*** EXP_1AOL_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_2_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912362632576.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912362632576.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912362632576.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.066444 +/- 11.189238 From: -30.031000 To: 28.125000
= -1.209875 +/- 6.829028 From: -19.031000 To: 17.516000
= 0.718545 +/- 12.899109 From: -23.938000 To: 43.469000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6010 % Filled.
Pdbmat> 660552 non-zero elements.
Pdbmat> 72274 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.93 +/- 24.82
Maximum number = 134
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 1.445480E+06
Pdbmat> Larger element = 496.469
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
228 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912362632576.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912362632576.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912362632576.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1786 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 228 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 75
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 89
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 101
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 120
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 136
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 157
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 170
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 180
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 198
Blocpdb> 21 atoms in block 14
Block first atom: 213
Blocpdb> 28 atoms in block 15
Block first atom: 234
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 262
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 276
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 306
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 320
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 336
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 349
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 359
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 373
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 397
Blocpdb> 21 atoms in block 26
Block first atom: 409
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 19 atoms in block 28
Block first atom: 444
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 463
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 11 atoms in block 31
Block first atom: 489
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 500
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 513
Blocpdb> 10 atoms in block 34
Block first atom: 525
Blocpdb> 10 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 545
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 557
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 566
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 578
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 597
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 627
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 642
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 656
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 670
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 687
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 702
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 721
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 740
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 757
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 773
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 789
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 806
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 821
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 836
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 851
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 870
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 883
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 893
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 914
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 932
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 946
Blocpdb> 10 atoms in block 63
Block first atom: 961
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 971
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 982
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 996
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 1019
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1030
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 1050
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1060
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 1076
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1087
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1105
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1131
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1147
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1159
Blocpdb> 20 atoms in block 77
Block first atom: 1179
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1199
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1214
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1229
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1245
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1260
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1287
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1303
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1316
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1333
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1350
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1370
Blocpdb> 13 atoms in block 90
Block first atom: 1385
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1398
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1415
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1433
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1446
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1459
Blocpdb> 13 atoms in block 96
Block first atom: 1475
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 1488
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 1509
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 1520
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 1542
Blocpdb> 19 atoms in block 101
Block first atom: 1560
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 1579
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1599
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1627
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1642
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1654
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1672
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1684
Blocpdb> 23 atoms in block 110
Block first atom: 1703
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1726
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1743
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1755
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1772
Blocpdb> 114 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 660666 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5358
Prepmat> Matrix trace = 1445480.0000
Prepmat> Last element read: 5358 5358 119.0302
Prepmat> 6556 lines saved.
Prepmat> 5360 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1786
RTB> Total mass = 1786.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1786
RTB> Number of blocks = 114
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 154988.8899
RTB> 41310 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 684
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41310
Diagstd> Projected matrix trace = 154988.8899
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 684 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 154988.8899
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6791670 1.7818109 2.8808955 3.6970618
3.9170088 4.7111810 6.1077886 6.7709180 8.5523183
9.9958041 10.6559410 12.1132193 13.0050737 13.2898600
15.0020642 16.7061911 18.2180499 18.7402535 20.6841052
20.7816433 22.1162100 22.5164019 23.0892442 25.3257501
25.6001687 27.8459460 28.2610563 28.7719214 29.8828798
30.9870044 32.0365179 33.4517897 33.8196832 34.6245263
36.1413620 37.5012877 38.1719550 39.2889021 39.8421411
40.5719621 40.9169034 42.4531447 43.9906362 44.3129518
44.9433726 45.4639364 46.1512250 46.5700262 47.1836386
49.9851514 50.6233320 51.7185233 52.1504407 52.5431259
54.1904547 55.1484845 56.0327246 57.0676352 57.6179253
58.5650171 59.4922973 61.1280639 61.6635586 62.3794536
62.8852206 63.8360522 64.4477532 65.2842941 67.6338131
68.6130152 68.8710597 69.3572549 70.5887896 71.4065746
72.3651564 73.1720875 73.4520552 73.7074421 74.9104035
75.5673459 76.2714847 77.2100864 77.9292328 78.7302747
79.5420151 80.8818404 81.3344433 82.0704960 82.5808417
83.5003264 84.8945602 85.3860468 85.7662979 86.0655762
87.4371260 87.9800642 88.4577821 89.4695146 90.3628403
91.1205000
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034334 0.0034338 0.0034340 0.0034344
0.0034351 89.4918699 144.9526241 184.3143013 208.7967036
214.9178834 235.7003220 268.3720464 282.5654502 317.5683467
343.3239871 354.4795493 377.9419245 391.6081203 395.8726364
420.6014740 443.8477293 463.4962497 470.0921630 493.8711414
495.0342225 510.6820970 515.2817684 521.7952711 546.4827265
549.4354710 573.0285610 577.2839396 582.4782490 593.6172387
604.4843720 614.6359137 628.0655310 631.5097318 638.9799048
652.8261430 664.9949857 670.9149697 680.6599955 685.4355334
691.6848854 694.6190020 707.5387226 720.2369559 722.8706975
727.9945194 732.1984383 737.7120833 741.0517227 745.9178405
767.7428603 772.6283572 780.9412051 784.1953664 787.1422671
799.3862573 806.4214507 812.8607446 820.3330676 824.2787208
831.0256285 837.5787491 849.0154640 852.7261319 857.6617925
861.1316958 867.6174751 871.7644823 877.4040538 893.0529651
899.4945424 901.1843951 904.3597565 912.3535111 917.6231902
923.7618719 928.8979463 930.6733035 932.2898375 939.8668857
943.9790691 948.3668838 954.1843723 958.6177817 963.5320465
968.4865077 976.6091582 979.3378271 983.7592054 986.8131607
992.2917188 1000.5417414 1003.4338186 1005.6656407 1007.4187287
1015.4141650 1018.5618777 1021.3234496 1027.1475174 1032.2626574
1036.5811987
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1786
Rtb_to_modes> Number of blocs = 114
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6792
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.782
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.697
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.711
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.771
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.552
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.12
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 684 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 0.99997 0.99996 0.99996 1.00002
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1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
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0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 32148 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
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0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
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1.00003 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996
1.00003 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 0.99997 0.99996 0.99996 1.00002
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912362632576.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912362632576.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912362632576.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912362632576.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.697
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.917
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.711
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.771
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.12
Bfactors> 106 vectors, 5358 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.679200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.532 for 228 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.047 +/- 0.19
Bfactors> = 91.890 +/- 7.32
Bfactors> Shiftng-fct= 91.843
Bfactors> Scaling-fct= 38.108
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912362632576 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912362632576.eigenfacs
24021912362632576.atom
24021912362632576.10.pdb
24021912362632576.11.pdb
24021912362632576.12.pdb
24021912362632576.13.pdb
24021912362632576.14.pdb
24021912362632576.15.pdb
24021912362632576.16.pdb
24021912362632576.7.pdb
24021912362632576.8.pdb
24021912362632576.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m6.079s
user 0m6.027s
sys 0m0.052s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912362632576.Chkmod.res: No such file or directory
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