*** 1R88_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220085926145927.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220085926145927.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220085926145927.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 267
First residue number = 1
Last residue number = 267
Number of atoms found = 1968
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.329195 +/- 10.125911 From: -22.578000 To: 26.781000
= -0.978220 +/- 10.080586 From: -22.422000 To: 22.141000
= -0.029712 +/- 8.341118 From: -19.547000 To: 19.484000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.5446 % Filled.
Pdbmat> 792200 non-zero elements.
Pdbmat> 86783 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 88.19 +/- 23.10
Maximum number = 130
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 1.735660E+06
Pdbmat> Larger element = 508.956
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
267 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220085926145927.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220085926145927.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220085926145927.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1968 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 267 residues.
Blocpdb> 10 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 11
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 47
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 63
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 77
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 90
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 104
Blocpdb> 16 atoms in block 9
Block first atom: 119
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 135
Blocpdb> 16 atoms in block 11
Block first atom: 149
Blocpdb> 13 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 178
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 186
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 203
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 215
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 235
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 251
Blocpdb> 13 atoms in block 19
Block first atom: 267
Blocpdb> 11 atoms in block 20
Block first atom: 280
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 306
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 320
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 341
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 353
Blocpdb> 13 atoms in block 26
Block first atom: 365
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 378
Blocpdb> 13 atoms in block 28
Block first atom: 393
Blocpdb> 13 atoms in block 29
Block first atom: 406
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 419
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 431
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 444
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 456
Blocpdb> 8 atoms in block 34
Block first atom: 468
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 476
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 493
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 526
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 548
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 566
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 578
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 593
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 616
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 631
Blocpdb> 11 atoms in block 45
Block first atom: 650
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 661
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 678
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 693
Blocpdb> 10 atoms in block 49
Block first atom: 715
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 725
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 744
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 756
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 768
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 776
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 791
Blocpdb> 9 atoms in block 56
Block first atom: 803
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 812
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 826
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 834
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 850
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 863
Blocpdb> 10 atoms in block 62
Block first atom: 876
Blocpdb> 21 atoms in block 63
Block first atom: 886
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 907
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 922
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 944
Blocpdb> 9 atoms in block 67
Block first atom: 959
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 968
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 982
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 992
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1011
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1030
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1044
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1058
Blocpdb> 9 atoms in block 75
Block first atom: 1073
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1082
Blocpdb> 9 atoms in block 77
Block first atom: 1095
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1104
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1121
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 1141
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1149
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1164
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1179
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1191
Blocpdb> 12 atoms in block 85
Block first atom: 1209
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1221
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1238
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 1253
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 1276
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1300
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1315
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1336
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1351
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1365
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1378
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1395
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1410
Blocpdb> 21 atoms in block 98
Block first atom: 1428
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1449
Blocpdb> 14 atoms in block 100
Block first atom: 1469
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1483
Blocpdb> 9 atoms in block 102
Block first atom: 1498
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1507
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1521
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1533
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1546
Blocpdb> 14 atoms in block 107
Block first atom: 1558
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1572
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1586
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 1599
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1611
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1628
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 1647
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 1667
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1688
Blocpdb> 11 atoms in block 116
Block first atom: 1705
Blocpdb> 14 atoms in block 117
Block first atom: 1716
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1730
Blocpdb> 21 atoms in block 119
Block first atom: 1742
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1763
Blocpdb> 12 atoms in block 121
Block first atom: 1782
Blocpdb> 10 atoms in block 122
Block first atom: 1794
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 1804
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 1820
Blocpdb> 10 atoms in block 125
Block first atom: 1838
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 1848
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 1867
Blocpdb> 12 atoms in block 128
Block first atom: 1883
Blocpdb> 13 atoms in block 129
Block first atom: 1895
Blocpdb> 10 atoms in block 130
Block first atom: 1908
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1918
Blocpdb> 11 atoms in block 132
Block first atom: 1934
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 1945
Blocpdb> 11 atoms in block 134
Block first atom: 1957
Blocpdb> 134 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 792334 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5904
Prepmat> Matrix trace = 1735660.0000
Prepmat> Last element read: 5904 5904 92.3349
Prepmat> 9046 lines saved.
Prepmat> 7471 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1968
RTB> Total mass = 1968.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1968
RTB> Number of blocks = 134
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 204566.5314
RTB> 54654 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 804
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54654
Diagstd> Projected matrix trace = 204566.5314
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 804 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 204566.5314
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 8.6338138 10.6539012 12.5674395 15.6517790
17.7836684 19.3971217 19.7669165 20.9655067 21.8080332
22.4768078 25.2383012 26.4974428 26.7102406 27.6220733
29.4560250 29.6708062 31.7646380 32.5215973 33.4332158
35.3856950 38.2248591 39.3324381 39.8574117 40.6913056
42.4058798 42.7249271 44.4814584 46.1299465 47.1268086
48.0332401 48.9112103 49.5118474 50.6307041 51.2494618
52.0990864 52.7267359 53.9334586 55.2180892 55.8409913
57.3510852 58.2633495 58.9275443 60.2774626 60.6880722
63.1472828 64.0318201 64.8736137 65.6821281 66.5060719
66.7188758 68.6298260 68.7121631 69.8188970 70.7829729
72.5476402 72.8309735 74.2407658 75.3754054 75.5575241
76.1944289 76.4678740 77.7004464 78.0121065 80.5361460
81.4836335 81.8209653 83.9298556 84.0931945 84.6441475
84.8938354 86.2660947 87.4254806 87.7599560 88.7344520
89.5267962 89.9843932 91.9798539 93.2421911 93.2640852
94.0114558 94.8484395 95.9469771 96.6844384 97.0194240
98.1869302 99.6862985 100.3337325 100.5946004 101.7130518
101.8961702 102.9893028 103.6741811 104.4668607 105.3107412
106.4288139 107.0672130 107.8699748 108.3971260 108.6726708
110.1056854
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034331 0.0034338 0.0034340 0.0034347
0.0034347 319.0778219 354.4456186 384.9627269 429.6127229
457.9372341 478.2598521 482.7972010 497.2192814 507.1115825
514.8285185 545.5384180 558.9812772 561.2213455 570.7204272
589.3622980 591.5070884 612.0222839 619.2716718 627.8911420
645.9652343 671.3797332 681.0370110 685.5668774 692.7014431
707.1447466 709.7999188 724.2438049 737.5419981 745.4684976
752.6034798 759.4505224 764.0993774 772.6846124 777.3917632
783.8091590 788.5163873 797.4884754 806.9301954 811.4688256
822.3678058 828.8825645 833.5937541 843.0877154 845.9543957
862.9241317 868.9468311 874.6399804 880.0733865 885.5761850
886.9918723 899.6047280 900.1442066 907.3644754 913.6075497
924.9258675 926.7302467 935.6566353 942.7794570 943.9177205
947.8877033 949.5870607 957.2095813 959.1273666 974.5198771
980.2356056 982.2625349 994.8406401 995.8082172 999.0650076
1000.5374705 1008.5916051 1015.3465430 1017.2869628 1022.9194019
1027.4762733 1030.0987884 1041.4577064 1048.5798686 1048.7029691
1052.8964690 1057.5730501 1063.6798407 1067.7598092 1069.6079599
1076.0244046 1084.2090186 1087.7241338 1089.1372585 1095.1752556
1096.1606579 1102.0247273 1105.6828848 1109.9017913 1114.3756530
1120.2756370 1123.6305261 1127.8350028 1130.5874599 1132.0235208
1139.4628036
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1968
Rtb_to_modes> Number of blocs = 134
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.634
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 804 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001
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0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000
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0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 35424 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000
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1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002
1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220085926145927.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220085926145927.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220085926145927.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220085926145927.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 267
First residue number = 1
Last residue number = 267
Number of atoms found = 1968
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.634
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.1
Bfactors> 106 vectors, 5904 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 8.634000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.762 for 267 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.016 +/- 0.02
Bfactors> = 97.447 +/- 3.38
Bfactors> Shiftng-fct= 97.431
Bfactors> Scaling-fct= 220.453
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220085926145927 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220085926145927.eigenfacs
240220085926145927.atom
240220085926145927.10.pdb
240220085926145927.11.pdb
240220085926145927.12.pdb
240220085926145927.13.pdb
240220085926145927.14.pdb
240220085926145927.15.pdb
240220085926145927.16.pdb
240220085926145927.7.pdb
240220085926145927.8.pdb
240220085926145927.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m9.043s
user 0m9.007s
sys 0m0.036s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220085926145927.Chkmod.res: No such file or directory
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