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***  EXP_1IZN_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_5_seed_000  ***

LOGs for ID: 24021912391537046

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 24021912391537046.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 24021912391537046.atom to be opened. Openam> File opened: 24021912391537046.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 270 First residue number = 1 Last residue number = 270 Number of atoms found = 2140 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -4.816421 +/- 16.545500 From: -46.750000 To: 23.125000 = -1.694107 +/- 10.272788 From: -28.109000 To: 21.016000 = 4.752385 +/- 16.758618 From: -21.547000 To: 58.938000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.4639 % Filled. Pdbmat> 713963 non-zero elements. Pdbmat> 78007 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 72.90 +/- 23.23 Maximum number = 126 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.560140E+06 Pdbmat> Larger element = 484.616 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 270 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 24021912391537046.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 24021912391537046.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 24021912391537046.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2140 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 270 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 33 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 49 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 76 Blocpdb> 22 atoms in block 7 Block first atom: 92 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 114 Blocpdb> 16 atoms in block 9 Block first atom: 129 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 145 Blocpdb> 18 atoms in block 11 Block first atom: 162 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 180 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 196 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 210 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 226 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 242 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 256 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 270 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 285 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 301 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 315 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 328 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 345 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 360 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 377 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 393 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 410 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 424 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 437 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 457 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 473 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 507 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 526 Blocpdb> 18 atoms in block 35 Block first atom: 538 Blocpdb> 17 atoms in block 36 Block first atom: 556 Blocpdb> 21 atoms in block 37 Block first atom: 573 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 594 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 608 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 629 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 644 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 659 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 676 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 685 Blocpdb> 11 atoms in block 45 Block first atom: 700 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 20 atoms in block 47 Block first atom: 730 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 750 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 767 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 783 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 796 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 809 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 828 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 849 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 868 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 888 Blocpdb> 8 atoms in block 57 Block first atom: 908 Blocpdb> 13 atoms in block 58 Block first atom: 916 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 942 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 962 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 984 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 1000 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 1014 Blocpdb> 11 atoms in block 65 Block first atom: 1030 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1041 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1057 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1074 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1088 Blocpdb> 10 atoms in block 70 Block first atom: 1100 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1110 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1128 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1145 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1155 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1177 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1191 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1208 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1224 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1240 Blocpdb> 12 atoms in block 80 Block first atom: 1258 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1270 Blocpdb> 12 atoms in block 82 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1297 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1319 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1336 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1349 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1363 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1379 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1401 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1417 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 1434 Blocpdb> 10 atoms in block 92 Block first atom: 1445 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1455 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1470 Blocpdb> 8 atoms in block 95 Block first atom: 1486 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1494 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 1508 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1526 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1543 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1561 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1578 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1592 Blocpdb> 12 atoms in block 103 Block first atom: 1606 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1618 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1635 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1648 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1664 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1679 Blocpdb> 17 atoms in block 109 Block first atom: 1694 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1711 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 1728 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1745 Blocpdb> 13 atoms in block 113 Block first atom: 1764 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1777 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1793 Blocpdb> 23 atoms in block 116 Block first atom: 1810 Blocpdb> 13 atoms in block 117 Block first atom: 1833 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1846 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1862 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1878 Blocpdb> 12 atoms in block 121 Block first atom: 1893 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 1905 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1922 Blocpdb> 13 atoms in block 124 Block first atom: 1938 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1951 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1966 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 1983 Blocpdb> 18 atoms in block 128 Block first atom: 2004 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 2022 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 2039 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 2059 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2073 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2089 Blocpdb> 20 atoms in block 134 Block first atom: 2104 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2123 Blocpdb> 135 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 714098 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6420 Prepmat> Matrix trace = 1560140.0000 Prepmat> Last element read: 6420 6420 166.4087 Prepmat> 9181 lines saved. Prepmat> 7979 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2140 RTB> Total mass = 2140.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2140 RTB> Number of blocks = 135 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 160285.1061 RTB> 41211 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 810 Diagstd> Nb of non-zero elements: 41211 Diagstd> Projected matrix trace = 160285.1061 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 810 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 160285.1061 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0071617 0.0110409 0.0627001 0.1094585 0.4021844 0.8973329 1.1637973 1.3944549 1.4804878 1.8117104 2.1261654 2.2946539 2.7370244 2.9022290 3.3551274 3.6842227 4.5238109 5.0620429 5.3228075 5.4797264 6.1240759 6.3087185 7.2415983 8.0141416 8.5076763 8.6723671 9.1382017 10.0688600 10.2778148 10.9013598 11.6579282 11.9548104 12.7550671 14.0841783 14.4032574 15.0283703 15.4863184 15.9187679 16.2872274 16.4247632 17.7478888 18.5602989 18.8171766 19.4952317 19.8008836 20.5776889 21.2010582 21.4231488 22.2867845 22.4138636 23.3282264 23.5968547 23.6196979 24.8448035 25.2015896 25.3516397 25.9782209 26.8150505 27.0907136 27.7568372 28.3034375 28.8595450 29.1038727 29.6128544 30.6854028 31.3900841 31.8369840 33.2200432 34.2478501 34.7484950 36.1427952 36.9155611 37.5193084 38.6544528 38.8849199 39.0503080 39.3888798 40.0813193 40.2566983 40.9870131 41.7463165 42.0625610 42.6393097 42.8157858 43.0509357 44.6113294 45.2551023 45.6313429 46.9009813 47.0268756 47.6071244 49.0807481 49.5825079 50.3744275 52.5846130 53.4015311 53.7196937 54.1659617 54.2668417 55.3939917 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034331 0.0034335 0.0034338 0.0034339 0.0034341 9.1897190 11.4103157 27.1912670 35.9269198 68.8664844 102.8660557 117.1477515 128.2323245 132.1288611 146.1637455 158.3411519 164.4954433 179.6530592 184.9954803 198.9068731 208.4338347 230.9657071 244.3195337 250.5334166 254.1995159 268.7296353 272.7506882 292.2217228 307.4141024 316.7384293 319.7894313 328.2658083 344.5763217 348.1333863 358.5383521 370.7711795 375.4625511 387.8257621 407.5313630 412.1218512 420.9700749 427.3358938 433.2614073 438.2469069 440.0933835 457.4763317 467.8296713 471.0559682 479.4678377 483.2118382 492.5990599 500.0046576 502.6167209 512.6476695 514.1071488 524.4887068 527.4998483 527.7551129 541.2688860 545.1415041 546.7619797 553.4775161 562.3213723 565.2043594 572.1109627 577.7166343 583.3645311 585.8287366 590.9291531 601.5354053 608.4032427 612.7188482 625.8862013 635.4947065 640.1227758 652.8390872 659.7813226 665.1547431 675.1418747 677.1515624 678.5900882 681.5254771 687.4898402 688.9922819 695.2138501 701.6238785 704.2764006 709.0883703 710.5542474 712.5028042 725.3003097 730.5148614 733.5452435 743.6802445 744.6776908 749.2577695 760.7656010 764.6444230 770.7265890 787.4529629 793.5460514 795.9064862 799.2055835 799.9494675 808.2144506 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2140 Rtb_to_modes> Number of blocs = 135 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1617E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1041E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2700E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.014 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 24021912391537046.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 24021912391537046.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 24021912391537046.atom Openam> file on opening on unit 11: 24021912391537046.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 270 First residue number = 1 Last residue number = 270 Number of atoms found = 2140 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1617E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1041E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2700E-02 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.014 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.39 Bfactors> 106 vectors, 6420 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.007162 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.442 for 270 C-alpha atoms. Bfactors> = 1.835 +/- 4.65 Bfactors> = 89.243 +/- 8.78 Bfactors> Shiftng-fct= 87.409 Bfactors> Scaling-fct= 1.887 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912391537046 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912391537046.eigenfacs 24021912391537046.atom 24021912391537046.10.pdb 24021912391537046.11.pdb 24021912391537046.12.pdb 24021912391537046.13.pdb 24021912391537046.14.pdb 24021912391537046.15.pdb 24021912391537046.16.pdb 24021912391537046.7.pdb 24021912391537046.8.pdb 24021912391537046.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m9.137s user 0m9.089s sys 0m0.048s ../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory cat: 24021912391537046.Chkmod.res: No such file or directory




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