*** 1P5V ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240228061130936516.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240228061130936516.atom to be opened.
Openam> File opened: 240228061130936516.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 191
First residue number = 1
Last residue number = 191
Number of atoms found = 1505
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 14.799746 +/- 8.325326 From: -7.954000 To: 33.145000
= 35.153516 +/- 12.836721 From: 13.467000 To: 63.651000
= 18.822471 +/- 12.191843 From: -26.161000 To: 40.888000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.2839 % Filled.
Pdbmat> 538682 non-zero elements.
Pdbmat> 58863 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.22 +/- 25.48
Maximum number = 144
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.177260E+06
Pdbmat> Larger element = 609.698
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
191 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240228061130936516.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240228061130936516.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240228061130936516.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1505 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 191 residues.
Blocpdb> 11 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 5 atoms in block 2
Block first atom: 12
Blocpdb> 6 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 5 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 5 atoms in block 5
Block first atom: 28
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 33
Blocpdb> 4 atoms in block 7
Block first atom: 45
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 49
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 63
Blocpdb> 4 atoms in block 11
Block first atom: 71
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 75
Blocpdb> 6 atoms in block 13
Block first atom: 84
Blocpdb> 11 atoms in block 14
Block first atom: 90
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 101
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 109
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 117
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 129
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 136
Blocpdb> 8 atoms in block 20
Block first atom: 144
Blocpdb> 5 atoms in block 21
Block first atom: 152
Blocpdb> 5 atoms in block 22
Block first atom: 157
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 162
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 166
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 173
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 181
Blocpdb> 12 atoms in block 27
Block first atom: 188
Blocpdb> 21 atoms in block 28
Block first atom: 200
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 221
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 230
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 238
Blocpdb> 9 atoms in block 32
Block first atom: 245
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 254
Blocpdb> 12 atoms in block 34
Block first atom: 262
Blocpdb> 7 atoms in block 35
Block first atom: 274
Blocpdb> 7 atoms in block 36
Block first atom: 281
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 288
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 296
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 304
Blocpdb> 6 atoms in block 40
Block first atom: 313
Blocpdb> 11 atoms in block 41
Block first atom: 319
Blocpdb> 8 atoms in block 42
Block first atom: 330
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 338
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 350
Blocpdb> 7 atoms in block 45
Block first atom: 358
Blocpdb> 11 atoms in block 46
Block first atom: 365
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 376
Blocpdb> 14 atoms in block 48
Block first atom: 383
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 397
Blocpdb> 7 atoms in block 50
Block first atom: 404
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 411
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 418
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 426
Blocpdb> 11 atoms in block 54
Block first atom: 437
Blocpdb> 8 atoms in block 55
Block first atom: 448
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 456
Blocpdb> 5 atoms in block 57
Block first atom: 464
Blocpdb> 9 atoms in block 58
Block first atom: 469
Blocpdb> 9 atoms in block 59
Block first atom: 478
Blocpdb> 9 atoms in block 60
Block first atom: 487
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 496
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 504
Blocpdb> 8 atoms in block 63
Block first atom: 516
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 524
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 535
Blocpdb> 5 atoms in block 66
Block first atom: 543
Blocpdb> 9 atoms in block 67
Block first atom: 548
Blocpdb> 4 atoms in block 68
Block first atom: 557
Blocpdb> 4 atoms in block 69
Block first atom: 561
Blocpdb> 4 atoms in block 70
Block first atom: 565
Blocpdb> 4 atoms in block 71
Block first atom: 569
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 573
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 584
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 591
Blocpdb> 4 atoms in block 75
Block first atom: 595
Blocpdb> 9 atoms in block 76
Block first atom: 599
Blocpdb> 9 atoms in block 77
Block first atom: 608
Blocpdb> 6 atoms in block 78
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 623
Blocpdb> 9 atoms in block 80
Block first atom: 631
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 640
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 654
Blocpdb> 6 atoms in block 83
Block first atom: 662
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 668
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 675
Blocpdb> 4 atoms in block 86
Block first atom: 684
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 688
Blocpdb> 7 atoms in block 88
Block first atom: 696
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 703
Blocpdb> 5 atoms in block 90
Block first atom: 708
Blocpdb> 7 atoms in block 91
Block first atom: 713
Blocpdb> 4 atoms in block 92
Block first atom: 720
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 724
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 731
Blocpdb> 7 atoms in block 95
Block first atom: 742
Blocpdb> 8 atoms in block 96
Block first atom: 749
Blocpdb> 11 atoms in block 97
Block first atom: 757
Blocpdb> 5 atoms in block 98
Block first atom: 768
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 773
Blocpdb> 8 atoms in block 100
Block first atom: 781
Blocpdb> 8 atoms in block 101
Block first atom: 789
Blocpdb> 6 atoms in block 102
Block first atom: 797
Blocpdb> 8 atoms in block 103
Block first atom: 803
Blocpdb> 9 atoms in block 104
Block first atom: 811
Blocpdb> 8 atoms in block 105
Block first atom: 820
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 828
Blocpdb> 7 atoms in block 107
Block first atom: 836
Blocpdb> 11 atoms in block 108
Block first atom: 843
Blocpdb> 7 atoms in block 109
Block first atom: 854
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 861
Blocpdb> 9 atoms in block 111
Block first atom: 869
Blocpdb> 8 atoms in block 112
Block first atom: 878
Blocpdb> 4 atoms in block 113
Block first atom: 886
Blocpdb> 4 atoms in block 114
Block first atom: 890
Blocpdb> 7 atoms in block 115
Block first atom: 894
Blocpdb> 7 atoms in block 116
Block first atom: 901
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 908
Blocpdb> 9 atoms in block 118
Block first atom: 916
Blocpdb> 11 atoms in block 119
Block first atom: 925
Blocpdb> 5 atoms in block 120
Block first atom: 936
Blocpdb> 9 atoms in block 121
Block first atom: 941
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 950
Blocpdb> 8 atoms in block 123
Block first atom: 958
Blocpdb> 6 atoms in block 124
Block first atom: 966
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 972
Blocpdb> 9 atoms in block 126
Block first atom: 986
Blocpdb> 7 atoms in block 127
Block first atom: 995
Blocpdb> 8 atoms in block 128
Block first atom: 1002
Blocpdb> 4 atoms in block 129
Block first atom: 1010
Blocpdb> 4 atoms in block 130
Block first atom: 1014
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1018
Blocpdb> 8 atoms in block 132
Block first atom: 1027
Blocpdb> 8 atoms in block 133
Block first atom: 1035
Blocpdb> 5 atoms in block 134
Block first atom: 1043
Blocpdb> 9 atoms in block 135
Block first atom: 1048
Blocpdb> 8 atoms in block 136
Block first atom: 1057
Blocpdb> 7 atoms in block 137
Block first atom: 1065
Blocpdb> 6 atoms in block 138
Block first atom: 1072
Blocpdb> 7 atoms in block 139
Block first atom: 1078
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 1085
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 1096
Blocpdb> 8 atoms in block 142
Block first atom: 1108
Blocpdb> 8 atoms in block 143
Block first atom: 1116
Blocpdb> 8 atoms in block 144
Block first atom: 1124
Blocpdb> 4 atoms in block 145
Block first atom: 1132
Blocpdb> 9 atoms in block 146
Block first atom: 1136
Blocpdb> 8 atoms in block 147
Block first atom: 1145
Blocpdb> 7 atoms in block 148
Block first atom: 1153
Blocpdb> 11 atoms in block 149
Block first atom: 1160
Blocpdb> 4 atoms in block 150
Block first atom: 1171
Blocpdb> 4 atoms in block 151
Block first atom: 1175
Blocpdb> 9 atoms in block 152
Block first atom: 1179
Blocpdb> 6 atoms in block 153
Block first atom: 1188
Blocpdb> 8 atoms in block 154
Block first atom: 1194
Blocpdb> 7 atoms in block 155
Block first atom: 1202
Blocpdb> 6 atoms in block 156
Block first atom: 1209
Blocpdb> 10 atoms in block 157
Block first atom: 1215
Blocpdb> 12 atoms in block 158
Block first atom: 1225
Blocpdb> 8 atoms in block 159
Block first atom: 1237
Blocpdb> 7 atoms in block 160
Block first atom: 1245
Blocpdb> 7 atoms in block 161
Block first atom: 1252
Blocpdb> 9 atoms in block 162
Block first atom: 1259
Blocpdb> 6 atoms in block 163
Block first atom: 1268
Blocpdb> 7 atoms in block 164
Block first atom: 1274
Blocpdb> 14 atoms in block 165
Block first atom: 1281
Blocpdb> 5 atoms in block 166
Block first atom: 1295
Blocpdb> 11 atoms in block 167
Block first atom: 1300
Blocpdb> 8 atoms in block 168
Block first atom: 1311
Blocpdb> 8 atoms in block 169
Block first atom: 1319
Blocpdb> 7 atoms in block 170
Block first atom: 1327
Blocpdb> 8 atoms in block 171
Block first atom: 1334
Blocpdb> 7 atoms in block 172
Block first atom: 1342
Blocpdb> 6 atoms in block 173
Block first atom: 1349
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 1355
Blocpdb> 11 atoms in block 175
Block first atom: 1369
Blocpdb> 8 atoms in block 176
Block first atom: 1380
Blocpdb> 8 atoms in block 177
Block first atom: 1388
Blocpdb> 8 atoms in block 178
Block first atom: 1396
Blocpdb> 8 atoms in block 179
Block first atom: 1404
Blocpdb> 9 atoms in block 180
Block first atom: 1412
Blocpdb> 4 atoms in block 181
Block first atom: 1421
Blocpdb> 4 atoms in block 182
Block first atom: 1425
Blocpdb> 8 atoms in block 183
Block first atom: 1429
Blocpdb> 8 atoms in block 184
Block first atom: 1437
Blocpdb> 11 atoms in block 185
Block first atom: 1445
Blocpdb> 8 atoms in block 186
Block first atom: 1456
Blocpdb> 12 atoms in block 187
Block first atom: 1464
Blocpdb> 6 atoms in block 188
Block first atom: 1476
Blocpdb> 9 atoms in block 189
Block first atom: 1482
Blocpdb> 8 atoms in block 190
Block first atom: 1491
Blocpdb> 7 atoms in block 191
Block first atom: 1498
Blocpdb> 191 blocks.
Blocpdb> At most, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 538873 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4515
Prepmat> Matrix trace = 1177260.0000
Prepmat> Last element read: 4515 4515 269.1388
Prepmat> 18337 lines saved.
Prepmat> 16114 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1505
RTB> Total mass = 1505.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1505
RTB> Number of blocks = 191
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 267014.5104
RTB> 77127 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1146
Diagstd> Nb of non-zero elements: 77127
Diagstd> Projected matrix trace = 267014.5104
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1146 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 267014.5104
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0487244 0.0772277 0.1215160 0.1333610
0.4147529 0.6351517 0.8618109 0.9643188 1.5053844
1.5888113 1.8366055 2.1120455 2.1844094 3.7563068
5.0722002 5.2230761 5.6723941 6.4309583 6.9317964
7.4044157 7.9505163 9.1554436 10.0633113 10.8901105
11.2953607 12.7139309 14.5525221 14.8969823 15.6608596
16.1415668 16.9227069 17.6752037 18.5283464 18.9567417
20.2520008 21.2655987 21.9387350 22.9174749 23.4424435
23.6840946 24.6575155 26.1241267 27.0262870 28.3179642
28.8752572 29.8364487 29.9490896 30.8034442 31.8245281
32.9388676 33.3823701 34.1103818 34.8071742 35.3028911
36.1284143 37.0631676 37.3102071 38.3540917 38.7057597
39.7589002 40.2423600 40.8991824 41.8587368 42.2927089
42.5267066 44.2076898 45.1379793 45.2381944 45.6946246
45.9074142 46.7758234 47.4174465 48.1085376 48.8388911
49.6786815 49.9265185 50.1225082 50.3352399 50.9683004
51.1491301 51.7072405 52.1018349 52.6853168 52.8670295
54.1735058 54.5925802 54.7258862 55.4999267 55.9738994
56.0500916 56.4568112 57.5399526 58.2440139 58.6534924
59.1733232 59.3859564 60.5282107 61.4621795 62.0191472
63.0558476
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034331 0.0034333 0.0034333 0.0034337
0.0034339 23.9700249 30.1773951 37.8540133 39.6560772
69.9342591 86.5434103 100.8094582 106.6364278 133.2352005
136.8773024 147.1645550 157.8145056 160.4952935 210.4630265
244.5645327 248.1752428 258.6297500 275.3804642 285.9026492
295.4885639 306.1913700 328.5753476 344.4813661 358.3533130
364.9600534 387.1998714 414.2518095 419.1258350 429.7373276
436.2828328 446.7146510 456.5385904 467.4268020 472.7996285
488.6852698 500.7651391 508.6289457 519.8507347 525.7711108
528.4740584 539.2248992 555.0296333 564.5318807 577.8648717
583.5233124 593.1558868 594.2744962 602.6912958 612.5989762
623.2318107 627.4135069 634.2180103 640.6630307 645.2089997
652.7091946 661.0990713 663.2986448 672.5136930 675.5897913
684.7191296 688.8695711 694.4685672 702.5679587 706.2005178
708.1514611 722.0116251 729.5689402 730.3783837 734.0537086
735.7608852 742.6873060 747.7636709 753.1931436 758.8888595
765.3856419 767.2924440 768.7969970 770.4267464 775.2563931
776.6304354 780.8560163 783.8298340 788.2066198 789.5647202
799.2612376 802.3467371 803.3257384 808.9868921 812.4339465
812.9867048 815.9310353 823.7207956 828.7450146 831.6531146
835.3303489 836.8298396 844.8394752 851.3325890 855.1812596
862.2991622
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1505
Rtb_to_modes> Number of blocs = 191
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.87
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.06
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
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1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 27090 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
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1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
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1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
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1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240228061130936516.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240228061130936516.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240228061130936516.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240228061130936516.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 191
First residue number = 1
Last residue number = 191
Number of atoms found = 1505
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.155
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.06
Bfactors> 106 vectors, 4515 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.048724
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.114 for 196 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.639 +/- 3.45
Bfactors> = 12.933 +/- 5.45
Bfactors> Shiftng-fct= 12.294
Bfactors> Scaling-fct= 1.580
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 8 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 9 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 10 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 12 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 13 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 240228061130936516 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240228061130936516.eigenfacs
240228061130936516.atom
240228061130936516.10.pdb
240228061130936516.11.pdb
240228061130936516.12.pdb
240228061130936516.13.pdb
240228061130936516.14.pdb
240228061130936516.15.pdb
240228061130936516.16.pdb
240228061130936516.7.pdb
240228061130936516.8.pdb
240228061130936516.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.177s
user 0m20.161s
sys 0m0.016s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 240228061130936516.Chkmod.res: No such file or directory
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