*** 2CMZ_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220090224150099.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220090224150099.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220090224150099.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 409
First residue number = 1
Last residue number = 409
Number of atoms found = 3233
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.722255 +/- 24.783772 From: -54.781000 To: 42.625000
= -0.139408 +/- 14.762958 From: -32.094000 To: 44.438000
= -1.943584 +/- 22.293431 From: -55.688000 To: 45.750000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4115 % Filled.
Pdbmat> 1134392 non-zero elements.
Pdbmat> 124111 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.78 +/- 23.07
Maximum number = 130
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.482220E+06
Pdbmat> Larger element = 484.763
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
409 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220090224150099.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220090224150099.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220090224150099.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3233 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 409 residues.
Blocpdb> 27 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 26 atoms in block 2
Block first atom: 28
Blocpdb> 25 atoms in block 3
Block first atom: 54
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 79
Blocpdb> 31 atoms in block 5
Block first atom: 101
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 132
Blocpdb> 26 atoms in block 7
Block first atom: 154
Blocpdb> 28 atoms in block 8
Block first atom: 180
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 208
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 227
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 249
Blocpdb> 24 atoms in block 12
Block first atom: 281
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 305
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 324
Blocpdb> 24 atoms in block 15
Block first atom: 346
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 370
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 392
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 416
Blocpdb> 26 atoms in block 19
Block first atom: 438
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 464
Blocpdb> 20 atoms in block 21
Block first atom: 488
Blocpdb> 28 atoms in block 22
Block first atom: 508
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 536
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 557
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 593
Blocpdb> 29 atoms in block 26
Block first atom: 616
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 645
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 667
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 692
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 717
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 739
Blocpdb> 23 atoms in block 32
Block first atom: 763
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 786
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 811
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 833
Blocpdb> 19 atoms in block 36
Block first atom: 862
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 881
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 906
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 927
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 948
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 969
Blocpdb> 20 atoms in block 42
Block first atom: 991
Blocpdb> 23 atoms in block 43
Block first atom: 1011
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1034
Blocpdb> 25 atoms in block 45
Block first atom: 1058
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1083
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1107
Blocpdb> 30 atoms in block 48
Block first atom: 1130
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1160
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1183
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 1210
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1229
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1255
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 1276
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 1300
Blocpdb> 31 atoms in block 56
Block first atom: 1321
Blocpdb> 26 atoms in block 57
Block first atom: 1352
Blocpdb> 25 atoms in block 58
Block first atom: 1378
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 1403
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 1421
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1443
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1465
Blocpdb> 29 atoms in block 63
Block first atom: 1489
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1518
Blocpdb> 21 atoms in block 65
Block first atom: 1541
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1562
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1582
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1604
Blocpdb> 28 atoms in block 69
Block first atom: 1619
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 1647
Blocpdb> 26 atoms in block 71
Block first atom: 1678
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1704
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1719
Blocpdb> 26 atoms in block 74
Block first atom: 1739
Blocpdb> 27 atoms in block 75
Block first atom: 1765
Blocpdb> 28 atoms in block 76
Block first atom: 1792
Blocpdb> 26 atoms in block 77
Block first atom: 1820
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1846
Blocpdb> 32 atoms in block 79
Block first atom: 1863
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1895
Blocpdb> 25 atoms in block 81
Block first atom: 1917
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 1942
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1966
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 1987
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 2014
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 2036
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 2052
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 2071
Blocpdb> 20 atoms in block 89
Block first atom: 2093
Blocpdb> 21 atoms in block 90
Block first atom: 2113
Blocpdb> 25 atoms in block 91
Block first atom: 2134
Blocpdb> 24 atoms in block 92
Block first atom: 2159
Blocpdb> 27 atoms in block 93
Block first atom: 2183
Blocpdb> 26 atoms in block 94
Block first atom: 2210
Blocpdb> 23 atoms in block 95
Block first atom: 2236
Blocpdb> 30 atoms in block 96
Block first atom: 2259
Blocpdb> 23 atoms in block 97
Block first atom: 2289
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2312
Blocpdb> 23 atoms in block 99
Block first atom: 2332
Blocpdb> 20 atoms in block 100
Block first atom: 2355
Blocpdb> 22 atoms in block 101
Block first atom: 2375
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2397
Blocpdb> 24 atoms in block 103
Block first atom: 2422
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 2446
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 2464
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 2480
Blocpdb> 20 atoms in block 107
Block first atom: 2506
Blocpdb> 24 atoms in block 108
Block first atom: 2526
Blocpdb> 32 atoms in block 109
Block first atom: 2550
Blocpdb> 30 atoms in block 110
Block first atom: 2582
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 2612
Blocpdb> 21 atoms in block 112
Block first atom: 2638
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 2659
Blocpdb> 25 atoms in block 114
Block first atom: 2679
Blocpdb> 19 atoms in block 115
Block first atom: 2704
Blocpdb> 22 atoms in block 116
Block first atom: 2723
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 2745
Blocpdb> 27 atoms in block 118
Block first atom: 2763
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 2790
Blocpdb> 30 atoms in block 120
Block first atom: 2821
Blocpdb> 24 atoms in block 121
Block first atom: 2851
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 2875
Blocpdb> 21 atoms in block 123
Block first atom: 2899
Blocpdb> 19 atoms in block 124
Block first atom: 2920
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2939
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 2965
Blocpdb> 25 atoms in block 127
Block first atom: 2984
Blocpdb> 26 atoms in block 128
Block first atom: 3009
Blocpdb> 28 atoms in block 129
Block first atom: 3035
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 3063
Blocpdb> 24 atoms in block 131
Block first atom: 3081
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 3105
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3127
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 3151
Blocpdb> 27 atoms in block 135
Block first atom: 3171
Blocpdb> 26 atoms in block 136
Block first atom: 3198
Blocpdb> 10 atoms in block 137
Block first atom: 3223
Blocpdb> 137 blocks.
Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1134529 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9699
Prepmat> Matrix trace = 2482220.0000
Prepmat> Last element read: 9699 9699 51.5557
Prepmat> 9454 lines saved.
Prepmat> 8314 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3233
RTB> Total mass = 3233.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3233
RTB> Number of blocks = 137
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 159711.0483
RTB> 38949 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 822
Diagstd> Nb of non-zero elements: 38949
Diagstd> Projected matrix trace = 159711.0483
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 822 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 159711.0483
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0517049 0.0776522 0.1480130 0.2580579
0.3847333 0.5928588 1.0736093 1.4588144 1.7841745
2.3579689 2.7993496 3.2046874 3.3755221 3.8882452
4.5169520 4.5872749 5.5084836 6.1289161 7.2328535
7.4257910 8.5075367 8.7875438 9.2187255 10.7541162
11.4472858 12.9358894 13.1981529 14.3719034 15.2603277
16.2402588 16.3752763 16.6263261 17.3776842 18.3536438
18.7837049 19.5121220 19.6155816 21.4655070 21.9729859
22.3928022 23.2806246 23.7848316 24.2234566 24.6477810
25.8016579 26.1482875 26.8453920 27.7159871 28.5859090
28.8553200 29.2735407 29.6185012 30.2060358 31.4134467
32.0647600 33.0739574 33.1645269 33.6614324 34.3928773
35.3408448 36.1547201 36.5632634 36.9160604 37.9485652
38.4281592 39.0232154 39.1048903 39.9015560 39.9677907
40.1178770 40.4344603 41.2764615 41.4551756 42.7029828
42.8810266 43.0312772 44.8983374 45.1470640 45.2751265
46.6588676 46.7946537 47.2944835 48.2750707 49.0443059
49.2824163 50.0007023 50.3549542 51.1774790 51.8125950
51.9614592 52.4821705 53.6380240 53.8023672 54.3155417
54.9509605 55.3192163 55.4921563 56.5892958 56.8439103
57.8860046
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034334 0.0034339 0.0034339 0.0034340
0.0034346 24.6922812 30.2602319 41.7777673 55.1637612
67.3558234 83.6124426 112.5170686 131.1581572 145.0487354
166.7494135 181.6869970 194.3963539 199.5104999 214.1273314
230.7905468 232.5801587 254.8656518 268.8358109 292.0452292
295.9147694 316.7358300 321.9059696 329.7089392 356.1087481
367.4062523 390.5650945 394.5044063 411.6730389 424.2063935
437.6145497 439.4298940 442.7855379 452.6799197 465.2179145
470.6368289 479.6754939 480.9455101 503.1133670 509.0258281
513.8655484 523.9533167 529.5967620 534.4576991 539.1184487
551.5934325 555.2862325 562.6394177 571.6898152 580.5923164
583.3218271 587.5338701 590.9854911 596.8183212 608.6296077
614.9067733 624.5085109 625.3630020 630.0305029 636.8388292
645.5557351 652.9467760 656.6255167 659.7857847 668.9489256
673.1627424 678.3546492 679.0641701 685.9464240 686.5155066
687.8032938 690.5118016 697.6643158 699.1730177 709.6176127
711.0953967 712.3401090 727.6296875 729.6423549 730.6764605
741.7582367 742.8367803 746.7934904 754.4956487 760.4831160
762.3269563 767.8622768 770.5776048 776.8456255 781.6511159
782.7732023 786.6855523 795.3012506 796.5186931 800.3083314
804.9759851 807.6687687 808.9302586 816.8878283 818.7234937
826.1940587
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3233
Rtb_to_modes> Number of blocs = 137
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1705E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7652E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2581
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3847
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5929
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.074
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.459
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.784
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.799
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.376
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.888
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.517
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.788
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.219
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.89
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 822 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00003 0.99999 0.99998 1.00004 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 0.99997
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00004 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00003 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 58194 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00003 0.99999 0.99998 1.00004 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 0.99997
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00004 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00003 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220090224150099.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220090224150099.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220090224150099.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220090224150099.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 409
First residue number = 1
Last residue number = 409
Number of atoms found = 3233
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1705E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7652E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3847
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.074
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.459
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.784
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.799
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.888
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.517
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.219
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.89
Bfactors> 106 vectors, 9699 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.051705
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.006 for 409 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.248 +/- 0.22
Bfactors> = 80.934 +/- 13.18
Bfactors> Shiftng-fct= 80.687
Bfactors> Scaling-fct= 60.351
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220090224150099 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220090224150099.eigenfacs
240220090224150099.atom
240220090224150099.10.pdb
240220090224150099.11.pdb
240220090224150099.12.pdb
240220090224150099.13.pdb
240220090224150099.14.pdb
240220090224150099.15.pdb
240220090224150099.16.pdb
240220090224150099.7.pdb
240220090224150099.8.pdb
240220090224150099.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.636s
user 0m11.569s
sys 0m0.048s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220090224150099.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
