*** 1Z7H_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240220091409163486.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240220091409163486.atom to be opened.
Openam> File opened: 240220091409163486.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 1
Last residue number = 426
Number of atoms found = 3453
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.988902 +/- 12.803843 From: -35.469000 To: 29.453000
= -2.466899 +/- 13.173543 From: -37.531000 To: 32.219000
= -0.671162 +/- 12.355978 From: -33.281000 To: 30.281000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4699 % Filled.
Pdbmat> 1325346 non-zero elements.
Pdbmat> 145117 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.05 +/- 24.16
Maximum number = 128
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.902340E+06
Pdbmat> Larger element = 497.091
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
426 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240220091409163486.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240220091409163486.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240220091409163486.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3453 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 426 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 34 atoms in block 3
Block first atom: 47
Blocpdb> 21 atoms in block 4
Block first atom: 81
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 102
Blocpdb> 23 atoms in block 6
Block first atom: 125
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 148
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 172
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 195
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 222
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 242
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 274
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 299
Blocpdb> 27 atoms in block 14
Block first atom: 323
Blocpdb> 29 atoms in block 15
Block first atom: 350
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 379
Blocpdb> 32 atoms in block 17
Block first atom: 406
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 438
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 458
Blocpdb> 26 atoms in block 20
Block first atom: 482
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 508
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 527
Blocpdb> 15 atoms in block 23
Block first atom: 552
Blocpdb> 33 atoms in block 24
Block first atom: 567
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 600
Blocpdb> 31 atoms in block 26
Block first atom: 623
Blocpdb> 21 atoms in block 27
Block first atom: 654
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 675
Blocpdb> 30 atoms in block 29
Block first atom: 700
Blocpdb> 24 atoms in block 30
Block first atom: 730
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 754
Blocpdb> 30 atoms in block 32
Block first atom: 778
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 808
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 833
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 853
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 871
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 895
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 920
Blocpdb> 27 atoms in block 39
Block first atom: 941
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 968
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 986
Blocpdb> 25 atoms in block 42
Block first atom: 1012
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1037
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 1063
Blocpdb> 19 atoms in block 45
Block first atom: 1085
Blocpdb> 27 atoms in block 46
Block first atom: 1104
Blocpdb> 26 atoms in block 47
Block first atom: 1131
Blocpdb> 21 atoms in block 48
Block first atom: 1157
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 1178
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 1194
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 1216
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1237
Blocpdb> 27 atoms in block 53
Block first atom: 1260
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 1287
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1302
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1324
Blocpdb> 27 atoms in block 57
Block first atom: 1349
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 1376
Blocpdb> 26 atoms in block 59
Block first atom: 1395
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1421
Blocpdb> 31 atoms in block 61
Block first atom: 1446
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1477
Blocpdb> 23 atoms in block 63
Block first atom: 1501
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 1524
Blocpdb> 25 atoms in block 65
Block first atom: 1542
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1567
Blocpdb> 28 atoms in block 67
Block first atom: 1589
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1617
Blocpdb> 27 atoms in block 69
Block first atom: 1638
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1665
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1689
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1712
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 1733
Blocpdb> 27 atoms in block 74
Block first atom: 1754
Blocpdb> 28 atoms in block 75
Block first atom: 1781
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1809
Blocpdb> 24 atoms in block 77
Block first atom: 1829
Blocpdb> 27 atoms in block 78
Block first atom: 1853
Blocpdb> 25 atoms in block 79
Block first atom: 1880
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1905
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1927
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 1951
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1975
Blocpdb> 25 atoms in block 84
Block first atom: 1997
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 2022
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2044
Blocpdb> 29 atoms in block 87
Block first atom: 2070
Blocpdb> 29 atoms in block 88
Block first atom: 2099
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 2128
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 2149
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2172
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 2198
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2217
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2239
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2263
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2285
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2310
Blocpdb> 25 atoms in block 98
Block first atom: 2338
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 2363
Blocpdb> 26 atoms in block 100
Block first atom: 2387
Blocpdb> 21 atoms in block 101
Block first atom: 2413
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 2434
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2457
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2480
Blocpdb> 23 atoms in block 105
Block first atom: 2500
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 2523
Blocpdb> 26 atoms in block 107
Block first atom: 2547
Blocpdb> 26 atoms in block 108
Block first atom: 2573
Blocpdb> 30 atoms in block 109
Block first atom: 2599
Blocpdb> 30 atoms in block 110
Block first atom: 2629
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 2659
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2687
Blocpdb> 25 atoms in block 113
Block first atom: 2709
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2734
Blocpdb> 26 atoms in block 115
Block first atom: 2757
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 2783
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 2811
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2839
Blocpdb> 27 atoms in block 119
Block first atom: 2861
Blocpdb> 23 atoms in block 120
Block first atom: 2888
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 2911
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 2932
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 2961
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 2986
Blocpdb> 29 atoms in block 125
Block first atom: 3012
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 3041
Blocpdb> 25 atoms in block 127
Block first atom: 3063
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3088
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 3112
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 3135
Blocpdb> 27 atoms in block 131
Block first atom: 3159
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 3186
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3209
Blocpdb> 25 atoms in block 134
Block first atom: 3233
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 3258
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 3281
Blocpdb> 30 atoms in block 137
Block first atom: 3304
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 3334
Blocpdb> 26 atoms in block 139
Block first atom: 3355
Blocpdb> 23 atoms in block 140
Block first atom: 3381
Blocpdb> 27 atoms in block 141
Block first atom: 3404
Blocpdb> 23 atoms in block 142
Block first atom: 3430
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1325488 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10359
Prepmat> Matrix trace = 2902340.0000
Prepmat> Last element read: 10359 10359 41.6231
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8734 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3453
RTB> Total mass = 3453.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3453
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 186443.5080
RTB> 48954 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 48954
Diagstd> Projected matrix trace = 186443.5080
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 186443.5080
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.2121859 2.3948036 3.2598964 3.9544372
4.2467569 4.5630272 5.3697885 5.9201284 6.5637281
6.8926229 8.0587899 8.5709579 9.3755630 11.0252977
11.3159173 11.8428120 12.2033848 12.7341385 13.2600176
13.7355653 15.5276679 15.6671393 15.9252624 17.2474594
18.2457628 18.4262841 18.8875229 19.5251879 19.9958443
20.8036723 20.9803313 21.5532413 22.0180034 22.5427518
23.6323148 24.1111948 24.5194892 25.7423745 26.4286431
27.1652183 28.5671622 28.8905008 29.6878368 30.4023119
32.0167802 32.5617935 32.9454097 33.2182078 33.8214392
34.0575250 34.9805416 35.7114369 36.4699580 36.6358410
37.3954141 37.6639859 38.1617470 38.6516566 39.7714494
41.2495576 42.4236923 42.9290905 43.3752882 44.3512848
45.0468782 45.4633789 45.9940063 47.7571981 48.1000727
48.2490018 49.1555340 49.6908992 51.0119444 51.3068417
51.3725626 52.3817382 52.7839285 54.0709601 54.9231604
55.2504947 55.7509497 55.9959609 57.2924800 57.7390159
58.1754680 58.4558163 59.0003804 59.8802456 60.2036478
60.9659017 61.8766687 62.6261292 62.9483502 63.7833413
64.1490895 64.4158880 65.1944906 66.0476401 66.3646216
66.9507681
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034336 0.0034341 0.0034342 0.0034343 0.0034347
0.0034349 161.5124803 168.0467948 196.0636924 215.9422494
223.7813965 231.9646522 251.6366350 264.2170534 278.2086140
285.0936471 308.2692431 317.9142251 332.5017670 360.5707083
365.2920017 373.6996564 379.3459330 387.5074570 395.4279200
402.4561320 427.9060206 429.8234767 433.3497780 450.9805857
463.8486454 466.1376283 471.9356469 479.8360696 485.5848777
495.2965268 497.3950408 504.1404855 509.5469986 515.5831853
527.8960488 533.2178091 537.7135611 550.9593815 558.2551179
565.9810359 580.4019070 583.6773158 591.6768225 598.7542176
614.4465461 619.6542595 623.2936987 625.8689111 631.5261263
633.7264334 642.2565544 648.9316294 655.7871645 657.2768905
664.0556157 666.4359546 670.8252550 675.1174542 684.8271809
697.4369103 707.2932483 711.4938070 715.1818211 723.1832907
728.8323317 732.1939487 736.4544663 750.4377966 753.1268768
754.2919046 761.3449816 765.4797529 775.5882469 777.8268327
778.3248477 785.9324725 788.9439229 798.5044133 804.7723374
807.1669404 810.8143290 812.5940367 821.9475234 825.1444236
828.2572061 830.2504982 834.1087675 840.3052304 842.5713418
847.8885703 854.1983777 859.3559039 861.5638265 867.2591951
869.7421720 871.5489408 876.8003778 882.5187325 884.6339279
888.5319771
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3453
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.95
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
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1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
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1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
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1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 62154 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
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1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002
1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99996
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240220091409163486.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240220091409163486.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240220091409163486.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240220091409163486.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 1
Last residue number = 426
Number of atoms found = 3453
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.212
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.954
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.247
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.563
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.95
Bfactors> 106 vectors, 10359 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.212000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.568 for 426 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.024 +/- 0.04
Bfactors> = 91.267 +/- 10.38
Bfactors> Shiftng-fct= 91.243
Bfactors> Scaling-fct= 267.267
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240220091409163486 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240220091409163486.eigenfacs
240220091409163486.atom
240220091409163486.10.pdb
240220091409163486.11.pdb
240220091409163486.12.pdb
240220091409163486.13.pdb
240220091409163486.14.pdb
240220091409163486.15.pdb
240220091409163486.16.pdb
240220091409163486.7.pdb
240220091409163486.8.pdb
240220091409163486.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.123s
user 0m13.063s
sys 0m0.060s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240220091409163486.Chkmod.res: No such file or directory
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