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***  1DQZ_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000  ***

LOGs for ID: 240220092131172147

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 240220092131172147.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 240220092131172147.atom to be opened. Openam> File opened: 240220092131172147.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2180 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.154134 +/- 10.351494 From: -27.578000 To: 25.094000 = -0.418333 +/- 10.404475 From: -23.016000 To: 23.594000 = -2.040993 +/- 9.346330 From: -26.609000 To: 18.844000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.0433 % Filled. Pdbmat> 864815 non-zero elements. Pdbmat> 94730 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.91 +/- 23.83 Maximum number = 140 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.894600E+06 Pdbmat> Larger element = 495.406 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 280 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 240220092131172147.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 240220092131172147.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 240220092131172147.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2180 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 280 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 45 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 83 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 97 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 108 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 122 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 137 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 153 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 169 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 189 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 202 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 210 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 227 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 239 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 259 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 275 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 287 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 303 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 320 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 340 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 352 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 374 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 390 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 404 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 420 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 462 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 477 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 489 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 502 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 532 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 540 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 555 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 572 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 591 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 613 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 634 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 647 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 662 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 691 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 710 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 731 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 754 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 772 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 787 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 807 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 822 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 871 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 884 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 897 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 911 Blocpdb> 10 atoms in block 59 Block first atom: 923 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 933 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 944 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 958 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 972 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 980 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 991 Blocpdb> 13 atoms in block 66 Block first atom: 1007 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1020 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1037 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1056 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1074 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1092 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1109 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1120 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1134 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1149 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1165 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1178 Blocpdb> 28 atoms in block 78 Block first atom: 1193 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1221 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1235 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1251 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1263 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1276 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1292 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1302 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1318 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1331 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1345 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 1367 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1378 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1390 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 1405 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1424 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1444 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1460 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1475 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1491 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1506 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1525 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1537 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1553 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1571 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1593 Blocpdb> 10 atoms in block 104 Block first atom: 1612 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1622 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1634 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1648 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1662 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1674 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1686 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1702 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 1714 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1734 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 1751 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1763 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1778 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1796 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1813 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1831 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1850 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 1869 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1879 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1891 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1906 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1918 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1936 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 1955 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 1969 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1981 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 1998 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2018 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2037 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2059 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2077 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 2092 Blocpdb> 14 atoms in block 136 Block first atom: 2105 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2119 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2135 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2154 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 2168 Blocpdb> 140 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 864955 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6540 Prepmat> Matrix trace = 1894600.0000 Prepmat> Last element read: 6540 6540 142.4604 Prepmat> 9871 lines saved. Prepmat> 8232 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2180 RTB> Total mass = 2180.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2180 RTB> Number of blocks = 140 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 209844.9734 RTB> 56868 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 840 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56868 Diagstd> Projected matrix trace = 209844.9734 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 840 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 209844.9734 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.7023264 5.6117818 6.9463678 9.0979320 9.4759704 10.5097080 11.7916929 12.6134507 14.7214935 15.8751027 17.7282901 18.8623718 19.3388691 19.4743598 21.4098904 22.6094188 24.1573683 24.2106078 25.3581240 25.8808158 27.0535937 27.8201281 28.4493550 29.1685909 31.4390248 32.0345270 32.9522004 33.8192481 34.5453932 35.4111895 36.6775887 38.1445801 38.3750801 39.9165686 40.3762948 40.9941457 41.7019060 43.5644224 44.1165176 44.9025733 45.8931014 47.4318941 47.8282975 48.8161290 49.1400792 49.4607775 51.4423952 52.7292492 53.6799442 54.7700961 55.1843927 55.7061671 57.0118661 57.5510743 59.1703091 59.4681137 60.8972750 61.3331699 61.7225351 63.1916594 63.4628128 64.1986964 65.2267474 66.4755529 67.0227556 67.6654480 68.1065855 68.6140990 69.6820856 70.6325919 70.9091957 71.7198383 72.3552800 73.7514685 74.8938144 75.6560512 76.0819821 77.3871070 78.0944141 79.3929510 80.0247255 80.8832852 81.4944053 82.5189265 83.0897273 83.5680967 83.8962541 85.6019634 85.8196719 86.2987650 87.5245075 87.7950915 88.6059776 89.7435219 90.7922448 91.1565780 92.7048167 93.2120313 93.5704201 94.6901842 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034334 0.0034336 0.0034342 0.0034351 0.0034353 208.9453126 257.2442452 286.2029899 327.5417186 334.2774872 352.0388591 372.8922533 385.6667850 416.6498370 432.6667811 457.2236693 471.6213218 477.5411682 479.2111067 502.4611667 516.3450037 533.7281271 534.3159346 546.8318991 552.4389118 564.8170030 572.7628521 579.2039197 586.4797275 608.8773420 614.6168155 623.3579319 631.5056697 638.2493051 646.1978937 657.6512779 670.6743538 672.6976767 686.0754520 690.0149682 695.2743384 701.2505786 716.7393700 721.2667166 727.6640098 735.6461798 747.8775802 750.9962029 758.7119937 761.2252868 763.7052036 778.8536706 788.5351800 795.6119693 803.6501528 806.6839458 810.4886161 819.9321366 823.8003984 835.3090741 837.4084943 847.4112205 850.4386432 853.1338185 863.2272875 865.0773451 870.0783954 877.0172622 885.3729706 889.0095373 893.2617981 896.1688294 899.5016465 906.4750409 912.6365376 914.4217764 919.6338132 923.6988324 932.5682303 939.7628123 944.5329553 947.1880045 955.2775818 959.6332026 967.5785960 971.4207517 976.6178808 980.3003950 986.4431581 989.8489965 992.6943171 994.6414765 1004.7017142 1005.9785142 1008.7825716 1015.9214223 1017.4905824 1022.1786153 1028.7191743 1034.7124086 1036.7863888 1045.5539087 1048.4102698 1050.4238403 1056.6903977 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2180 Rtb_to_modes> Number of blocs = 140 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00003 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99996 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240220092131172147.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240220092131172147.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 240220092131172147.atom Openam> file on opening on unit 11: 240220092131172147.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2180 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.82 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.69 Bfactors> 106 vectors, 6540 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.702000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.490 for 280 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.03 Bfactors> = 94.368 +/- 9.16 Bfactors> Shiftng-fct= 94.349 Bfactors> Scaling-fct= 323.411 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 240220092131172147 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240220092131172147.eigenfacs 240220092131172147.atom 240220092131172147.10.pdb 240220092131172147.11.pdb 240220092131172147.12.pdb 240220092131172147.13.pdb 240220092131172147.14.pdb 240220092131172147.15.pdb 240220092131172147.16.pdb 240220092131172147.7.pdb 240220092131172147.8.pdb 240220092131172147.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m10.013s user 0m9.976s sys 0m0.036s ../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory cat: 240220092131172147.Chkmod.res: No such file or directory




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