 atoms in block 14
Block first atom: 322
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 353
Blocpdb> 19 atoms in block 16
Block first atom: 373
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 392
Blocpdb> 24 atoms in block 18
Block first atom: 416
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 440
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 464
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 486
Blocpdb> 29 atoms in block 22
Block first atom: 513
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 542
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 562
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 580
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 598
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 620
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 640
Blocpdb> 24 atoms in block 29
Block first atom: 665
Blocpdb> 29 atoms in block 30
Block first atom: 689
Blocpdb> 30 atoms in block 31
Block first atom: 718
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 748
Blocpdb> 32 atoms in block 33
Block first atom: 770
Blocpdb> 26 atoms in block 34
Block first atom: 802
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 828
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 850
Blocpdb> 26 atoms in block 37
Block first atom: 873
Blocpdb> 25 atoms in block 38
Block first atom: 899
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 924
Blocpdb> 25 atoms in block 40
Block first atom: 942
Blocpdb> 31 atoms in block 41
Block first atom: 967
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 998
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1022
Blocpdb> 21 atoms in block 44
Block first atom: 1048
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 1069
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 1087
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 1101
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 1121
Blocpdb> 28 atoms in block 49
Block first atom: 1139
Blocpdb> 25 atoms in block 50
Block first atom: 1167
Blocpdb> 25 atoms in block 51
Block first atom: 1192
Blocpdb> 21 atoms in block 52
Block first atom: 1217
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 1238
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 1258
Blocpdb> 26 atoms in block 55
Block first atom: 1277
Blocpdb> 29 atoms in block 56
Block first atom: 1303
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 1332
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 1352
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 1372
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 1390
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1408
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1428
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1449
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 1469
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1486
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 1505
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1521
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1540
Blocpdb> 25 atoms in block 69
Block first atom: 1557
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 1582
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1613
Blocpdb> 25 atoms in block 72
Block first atom: 1631
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1656
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1676
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 1692
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 1716
Blocpdb> 20 atoms in block 77
Block first atom: 1740
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 1760
Blocpdb> 27 atoms in block 79
Block first atom: 1789
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1816
Blocpdb> 26 atoms in block 81
Block first atom: 1841
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 1867
Blocpdb> 24 atoms in block 83
Block first atom: 1893
Blocpdb> 30 atoms in block 84
Block first atom: 1917
Blocpdb> 23 atoms in block 85
Block first atom: 1947
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1970
Blocpdb> 28 atoms in block 87
Block first atom: 1991
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 2019
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 2038
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 2059
Blocpdb> 23 atoms in block 91
Block first atom: 2078
Blocpdb> 26 atoms in block 92
Block first atom: 2101
Blocpdb> 24 atoms in block 93
Block first atom: 2127
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2151
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2178
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2204
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 2229
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 2248
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 2266
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2294
Blocpdb> 25 atoms in block 101
Block first atom: 2316
Blocpdb> 24 atoms in block 102
Block first atom: 2341
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2365
Blocpdb> 23 atoms in block 104
Block first atom: 2388
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 2411
Blocpdb> 30 atoms in block 106
Block first atom: 2432
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 2462
Blocpdb> 20 atoms in block 108
Block first atom: 2487
Blocpdb> 22 atoms in block 109
Block first atom: 2507
Blocpdb> 30 atoms in block 110
Block first atom: 2529
Blocpdb> 21 atoms in block 111
Block first atom: 2559
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 2580
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 2598
Blocpdb> 18 atoms in block 114
Block first atom: 2619
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 2637
Blocpdb> 20 atoms in block 116
Block first atom: 2664
Blocpdb> 25 atoms in block 117
Block first atom: 2684
Blocpdb> 26 atoms in block 118
Block first atom: 2709
Blocpdb> 21 atoms in block 119
Block first atom: 2735
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 2756
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 2775
Blocpdb> 17 atoms in block 122
Block first atom: 2800
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 2817
Blocpdb> 23 atoms in block 124
Block first atom: 2845
Blocpdb> 25 atoms in block 125
Block first atom: 2868
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2893
Blocpdb> 25 atoms in block 127
Block first atom: 2915
Blocpdb> 22 atoms in block 128
Block first atom: 2940
Blocpdb> 19 atoms in block 129
Block first atom: 2962
Blocpdb> 22 atoms in block 130
Block first atom: 2981
Blocpdb> 26 atoms in block 131
Block first atom: 3003
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 3029
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3044
Blocpdb> 19 atoms in block 134
Block first atom: 3068
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 3087
Blocpdb> 27 atoms in block 136
Block first atom: 3110
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 3137
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 3156
Blocpdb> 25 atoms in block 139
Block first atom: 3176
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 3201
Blocpdb> 13 atoms in block 141
Block first atom: 3222
Blocpdb> 141 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1151587 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9705
Prepmat> Matrix trace = 2518580.0000
Prepmat> Last element read: 9705 9705 61.6191
Prepmat> 10012 lines saved.
Prepmat> 8656 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3235
RTB> Total mass = 3235.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3235
RTB> Number of blocks = 141
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 170602.5239
RTB> 46665 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 846
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46665
Diagstd> Projected matrix trace = 170602.5239
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 846 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 170602.5239
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.1255748 1.4574696 1.6998546 1.7592020
2.8372769 3.7620509 4.2263457 4.7013696 5.4476745
5.5339564 5.9847070 6.6085582 7.4809123 7.7655819
8.1348436 8.9119531 9.0745311 9.7579730 10.1584145
11.1002008 11.1989472 11.5376958 11.9380745 12.7802174
13.1260040 14.4869902 14.8976601 15.4096124 16.2344604
16.8189020 17.1582525 17.3785794 17.5995788 18.7687568
19.0150949 19.9255704 20.2598031 20.7340677 21.3618103
22.1259792 23.3776848 23.5512788 23.8335192 24.5734398
25.6986372 25.7607210 25.9109467 26.5247569 27.3980227
28.0759608 28.5930975 28.8743468 29.4785191 30.0563751
30.4998666 30.9332339 31.3840449 31.7258854 32.3777920
32.5895033 33.5373275 33.6375721 34.1535595 34.7476859
35.0963580 35.4347712 36.8994197 37.0887911 37.6254889
38.2614360 39.4393934 40.0249254 40.5606577 41.1793687
41.4210194 41.8897720 42.4828530 42.8453035 43.3185088
43.7373313 45.0099209 45.1633167 45.6251262 46.0434915
46.2187469 46.7095305 47.1079994 47.5016462 48.7672198
48.9354931 49.9268062 50.6874382 51.4049763 52.1392762
52.3475287 52.5861131 52.8312668 53.2355715 53.9130773
54.3610182
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034329 0.0034337 0.0034339 0.0034341
0.0034349 115.2079530 131.0976879 141.5797603 144.0300570
182.9136618 210.6238829 223.2429693 235.4547605 253.4549954
255.4542589 265.6542243 279.1570753 297.0110193 302.6093082
309.7204518 324.1766467 327.1202108 339.2150299 346.1052956
361.7934489 363.3991257 368.8542766 375.1996478 388.2079279
393.4246310 413.3180422 419.1353688 426.2762510 437.5364203
445.3424559 449.8127983 452.6915804 455.5608734 470.4495247
473.5267618 484.7308511 488.7793958 494.4672552 501.8966623
510.7948739 525.0443988 526.9901851 530.1385275 538.3048059
550.4911320 551.1556798 552.7603974 559.2693078 568.4010755
575.3903770 580.6653125 583.5141125 589.5872882 595.3379685
599.7140865 603.9596755 608.3447140 611.6488391 617.9009953
619.9178628 628.8680141 629.8071708 634.6192865 640.1153239
643.3188927 646.4130221 659.6370614 661.3275559 666.0952799
671.7008732 681.9623423 687.0060248 691.5885181 696.8432899
698.8849236 702.8283618 707.7862437 710.7991373 714.7135725
718.1603445 728.5332964 729.7736770 733.4952736 736.8505374
738.2515437 742.1608331 745.3197172 748.4272828 758.3318190
759.6390196 767.2946546 773.1174062 778.5703522 784.1114203
785.6757925 787.4641947 789.2976186 792.3120130 797.3377769
800.6432963
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3235
Rtb_to_modes> Number of blocs = 141
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 846 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
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0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
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0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 58230 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
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1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002
1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000
0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912353031383.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912353031383.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912353031383.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912353031383.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 422
First residue number = 1
Last residue number = 422
Number of atoms found = 3235
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.759
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.837
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.226
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.701
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.448
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.534
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.481
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.135
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.912
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.758
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36
Bfactors> 106 vectors, 9705 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.126000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.529 for 422 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.032 +/- 0.04
Bfactors> = 84.080 +/- 17.89
Bfactors> Shiftng-fct= 84.048
Bfactors> Scaling-fct= 425.337
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912353031383 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912353031383.eigenfacs
24021912353031383.atom
24021912353031383.10.pdb
24021912353031383.11.pdb
24021912353031383.12.pdb
24021912353031383.13.pdb
24021912353031383.14.pdb
24021912353031383.15.pdb
24021912353031383.16.pdb
24021912353031383.7.pdb
24021912353031383.8.pdb
24021912353031383.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.353s
user 0m12.297s
sys 0m0.056s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912353031383.Chkmod.res: No such file or directory
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