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***  EXP_1DQZ_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000  ***

LOGs for ID: 24021912402138273

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 24021912402138273.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 24021912402138273.atom to be opened. Openam> File opened: 24021912402138273.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2180 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.360748 +/- 9.520353 From: -26.422000 To: 23.109000 = -0.546793 +/- 10.213864 From: -26.312000 To: 21.906000 = -1.373243 +/- 10.428148 From: -25.906000 To: 23.391000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.0403 % Filled. Pdbmat> 864188 non-zero elements. Pdbmat> 94657 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.84 +/- 23.69 Maximum number = 138 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 1.893140E+06 Pdbmat> Larger element = 504.670 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 280 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 24021912402138273.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 24021912402138273.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 24021912402138273.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2180 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 280 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 45 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 83 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 97 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 108 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 122 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 137 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 153 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 169 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 189 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 202 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 210 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 227 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 239 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 259 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 275 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 287 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 303 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 320 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 340 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 352 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 374 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 390 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 404 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 420 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 462 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 477 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 489 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 502 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 532 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 540 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 555 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 572 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 591 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 613 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 634 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 647 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 662 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 691 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 710 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 731 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 754 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 772 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 787 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 807 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 822 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 871 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 884 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 897 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 911 Blocpdb> 10 atoms in block 59 Block first atom: 923 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 933 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 944 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 958 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 972 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 980 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 991 Blocpdb> 13 atoms in block 66 Block first atom: 1007 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1020 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1037 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1056 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1074 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1092 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1109 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1120 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1134 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1149 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1165 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1178 Blocpdb> 28 atoms in block 78 Block first atom: 1193 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1221 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1235 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1251 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1263 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1276 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1292 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1302 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1318 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1331 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1345 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 1367 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1378 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1390 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 1405 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1424 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1444 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1460 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1475 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1491 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1506 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1525 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1537 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1553 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1571 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1593 Blocpdb> 10 atoms in block 104 Block first atom: 1612 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1622 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1634 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1648 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1662 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1674 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1686 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1702 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 1714 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1734 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 1751 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1763 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1778 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1796 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1813 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1831 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1850 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 1869 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1879 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1891 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1906 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1918 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1936 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 1955 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 1969 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1981 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 1998 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2018 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2037 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2059 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2077 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 2092 Blocpdb> 14 atoms in block 136 Block first atom: 2105 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2119 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2135 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2154 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 2168 Blocpdb> 140 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 864328 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6540 Prepmat> Matrix trace = 1893140.0000 Prepmat> Last element read: 6540 6540 177.9265 Prepmat> 9871 lines saved. Prepmat> 8226 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2180 RTB> Total mass = 2180.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2180 RTB> Number of blocks = 140 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 209515.1786 RTB> 57084 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 840 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57084 Diagstd> Projected matrix trace = 209515.1786 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 840 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 209515.1786 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.0791411 6.1356569 7.9748559 9.1352356 11.3308563 11.5422125 12.8703968 14.6371073 15.9129887 17.7448282 18.5908806 19.1560301 19.4759347 21.0912911 22.4332102 23.8711820 24.0467809 24.9520450 25.5123409 26.7382229 27.4264899 28.3802354 28.8108355 31.2054545 31.4099715 33.1003154 33.4712295 34.9717164 35.6978800 36.3406371 37.6273854 37.7984507 38.1824370 39.4593488 40.7017596 41.3507288 41.8406211 43.3036694 43.8355423 44.2474790 46.3997446 47.4372296 48.6303765 48.8656844 49.3903403 50.3743724 52.2805255 52.9722246 54.1630539 54.3867243 55.7550826 56.6949327 57.5083867 58.8789861 59.6697912 60.2729789 61.3274402 62.2503592 62.5975341 63.5658304 64.2900103 64.8514350 65.6736046 66.6834719 67.3991559 68.0186446 68.5218793 69.5601726 70.6221841 70.9225558 71.1032711 72.4738108 73.8276280 74.6183706 75.8184439 76.4412115 77.0199342 79.0949910 79.9129638 80.5642423 81.4869298 81.8958219 82.1807360 82.6215908 83.1755801 84.7676998 85.2554828 86.2785831 86.8165090 87.5554082 88.0302172 88.7703212 90.0718141 90.4231883 91.4445858 91.5598698 92.5412113 93.5862315 93.8789763 94.7354946 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034324 0.0034332 0.0034332 0.0034339 0.0034343 244.7318081 268.9836071 306.6596972 328.2125296 365.5330458 368.9264678 389.5751521 415.4539648 433.1827529 457.4368844 468.2149329 475.2783549 479.2304836 498.7086071 514.3289775 530.5572367 532.5050779 542.4358105 548.4921736 561.5152428 568.6962894 578.4998847 582.8720183 606.6113560 608.5959412 624.7573101 628.2479973 642.1755317 648.8084437 654.6234354 666.1120665 667.6245214 671.0070797 682.1348487 692.7904189 698.2916753 702.4159131 714.5911435 718.9661970 722.3364758 739.6956679 747.9196420 757.2671124 759.0969964 763.1612130 770.7261678 785.1728110 790.3498696 799.1841316 800.8325770 810.8443821 817.6499273 823.4948216 833.2502293 838.8272671 843.0563588 850.3989180 856.7738666 859.1596907 865.7791898 870.6969596 874.4904591 880.0162814 886.7565031 891.5023842 895.5900646 898.8969627 905.6817271 912.5692960 914.5079163 915.6722880 924.4551136 933.0496145 938.0330948 945.5461126 949.4214975 953.0086703 965.7612388 970.7421769 974.6898504 980.2554324 982.7117600 984.4196938 987.0565994 990.3602471 999.7938929 1002.6663485 1008.6646079 1011.8041106 1016.1007429 1018.8521515 1023.1261289 1030.5990435 1032.6072936 1038.4229522 1039.0773148 1044.6309050 1050.5125864 1052.1543447 1056.9431870 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2180 Rtb_to_modes> Number of blocs = 140 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.136 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 24021912402138273.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 24021912402138273.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 24021912402138273.atom Openam> file on opening on unit 11: 24021912402138273.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2180 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.136 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.74 Bfactors> 106 vectors, 6540 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.079000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.541 for 280 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.02 Bfactors> = 95.565 +/- 6.08 Bfactors> Shiftng-fct= 95.546 Bfactors> Scaling-fct= 283.664 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 24021912402138273 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=0 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=20 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=40 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=60 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=80 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom calculating perturbed structure for DQ=100 24021912402138273.eigenfacs 24021912402138273.atom 24021912402138273.10.pdb 24021912402138273.11.pdb 24021912402138273.12.pdb 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