*** 1AOL_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_4_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220085659142820.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220085659142820.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220085659142820.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.159750 +/- 11.465976 From: -22.781000 To: 31.656000
= 1.175489 +/- 8.666564 From: -25.391000 To: 22.000000
= -1.139940 +/- 11.541948 From: -22.547000 To: 37.031000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6133 % Filled.
Pdbmat> 662317 non-zero elements.
Pdbmat> 72464 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.15 +/- 25.47
Maximum number = 136
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.449280E+06
Pdbmat> Larger element = 510.213
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
228 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220085659142820.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220085659142820.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220085659142820.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1786 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 228 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 75
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 89
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 101
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 120
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 136
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 157
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 170
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 180
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 198
Blocpdb> 21 atoms in block 14
Block first atom: 213
Blocpdb> 28 atoms in block 15
Block first atom: 234
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 262
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 276
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 306
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 320
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 336
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 349
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 359
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 373
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 397
Blocpdb> 21 atoms in block 26
Block first atom: 409
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 19 atoms in block 28
Block first atom: 444
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 463
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 11 atoms in block 31
Block first atom: 489
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 500
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 513
Blocpdb> 10 atoms in block 34
Block first atom: 525
Blocpdb> 10 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 545
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 557
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 566
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 578
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 597
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 627
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 642
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 656
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 670
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 687
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 702
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 721
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 740
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 757
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 773
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 789
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 806
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 821
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 836
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 851
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 870
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 883
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 893
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 914
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 932
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 946
Blocpdb> 10 atoms in block 63
Block first atom: 961
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 971
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 982
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 996
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 1019
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1030
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 1050
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1060
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 1076
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1087
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1105
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1131
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1147
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1159
Blocpdb> 20 atoms in block 77
Block first atom: 1179
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1199
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1214
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1229
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1245
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1260
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1287
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1303
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1316
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1333
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1350
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1370
Blocpdb> 13 atoms in block 90
Block first atom: 1385
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1398
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1415
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1433
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1446
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1459
Blocpdb> 13 atoms in block 96
Block first atom: 1475
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 1488
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 1509
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 1520
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 1542
Blocpdb> 19 atoms in block 101
Block first atom: 1560
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 1579
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1599
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1612
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1627
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1642
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1654
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1672
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1684
Blocpdb> 23 atoms in block 110
Block first atom: 1703
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1726
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1743
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1755
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1772
Blocpdb> 114 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 662431 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5358
Prepmat> Matrix trace = 1449280.0000
Prepmat> Last element read: 5358 5358 60.5293
Prepmat> 6556 lines saved.
Prepmat> 5365 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1786
RTB> Total mass = 1786.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1786
RTB> Number of blocks = 114
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 154909.2517
RTB> 41119 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 684
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41119
Diagstd> Projected matrix trace = 154909.2517
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 684 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 154909.2517
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5112914 1.4773086 2.2896426 2.9120428
3.9384864 4.2363530 5.3430169 5.5338454 6.4009112
7.7466396 8.6604847 10.2302494 10.6672274 11.6354334
11.9578607 12.9010037 14.0112372 15.7080107 18.2897382
19.5096747 20.2974706 20.7740561 21.2285867 22.4057620
22.5626232 25.0541535 25.1934190 25.7363815 26.5989558
26.8984928 27.7502793 28.3696557 29.4894973 31.3325806
31.8148182 32.5098837 34.1507461 35.1582578 36.4147277
37.4766706 38.3478579 38.4619009 39.7175885 40.5135277
41.1257585 42.3529759 44.2288644 44.9618720 45.3939063
46.1350394 46.9281961 48.2201545 49.7268423 50.4572111
50.7798518 51.2612564 51.7849141 52.6366058 53.3316987
53.7675196 54.9155895 55.9792068 56.3314562 57.4977238
59.3066452 59.7209047 61.3914732 61.8128451 62.1488075
62.3774388 63.3472310 64.2431230 64.4995405 65.4444986
66.7010793 67.3129079 67.7056908 68.4260780 70.7388913
71.3003371 72.2300685 72.9811667 73.6096700 74.0110064
75.5210741 76.0080130 76.3711237 77.8266896 78.3520536
78.8047519 79.7735868 80.3631479 80.6600514 81.7638065
82.8104546 83.2607347 84.0726515 84.4106021 85.9031868
86.5628317
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034334 0.0034335 0.0034338 0.0034344
0.0034347 77.6478630 131.9869209 164.3157266 185.3079944
215.5062911 223.5071130 251.0085730 255.4516962 274.7363861
302.2400117 319.5702768 347.3268773 354.6672254 370.4132915
375.5104478 390.0380988 406.4747032 430.3837587 464.4072863
479.6454113 489.2335595 494.9438476 500.3291672 514.0142266
515.8103776 543.5445520 545.0531267 550.8952439 560.0509964
563.1956003 572.0433739 578.3920473 589.6970637 607.8457203
612.5055150 619.1601374 634.5931479 643.8859569 655.2904126
664.7766874 672.4590377 673.4582115 684.3633074 691.1866014
696.3895422 706.7035057 722.1845193 728.1443311 731.6343020
737.5827107 743.8959774 754.0663811 765.7565520 771.3596219
773.8218609 777.4812127 781.4422894 787.8421619 793.0270272
796.2606998 804.7168688 812.4724628 815.0246973 823.4184737
836.2708509 839.1864623 850.8427602 853.7577267 856.0747352
857.6479416 864.2892240 870.3793979 872.1146675 878.4799474
886.8735667 890.9317921 893.5273840 898.2683636 913.3230213
916.9403235 922.8992510 927.6853138 931.6712967 934.2076843
943.6900137 946.7274509 948.9861425 957.9868754 961.2148509
963.9876793 969.8952671 973.4726409 975.2692414 981.9193786
988.1841067 990.8670794 995.6865772 997.6857731 1006.4678765
1010.3247866
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1786
Rtb_to_modes> Number of blocs = 114
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5113
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.477
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.912
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.236
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.343
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.534
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.747
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.660
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.56
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 684 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
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1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 32148 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99996 1.00002 1.00006 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00004 0.99996 1.00002 1.00003 0.99998
0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000
0.99996 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 1.00002 0.99996 0.99999
0.99999 1.00002 1.00003 0.99997 1.00004
1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220085659142820.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220085659142820.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220085659142820.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220085659142820.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 228
First residue number = 1
Last residue number = 228
Number of atoms found = 1786
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5113
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.477
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.912
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.343
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.534
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.747
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.660
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.56
Bfactors> 106 vectors, 5358 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.511300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.539 for 228 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.059 +/- 0.25
Bfactors> = 91.797 +/- 8.37
Bfactors> Shiftng-fct= 91.739
Bfactors> Scaling-fct= 34.058
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085659142820 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085659142820.eigenfacs
240220085659142820.atom
240220085659142820.10.pdb
240220085659142820.11.pdb
240220085659142820.12.pdb
240220085659142820.13.pdb
240220085659142820.14.pdb
240220085659142820.15.pdb
240220085659142820.16.pdb
240220085659142820.7.pdb
240220085659142820.8.pdb
240220085659142820.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m5.963s
user 0m5.927s
sys 0m0.036s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220085659142820.Chkmod.res: No such file or directory
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