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***  1DQZ  ***

LOGs for ID: 240228060125923889

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 240228060125923889.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 240228060125923889.atom to be opened. Openam> File opened: 240228060125923889.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2181 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -12.471909 +/- 9.874346 From: -32.399000 To: 13.164000 = 26.802095 +/- 9.793581 From: 2.617000 To: 52.195000 = 47.064913 +/- 10.568349 From: 22.718000 To: 72.971000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.0501 % Filled. Pdbmat> 867082 non-zero elements. Pdbmat> 94899 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.02 +/- 23.48 Maximum number = 138 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.897980E+06 Pdbmat> Larger element = 499.482 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 280 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 240228060125923889.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 240228060125923889.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 240228060125923889.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2181 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 280 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 45 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 83 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 97 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 108 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 122 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 137 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 153 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 169 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 189 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 202 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 210 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 227 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 239 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 259 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 275 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 287 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 303 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 320 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 340 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 352 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 374 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 390 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 404 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 420 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 462 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 477 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 489 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 502 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 532 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 540 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 555 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 572 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 591 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 613 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 634 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 647 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 662 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 691 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 710 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 731 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 754 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 772 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 787 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 807 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 822 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 871 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 884 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 897 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 911 Blocpdb> 10 atoms in block 59 Block first atom: 923 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 933 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 944 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 958 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 972 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 980 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 991 Blocpdb> 13 atoms in block 66 Block first atom: 1007 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1020 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1037 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1056 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1074 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1092 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1109 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1120 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1134 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1149 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1165 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1178 Blocpdb> 28 atoms in block 78 Block first atom: 1193 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1221 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1235 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1251 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1263 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1276 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1292 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1302 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1318 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1331 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1345 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 1367 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1378 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1390 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 1405 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1424 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1444 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1460 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1475 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1491 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1506 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1525 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1537 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1553 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1571 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1593 Blocpdb> 10 atoms in block 104 Block first atom: 1612 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1622 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1634 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1648 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1662 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1674 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1686 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1702 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 1714 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1734 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 1751 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1763 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1778 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1796 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1813 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1831 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1850 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 1869 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1879 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1891 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1906 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1918 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1936 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 1955 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 1969 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1981 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 1998 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2018 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2037 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2059 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2077 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 2092 Blocpdb> 14 atoms in block 136 Block first atom: 2105 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2119 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2135 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2154 Blocpdb> 13 atoms in block 140 Block first atom: 2168 Blocpdb> 140 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 867222 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6543 Prepmat> Matrix trace = 1897980.0000 Prepmat> Last element read: 6543 6543 217.9617 Prepmat> 9871 lines saved. Prepmat> 8250 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2181 RTB> Total mass = 2181.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2181 RTB> Number of blocks = 140 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 209984.4231 RTB> 56220 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 840 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56220 Diagstd> Projected matrix trace = 209984.4231 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 840 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 209984.4231 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0866663 2.3786987 5.1068711 6.7774526 8.4188005 10.5551031 10.7729106 11.6055336 13.1900378 16.2131536 16.4361309 18.3165311 18.9176758 19.2608921 19.8722078 21.8220228 22.5993175 23.7077715 24.2947861 25.6199719 27.2614920 27.5802640 28.8289705 30.4328528 31.0455661 32.0081871 33.5532983 34.2922323 34.7414836 35.4251325 36.0573102 37.3534890 37.8688222 39.5119361 40.7466534 41.2165956 41.5828787 43.1596353 43.5981968 45.1290503 45.3066748 46.6290255 47.6287485 48.4224059 49.5106413 50.6060127 51.4649262 51.6995833 53.4497103 54.2513227 55.6092218 55.8886364 57.4032200 57.4929103 58.4640958 59.3496420 60.3374890 61.7098723 62.0926339 62.9042484 63.1518355 64.4692999 66.0370207 66.6302582 67.7085277 68.2582735 68.8204161 69.3738088 69.4438008 70.9290773 72.8453181 73.5813664 73.6726249 75.3783984 76.2453394 77.5001896 77.7379747 78.8725272 79.7263670 80.1183459 81.0296570 82.0512318 82.7051596 83.8065709 85.0283432 85.1933304 86.1719518 87.2871707 87.9005540 88.1145995 89.1959531 90.3991386 91.1465994 91.8991602 93.0671529 93.7067139 93.9692829 94.7805144 95.0341098 95.4070188 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034335 0.0034335 0.0034338 0.0034342 0.0034355 156.8634570 167.4807895 245.3989649 282.7017686 315.0796751 352.7983301 356.4197892 369.9370562 394.3831043 437.2492057 440.2456521 464.7473195 472.3122062 476.5774398 484.0813377 507.2742094 516.2296466 528.7381490 535.2440150 549.6479403 566.9830694 570.2883366 583.0554340 599.0548837 605.0553031 614.3640838 629.0177332 635.9063459 640.0581924 646.3251000 652.0665821 663.6832652 668.2457096 682.5892363 693.1723852 697.1581984 700.2490944 713.4017383 717.0171509 729.4967769 730.9309888 741.5209912 749.4279141 755.6461292 764.0900705 772.4961796 779.0242150 780.7981965 793.9039416 799.8350761 809.7830628 811.8149355 822.7415065 823.3840062 830.3092933 836.5739402 843.5073993 853.0463009 855.6877638 861.2619663 862.9552379 871.9101977 882.4477823 886.4026146 893.5461040 897.1662541 900.8529965 904.4676741 904.9238228 914.5499606 926.8215054 931.4921611 932.0696189 942.7981749 948.2043234 955.9752808 957.4407132 964.4021247 969.6081727 971.9888149 977.5011577 983.6437412 987.5556599 994.1097102 1001.3297943 1002.3008029 1008.0411132 1014.5430700 1018.1015213 1019.3403507 1025.5760152 1032.4699642 1036.7296404 1041.0007720 1047.5951869 1051.1885809 1052.6602816 1057.1942954 1058.6076685 1060.6825962 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2181 Rtb_to_modes> Number of blocs = 140 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99992 0.99999 1.00000 0.99995 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00005 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240228060125923889.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240228060125923889.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 240228060125923889.atom Openam> file on opening on unit 11: 240228060125923889.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 280 First residue number = 1 Last residue number = 280 Number of atoms found = 2181 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.777 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.58 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.41 Bfactors> 106 vectors, 6543 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.087000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.619 for 280 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.022 +/- 0.06 Bfactors> = 18.659 +/- 5.48 Bfactors> Shiftng-fct= 18.637 Bfactors> Scaling-fct= 95.046 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 10 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 12 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 13 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 14 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 15 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 240228060125923889 16 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom calculating perturbed structure for DQ=100 240228060125923889.eigenfacs 240228060125923889.atom 240228060125923889.10.pdb 240228060125923889.11.pdb 240228060125923889.12.pdb 240228060125923889.13.pdb 240228060125923889.14.pdb 240228060125923889.15.pdb 240228060125923889.16.pdb 240228060125923889.7.pdb 240228060125923889.8.pdb 240228060125923889.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m10.313s user 0m10.273s sys 0m0.040s ../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory cat: 240228060125923889.Chkmod.res: No such file or directory




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