Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* EXP_1QNX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_1_seed_000 *

LOGs for ID: 24021912510351363

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 24021912510351363.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 24021912510351363.atom to be opened.

 Openam> File opened: 24021912510351363.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    209
            Number of atoms found    =   1675
            Mean number per residue  =      8.0

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.413527 +/-     9.609480 From:   -24.125000 To:    26.906000
 =     2.257724 +/-     9.554770 From:   -17.609000 To:    28.984000
 =    -0.125679 +/-    10.595273 From:   -22.797000 To:    25.375000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.9991 % Filled.
 Pdbmat>       631274  non-zero elements.
 Pdbmat>        69081 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.48 +/-     25.53
         Maximum number =    137
         Minimum number =     11

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.381620E+06
 Pdbmat> Larger element =  495.315    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
209 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 24021912510351363.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 24021912510351363.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 24021912510351363.atom                                                                                                          

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1675 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   209 residues.
 Blocpdb>    14 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    14 atoms in block      2
 Block first atom:     15
 Blocpdb>    19 atoms in block      3
 Block first atom:     29
 Blocpdb>    20 atoms in block      4
 Block first atom:     48
 Blocpdb>    15 atoms in block      5
 Block first atom:     68
 Blocpdb>    17 atoms in block      6
 Block first atom:     83
 Blocpdb>    14 atoms in block      7
 Block first atom:    100
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    114
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    127
 Blocpdb>    17 atoms in block     10
 Block first atom:    138
 Blocpdb>    11 atoms in block     11
 Block first atom:    155
 Blocpdb>    21 atoms in block     12
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    10 atoms in block     13
 Block first atom:    187
 Blocpdb>    17 atoms in block     14
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    10 atoms in block     16
 Block first atom:    229
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    239
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    256
 Blocpdb>    13 atoms in block     19
 Block first atom:    270
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    283
 Blocpdb>    15 atoms in block     21
 Block first atom:    299
 Blocpdb>    18 atoms in block     22
 Block first atom:    314
 Blocpdb>    18 atoms in block     23
 Block first atom:    332
 Blocpdb>    17 atoms in block     24
 Block first atom:    350
 Blocpdb>    16 atoms in block     25
 Block first atom:    367
 Blocpdb>    18 atoms in block     26
 Block first atom:    383
 Blocpdb>    18 atoms in block     27
 Block first atom:    401
 Blocpdb>    19 atoms in block     28
 Block first atom:    419
 Blocpdb>    20 atoms in block     29
 Block first atom:    438
 Blocpdb>    17 atoms in block     30
 Block first atom:    458
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    12 atoms in block     32
 Block first atom:    491
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    503
 Blocpdb>    15 atoms in block     34
 Block first atom:    519
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    534
 Blocpdb>    11 atoms in block     36
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    560
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    576
 Blocpdb>    17 atoms in block     39
 Block first atom:    588
 Blocpdb>    17 atoms in block     40
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    16 atoms in block     41
 Block first atom:    622
 Blocpdb>    21 atoms in block     42
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    659
 Blocpdb>    17 atoms in block     44
 Block first atom:    675
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    692
 Blocpdb>    12 atoms in block     46
 Block first atom:    709
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    721
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    737
 Blocpdb>    17 atoms in block     49
 Block first atom:    756
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    16 atoms in block     51
 Block first atom:    788
 Blocpdb>    18 atoms in block     52
 Block first atom:    804
 Blocpdb>    13 atoms in block     53
 Block first atom:    822
 Blocpdb>    19 atoms in block     54
 Block first atom:    835
 Blocpdb>    12 atoms in block     55
 Block first atom:    854
 Blocpdb>    21 atoms in block     56
 Block first atom:    866
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    887
 Blocpdb>    13 atoms in block     58
 Block first atom:    903
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    916
 Blocpdb>    13 atoms in block     60
 Block first atom:    931
 Blocpdb>    11 atoms in block     61
 Block first atom:    944
 Blocpdb>    13 atoms in block     62
 Block first atom:    955
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    968
 Blocpdb>    21 atoms in block     64
 Block first atom:    978
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:    999
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:   1015
 Blocpdb>    17 atoms in block     67
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1046
 Blocpdb>    22 atoms in block     69
 Block first atom:   1062
 Blocpdb>    17 atoms in block     70
 Block first atom:   1084
 Blocpdb>    16 atoms in block     71
 Block first atom:   1101
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    20 atoms in block     73
 Block first atom:   1134
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1170
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1188
 Blocpdb>    12 atoms in block     77
 Block first atom:   1205
 Blocpdb>    19 atoms in block     78
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    17 atoms in block     79
 Block first atom:   1236
 Blocpdb>    11 atoms in block     80
 Block first atom:   1253
 Blocpdb>    22 atoms in block     81
 Block first atom:   1264
 Blocpdb>    16 atoms in block     82
 Block first atom:   1286
 Blocpdb>    15 atoms in block     83
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    19 atoms in block     84
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    15 atoms in block     85
 Block first atom:   1336
 Blocpdb>    18 atoms in block     86
 Block first atom:   1351
 Blocpdb>    11 atoms in block     87
 Block first atom:   1369
 Blocpdb>    10 atoms in block     88
 Block first atom:   1380
 Blocpdb>    14 atoms in block     89
 Block first atom:   1390
 Blocpdb>    21 atoms in block     90
 Block first atom:   1404
 Blocpdb>    17 atoms in block     91
 Block first atom:   1425
 Blocpdb>    18 atoms in block     92
 Block first atom:   1442
 Blocpdb>    24 atoms in block     93
 Block first atom:   1460
 Blocpdb>    19 atoms in block     94
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    20 atoms in block     95
 Block first atom:   1503
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1523
 Blocpdb>    20 atoms in block     97
 Block first atom:   1536
 Blocpdb>    11 atoms in block     98
 Block first atom:   1556
 Blocpdb>    10 atoms in block     99
 Block first atom:   1567
 Blocpdb>    19 atoms in block    100
 Block first atom:   1577
 Blocpdb>    17 atoms in block    101
 Block first atom:   1596
 Blocpdb>    18 atoms in block    102
 Block first atom:   1613
 Blocpdb>    20 atoms in block    103
 Block first atom:   1631
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1651
 Blocpdb>     9 atoms in block    105
 Block first atom:   1666

 Blocpdb>   105 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       631379 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5025

 Prepmat> Matrix trace    =    1381620.0000
 Prepmat> Last element read:    5025   5025       110.6793
 Prepmat>         5566 lines saved.
 Prepmat>         4452 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1675
 RTB> Total mass =        1675.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1675
 RTB> Number of blocks =   105
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  145438.0313
 RTB>     38493 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      630
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    38493
 Diagstd> Projected matrix trace =  145438.0313

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    630 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 145438.0313
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      3.2539564      4.2844398      5.5011558      6.1507865
      8.0630349     10.3911243     12.1479135     13.1884332     14.7724225
     15.7384675     17.6646043     17.9700485     18.5368815     20.3987008
     21.1811341     21.9577616     22.3290748     24.0324884     24.3699161
     25.1150435     27.5677896     28.7634196     30.2074720     30.5142402
     32.4730330     34.2065388     35.7927912     36.6713529     37.1616086
     38.4114429     39.5749862     39.9800252     40.6226095     41.6933037
     42.1053002     43.6297911     44.3202670     46.2297349     46.7907808
     47.4400825     48.9225597     50.1286283     50.8117497     51.7635729
     52.6384142     54.0004242     54.3358082     55.0878465     55.9375920
     57.1846283     57.3744594     58.4958580     59.9869416     60.2960757
     60.7484604     60.8907956     61.8659837     63.7122564     64.2147666
     65.9223807     67.0662321     68.2088354     69.2515998     69.6442591
     69.8287589     71.3528696     71.6897181     73.3164112     73.9637654
     75.5081690     76.2747337     76.9577758     77.3441523     78.5103247
     79.2640496     79.9439993     81.1203381     82.2423893     83.2351350
     83.7027068     84.2664377     85.1984085     86.1274917     86.5776080
     86.9096236     87.4702940     88.6864459     89.1893396     89.8555201
     90.2840315     91.1302311     91.9988616     92.1949022     93.0838977
     93.8352234     94.4914913     95.7217205     96.0543743     97.7224015
     97.9688183

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034330      0.0034333      0.0034338      0.0034340      0.0034343
      0.0034347    195.8849843    224.7720471    254.6960762    269.3150399
    308.3504249    350.0471540    378.4827800    394.3591147    417.3699149
    430.8008001    456.4016824    460.3306634    467.5344499    490.4520275
    499.7696576    508.8494545    513.1338256    532.3468041    536.0709797
    544.2046487    570.1593532    582.3921851    596.8325095    599.8553832
    618.8091217    635.1113100    649.6703753    657.5953695    661.9764397
    673.0163133    683.1336306    686.6205728    692.1164787    701.1782476
    704.6341126    717.2769043    722.9303608    738.3392941    742.8060402
    747.9421322    759.5386284    768.8439313    774.0648652    781.2812522
    787.8556955    797.9834162    800.4576249    805.9779820    812.1704123
    821.1735105    822.5353728    830.5348069    841.0535344    843.2178740
    846.3751777    847.3661376    854.1246220    866.7757916    870.1872874
    881.6814869    889.2978330    896.8412957    903.6706672    906.2289702
    907.4285556    917.2780521    919.4406834    929.8135683    933.9094854
    943.6093810    948.3870832    952.6240335    955.0124256    962.1851878
    966.7928028    970.9306603    978.0479705    984.7888883    990.7147398
    993.4935033    996.8334383   1002.3306748   1007.7810319   1010.4110143
   1012.3465680   1015.6067375   1022.6426604   1025.5379931   1029.3608852
   1031.8124222   1036.6365472   1041.5653097   1042.6744564   1047.6894249
   1051.9091344   1055.5811637   1062.4304960   1064.2749838   1073.4760162
   1074.8286026

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1675
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    105

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9964E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.254    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.284    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.501    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.151    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.063    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.97    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    630 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99997
 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003
 1.00003 1.00000 0.99998 1.00005 0.99997
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 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
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 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 0.99995
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 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    30150 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
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 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003
 1.00003 1.00000 0.99998 1.00005 0.99997
 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 0.99994 1.00000 1.00003 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 0.99995
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 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 24021912510351363.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 24021912510351363.eigenfacs                                     
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 24021912510351363.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 24021912510351363.atom                                          
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    209
            Number of atoms found    =   1675
            Mean number per residue  =      8.0

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9964E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.254    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.284    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.501    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.151    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.063    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.97    

 Bfactors>  106 vectors,   5025 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     3.254000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.676 for    209 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.024 +/-   0.02
 Bfactors> =     95.015 +/-   7.31
 Bfactors> Shiftng-fct=     94.990
 Bfactors> Scaling-fct=    306.351

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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getting mode 13
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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24021912510351363.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 24021912510351363 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
24021912510351363.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 15
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
24021912510351363.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
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24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
24021912510351363.eigenfacs
24021912510351363.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 16
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generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=100
24021912510351363.eigenfacs
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24021912510351363.10.pdb
24021912510351363.11.pdb
24021912510351363.12.pdb
24021912510351363.13.pdb
24021912510351363.14.pdb
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24021912510351363.16.pdb
24021912510351363.7.pdb
24021912510351363.8.pdb
24021912510351363.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m4.920s
user	0m4.874s
sys	0m0.032s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 24021912510351363.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
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*** EXP_1QNX_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_1_seed_000 ***

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

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