*** 1Z7H ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240221152914312729.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240221152914312729.atom to be opened.
Openam> File opened: 240221152914312729.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 400
Number of atoms found = 3237
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 28.702676 +/- 11.795507 From: -1.678000 To: 56.211000
= 24.631217 +/- 11.653466 From: -2.330000 To: 50.410000
= 41.552015 +/- 14.163204 From: 0.000000 To: 81.595000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.5737 % Filled.
Pdbmat> 1213658 non-zero elements.
Pdbmat> 132711 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.00 +/- 24.05
Maximum number = 130
Minimum number = 0
Pdbmat> Matrix trace = 2.654220E+06
Pdbmat> Larger element = 514.047
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
400 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240221152914312729.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240221152914312729.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240221152914312729.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3237 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 400 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 34 atoms in block 3
Block first atom: 47
Blocpdb> 21 atoms in block 4
Block first atom: 81
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 102
Blocpdb> 23 atoms in block 6
Block first atom: 125
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 148
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 172
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 195
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 222
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 242
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 274
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 299
Blocpdb> 27 atoms in block 14
Block first atom: 323
Blocpdb> 29 atoms in block 15
Block first atom: 350
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 379
Blocpdb> 32 atoms in block 17
Block first atom: 406
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 438
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 458
Blocpdb> 26 atoms in block 20
Block first atom: 482
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 508
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 527
Blocpdb> 15 atoms in block 23
Block first atom: 552
Blocpdb> 33 atoms in block 24
Block first atom: 567
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 600
Blocpdb> 31 atoms in block 26
Block first atom: 623
Blocpdb> 21 atoms in block 27
Block first atom: 654
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 675
Blocpdb> 30 atoms in block 29
Block first atom: 700
Blocpdb> 24 atoms in block 30
Block first atom: 730
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 754
Blocpdb> 30 atoms in block 32
Block first atom: 778
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 808
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 833
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 853
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 871
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 895
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 920
Blocpdb> 27 atoms in block 39
Block first atom: 941
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 968
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 986
Blocpdb> 25 atoms in block 42
Block first atom: 1012
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1037
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 1063
Blocpdb> 19 atoms in block 45
Block first atom: 1085
Blocpdb> 27 atoms in block 46
Block first atom: 1104
Blocpdb> 26 atoms in block 47
Block first atom: 1131
Blocpdb> 21 atoms in block 48
Block first atom: 1157
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 1178
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 1194
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 1216
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1237
Blocpdb> 27 atoms in block 53
Block first atom: 1260
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 1287
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1302
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1324
Blocpdb> 27 atoms in block 57
Block first atom: 1349
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 1376
Blocpdb> 26 atoms in block 59
Block first atom: 1395
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1421
Blocpdb> 31 atoms in block 61
Block first atom: 1446
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1477
Blocpdb> 23 atoms in block 63
Block first atom: 1501
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 1524
Blocpdb> 25 atoms in block 65
Block first atom: 1542
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1567
Blocpdb> 28 atoms in block 67
Block first atom: 1589
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1617
Blocpdb> 27 atoms in block 69
Block first atom: 1638
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1665
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1689
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1712
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 1733
Blocpdb> 27 atoms in block 74
Block first atom: 1754
Blocpdb> 28 atoms in block 75
Block first atom: 1781
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1809
Blocpdb> 24 atoms in block 77
Block first atom: 1829
Blocpdb> 27 atoms in block 78
Block first atom: 1853
Blocpdb> 25 atoms in block 79
Block first atom: 1880
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1905
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1927
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 1951
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1975
Blocpdb> 25 atoms in block 84
Block first atom: 1997
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 2022
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2044
Blocpdb> 29 atoms in block 87
Block first atom: 2070
Blocpdb> 29 atoms in block 88
Block first atom: 2099
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 2128
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 2149
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2172
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 2198
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2217
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2239
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2263
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2285
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2310
Blocpdb> 25 atoms in block 98
Block first atom: 2338
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 2363
Blocpdb> 26 atoms in block 100
Block first atom: 2387
Blocpdb> 21 atoms in block 101
Block first atom: 2413
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 2434
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2457
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2480
Blocpdb> 23 atoms in block 105
Block first atom: 2500
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 2523
Blocpdb> 26 atoms in block 107
Block first atom: 2547
Blocpdb> 26 atoms in block 108
Block first atom: 2573
Blocpdb> 30 atoms in block 109
Block first atom: 2599
Blocpdb> 30 atoms in block 110
Block first atom: 2629
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 2659
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2687
Blocpdb> 25 atoms in block 113
Block first atom: 2709
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2734
Blocpdb> 26 atoms in block 115
Block first atom: 2757
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 2783
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 2811
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2839
Blocpdb> 27 atoms in block 119
Block first atom: 2861
Blocpdb> 23 atoms in block 120
Block first atom: 2888
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 2911
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 2932
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 2961
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 2986
Blocpdb> 29 atoms in block 125
Block first atom: 3012
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 3041
Blocpdb> 25 atoms in block 127
Block first atom: 3063
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3088
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 3112
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 3135
Blocpdb> 27 atoms in block 131
Block first atom: 3159
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 3186
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3209
Blocpdb> 5 atoms in block 134
Block first atom: 3232
Blocpdb> 134 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1213792 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9711
Prepmat> Matrix trace = 2654220.0000
Prepmat> Last element read: 9711 9711 0.0000
Prepmat> 9046 lines saved.
Prepmat> 7756 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3237
RTB> Total mass = 3237.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3237
RTB> Number of blocks = 134
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 169725.7946
RTB> 44394 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 804
Diagstd> Nb of non-zero elements: 44394
Diagstd> Projected matrix trace = 169725.7946
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 804 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 169725.7946
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0325682 0.3635954 1.6069288 1.9390028
2.5502448 3.0160792 3.2066693 3.4593447 3.9673372
5.0365215 5.3733986 5.8905497 6.5347415 7.3253663
7.8681326 8.5054201 9.0153649 10.1292741 10.3729078
10.8709532 12.0768498 12.5352752 13.0611783 15.0857958
15.5716360 16.2528102 16.4411655 16.7717053 17.5677648
17.8117780 18.2474394 19.2719444 19.7488951 20.0093994
20.3025667 21.0483836 21.2802162 21.9204355 22.5669394
23.4167630 24.1441739 24.7229581 26.5430070 27.6212094
28.4450875 28.9848220 29.2137372 29.2347054 30.2897378
30.8692265 32.1213435 32.6771040 33.2661828 33.6979477
33.9766455 35.2060001 35.8927382 36.2507362 36.6396355
36.8451764 36.9992836 37.9812626 38.4060741 39.6402051
40.1387470 40.3244931 41.4783594 42.4734542 43.0983010
43.8566292 45.2025063 45.8356579 46.4094605 47.3865694
48.3235133 48.4754651 49.0319874 49.6820604 50.2868856
50.5545614 51.1316337 52.5002606 52.6117203 52.9565309
53.9658448 54.6625121 54.8639425 55.2536283 56.4232886
57.2938558 57.9556522 58.7410300 59.0872435 59.4847082
60.3139536 60.7835851 61.1034483 61.5130623 62.8597565
63.4942749
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034334 0.0034337 0.0034339 0.0034345
0.0034348 19.5971150 65.4793643 137.6555091 151.2113861
173.4148216 188.5891270 194.4564554 201.9724799 216.2941813
243.7028610 251.7212088 263.5561737 277.5936239 293.9070165
304.6008539 316.6964280 326.0520504 345.6085212 349.7401874
358.0379766 377.3741191 384.4697859 392.4519215 421.7735995
428.5114216 437.7836241 440.3130742 444.7171637 455.1489388
458.2990073 463.8699568 476.7141549 482.5770696 485.7494377
489.2949727 498.2010695 500.9372164 508.4167725 515.8597123
525.4830481 533.5823499 539.9399931 559.4616742 570.7115025
579.1604776 584.6293293 586.9334210 587.1440188 597.6446519
603.3344918 615.4490863 620.7504751 626.3206999 630.3721335
632.9735024 644.3229839 650.5768057 653.8132167 657.3109281
659.1520398 660.5290731 669.2370543 672.9692773 683.6962955
687.9821743 689.5721901 699.3684963 707.7079447 712.8946496
719.1391040 730.0902320 735.1856386 739.7731082 747.5201680
754.8741111 756.0600186 760.3876044 765.4116699 770.0566047
772.1033805 776.4975944 786.8211216 787.6559017 790.2327859
797.7278798 802.8604669 804.3383697 807.1898296 815.6887600
821.9573925 826.6909416 832.2734854 834.7225486 837.5253247
843.3428730 846.6198293 848.8445025 851.6849134 860.9573290
865.2917523
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3237
Rtb_to_modes> Number of blocs = 134
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2568E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3636
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.607
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.939
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.49
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 804 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
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1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 58266 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00005 0.99998 1.00002 0.99999
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0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
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0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
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1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240221152914312729.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240221152914312729.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240221152914312729.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240221152914312729.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 400
Number of atoms found = 3237
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2568E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.607
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.016
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.459
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.037
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.373
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.891
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.015
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.49
Bfactors> 106 vectors, 9711 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.032568
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.536 for 400 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.032 +/- 0.06
Bfactors> = 34.917 +/- 24.93
Bfactors> Shiftng-fct= 34.885
Bfactors> Scaling-fct= 393.893
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240221152914312729 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240221152914312729.eigenfacs
240221152914312729.atom
240221152914312729.10.pdb
240221152914312729.11.pdb
240221152914312729.12.pdb
240221152914312729.13.pdb
240221152914312729.14.pdb
240221152914312729.15.pdb
240221152914312729.16.pdb
240221152914312729.7.pdb
240221152914312729.8.pdb
240221152914312729.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.635s
user 0m11.541s
sys 0m0.072s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240221152914312729.Chkmod.res: No such file or directory
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