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***  vegf  ***

CA distance fluctuations for 240125104642330507

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ARG 306 0.03 GLU 1 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.04 VAL 2 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.04 VAL 3 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.04 LYS 4 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.05 PHE 5 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.05 MET 6 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.05 ASP 7 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.05 VAL 8 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.05 TYR 9 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.06 GLN 10 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.06 ARG 11 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.06 SER 12 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.07 TYR 13 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.07 CYX 14 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 HID 15 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 PRO 16 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.09 ILE 17 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.10 GLU 18 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.09 THR 19 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.09 LEU 20 -0.10 GLN 274
ASP 149 0.11 VAL 21 -0.11 ASP 272
ASP 149 0.13 ASP 22 -0.11 ASP 272
ASP 149 0.13 ILE 23 -0.09 ASP 272
ASP 149 0.15 PHE 24 -0.12 SER 262
ASP 149 0.16 GLN 25 -0.12 ASP 272
ARG 137 0.14 GLU 26 -0.10 ASP 272
LEU 139 0.15 TYR 27 -0.09 SER 262
LEU 139 0.16 PRO 28 -0.12 ASP 29
ASP 149 0.15 ASP 29 -0.12 PRO 28
LEU 139 0.14 GLU 30 -0.08 SER 262
LEU 139 0.13 ILE 31 -0.09 HIE 267
LEU 139 0.13 GLU 32 -0.05 HIE 267
LEU 139 0.13 TYR 33 -0.03 GLU 255
ASP 149 0.12 ILE 34 -0.04 ASP 272
ARG 306 0.12 PHE 35 -0.05 ASP 272
ARG 306 0.14 LYS 36 -0.04 ASP 272
ARG 306 0.13 PRO 37 -0.05 ASP 272
ASP 149 0.12 SER 38 -0.08 ASP 272
ASP 149 0.11 CYX 39 -0.09 ASP 272
ARG 306 0.11 VAL 40 -0.08 ASP 272
ARG 306 0.11 PRO 41 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.10 LEU 42 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.10 MET 43 -0.08 GLN 274
CYX 45 0.08 ARG 44 -0.10 GLN 274
ARG 44 0.08 CYX 45 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.07 GLY 46 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.07 GLY 47 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.07 CYX 48 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.07 CYX 49 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.06 ASN 50 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.06 ASP 51 -0.07 GLN 274
GLN 25 0.07 GLU 52 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.09 GLY 53 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.09 LEU 54 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.10 GLU 55 -0.07 GLN 274
GLN 25 0.08 CYX 56 -0.08 GLN 274
GLU 26 0.09 VAL 57 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 PRO 58 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.07 THR 59 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 GLU 60 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 GLU 61 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.10 SER 62 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.11 ASN 63 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.13 ILE 64 -0.08 GLU 154
ARG 306 0.14 THR 65 -0.05 GLU 154
ARG 306 0.15 MET 66 -0.04 GLN 274
ARG 306 0.18 GLN 67 -0.04 ASP 7
ARG 306 0.17 ILE 68 -0.03 ASP 272
ARG 306 0.18 MET 69 -0.03 ASP 7
ARG 306 0.16 ARG 70 -0.03 GLU 255
ARG 306 0.16 ILE 71 -0.05 GLU 255
ARG 306 0.16 LYS 72 -0.06 GLU 255
ILE 71 0.13 PRO 73 -0.08 GLN 75
GLU 296 0.18 HIE 74 -0.08 GLU 255
ARG 306 0.22 GLN 75 -0.08 GLU 255
ARG 306 0.24 GLY 76 -0.08 GLU 255
ARG 306 0.23 GLN 77 -0.04 GLN 254
ARG 306 0.23 HIE 78 -0.04 GLN 254
ARG 306 0.22 ILE 79 -0.03 ASP 7
ARG 306 0.20 GLY 80 -0.03 ASP 7
ARG 306 0.17 GLU 81 -0.03 ASP 29
ARG 306 0.14 MET 82 -0.05 ASP 29
ARG 306 0.12 SER 83 -0.05 ASP 272
ARG 137 0.11 PHE 84 -0.07 ASP 272
ARG 137 0.11 LEU 85 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.09 GLN 86 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.09 HIE 87 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.09 ASN 88 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 LYS 89 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.08 CYX 90 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.07 GLU 91 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.07 CYX 92 -0.07 GLN 274
GLN 25 0.10 ARG 93 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.10 PRO 94 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.14 LYS 95 -0.05 PRO 94
GLN 25 0.15 LYS 96 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.13 ASP 97 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.11 ARG 98 -0.04 GLN 274
GLN 25 0.13 ALA 99 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.13 ARG 100 -0.02 GLN 274
GLN 25 0.11 GLN 101 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.11 GLU 102 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.10 ASN 103 -0.04 GLN 274
GLN 25 0.10 PRO 104 -0.04 GLN 274
GLN 25 0.08 CYX 105 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.08 GLY 106 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.08 PRO 107 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.09 CYX 108 -0.04 GLN 274
GLN 25 0.09 SER 109 -0.03 GLN 274
PRO 28 0.10 GLU 110 -0.02 ARG 153
GLN 25 0.10 ARG 111 -0.02 GLN 274
GLN 25 0.10 ARG 112 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.09 LYS 113 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.09 HIE 114 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.09 LEU 115 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.08 PHE 116 -0.04 GLY 229
GLN 25 0.07 VAL 117 -0.03 GLN 274
GLN 25 0.07 GLN 118 -0.04 GLN 274
PRO 28 0.06 ASP 119 -0.04 GLN 274
PRO 28 0.07 PRO 120 -0.04 GLN 274
PRO 28 0.06 GLN 121 -0.04 GLN 274
PRO 28 0.07 THR 122 -0.03 GLU 1
PRO 28 0.08 CYX 123 -0.02 GLN 274
PRO 28 0.08 LYS 124 -0.03 GLN 274
PRO 28 0.08 CYX 125 -0.03 GLN 274
PRO 28 0.09 SER 126 -0.02 HIE 231
PRO 28 0.08 CYX 127 -0.02 GLU 140
PRO 28 0.09 LYS 128 -0.03 GLY 229
PRO 28 0.10 ASN 129 -0.03 GLY 229
PRO 28 0.10 THR 130 -0.03 GLY 229
PRO 28 0.12 ASP 131 -0.02 GLY 229
PRO 28 0.12 SER 132 -0.03 GLY 229
PRO 28 0.13 ARG 133 -0.02 GLY 229
PRO 28 0.14 CYX 134 -0.02 GLY 229
PRO 28 0.14 LYS 135 -0.02 LYS 128
PRO 28 0.14 ALA 136 -0.02 GLY 229
PRO 28 0.16 ARG 137 -0.02 LYS 128
PRO 28 0.16 GLN 138 -0.02 LYS 128
PRO 28 0.16 LEU 139 -0.02 CYX 127
PRO 28 0.15 GLU 140 -0.02 CYX 127
PRO 28 0.14 LEU 141 -0.01 GLY 229
PRO 28 0.13 ASN 142 -0.01 GLU 143
PRO 28 0.12 GLU 143 -0.02 GLU 140
PRO 28 0.11 ARG 144 -0.01 GLY 233
PRO 28 0.12 THR 145 -0.01 ARG 147
PRO 28 0.12 CYX 146 -0.01 HIE 231
GLN 25 0.14 ARG 147 -0.01 THR 145
GLN 25 0.16 CYX 148 -0.01 ALA 99
GLN 25 0.16 ASP 149 -0.02 ASP 97
GLN 25 0.15 LYS 150 -0.03 PRO 94
GLN 25 0.13 PRO 151 -0.02 LYS 96
GLN 25 0.12 ARG 152 -0.03 GLN 274
ASP 29 0.11 ARG 153 -0.03 CYX 108
ARG 306 0.18 GLU 154 -0.08 ILE 64
ARG 306 0.18 VAL 155 -0.05 ASP 7
ARG 306 0.17 VAL 156 -0.05 ASP 7
ARG 306 0.19 LYS 157 -0.05 ASP 7
ARG 306 0.19 PHE 158 -0.05 ASP 7
PRO 304 0.19 MET 159 -0.06 ASP 7
ARG 306 0.17 ASP 160 -0.06 ASP 7
ARG 306 0.15 VAL 161 -0.05 ASP 7
PRO 304 0.16 TYR 162 -0.05 ASP 7
PRO 304 0.16 GLN 163 -0.07 ASP 7
PRO 304 0.13 ARG 164 -0.07 ASP 7
ARG 306 0.12 SER 165 -0.07 GLN 274
LYS 288 0.12 TYR 166 -0.07 GLN 274
LYS 288 0.10 CYX 167 -0.09 GLN 274
LYS 288 0.09 HIE 168 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.07 PRO 169 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.08 ILE 170 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.07 GLU 171 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.07 THR 172 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.06 LEU 173 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.06 VAL 174 -0.10 GLN 274
GLN 25 0.08 ASP 175 -0.09 GLN 274
GLN 25 0.08 ILE 176 -0.09 GLN 274
GLN 25 0.11 PHE 177 -0.07 GLN 274
GLY 199 0.12 GLN 178 -0.08 GLN 274
VAL 210 0.11 GLU 179 -0.09 GLN 274
VAL 210 0.09 TYR 180 -0.08 GLN 274
GLN 25 0.12 PRO 181 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.10 ASP 182 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.09 GLU 183 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.11 ILE 184 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.11 GLU 185 -0.04 GLN 274
GLN 25 0.09 TYR 186 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.08 ILE 187 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.07 PHE 188 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.06 LYS 189 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.06 PRO 190 -0.08 GLN 274
GLN 25 0.07 SER 191 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.06 CYX 192 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.06 VAL 193 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.06 PRO 194 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.06 LEU 195 -0.11 GLN 274
ARG 306 0.06 MET 196 -0.12 GLN 274
GLN 178 0.08 ARG 197 -0.12 GLN 274
GLN 178 0.09 CYX 198 -0.13 GLN 274
GLN 178 0.12 GLY 199 -0.13 GLN 274
GLN 178 0.11 GLY 200 -0.11 GLN 274
ASP 149 0.11 CYX 201 -0.10 ASP 272
LYS 288 0.11 CYX 202 -0.07 ASP 272
LYS 288 0.12 ASN 203 -0.06 ASP 272
LYS 288 0.12 ASP 204 -0.05 ASP 272
LYS 150 0.12 GLU 205 -0.06 ASP 272
LYS 150 0.12 GLY 206 -0.08 ASP 272
LYS 150 0.12 LEU 207 -0.09 ASP 272
LYS 150 0.13 GLU 208 -0.12 ASP 272
GLN 178 0.12 CYX 209 -0.13 GLN 274
GLN 178 0.12 VAL 210 -0.15 GLN 274
GLN 178 0.09 PRO 211 -0.14 GLN 274
GLN 178 0.07 THR 212 -0.13 GLN 274
LYS 288 0.06 GLU 213 -0.13 GLN 274
ARG 306 0.05 GLU 214 -0.13 GLN 274
ARG 306 0.04 SER 215 -0.13 GLN 274
ARG 306 0.04 ASN 216 -0.12 GLN 274
ARG 306 0.04 ILE 217 -0.12 GLN 274
ARG 306 0.04 THR 218 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.04 MET 219 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.04 GLN 220 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.05 ILE 221 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.05 MET 222 -0.07 GLN 274
GLN 25 0.06 ARG 223 -0.07 GLN 274
GLN 25 0.06 ILE 224 -0.06 GLN 274
GLN 25 0.06 LYS 225 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.07 PRO 226 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.06 HIE 227 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.05 GLN 228 -0.05 GLN 274
GLN 25 0.06 GLY 229 -0.05 GLN 274
ARG 306 0.05 GLN 230 -0.06 GLN 274
ARG 306 0.05 HIE 231 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.04 ILE 232 -0.07 GLN 274
ARG 306 0.04 GLY 233 -0.08 GLN 274
ARG 306 0.04 GLU 234 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.04 MET 235 -0.09 GLN 274
ARG 306 0.04 SER 236 -0.10 GLN 274
ARG 306 0.04 PHE 237 -0.12 GLN 274
ARG 306 0.04 LEU 238 -0.13 GLN 274
ARG 306 0.05 GLN 239 -0.13 GLN 274
GLN 178 0.06 HIE 240 -0.13 GLN 274
LYS 288 0.07 ASN 241 -0.11 GLN 274
LYS 288 0.08 LYS 242 -0.11 GLN 274
LYS 288 0.08 CYX 243 -0.11 GLN 274
LYS 288 0.10 GLU 244 -0.09 GLN 274
LYS 150 0.10 CYX 245 -0.08 GLN 274
LYS 150 0.11 ARG 246 -0.09 GLN 274
LYS 150 0.12 PRO 247 -0.08 PRO 273
LYS 150 0.13 LYS 248 -0.13 PRO 273
LYS 150 0.13 LYS 249 -0.15 PRO 273
LYS 150 0.11 ASP 250 -0.15 PRO 273
LYS 150 0.10 ARG 251 -0.05 VAL 210
LYS 150 0.11 ALA 252 -0.05 GLY 76
SER 285 0.11 ARG 253 -0.06 GLY 76
SER 285 0.15 GLN 254 -0.07 GLY 76
SER 285 0.16 GLU 255 -0.08 GLN 75
SER 285 0.14 ASN 256 -0.07 HIE 74
LYS 288 0.11 PRO 257 -0.06 GLY 76
LYS 150 0.11 CYX 258 -0.05 ASP 272
LYS 150 0.10 GLY 259 -0.05 VAL 270
LEU 139 0.10 PRO 260 -0.09 PHE 24
GLN 138 0.08 CYX 261 -0.11 PHE 24
GLU 263 0.09 SER 262 -0.12 PHE 24
GLN 138 0.10 GLU 263 -0.11 HIE 267
LEU 139 0.11 ARG 264 -0.08 HIE 267
LEU 139 0.10 ARG 265 -0.06 PHE 24
GLN 138 0.09 LYS 266 -0.05 GLN 25
GLN 138 0.07 HIE 267 -0.11 GLU 263
GLN 138 0.06 LEU 268 -0.09 GLN 25
GLN 138 0.06 PHE 269 -0.08 GLN 25
GLN 138 0.05 VAL 270 -0.11 GLN 25
GLU 255 0.06 GLN 271 -0.10 GLN 25
GLU 255 0.05 ASP 272 -0.14 VAL 210
GLU 255 0.06 PRO 273 -0.15 LYS 249
GLU 255 0.06 GLN 274 -0.15 VAL 210
GLU 255 0.07 THR 275 -0.12 VAL 210
GLU 255 0.10 CYX 276 -0.10 LYS 249
GLU 255 0.09 LYS 277 -0.10 ASP 250
GLU 255 0.09 CYX 278 -0.08 ASP 250
ASN 256 0.11 SER 279 -0.05 GLN 25
GLN 77 0.08 CYX 280 -0.06 GLN 25
GLN 77 0.06 LYS 281 -0.10 GLN 25
GLN 77 0.09 ASN 282 -0.08 PRO 28
GLU 255 0.11 THR 283 -0.09 THR 275
GLU 255 0.15 ASP 284 -0.09 THR 275
GLU 255 0.16 SER 285 -0.10 THR 275
GLN 77 0.12 ARG 286 -0.08 THR 275
GLN 77 0.14 CYX 287 -0.07 THR 275
GLN 77 0.18 LYS 288 -0.07 THR 275
MET 159 0.16 ALA 289 -0.08 THR 275
GLN 77 0.15 ARG 290 -0.06 THR 275
GLN 77 0.18 GLN 291 -0.06 THR 275
GLN 77 0.18 LEU 292 -0.05 THR 275
GLN 77 0.20 GLU 293 -0.05 SER 279
GLN 77 0.19 LEU 294 -0.04 SER 279
GLN 77 0.17 ASN 295 -0.04 GLU 263
GLN 77 0.19 GLU 296 -0.05 THR 298
GLN 77 0.14 ARG 297 -0.04 GLU 255
GLN 77 0.09 THR 298 -0.07 GLU 263
GLN 77 0.11 CYX 299 -0.06 GLU 263
GLN 75 0.12 ARG 300 -0.10 GLU 263
GLN 75 0.14 CYX 301 -0.07 GLU 263
GLN 75 0.16 ASP 302 -0.07 GLU 263
GLN 77 0.18 LYS 303 -0.05 GLU 263
GLY 76 0.23 PRO 304 -0.03 THR 275
GLY 76 0.20 ARG 305 -0.03 GLU 263
GLY 76 0.24 ARG 306 -0.02 CYX 276

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