*** 1R88 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240221152813312596.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240221152813312596.atom to be opened.
Openam> File opened: 240221152813312596.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 267
First residue number = 1
Last residue number = 267
Number of atoms found = 1968
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 26.914614 +/- 9.229689 From: 6.437000 To: 49.291000
= 31.818428 +/- 9.875686 From: 8.059000 To: 55.290000
= 28.538029 +/- 9.600790 From: 2.549000 To: 51.917000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.5198 % Filled.
Pdbmat> 787870 non-zero elements.
Pdbmat> 86243 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 87.65 +/- 23.00
Maximum number = 130
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.724860E+06
Pdbmat> Larger element = 484.289
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
267 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240221152813312596.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240221152813312596.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240221152813312596.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1968 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 267 residues.
Blocpdb> 10 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 11
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 47
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 63
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 77
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 90
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 104
Blocpdb> 16 atoms in block 9
Block first atom: 119
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 135
Blocpdb> 16 atoms in block 11
Block first atom: 149
Blocpdb> 13 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 178
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 186
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 203
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 215
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 235
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 251
Blocpdb> 13 atoms in block 19
Block first atom: 267
Blocpdb> 11 atoms in block 20
Block first atom: 280
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 306
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 320
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 341
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 353
Blocpdb> 13 atoms in block 26
Block first atom: 365
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 378
Blocpdb> 13 atoms in block 28
Block first atom: 393
Blocpdb> 13 atoms in block 29
Block first atom: 406
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 419
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 431
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 444
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 456
Blocpdb> 8 atoms in block 34
Block first atom: 468
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 476
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 493
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 526
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 548
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 566
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 578
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 593
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 616
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 631
Blocpdb> 11 atoms in block 45
Block first atom: 650
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 661
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 678
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 693
Blocpdb> 10 atoms in block 49
Block first atom: 715
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 725
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 744
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 756
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 768
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 776
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 791
Blocpdb> 9 atoms in block 56
Block first atom: 803
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 812
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 826
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 834
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 850
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 863
Blocpdb> 10 atoms in block 62
Block first atom: 876
Blocpdb> 21 atoms in block 63
Block first atom: 886
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 907
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 922
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 944
Blocpdb> 9 atoms in block 67
Block first atom: 959
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 968
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 982
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 992
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1011
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1030
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1044
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1058
Blocpdb> 9 atoms in block 75
Block first atom: 1073
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1082
Blocpdb> 9 atoms in block 77
Block first atom: 1095
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1104
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1121
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 1141
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1149
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1164
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1179
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1191
Blocpdb> 12 atoms in block 85
Block first atom: 1209
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1221
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1238
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 1253
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 1276
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1300
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1315
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1336
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1351
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1365
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1378
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1395
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1410
Blocpdb> 21 atoms in block 98
Block first atom: 1428
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1449
Blocpdb> 14 atoms in block 100
Block first atom: 1469
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1483
Blocpdb> 9 atoms in block 102
Block first atom: 1498
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1507
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1521
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1533
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1546
Blocpdb> 14 atoms in block 107
Block first atom: 1558
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1572
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1586
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 1599
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1611
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1628
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 1647
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 1667
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1688
Blocpdb> 11 atoms in block 116
Block first atom: 1705
Blocpdb> 14 atoms in block 117
Block first atom: 1716
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1730
Blocpdb> 21 atoms in block 119
Block first atom: 1742
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1763
Blocpdb> 12 atoms in block 121
Block first atom: 1782
Blocpdb> 10 atoms in block 122
Block first atom: 1794
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 1804
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 1820
Blocpdb> 10 atoms in block 125
Block first atom: 1838
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 1848
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 1867
Blocpdb> 12 atoms in block 128
Block first atom: 1883
Blocpdb> 13 atoms in block 129
Block first atom: 1895
Blocpdb> 10 atoms in block 130
Block first atom: 1908
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1918
Blocpdb> 11 atoms in block 132
Block first atom: 1934
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 1945
Blocpdb> 11 atoms in block 134
Block first atom: 1957
Blocpdb> 134 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 788004 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5904
Prepmat> Matrix trace = 1724860.0000
Prepmat> Last element read: 5904 5904 125.4115
Prepmat> 9046 lines saved.
Prepmat> 7478 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1968
RTB> Total mass = 1968.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1968
RTB> Number of blocks = 134
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 203010.7054
RTB> 54402 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 804
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54402
Diagstd> Projected matrix trace = 203010.7054
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 804 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 203010.7054
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 7.4609459 9.8198109 10.6095171 12.6141185
15.9073168 17.8397952 19.1160219 20.2617150 21.1364824
22.1827445 24.9213270 26.1404067 26.7346386 27.6111457
28.9511550 29.5006127 29.9093249 30.4961307 32.6584473
33.3006734 35.2101605 38.3891245 40.2015881 40.5403404
41.9716073 42.7697148 44.9944025 45.9876211 46.2455091
47.4930184 47.6959009 48.4472787 48.9109046 50.3325752
50.6615480 51.3944969 52.4972562 53.1891473 54.8489548
56.1620126 56.6274825 58.3918513 59.4232537 59.9752476
60.8804517 63.0935009 64.0514363 64.6048237 65.2903542
66.7199492 67.3196726 67.6401038 68.6839239 69.1899300
70.3371417 71.3400471 72.5827301 72.7537955 73.0470606
74.9550295 75.2919189 76.5082244 77.2578518 77.9327253
78.0507414 78.7348123 80.5723925 81.1669014 82.8568950
83.2905138 83.8954417 84.3076197 85.5830537 85.9778647
87.3537549 87.7786226 88.4200492 89.4167871 90.7734736
91.1941399 92.3445233 93.6999774 94.6416134 95.2685594
95.8880277 96.2592235 98.4266580 98.8618580 100.0619569
100.7554875 101.1422481 102.3898537 103.4098549 103.5218647
104.5258848 105.4120247 105.9334022 106.6324481 107.4614759
107.8537734
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034338 0.0034342 0.0034343 0.0034344 0.0034347
0.0034350 296.6143962 340.2881638 353.7065391 385.6769944
433.1055460 458.6593087 474.7817753 488.8024581 499.2425997
511.4496894 542.1018155 555.2025476 561.4776053 570.6075245
584.2896959 589.8081893 593.8798437 599.6773566 620.5732432
626.6453021 644.3610529 672.8207610 688.5205155 691.4152847
703.5145446 710.1718564 728.4076941 736.4033446 738.4652488
748.3593106 749.9560425 755.8401785 759.4481490 770.4063538
772.9199343 778.4909884 786.7986080 791.9664688 804.2284982
813.7979879 817.1634013 829.7961252 837.0925838 840.9715523
847.2941605 862.5565816 869.0799222 872.8261579 877.4447756
886.9990074 890.9765582 893.0944962 899.9592177 903.2682105
910.7257961 917.1956282 925.1495246 926.2390947 928.1040178
940.1467955 942.2571964 949.8375660 954.4794760 958.6392623
959.3648375 963.5598126 974.7391507 978.3286313 988.4611563
991.0442608 994.6366612 997.0769903 1004.5907371 1006.9052561
1014.9299517 1017.3951454 1021.1055963 1026.8448059 1034.6054399
1036.9999756 1043.5201803 1051.1507956 1056.4193512 1059.9126595
1063.3530306 1065.4092360 1077.3371845 1079.7163164 1086.2499673
1090.0078725 1092.0979242 1098.8128800 1104.2724685 1104.8703610
1110.2152957 1114.9114045 1117.6652304 1121.3468572 1125.6974459
1127.7503027
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1968
Rtb_to_modes> Number of blocs = 134
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.461
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.820
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 804 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999
1.00004 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 35424 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999
1.00004 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240221152813312596.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240221152813312596.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240221152813312596.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240221152813312596.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 267
First residue number = 1
Last residue number = 267
Number of atoms found = 1968
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.461
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9
Bfactors> 106 vectors, 5904 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.461000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.383 for 267 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.017 +/- 0.03
Bfactors> = 20.787 +/- 4.54
Bfactors> Shiftng-fct= 20.770
Bfactors> Scaling-fct= 156.647
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152813312596 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152813312596.eigenfacs
240221152813312596.atom
240221152813312596.10.pdb
240221152813312596.11.pdb
240221152813312596.12.pdb
240221152813312596.13.pdb
240221152813312596.14.pdb
240221152813312596.15.pdb
240221152813312596.16.pdb
240221152813312596.7.pdb
240221152813312596.8.pdb
240221152813312596.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.717s
user 0m8.684s
sys 0m0.032s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240221152813312596.Chkmod.res: No such file or directory
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
