*** 6DNP ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228060517928664.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228060517928664.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228060517928664.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 422
First residue number = 1
Last residue number = 422
Number of atoms found = 3237
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 26.622836 +/- 20.033258 From: -12.588000 To: 73.538000
= 87.101221 +/- 9.610135 From: 0.000000 To: 111.195000
= 59.390809 +/- 15.544136 From: 0.000000 To: 92.862000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4441 % Filled.
Pdbmat> 1152575 non-zero elements.
Pdbmat> 125929 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.81 +/- 23.05
Maximum number = 125
Minimum number = 0
Pdbmat> Matrix trace = 2.518580E+06
Pdbmat> Larger element = 483.840
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
422 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228060517928664.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228060517928664.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228060517928664.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3237 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 422 residues.
Blocpdb> 26 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 27
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 47
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 26 atoms in block 5
Block first atom: 91
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 117
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 148
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 171
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 193
Blocpdb> 24 atoms in block 10
Block first atom: 211
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 235
Blocpdb> 30 atoms in block 12
Block first atom: 256
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 286
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 305
Blocpdb> 21 atoms in block 15
Block first atom: 328
Blocpdb> 29 atoms in block 16
Block first atom: 349
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 378
Blocpdb> 24 atoms in block 18
Block first atom: 400
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 424
Blocpdb> 26 atoms in block 20
Block first atom: 448
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 474
Blocpdb> 31 atoms in block 22
Block first atom: 496
Blocpdb> 32 atoms in block 23
Block first atom: 527
Blocpdb> 26 atoms in block 24
Block first atom: 559
Blocpdb> 24 atoms in block 25
Block first atom: 585
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 609
Blocpdb> 36 atoms in block 27
Block first atom: 633
Blocpdb> 28 atoms in block 28
Block first atom: 669
Blocpdb> 24 atoms in block 29
Block first atom: 697
Blocpdb> 24 atoms in block 30
Block first atom: 721
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 745
Blocpdb> 23 atoms in block 32
Block first atom: 769
Blocpdb> 26 atoms in block 33
Block first atom: 792
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 818
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 838
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 857
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 879
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 900
Blocpdb> 24 atoms in block 39
Block first atom: 916
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 940
Blocpdb> 21 atoms in block 41
Block first atom: 961
Blocpdb> 27 atoms in block 42
Block first atom: 982
Blocpdb> 21 atoms in block 43
Block first atom: 1009
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 1030
Blocpdb> 29 atoms in block 45
Block first atom: 1048
Blocpdb> 26 atoms in block 46
Block first atom: 1077
Blocpdb> 21 atoms in block 47
Block first atom: 1103
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1124
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1147
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1170
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 1193
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1210
Blocpdb> 26 atoms in block 53
Block first atom: 1232
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 1258
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 1282
Blocpdb> 24 atoms in block 56
Block first atom: 1305
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1329
Blocpdb> 31 atoms in block 58
Block first atom: 1351
Blocpdb> 24 atoms in block 59
Block first atom: 1382
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1406
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1426
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1446
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 1467
Blocpdb> 22 atoms in block 64
Block first atom: 1484
Blocpdb> 23 atoms in block 65
Block first atom: 1506
Blocpdb> 21 atoms in block 66
Block first atom: 1529
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1550
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1572
Blocpdb> 23 atoms in block 69
Block first atom: 1592
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1615
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1634
Blocpdb> 24 atoms in block 72
Block first atom: 1654
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 1678
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1699
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1715
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1735
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 1755
Blocpdb> 26 atoms in block 78
Block first atom: 1778
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1804
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1826
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1851
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1875
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1897
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1917
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1939
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 1959
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 1983
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 2006
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 2026
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 2048
Blocpdb> 28 atoms in block 91
Block first atom: 2072
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 2100
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 2118
Blocpdb> 18 atoms in block 94
Block first atom: 2138
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2156
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2180
Blocpdb> 30 atoms in block 97
Block first atom: 2207
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2237
Blocpdb> 21 atoms in block 99
Block first atom: 2257
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 2278
Blocpdb> 26 atoms in block 101
Block first atom: 2296
Blocpdb> 27 atoms in block 102
Block first atom: 2322
Blocpdb> 31 atoms in block 103
Block first atom: 2349
Blocpdb> 19 atoms in block 104
Block first atom: 2380
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 2399
Blocpdb> 31 atoms in block 106
Block first atom: 2411
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 2442
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2461
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2486
Blocpdb> 26 atoms in block 110
Block first atom: 2512
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2538
Blocpdb> 23 atoms in block 112
Block first atom: 2560
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 2583
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2604
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2626
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 2644
Blocpdb> 21 atoms in block 117
Block first atom: 2671
Blocpdb> 21 atoms in block 118
Block first atom: 2692
Blocpdb> 26 atoms in block 119
Block first atom: 2713
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 2739
Blocpdb> 23 atoms in block 121
Block first atom: 2759
Blocpdb> 21 atoms in block 122
Block first atom: 2782
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 2803
Blocpdb> 24 atoms in block 124
Block first atom: 2821
Blocpdb> 24 atoms in block 125
Block first atom: 2845
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 2869
Blocpdb> 32 atoms in block 127
Block first atom: 2887
Blocpdb> 25 atoms in block 128
Block first atom: 2919
Blocpdb> 22 atoms in block 129
Block first atom: 2944
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 2966
Blocpdb> 23 atoms in block 131
Block first atom: 2987
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 3010
Blocpdb> 25 atoms in block 133
Block first atom: 3032
Blocpdb> 27 atoms in block 134
Block first atom: 3057
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 3084
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 3107
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 3126
Blocpdb> 30 atoms in block 138
Block first atom: 3150
Blocpdb> 20 atoms in block 139
Block first atom: 3180
Blocpdb> 26 atoms in block 140
Block first atom: 3200
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 3225
Blocpdb> 141 blocks.
Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1152716 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9711
Prepmat> Matrix trace = 2518580.0000
Prepmat> Last element read: 9711 9711 0.0000
Prepmat> 10012 lines saved.
Prepmat> 8730 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3237
RTB> Total mass = 3237.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3237
RTB> Number of blocks = 141
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 169335.0153
RTB> 44001 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 846
Diagstd> Nb of non-zero elements: 44001
Diagstd> Projected matrix trace = 169335.0153
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 846 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 169335.0153
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0896770 0.1639511 0.2554286 0.3516304
0.3774036 0.5542899 0.8451614 1.1528349 1.3475906
2.3677582 2.6450523 3.2743763 3.3397413 3.7387803
3.9436092 4.3499522 5.0714672 5.4467909 6.4459147
6.7526922 7.2758531 8.7314972 9.3250755 10.1086973
11.1719114 11.8726887 12.3419922 13.0502390 13.7736087
14.2037898 14.3385480 15.1044815 16.4436141 16.6995206
17.4642293 18.3708529 18.6209126 19.7638005 20.0719407
20.5908499 21.0747469 22.1039830 23.4452321 23.8892575
24.2686497 24.7587297 25.8072548 25.9008796 26.4806736
27.1500213 27.6732082 28.6958676 29.0085955 29.4117209
29.8421588 30.5279710 30.8771238 31.3428850 32.0811195
32.2097785 32.7732109 33.0343289 34.1463563 34.9491478
35.4949479 35.8117819 36.1566573 36.5311385 36.7086414
37.2248710 37.4992378 38.3096859 38.7568874 39.7030026
40.3683040 41.1965311 41.5665784 41.9377494 42.4655882
43.2164231 43.6324043 43.9701103 44.5205184 45.0537135
45.6022492 45.9659642 46.3057286 47.2924583 47.6547258
48.7356454 49.1931447 49.7276050 50.3147700 50.9887614
51.2886678 52.0461427 52.8374043 53.3096276 53.8420134
54.5024252
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034334 0.0034342 0.0034342 0.0034344
0.0034355 32.5188938 43.9695936 54.8820157 64.3929768
66.7111322 80.8469748 99.8309307 116.5947073 126.0591170
167.0951927 176.6088299 196.4986513 198.4502709 209.9714520
215.6464024 226.4839967 244.5468603 253.4344407 275.7005030
282.1848925 292.9120512 320.8777774 331.6052972 345.2573052
362.9602140 374.1707383 381.4941769 392.2875391 403.0130880
409.2582076 411.1950396 422.0347295 440.3458611 443.7591110
453.8057482 465.4359668 468.5929613 482.7591472 486.5079742
492.7565621 498.5129722 510.5409118 525.8023810 530.7580699
534.9560300 540.3304712 551.6532552 552.6530059 558.8043710
565.8227014 571.2484506 581.7078982 584.8690385 588.9189084
593.2126435 599.9903296 603.4116630 607.9456629 615.0636173
616.2957167 621.6626520 624.1342629 634.5523602 641.9682879
646.9616714 649.8427018 652.9642689 656.3369940 657.9296156
662.5396608 664.9768101 672.1242674 676.0358483 684.2376324
689.9466849 696.9884872 700.1118343 703.2307300 707.6424087
713.8709173 717.2983843 720.0689062 724.5617214 728.8876246
733.3113584 736.2299279 738.9458954 746.7775012 749.6322595
758.0862877 761.6361927 765.7624239 770.2700759 775.4119888
777.6890600 783.4108001 789.3434644 792.8629149 796.8121107
801.6839590
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3237
Rtb_to_modes> Number of blocs = 141
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.50
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 846 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 0.99997 0.99996 0.99999 1.00000
1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
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0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 58266 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
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1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
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1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001
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1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228060517928664.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228060517928664.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228060517928664.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228060517928664.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 422
First residue number = 1
Last residue number = 422
Number of atoms found = 3237
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9677E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2554
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3516
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3774
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5543
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8452
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.153
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.645
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.340
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.944
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.350
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.071
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.447
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.731
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.50
Bfactors> 106 vectors, 9711 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.089677
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.520 for 426 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.098 +/- 0.13
Bfactors> = 39.257 +/- 10.69
Bfactors> Shiftng-fct= 39.159
Bfactors> Scaling-fct= 82.237
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228060517928664 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228060517928664.eigenfacs
240228060517928664.atom
240228060517928664.10.pdb
240228060517928664.11.pdb
240228060517928664.12.pdb
240228060517928664.13.pdb
240228060517928664.14.pdb
240228060517928664.15.pdb
240228060517928664.16.pdb
240228060517928664.7.pdb
240228060517928664.8.pdb
240228060517928664.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.591s
user 0m12.515s
sys 0m0.076s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228060517928664.Chkmod.res: No such file or directory
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