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***  EXP_4L79_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000  ***

LOGs for ID: 24021912371233467

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 24021912371233467.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 24021912371233467.atom to be opened. Openam> File opened: 24021912371233467.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 147 First residue number = 1 Last residue number = 147 Number of atoms found = 1160 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.583744 +/- 12.990050 From: -25.828000 To: 25.625000 = 0.482961 +/- 7.500551 From: -17.391000 To: 22.281000 = 1.332316 +/- 12.422638 From: -22.844000 To: 31.469000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.1855 % Filled. Pdbmat> 374654 non-zero elements. Pdbmat> 40906 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 70.53 +/- 21.54 Maximum number = 124 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 818120. Pdbmat> Larger element = 493.725 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 147 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 24021912371233467.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 24021912371233467.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 24021912371233467.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1160 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 147 residues. Blocpdb> 8 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 9 atoms in block 2 Block first atom: 9 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 18 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 26 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 33 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 42 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 51 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 60 Blocpdb> 5 atoms in block 9 Block first atom: 68 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 73 Blocpdb> 11 atoms in block 11 Block first atom: 82 Blocpdb> 9 atoms in block 12 Block first atom: 93 Blocpdb> 9 atoms in block 13 Block first atom: 102 Blocpdb> 5 atoms in block 14 Block first atom: 111 Blocpdb> 11 atoms in block 15 Block first atom: 116 Blocpdb> 6 atoms in block 16 Block first atom: 127 Blocpdb> 8 atoms in block 17 Block first atom: 133 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 141 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 152 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 160 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 169 Blocpdb> 4 atoms in block 22 Block first atom: 177 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 181 Blocpdb> 4 atoms in block 24 Block first atom: 189 Blocpdb> 7 atoms in block 25 Block first atom: 193 Blocpdb> 8 atoms in block 26 Block first atom: 200 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 208 Blocpdb> 7 atoms in block 28 Block first atom: 215 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 222 Blocpdb> 9 atoms in block 30 Block first atom: 231 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 240 Blocpdb> 4 atoms in block 32 Block first atom: 248 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 252 Blocpdb> 7 atoms in block 34 Block first atom: 259 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 266 Blocpdb> 11 atoms in block 36 Block first atom: 274 Blocpdb> 6 atoms in block 37 Block first atom: 285 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 291 Blocpdb> 4 atoms in block 39 Block first atom: 299 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 303 Blocpdb> 8 atoms in block 41 Block first atom: 312 Blocpdb> 7 atoms in block 42 Block first atom: 320 Blocpdb> 7 atoms in block 43 Block first atom: 327 Blocpdb> 9 atoms in block 44 Block first atom: 334 Blocpdb> 5 atoms in block 45 Block first atom: 343 Blocpdb> 9 atoms in block 46 Block first atom: 348 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 357 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 365 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 374 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 382 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 390 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 398 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 406 Blocpdb> 7 atoms in block 54 Block first atom: 415 Blocpdb> 8 atoms in block 55 Block first atom: 422 Blocpdb> 5 atoms in block 56 Block first atom: 430 Blocpdb> 8 atoms in block 57 Block first atom: 435 Blocpdb> 4 atoms in block 58 Block first atom: 443 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 447 Blocpdb> 4 atoms in block 60 Block first atom: 455 Blocpdb> 7 atoms in block 61 Block first atom: 459 Blocpdb> 8 atoms in block 62 Block first atom: 466 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 474 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 482 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 493 Blocpdb> 9 atoms in block 66 Block first atom: 500 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 509 Blocpdb> 8 atoms in block 68 Block first atom: 520 Blocpdb> 7 atoms in block 69 Block first atom: 528 Blocpdb> 8 atoms in block 70 Block first atom: 535 Blocpdb> 8 atoms in block 71 Block first atom: 543 Blocpdb> 5 atoms in block 72 Block first atom: 551 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 556 Blocpdb> 9 atoms in block 74 Block first atom: 567 Blocpdb> 8 atoms in block 75 Block first atom: 576 Blocpdb> 9 atoms in block 76 Block first atom: 584 Blocpdb> 8 atoms in block 77 Block first atom: 593 Blocpdb> 7 atoms in block 78 Block first atom: 601 Blocpdb> 8 atoms in block 79 Block first atom: 608 Blocpdb> 6 atoms in block 80 Block first atom: 616 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 622 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 631 Blocpdb> 9 atoms in block 83 Block first atom: 640 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 649 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 657 Blocpdb> 9 atoms in block 86 Block first atom: 668 Blocpdb> 5 atoms in block 87 Block first atom: 677 Blocpdb> 11 atoms in block 88 Block first atom: 682 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 693 Blocpdb> 7 atoms in block 90 Block first atom: 704 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 711 Blocpdb> 8 atoms in block 92 Block first atom: 722 Blocpdb> 9 atoms in block 93 Block first atom: 730 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 739 Blocpdb> 4 atoms in block 95 Block first atom: 747 Blocpdb> 8 atoms in block 96 Block first atom: 751 Blocpdb> 4 atoms in block 97 Block first atom: 759 Blocpdb> 12 atoms in block 98 Block first atom: 763 Blocpdb> 8 atoms in block 99 Block first atom: 775 Blocpdb> 6 atoms in block 100 Block first atom: 783 Blocpdb> 5 atoms in block 101 Block first atom: 789 Blocpdb> 5 atoms in block 102 Block first atom: 794 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 799 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 808 Blocpdb> 11 atoms in block 105 Block first atom: 816 Blocpdb> 10 atoms in block 106 Block first atom: 827 Blocpdb> 7 atoms in block 107 Block first atom: 837 Blocpdb> 8 atoms in block 108 Block first atom: 844 Blocpdb> 7 atoms in block 109 Block first atom: 852 Blocpdb> 8 atoms in block 110 Block first atom: 859 Blocpdb> 8 atoms in block 111 Block first atom: 867 Blocpdb> 4 atoms in block 112 Block first atom: 875 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 879 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 888 Blocpdb> 8 atoms in block 115 Block first atom: 897 Blocpdb> 7 atoms in block 116 Block first atom: 905 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 912 Blocpdb> 9 atoms in block 118 Block first atom: 920 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 929 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 938 Blocpdb> 8 atoms in block 121 Block first atom: 945 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 953 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 962 Blocpdb> 8 atoms in block 124 Block first atom: 970 Blocpdb> 11 atoms in block 125 Block first atom: 978 Blocpdb> 9 atoms in block 126 Block first atom: 989 Blocpdb> 5 atoms in block 127 Block first atom: 998 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1003 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1011 Blocpdb> 8 atoms in block 130 Block first atom: 1019 Blocpdb> 4 atoms in block 131 Block first atom: 1027 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1031 Blocpdb> 4 atoms in block 133 Block first atom: 1039 Blocpdb> 9 atoms in block 134 Block first atom: 1043 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1052 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1059 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 1067 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 1079 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1088 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 1097 Blocpdb> 7 atoms in block 141 Block first atom: 1108 Blocpdb> 9 atoms in block 142 Block first atom: 1115 Blocpdb> 8 atoms in block 143 Block first atom: 1124 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1132 Blocpdb> 7 atoms in block 145 Block first atom: 1140 Blocpdb> 5 atoms in block 146 Block first atom: 1147 Blocpdb> 9 atoms in block 147 Block first atom: 1151 Blocpdb> 147 blocks. Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 374801 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3480 Prepmat> Matrix trace = 818120.0000 Prepmat> Last element read: 3480 3480 113.6619 Prepmat> 10879 lines saved. Prepmat> 9347 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1160 RTB> Total mass = 1160.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1160 RTB> Number of blocks = 147 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 183721.8144 RTB> 52911 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 882 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52911 Diagstd> Projected matrix trace = 183721.8144 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 882 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 183721.8144 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0503747 0.0765852 0.1414571 0.7207147 1.2234253 2.4108786 2.9455176 3.6738062 3.7587688 4.3069580 5.1545775 6.0939787 6.7993158 7.1038793 8.2555673 10.1320524 10.8161788 12.4090359 12.4711439 13.4287819 14.8367101 15.6267886 16.3946574 16.6043649 19.0902580 19.6289336 20.3659587 20.8936980 20.9410433 22.0595832 22.8795218 23.6437976 23.9365808 24.9275234 25.1335962 25.6278730 26.0563863 27.1310300 28.1549073 28.3554264 29.7357520 30.7377229 31.5346597 31.8494827 32.4623052 33.2331741 34.5906928 35.3143979 36.2445172 36.4771622 37.0260397 37.8367821 38.1789409 38.6453640 39.1813885 40.5372878 41.1457918 41.7121565 42.4058382 43.0192197 43.4908116 44.3935348 44.9614669 45.2089178 46.5284635 47.2372059 47.4438492 49.2474358 49.2946607 49.9783856 50.7393435 50.9865797 51.4312016 52.0137560 52.8717255 53.7725792 54.7876202 55.6926909 57.2830651 58.3635137 59.2301746 59.8548960 61.0264197 61.4183775 62.2089642 62.7627389 63.8778637 64.0133447 64.5001948 66.1455470 66.3797360 66.5781326 67.5502827 68.5943878 69.9083394 70.1367870 71.1637589 71.9460441 72.7559786 73.5961481 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034327 0.0034331 0.0034335 0.0034343 0.0034349 24.3725900 30.0516124 40.8420556 92.1885441 120.1113387 168.6098542 186.3700380 208.1389699 210.5319868 225.3619546 246.5425134 268.0684769 283.1573801 289.4296824 312.0101643 345.6559162 357.1348322 382.5289430 383.4850386 397.9363306 418.2770981 429.2696153 439.6898634 442.4930101 474.4617199 481.1091689 490.0582559 496.3670416 496.9291092 510.0278972 519.4201001 528.0242841 531.2835105 542.1692053 544.4056169 549.7326885 554.3095651 565.6247710 576.1987755 578.2469775 592.1541040 602.0480111 609.8027162 612.8391074 618.7068988 626.0098863 638.6676380 645.3141431 653.7571319 655.8519320 660.7678612 667.9629547 670.9763589 675.0624966 679.7280487 691.3892527 696.5591352 701.3367587 707.1443993 712.2403022 716.1335763 723.5276688 728.1410509 730.1420083 740.7209634 746.3411390 747.9718249 762.0563591 762.4216514 767.6908988 773.5131519 775.3953994 778.7689285 783.1670156 789.5997867 796.2981636 803.7787099 810.3905752 821.8799853 829.5947509 835.7315288 840.1273448 848.3092959 851.0291771 856.4889521 860.2926730 867.9015663 868.8214609 872.1190907 883.1725993 884.7346586 886.0558251 892.5013171 899.3724344 907.9454850 909.4277741 916.0616876 921.0829433 926.2529911 931.5857200 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1160 Rtb_to_modes> Number of blocs = 147 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0375E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6585E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.759 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.799 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 0.99999 0.99996 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99997 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 24021912371233467.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 24021912371233467.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 24021912371233467.atom Openam> file on opening on unit 11: 24021912371233467.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 147 First residue number = 1 Last residue number = 147 Number of atoms found = 1160 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0375E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6585E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1415 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.799 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.60 Bfactors> 106 vectors, 3480 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.050375 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.168 for 147 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.591 +/- 0.39 Bfactors> = 84.057 +/- 9.29 Bfactors> Shiftng-fct= 83.465 Bfactors> Scaling-fct= 23.565 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912371233467 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912371233467.eigenfacs 24021912371233467.atom 24021912371233467.10.pdb 24021912371233467.11.pdb 24021912371233467.12.pdb 24021912371233467.13.pdb 24021912371233467.14.pdb 24021912371233467.15.pdb 24021912371233467.16.pdb 24021912371233467.7.pdb 24021912371233467.8.pdb 24021912371233467.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m9.669s user 0m9.645s sys 0m0.024s ../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory cat: 24021912371233467.Chkmod.res: No such file or directory




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