*** 2VIU ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228060025923099.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228060025923099.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228060025923099.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 320
First residue number = 1
Last residue number = 320
Number of atoms found = 2472
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 12.167789 +/- 14.403871 From: -33.435000 To: 42.920000
= 45.768842 +/- 20.795807 From: 13.175000 To: 104.028000
= 110.982536 +/- 14.824633 From: 63.210000 To: 140.990000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.2812 % Filled.
Pdbmat> 902399 non-zero elements.
Pdbmat> 98633 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.80 +/- 24.43
Maximum number = 134
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 1.972660E+06
Pdbmat> Larger element = 478.142
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
320 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228060025923099.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228060025923099.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228060025923099.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2472 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 320 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 12 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 26
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 52
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 72
Blocpdb> 15 atoms in block 7
Block first atom: 84
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 99
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 110
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 125
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 141
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 156
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 172
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 189
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 205
Blocpdb> 12 atoms in block 16
Block first atom: 220
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 232
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 249
Blocpdb> 12 atoms in block 19
Block first atom: 265
Blocpdb> 13 atoms in block 20
Block first atom: 277
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 290
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 303
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 317
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 333
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 350
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 369
Blocpdb> 12 atoms in block 27
Block first atom: 385
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 397
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 411
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 426
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 442
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 455
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 467
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 482
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 498
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 513
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 533
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 550
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 571
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 587
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 605
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 625
Blocpdb> 16 atoms in block 43
Block first atom: 640
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 656
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 670
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 688
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 707
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 722
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 737
Blocpdb> 14 atoms in block 50
Block first atom: 754
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 768
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 785
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 800
Blocpdb> 10 atoms in block 54
Block first atom: 811
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 821
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 836
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 856
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 871
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 884
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 902
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 923
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 934
Blocpdb> 12 atoms in block 63
Block first atom: 951
Blocpdb> 10 atoms in block 64
Block first atom: 963
Blocpdb> 13 atoms in block 65
Block first atom: 973
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 986
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1001
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 1016
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 1027
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1037
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1059
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1076
Blocpdb> 22 atoms in block 73
Block first atom: 1092
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1114
Blocpdb> 10 atoms in block 75
Block first atom: 1130
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1140
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1153
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1172
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1187
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1202
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1217
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1232
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1248
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1267
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1284
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1304
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1326
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1338
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1358
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1371
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 1386
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1404
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1420
Blocpdb> 19 atoms in block 94
Block first atom: 1434
Blocpdb> 14 atoms in block 95
Block first atom: 1453
Blocpdb> 10 atoms in block 96
Block first atom: 1467
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1477
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1495
Blocpdb> 13 atoms in block 99
Block first atom: 1509
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 1522
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1544
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1559
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1575
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1591
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 1606
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1618
Blocpdb> 21 atoms in block 107
Block first atom: 1635
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1656
Blocpdb> 12 atoms in block 109
Block first atom: 1674
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 1686
Blocpdb> 19 atoms in block 111
Block first atom: 1698
Blocpdb> 14 atoms in block 112
Block first atom: 1717
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 1731
Blocpdb> 15 atoms in block 114
Block first atom: 1757
Blocpdb> 16 atoms in block 115
Block first atom: 1772
Blocpdb> 11 atoms in block 116
Block first atom: 1788
Blocpdb> 15 atoms in block 117
Block first atom: 1799
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1814
Blocpdb> 16 atoms in block 119
Block first atom: 1829
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1845
Blocpdb> 12 atoms in block 121
Block first atom: 1859
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 1871
Blocpdb> 12 atoms in block 123
Block first atom: 1887
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1899
Blocpdb> 23 atoms in block 125
Block first atom: 1914
Blocpdb> 17 atoms in block 126
Block first atom: 1937
Blocpdb> 18 atoms in block 127
Block first atom: 1954
Blocpdb> 13 atoms in block 128
Block first atom: 1972
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1985
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1997
Blocpdb> 17 atoms in block 131
Block first atom: 2013
Blocpdb> 13 atoms in block 132
Block first atom: 2030
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2043
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2058
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2073
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2087
Blocpdb> 14 atoms in block 137
Block first atom: 2102
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 2116
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2130
Blocpdb> 14 atoms in block 140
Block first atom: 2142
Blocpdb> 15 atoms in block 141
Block first atom: 2156
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2171
Blocpdb> 18 atoms in block 143
Block first atom: 2188
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2206
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2223
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2238
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 2255
Blocpdb> 9 atoms in block 148
Block first atom: 2274
Blocpdb> 13 atoms in block 149
Block first atom: 2283
Blocpdb> 21 atoms in block 150
Block first atom: 2296
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2317
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2333
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 2350
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2365
Blocpdb> 12 atoms in block 155
Block first atom: 2382
Blocpdb> 12 atoms in block 156
Block first atom: 2394
Blocpdb> 19 atoms in block 157
Block first atom: 2406
Blocpdb> 14 atoms in block 158
Block first atom: 2425
Blocpdb> 18 atoms in block 159
Block first atom: 2439
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2456
Blocpdb> 160 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 902559 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7416
Prepmat> Matrix trace = 1972660.0000
Prepmat> Last element read: 7416 7416 78.9006
Prepmat> 12881 lines saved.
Prepmat> 11300 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2472
RTB> Total mass = 2472.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2472
RTB> Number of blocks = 160
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 214345.2033
RTB> 54480 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 960
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54480
Diagstd> Projected matrix trace = 214345.2033
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 960 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 214345.2033
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0123099 0.0207806 0.0907794 0.1570125
0.2378910 0.2717382 0.3422937 0.5757714 0.7991654
0.8941851 1.3452803 1.4877884 1.7902815 1.9845899
2.1167372 2.5861577 2.9520873 3.6539379 4.4014122
4.9916609 5.7213114 6.0746865 6.5737726 7.4484636
7.5831228 8.2749945 9.5685422 9.7771076 10.1702942
10.6219013 10.9788123 11.9118728 13.8018788 13.9182035
14.2569266 14.9389874 15.8152909 15.8427611 16.1549795
17.2150509 17.8108948 18.8313798 19.3583052 19.5970797
20.9015494 22.5423133 22.9599291 24.0873752 24.4806309
24.7240126 26.0271828 26.5666064 28.0272347 28.7900195
29.1746689 30.3849398 30.6601089 31.6556354 32.2435787
32.8180475 33.1871477 34.9373188 35.4560390 35.6704317
37.3574094 37.9607797 38.3721633 38.4477303 39.6427870
39.8217596 40.0857586 41.3450584 42.0402669 42.5562356
43.1428449 43.6412064 44.5999867 44.8914157 46.7262941
46.9341930 47.3657534 47.6504859 49.0406073 49.9889760
50.8154110 51.1155180 51.6643753 52.7252369 53.3393738
53.6154082 54.3454063 54.6525010 55.5065686 55.6244472
56.8692665 57.4470647 57.8154183 58.8368090 59.5107509
60.2821437
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034335 0.0034337 0.0034348 0.0034348
0.0034354 12.0482284 15.6539820 32.7181720 43.0291174
52.9644255 56.6070638 63.5323239 82.3986917 97.0763911
102.6854672 125.9510157 132.4542396 145.2967635 152.9785947
157.9896901 174.6315790 186.5777625 207.5753888 227.8197145
242.6150953 259.7425345 267.6438164 278.4214046 296.3661713
299.0331418 312.3770623 335.9063143 339.5474542 346.3076128
353.9129149 359.8097775 374.7876772 403.4264658 405.1229736
410.0230171 419.7163244 431.8509439 432.2258304 436.4640574
450.5566824 458.2876455 471.2337112 477.7810792 480.7186371
496.4602945 515.5781704 520.3320189 532.9543596 537.2873103
539.9515079 553.9988481 559.7103288 574.8908615 582.6614154
586.5408282 598.5831262 601.2874323 610.9712833 616.6189953
622.0877503 625.5762382 641.8596378 646.6069796 648.5589595
663.7180919 669.0565739 672.6721111 673.3341383 683.7185604
685.2601915 687.5279115 698.2437951 704.0897351 708.3972764
713.2629580 717.3707322 725.2080981 727.5735981 742.2939985
743.9435071 747.3559644 749.5989116 760.4544404 767.7722312
774.0927526 776.3752162 780.5322855 788.5051790 793.0840882
795.1335685 800.5283200 802.7869437 809.0352985 809.8939117
818.9060762 823.0556521 825.6901740 832.9517324 837.7086411
843.1204517
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2472
Rtb_to_modes> Number of blocs = 160
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0781E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0779E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1570
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2717
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5758
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7992
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8942
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.488
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.790
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.117
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.586
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.952
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.654
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.992
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.721
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.574
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.448
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.275
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.569
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.777
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.28
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 960 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
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0.99998 1.00003 1.00001 1.00006 1.00001
0.99996 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99997
1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
1.00003 1.00004 0.99997 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996
1.00001 0.99996 0.99999 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001
1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44496 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
0.99996 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
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0.99996 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99997
1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
1.00003 1.00004 0.99997 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996
1.00001 0.99996 0.99999 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001
1.00003 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228060025923099.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228060025923099.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228060025923099.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228060025923099.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 320
First residue number = 1
Last residue number = 320
Number of atoms found = 2472
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2310E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0781E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0779E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1570
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2717
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5758
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8942
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.790
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.117
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.401
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.721
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.574
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.448
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.583
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.777
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.28
Bfactors> 106 vectors, 7416 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.012310
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.148 for 320 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.205 +/- 8.29
Bfactors> = 17.181 +/- 9.91
Bfactors> Shiftng-fct= 15.977
Bfactors> Scaling-fct= 1.195
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060025923099 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060025923099.eigenfacs
240228060025923099.atom
240228060025923099.10.pdb
240228060025923099.11.pdb
240228060025923099.12.pdb
240228060025923099.13.pdb
240228060025923099.14.pdb
240228060025923099.15.pdb
240228060025923099.16.pdb
240228060025923099.7.pdb
240228060025923099.8.pdb
240228060025923099.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m15.220s
user 0m15.204s
sys 0m0.016s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228060025923099.Chkmod.res: No such file or directory
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