*** EXP_1RTG_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912452044392.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912452044392.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912452044392.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 203
First residue number = 1
Last residue number = 203
Number of atoms found = 1642
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.118422 +/- 9.806194 From: -26.719000 To: 21.016000
= 0.371357 +/- 9.759752 From: -23.297000 To: 34.344000
= -0.552726 +/- 8.925352 From: -21.203000 To: 20.375000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.0444 % Filled.
Pdbmat> 612145 non-zero elements.
Pdbmat> 66992 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.60 +/- 25.17
Maximum number = 129
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.339840E+06
Pdbmat> Larger element = 473.501
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
203 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912452044392.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912452044392.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912452044392.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1642 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 203 residues.
Blocpdb> 14 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 15 atoms in block 2
Block first atom: 15
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 14 atoms in block 4
Block first atom: 41
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 55
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 71
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 85
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 103
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 119
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 137
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 149
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 162
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 179
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 194
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 211
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 233
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 253
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 272
Blocpdb> 25 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 316
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 330
Blocpdb> 19 atoms in block 22
Block first atom: 344
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 363
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 379
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 391
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 406
Blocpdb> 12 atoms in block 27
Block first atom: 421
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 433
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 458
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 474
Blocpdb> 18 atoms in block 31
Block first atom: 489
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 507
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 523
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 535
Blocpdb> 12 atoms in block 35
Block first atom: 556
Blocpdb> 18 atoms in block 36
Block first atom: 568
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 586
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 604
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 616
Blocpdb> 9 atoms in block 40
Block first atom: 638
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 647
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 664
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 690
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 710
Blocpdb> 13 atoms in block 45
Block first atom: 721
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 734
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 751
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 766
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 785
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 801
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 816
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 830
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 842
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 856
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 871
Blocpdb> 15 atoms in block 56
Block first atom: 891
Blocpdb> 10 atoms in block 57
Block first atom: 906
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 916
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 935
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 955
Blocpdb> 18 atoms in block 61
Block first atom: 972
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 990
Blocpdb> 19 atoms in block 63
Block first atom: 1009
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 1028
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1037
Blocpdb> 25 atoms in block 66
Block first atom: 1054
Blocpdb> 23 atoms in block 67
Block first atom: 1079
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1102
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1119
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1135
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1153
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 1169
Blocpdb> 18 atoms in block 73
Block first atom: 1180
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1198
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1215
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1228
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1241
Blocpdb> 13 atoms in block 78
Block first atom: 1263
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1276
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1291
Blocpdb> 13 atoms in block 81
Block first atom: 1307
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1320
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1334
Blocpdb> 13 atoms in block 84
Block first atom: 1350
Blocpdb> 8 atoms in block 85
Block first atom: 1363
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1371
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 1387
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1410
Blocpdb> 9 atoms in block 89
Block first atom: 1430
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 1439
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1463
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1480
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1497
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1514
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1528
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1543
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1559
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1574
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1588
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 1603
Blocpdb> 12 atoms in block 101
Block first atom: 1625
Blocpdb> 6 atoms in block 102
Block first atom: 1636
Blocpdb> 102 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 612247 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4926
Prepmat> Matrix trace = 1339840.0000
Prepmat> Last element read: 4926 4926 191.8892
Prepmat> 5254 lines saved.
Prepmat> 4214 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1642
RTB> Total mass = 1642.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1642
RTB> Number of blocks = 102
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 137632.2012
RTB> 35874 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 612
Diagstd> Nb of non-zero elements: 35874
Diagstd> Projected matrix trace = 137632.2012
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 612 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 137632.2012
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0817789 0.6902982 0.9046338 2.4015207
4.0399240 6.7175133 7.4034167 9.8060779 11.1053495
12.3441308 13.8212997 14.3286964 17.0639674 17.4513578
18.1231342 18.9127844 20.3611039 21.0939297 21.8264587
23.1701903 24.2960706 25.1626562 26.8811180 28.0416253
29.1223881 32.1045149 32.6103788 33.9627113 34.4845710
35.2685500 36.6906239 37.6915440 38.6631294 39.5078533
39.9733636 41.7634709 42.8247457 43.8682939 44.7036023
45.6632044 46.5839452 48.1313872 48.9686256 50.3324610
51.2218778 52.2320121 52.6445778 53.0339843 55.7020005
55.9228259 58.0460949 58.2745338 59.2631716 59.3800703
60.4426493 61.0738527 61.6360660 62.6050923 63.6876068
64.0336162 64.9624764 65.4587846 66.0202437 66.5660092
67.3480733 68.0685119 68.6659571 69.7928319 70.3741234
70.8237273 72.1476069 73.4087348 74.2173456 74.7223288
75.6133680 76.5984009 77.0900543 77.4625474 78.5656426
79.7394608 80.4356873 81.4044487 83.1498462 83.6343145
85.1785422 85.9623019 86.8494728 87.0485080 88.0119108
89.8912581 90.4074366 90.7138341 91.8430306 92.4140919
93.6668148 94.5409801 94.8615237 96.3295240 96.5422395
97.8419507
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034325 0.0034330 0.0034330 0.0034337
0.0034354 31.0538914 90.2222527 103.2836748 168.2823020
218.2638832 281.4488943 295.4686284 340.0501332 361.8773459
381.5272287 403.7102002 411.0537557 448.5752278 453.6384848
462.2872694 472.2511415 489.9998426 498.7398006 507.3257648
522.7091242 535.2581644 544.7202523 563.0136759 575.0384321
586.0150539 615.2878457 620.1163785 632.8436945 637.6871919
644.8951081 657.7681320 666.6797198 675.2176429 682.5539690
686.5633673 701.7680189 710.6285910 719.2347335 726.0500186
733.8012930 741.1624589 753.3719904 759.8961384 770.4054798
777.1825273 784.8084284 787.9018200 790.8104654 810.4583042
812.0632087 827.3357369 828.9621172 835.9642889 836.7883670
844.2421406 848.6389071 852.5360175 859.2115575 866.6081022
868.9590176 875.2388089 878.5758248 882.3356803 885.9751497
891.1644801 895.9183015 899.8415012 907.1950887 910.9651847
913.8705240 922.3722862 930.3988177 935.5090414 938.6863004
944.2664768 950.3971646 953.4423884 955.7430919 962.5241035
969.6877909 973.9118920 979.7591997 990.2070302 993.0875356
1002.2138077 1006.8141222 1011.9961807 1013.1551260 1018.7462083
1029.5655672 1032.5173500 1034.2655088 1040.6828156 1043.9131791
1050.9647658 1055.8575517 1057.6459929 1065.7982121 1066.9743149
1074.1324366
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1642
Rtb_to_modes> Number of blocs = 102
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1779E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.402
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.040
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.718
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.806
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.84
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 612 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 0.99996 1.00003
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1.00002 1.00000 0.99997 0.99994 1.00001
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1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
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1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
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0.99997 1.00001 0.99998 1.00003 1.00003
1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001
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0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002
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1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 29556 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 0.99996 1.00003
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1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 0.99997 0.99994 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99995
1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
0.99997 1.00001 0.99998 1.00003 1.00003
1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00004 1.00003 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912452044392.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912452044392.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912452044392.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912452044392.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 203
First residue number = 1
Last residue number = 203
Number of atoms found = 1642
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1779E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.402
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.040
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.718
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.806
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.84
Bfactors> 106 vectors, 4926 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.081779
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.734 for 203 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.173 +/- 1.13
Bfactors> = 94.074 +/- 8.73
Bfactors> Shiftng-fct= 93.901
Bfactors> Scaling-fct= 7.754
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912452044392 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912452044392.eigenfacs
24021912452044392.atom
24021912452044392.10.pdb
24021912452044392.11.pdb
24021912452044392.12.pdb
24021912452044392.13.pdb
24021912452044392.14.pdb
24021912452044392.15.pdb
24021912452044392.16.pdb
24021912452044392.7.pdb
24021912452044392.8.pdb
24021912452044392.9.pdb
STDERR:
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user 0m4.542s
sys 0m0.036s
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mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912452044392.Chkmod.res: No such file or directory
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