*** EXP_1PC3_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 24021912472146850.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 24021912472146850.atom to be opened.
Openam> File opened: 24021912472146850.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 333
First residue number = 1
Last residue number = 333
Number of atoms found = 2423
Mean number per residue = 7.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.964194 +/- 11.754474 From: -27.703000 To: 24.922000
= -1.219803 +/- 10.700260 From: -29.250000 To: 26.188000
= -0.760116 +/- 11.573179 From: -28.641000 To: 25.969000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.6075 % Filled.
Pdbmat> 953194 non-zero elements.
Pdbmat> 104416 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.19 +/- 24.13
Maximum number = 132
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 2.088320E+06
Pdbmat> Larger element = 493.882
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
333 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 24021912472146850.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 24021912472146850.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
24021912472146850.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2423 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 333 residues.
Blocpdb> 12 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 13
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 27
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 39
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 51
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 65
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 80
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 94
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 105
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 118
Blocpdb> 19 atoms in block 11
Block first atom: 134
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 153
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 172
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 188
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 206
Blocpdb> 21 atoms in block 16
Block first atom: 218
Blocpdb> 20 atoms in block 17
Block first atom: 239
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 259
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 278
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 308
Blocpdb> 13 atoms in block 22
Block first atom: 320
Blocpdb> 11 atoms in block 23
Block first atom: 333
Blocpdb> 10 atoms in block 24
Block first atom: 344
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 354
Blocpdb> 13 atoms in block 26
Block first atom: 363
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 376
Blocpdb> 10 atoms in block 28
Block first atom: 390
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 400
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 411
Blocpdb> 12 atoms in block 31
Block first atom: 426
Blocpdb> 11 atoms in block 32
Block first atom: 438
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 449
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 462
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 482
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 497
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 509
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 522
Blocpdb> 13 atoms in block 39
Block first atom: 537
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 550
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 566
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 582
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 595
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 608
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 619
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 637
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 652
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 672
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 687
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 698
Blocpdb> 18 atoms in block 51
Block first atom: 713
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 731
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 748
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 760
Blocpdb> 13 atoms in block 55
Block first atom: 776
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 789
Blocpdb> 21 atoms in block 57
Block first atom: 802
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 823
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 834
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 851
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 872
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 888
Blocpdb> 13 atoms in block 63
Block first atom: 904
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 917
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 930
Blocpdb> 11 atoms in block 66
Block first atom: 945
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 956
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 972
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 983
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 995
Blocpdb> 15 atoms in block 71
Block first atom: 1009
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1024
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1045
Blocpdb> 10 atoms in block 74
Block first atom: 1059
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1069
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1081
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1099
Blocpdb> 16 atoms in block 78
Block first atom: 1118
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1134
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1154
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1169
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1186
Blocpdb> 18 atoms in block 83
Block first atom: 1202
Blocpdb> 13 atoms in block 84
Block first atom: 1220
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1233
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1246
Blocpdb> 11 atoms in block 87
Block first atom: 1261
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1272
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1286
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1305
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1317
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 1331
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1340
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1352
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1369
Blocpdb> 8 atoms in block 96
Block first atom: 1381
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1389
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 1404
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 1415
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1426
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 1442
Blocpdb> 13 atoms in block 102
Block first atom: 1453
Blocpdb> 17 atoms in block 103
Block first atom: 1466
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1483
Blocpdb> 14 atoms in block 105
Block first atom: 1495
Blocpdb> 19 atoms in block 106
Block first atom: 1509
Blocpdb> 17 atoms in block 107
Block first atom: 1528
Blocpdb> 11 atoms in block 108
Block first atom: 1545
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 1556
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 1576
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1588
Blocpdb> 14 atoms in block 112
Block first atom: 1601
Blocpdb> 12 atoms in block 113
Block first atom: 1615
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1627
Blocpdb> 10 atoms in block 115
Block first atom: 1641
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1651
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 1670
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1686
Blocpdb> 14 atoms in block 119
Block first atom: 1701
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1715
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1729
Blocpdb> 10 atoms in block 122
Block first atom: 1743
Blocpdb> 9 atoms in block 123
Block first atom: 1753
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1762
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 1778
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1793
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 1807
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1820
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 1834
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1848
Blocpdb> 12 atoms in block 131
Block first atom: 1864
Blocpdb> 12 atoms in block 132
Block first atom: 1876
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 1888
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 1903
Blocpdb> 15 atoms in block 135
Block first atom: 1919
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 1934
Blocpdb> 21 atoms in block 137
Block first atom: 1950
Blocpdb> 17 atoms in block 138
Block first atom: 1971
Blocpdb> 15 atoms in block 139
Block first atom: 1988
Blocpdb> 16 atoms in block 140
Block first atom: 2003
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2019
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2039
Blocpdb> 10 atoms in block 143
Block first atom: 2056
Blocpdb> 12 atoms in block 144
Block first atom: 2066
Blocpdb> 16 atoms in block 145
Block first atom: 2078
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2094
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2111
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 2127
Blocpdb> 19 atoms in block 149
Block first atom: 2145
Blocpdb> 15 atoms in block 150
Block first atom: 2164
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2179
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2191
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 2208
Blocpdb> 19 atoms in block 154
Block first atom: 2219
Blocpdb> 17 atoms in block 155
Block first atom: 2238
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2255
Blocpdb> 20 atoms in block 157
Block first atom: 2272
Blocpdb> 15 atoms in block 158
Block first atom: 2292
Blocpdb> 14 atoms in block 159
Block first atom: 2307
Blocpdb> 12 atoms in block 160
Block first atom: 2321
Blocpdb> 16 atoms in block 161
Block first atom: 2333
Blocpdb> 14 atoms in block 162
Block first atom: 2349
Blocpdb> 13 atoms in block 163
Block first atom: 2363
Blocpdb> 16 atoms in block 164
Block first atom: 2376
Blocpdb> 12 atoms in block 165
Block first atom: 2392
Blocpdb> 14 atoms in block 166
Block first atom: 2404
Blocpdb> 6 atoms in block 167
Block first atom: 2417
Blocpdb> 167 blocks.
Blocpdb> At most, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 953361 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7269
Prepmat> Matrix trace = 2088320.0000
Prepmat> Last element read: 7269 7269 152.4212
Prepmat> 14029 lines saved.
Prepmat> 12019 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2423
RTB> Total mass = 2423.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2423
RTB> Number of blocks = 167
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 247449.3023
RTB> 69819 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1002
Diagstd> Nb of non-zero elements: 69819
Diagstd> Projected matrix trace = 247449.3023
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1002 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 247449.3023
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.0070395 3.6824690 4.2278548 9.2708094
10.3757203 11.1508349 12.0829243 12.9244265 14.4653109
16.1293043 16.8169801 18.1167516 19.4893585 21.3464669
21.6281131 22.0904059 23.8342608 24.3232643 25.2165965
26.9871263 27.8803634 28.5312394 29.1966955 30.6702502
31.0094208 31.8811282 32.3879440 33.2658716 34.1313975
34.7021379 34.9464433 35.3356437 36.1432038 38.0154736
38.8946096 39.3868832 39.5559931 40.1378632 41.4333900
42.2465100 43.2354325 44.1224704 44.4408793 45.4017789
46.2159786 46.3046867 47.1920450 48.1347653 48.4402056
49.7326258 50.1652764 51.3725181 51.9242758 52.6809789
54.3105094 54.7079800 55.5417523 56.1934660 57.0251085
57.2266662 58.8529269 59.3770404 59.6131443 60.7643235
61.6887835 62.1696048 62.7580272 63.0731489 63.4984226
64.2449461 65.8584545 66.0003237 66.6083561 67.6742541
68.4151926 68.9038397 69.2487583 69.8202367 70.2637776
70.7613813 71.4487869 72.1264571 73.1059905 73.5631008
74.0402618 74.4417491 74.7432486 75.3316446 76.0496396
77.2738242 77.5663118 77.9496361 79.1350145 79.2603298
79.9999511 80.6252349 81.6293925 82.1031926 82.8875745
83.1380753
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034299 0.0034322 0.0034325 0.0034335 0.0034340
0.0034345 188.3062997 208.3842205 223.2828207 330.6390217
349.7875988 362.6176783 377.4690144 390.3920101 413.0086675
436.1170824 445.3170117 462.2058573 479.3956091 501.7163832
505.0153705 510.3840907 530.1467749 535.5576288 545.3037884
564.1227332 573.3825816 580.0368685 586.7622028 601.3868667
604.7029778 613.1434892 617.9978584 626.3177702 634.4133538
639.6956477 641.9434491 645.5082305 652.8427774 669.5383893
677.2359263 681.5082034 682.9696840 687.9746005 698.9892786
705.8146997 714.0279039 721.3153770 723.9133766 731.6977419
738.2294338 738.9375824 745.9842850 753.3984278 755.7850019
765.8010812 769.1249234 778.3245103 782.4930778 788.1741702
800.2712562 803.1943040 809.2916677 814.0258385 820.0273556
821.4752880 833.0658150 836.7670177 838.4290065 846.4856768
852.9005284 856.2179605 860.2603803 862.4174536 865.3200139
870.3917481 881.2538915 882.2025587 886.2569171 893.3199213
898.1969111 901.3988345 903.6521274 907.3731809 910.2507129
913.4681963 917.8943784 922.2370807 928.4783108 931.3765383
934.3923050 936.9222759 938.8176918 942.5057417 946.9866582
954.5781363 956.3830076 958.7432652 966.0055540 966.7701169
971.2703722 975.0587337 981.1119434 983.9551493 988.6441387
990.1369394
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2423
Rtb_to_modes> Number of blocs = 167
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9765E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.99
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.53
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.14
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00004 1.00002 1.00004 1.00003
0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 0.99997
0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99996
1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
1.00004 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 43614 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00004 1.00002 1.00004 1.00003
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0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99996
1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
1.00004 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 24021912472146850.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
24021912472146850.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 24021912472146850.atom
Openam> file on opening on unit 11:
24021912472146850.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 333
First residue number = 1
Last residue number = 333
Number of atoms found = 2423
Mean number per residue = 7.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9765E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.682
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.14
Bfactors> 106 vectors, 7269 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.007000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.619 for 333 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.020 +/- 0.02
Bfactors> = 98.029 +/- 1.27
Bfactors> Shiftng-fct= 98.009
Bfactors> Scaling-fct= 74.668
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912472146850 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912472146850.eigenfacs
24021912472146850.atom
24021912472146850.10.pdb
24021912472146850.11.pdb
24021912472146850.12.pdb
24021912472146850.13.pdb
24021912472146850.14.pdb
24021912472146850.15.pdb
24021912472146850.16.pdb
24021912472146850.7.pdb
24021912472146850.8.pdb
24021912472146850.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m15.698s
user 0m15.642s
sys 0m0.056s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912472146850.Chkmod.res: No such file or directory
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