CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  2V7Y  ***

LOGs for ID: 240228055913921343

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 240228055913921343.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 240228055913921343.atom to be opened. Openam> File opened: 240228055913921343.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 428 First residue number = 1 Last residue number = 428 Number of atoms found = 3237 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.493254 +/- 11.881537 From: -48.234000 To: 13.809000 = 17.061312 +/- 9.248150 From: -6.606000 To: 42.851000 = -48.081220 +/- 29.360217 From: -99.890000 To: 25.002000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.4044 % Filled. Pdbmat> 1133816 non-zero elements. Pdbmat> 123843 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.52 +/- 22.22 Maximum number = 124 Minimum number = 0 Pdbmat> Matrix trace = 2.476860E+06 Pdbmat> Larger element = 484.018 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 428 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 240228055913921343.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 240228055913921343.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 240228055913921343.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3237 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 428 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 44 Blocpdb> 18 atoms in block 4 Block first atom: 68 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 86 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 106 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 125 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 146 Blocpdb> 24 atoms in block 9 Block first atom: 166 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 190 Blocpdb> 21 atoms in block 11 Block first atom: 212 Blocpdb> 25 atoms in block 12 Block first atom: 233 Blocpdb> 20 atoms in block 13 Block first atom: 258 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 278 Blocpdb> 21 atoms in block 15 Block first atom: 301 Blocpdb> 24 atoms in block 16 Block first atom: 322 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 346 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 366 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 387 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 412 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 435 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 457 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 479 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 507 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 529 Blocpdb> 25 atoms in block 26 Block first atom: 556 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 581 Blocpdb> 30 atoms in block 28 Block first atom: 602 Blocpdb> 23 atoms in block 29 Block first atom: 632 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 655 Blocpdb> 21 atoms in block 31 Block first atom: 678 Blocpdb> 29 atoms in block 32 Block first atom: 699 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 728 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 751 Blocpdb> 28 atoms in block 35 Block first atom: 777 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 805 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 825 Blocpdb> 20 atoms in block 38 Block first atom: 850 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 870 Blocpdb> 28 atoms in block 40 Block first atom: 891 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 919 Blocpdb> 29 atoms in block 42 Block first atom: 940 Blocpdb> 21 atoms in block 43 Block first atom: 969 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 990 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 1007 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 1031 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1052 Blocpdb> 24 atoms in block 48 Block first atom: 1079 Blocpdb> 23 atoms in block 49 Block first atom: 1103 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 1126 Blocpdb> 25 atoms in block 51 Block first atom: 1141 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1166 Blocpdb> 27 atoms in block 53 Block first atom: 1186 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1213 Blocpdb> 23 atoms in block 55 Block first atom: 1237 Blocpdb> 28 atoms in block 56 Block first atom: 1260 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 1288 Blocpdb> 26 atoms in block 58 Block first atom: 1300 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1326 Blocpdb> 25 atoms in block 60 Block first atom: 1347 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 1372 Blocpdb> 27 atoms in block 62 Block first atom: 1388 Blocpdb> 21 atoms in block 63 Block first atom: 1415 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 1436 Blocpdb> 26 atoms in block 65 Block first atom: 1452 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1478 Blocpdb> 27 atoms in block 67 Block first atom: 1494 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1521 Blocpdb> 24 atoms in block 69 Block first atom: 1545 Blocpdb> 27 atoms in block 70 Block first atom: 1569 Blocpdb> 28 atoms in block 71 Block first atom: 1596 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1624 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1647 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1669 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 21 atoms in block 76 Block first atom: 1717 Blocpdb> 28 atoms in block 77 Block first atom: 1738 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1766 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1788 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1811 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1834 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1857 Blocpdb> 25 atoms in block 83 Block first atom: 1875 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1900 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 1922 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1948 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 1967 Blocpdb> 25 atoms in block 88 Block first atom: 1988 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2013 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 2038 Blocpdb> 25 atoms in block 91 Block first atom: 2060 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2085 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2114 Blocpdb> 25 atoms in block 94 Block first atom: 2133 Blocpdb> 27 atoms in block 95 Block first atom: 2158 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 2185 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2204 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 2231 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 2270 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 2292 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 2313 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2337 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 2360 Blocpdb> 26 atoms in block 105 Block first atom: 2374 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 2400 Blocpdb> 23 atoms in block 107 Block first atom: 2419 Blocpdb> 28 atoms in block 108 Block first atom: 2442 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2470 Blocpdb> 25 atoms in block 110 Block first atom: 2491 Blocpdb> 23 atoms in block 111 Block first atom: 2516 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2539 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 2561 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 2585 Blocpdb> 14 atoms in block 115 Block first atom: 2605 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 2619 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 2640 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 2659 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 2677 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 2701 Blocpdb> 23 atoms in block 121 Block first atom: 2723 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2746 Blocpdb> 18 atoms in block 123 Block first atom: 2768 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2786 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 2810 Blocpdb> 25 atoms in block 126 Block first atom: 2826 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 2876 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 2904 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 2926 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 2946 Blocpdb> 25 atoms in block 132 Block first atom: 2970 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 2995 Blocpdb> 25 atoms in block 134 Block first atom: 3012 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3037 Blocpdb> 26 atoms in block 136 Block first atom: 3058 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3084 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 3108 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3132 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 3152 Blocpdb> 23 atoms in block 141 Block first atom: 3173 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3196 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 143 blocks. Blocpdb> At most, 30 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1133959 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9711 Prepmat> Matrix trace = 2476860.0000 Prepmat> Last element read: 9711 9711 0.0000 Prepmat> 10297 lines saved. Prepmat> 9024 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3237 RTB> Total mass = 3237.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3237 RTB> Number of blocks = 143 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 169305.8616 RTB> 43647 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 858 Diagstd> Nb of non-zero elements: 43647 Diagstd> Projected matrix trace = 169305.8616 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 858 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 169305.8616 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0008992 0.0012060 0.0061848 0.0350485 0.0652664 0.2848606 1.0708849 1.3923734 1.9640981 2.4217620 2.8688694 3.2209957 3.3526884 4.3172126 4.4828691 4.8099835 5.3446313 5.8103380 5.9532545 6.2853159 6.8340187 7.0052348 7.1918231 8.1017169 8.7939543 9.3006329 10.2927330 10.7821749 10.9812755 11.2455079 11.6499876 12.6001992 13.1564238 13.6170691 13.8044198 13.9477225 14.4388021 15.4470038 15.7984638 17.0005562 17.5677423 18.0714728 19.1268699 20.2801744 20.6211962 21.3269238 21.9505520 22.6163029 23.0037663 23.1543962 24.1803921 24.7602349 25.1423261 25.3493529 25.7199557 26.2644818 26.5219308 27.2900729 27.5350772 28.8954828 29.8621613 30.0053278 30.7023090 31.0295740 31.6458073 32.7134892 33.6280979 33.6640444 34.3623827 35.1348286 35.2592962 36.0013688 36.3138365 36.9059043 37.2142070 37.7908397 38.7243086 38.7804111 39.8348297 40.1828206 40.5934587 41.6190970 42.0033187 42.2517732 42.9559289 43.0319429 43.6422108 44.5866771 44.8862316 45.2988537 45.6839689 46.4606922 46.6395541 47.5038544 47.9105653 48.2107059 49.0394600 49.4023549 49.9924593 50.8300756 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034332 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034344 0.0034345 3.2563212 3.7710986 8.5400198 20.3296518 27.7421588 57.9577403 112.3742164 128.1365826 152.1867608 168.9900016 183.9291946 194.8903563 198.8345625 225.6300814 229.9181775 238.1590411 251.0464902 261.7555991 264.9552352 272.2443238 283.8790621 287.4131462 291.2156950 309.0891866 322.0233636 331.1704146 348.3859506 356.5730102 359.8501388 364.1537755 370.6448849 385.4641433 393.8802525 400.7163851 403.4635997 405.5523564 412.6300585 426.7931176 431.6211425 447.7409796 455.1486472 461.6279061 474.9164707 489.0250686 493.1195350 501.4866649 508.7659093 516.4236061 520.8285152 522.5309391 533.9824086 540.3468955 544.5001551 546.7373192 550.7194163 556.5186189 559.2395129 567.2802033 569.8209727 583.7276403 593.4114186 594.8321968 601.7010920 604.8994463 610.8764318 621.0959746 629.7184703 630.0549470 636.5564388 643.6713807 644.8104984 651.5605582 654.3820041 659.6950200 662.4447532 667.5573028 675.7516529 676.2409792 685.3726391 688.3597839 691.8681020 700.5539839 703.7802624 705.8586651 711.7161776 712.3456191 717.3789875 725.0998806 727.5315866 730.8678973 733.9681153 740.1813161 741.6047030 748.4446786 751.6418070 753.9924991 760.4455450 763.2540300 767.7989805 774.2044408 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3237 Rtb_to_modes> Number of blocs = 143 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9922E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2060E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1848E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5048E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5266E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.221 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.301 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.83 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 58266 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240228055913921343.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240228055913921343.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 240228055913921343.atom Openam> file on opening on unit 11: 240228055913921343.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 428 First residue number = 1 Last residue number = 428 Number of atoms found = 3237 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9922E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2060E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1848E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5048E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5266E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.221 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.301 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.83 Bfactors> 106 vectors, 9711 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000899 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.449 for 428 C-alpha atoms. Bfactors> = 10.235 +/- 13.96 Bfactors> = 36.904 +/- 12.27 Bfactors> Shiftng-fct= 26.670 Bfactors> Scaling-fct= 0.879 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 240228055913921343 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228055913921343.eigenfacs 240228055913921343.atom 240228055913921343.10.pdb 240228055913921343.11.pdb 240228055913921343.12.pdb 240228055913921343.13.pdb 240228055913921343.14.pdb 240228055913921343.15.pdb 240228055913921343.16.pdb 240228055913921343.7.pdb 240228055913921343.8.pdb 240228055913921343.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m12.490s user 0m12.446s sys 0m0.044s ../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory cat: 240228055913921343.Chkmod.res: No such file or directory




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.