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***  vegf  ***

CA distance fluctuations for 240125104642330507

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLN 274 0.11 GLU 1 -0.13 GLN 121
GLN 274 0.12 VAL 2 -0.13 PRO 120
GLN 274 0.12 VAL 3 -0.10 PRO 120
GLN 274 0.11 LYS 4 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.11 PHE 5 -0.06 PRO 120
GLN 274 0.11 MET 6 -0.04 GLN 101
GLN 274 0.11 ASP 7 -0.04 PRO 120
GLN 274 0.12 VAL 8 -0.06 PRO 120
GLN 274 0.11 TYR 9 -0.03 PRO 120
GLN 274 0.11 GLN 10 -0.02 ARG 93
GLN 274 0.11 ARG 11 -0.03 PRO 120
GLN 274 0.11 SER 12 -0.02 ASP 175
CYX 127 0.12 TYR 13 -0.03 ASP 175
LYS 128 0.14 CYX 14 -0.04 ASP 175
LYS 128 0.14 HID 15 -0.05 GLN 178
LYS 128 0.12 PRO 16 -0.06 GLN 178
GLN 274 0.10 ILE 17 -0.06 GLN 178
GLN 274 0.10 GLU 18 -0.07 GLN 178
GLN 274 0.11 THR 19 -0.07 GLN 178
GLN 274 0.11 LEU 20 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.12 VAL 21 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.12 ASP 22 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.11 ILE 23 -0.06 GLN 121
GLN 274 0.13 PHE 24 -0.06 GLN 121
GLN 274 0.13 GLN 25 -0.06 GLN 121
GLN 274 0.11 GLU 26 -0.05 ARG 306
ARG 137 0.11 TYR 27 -0.06 ARG 306
ARG 137 0.11 PRO 28 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.11 ASP 29 -0.05 GLN 121
ARG 137 0.10 GLU 30 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.09 ILE 31 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.09 GLU 32 -0.09 ARG 306
ARG 137 0.09 TYR 33 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 ILE 34 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 PHE 35 -0.06 GLN 121
ARG 137 0.07 LYS 36 -0.07 GLN 121
GLN 274 0.07 PRO 37 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.09 SER 38 -0.07 GLN 121
GLN 274 0.10 CYX 39 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.09 VAL 40 -0.06 PRO 120
GLN 274 0.09 PRO 41 -0.06 GLN 178
LYS 128 0.10 LEU 42 -0.05 GLN 178
LYS 128 0.11 MET 43 -0.05 GLN 178
LYS 128 0.11 ARG 44 -0.05 GLN 178
LYS 128 0.11 CYX 45 -0.06 GLN 178
GLN 274 0.12 GLY 46 -0.07 GLN 178
GLN 274 0.13 GLY 47 -0.06 ASP 175
GLN 274 0.12 CYX 48 -0.03 PRO 120
PHE 116 0.12 CYX 49 -0.03 LYS 150
PHE 116 0.14 ASN 50 -0.03 ARG 93
PHE 116 0.16 ASP 51 -0.04 LYS 95
PHE 116 0.15 GLU 52 -0.04 LYS 95
PHE 116 0.14 GLY 53 -0.05 LYS 95
LYS 128 0.14 LEU 54 -0.04 LYS 95
GLN 274 0.13 GLU 55 -0.04 LYS 150
LYS 128 0.12 CYX 56 -0.05 LYS 150
LYS 128 0.13 VAL 57 -0.05 LYS 150
LYS 128 0.15 PRO 58 -0.05 LYS 150
LYS 128 0.18 THR 59 -0.04 LYS 150
LYS 128 0.17 GLU 60 -0.04 ARG 306
LYS 128 0.15 GLU 61 -0.05 ARG 306
LYS 128 0.14 SER 62 -0.05 ARG 306
LYS 128 0.13 ASN 63 -0.06 ARG 306
LYS 128 0.12 ILE 64 -0.06 ARG 306
LYS 128 0.11 THR 65 -0.07 ARG 306
LYS 128 0.10 MET 66 -0.06 ARG 306
LYS 128 0.09 GLN 67 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 ILE 68 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 MET 69 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 ARG 70 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 ILE 71 -0.06 ARG 306
ARG 137 0.08 LYS 72 -0.08 ARG 306
ARG 137 0.07 PRO 73 -0.07 GLN 121
GLU 255 0.07 HIE 74 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.07 GLN 75 -0.09 ARG 306
ARG 137 0.07 GLY 76 -0.08 ARG 306
ARG 137 0.07 GLN 77 -0.07 ARG 306
ARG 137 0.08 HIE 78 -0.09 ARG 306
ARG 137 0.08 ILE 79 -0.08 ARG 306
ALA 136 0.09 GLY 80 -0.09 ARG 306
LYS 128 0.10 GLU 81 -0.09 ARG 306
ALA 136 0.10 MET 82 -0.08 ARG 306
LYS 128 0.11 SER 83 -0.07 ARG 306
LYS 128 0.11 PHE 84 -0.06 ARG 306
LYS 128 0.12 LEU 85 -0.05 ARG 306
LYS 128 0.13 GLN 86 -0.05 ARG 306
LYS 128 0.13 HIE 87 -0.05 GLN 178
LYS 128 0.15 ASN 88 -0.04 GLN 178
LYS 128 0.16 LYS 89 -0.04 GLN 178
LYS 128 0.16 CYX 90 -0.04 GLN 178
LYS 128 0.18 GLU 91 -0.04 CYX 56
LYS 128 0.18 CYX 92 -0.03 LYS 150
LYS 128 0.15 ARG 93 -0.04 LYS 150
GLN 101 0.17 PRO 94 -0.06 LYS 95
GLN 274 0.13 LYS 95 -0.06 PRO 94
GLN 274 0.13 LYS 96 -0.03 ARG 98
GLN 274 0.12 ASP 97 -0.03 CYX 123
LEU 115 0.14 ARG 98 -0.08 ALA 99
PRO 94 0.17 ALA 99 -0.08 ARG 98
GLN 274 0.12 ARG 100 -0.05 GLN 230
PRO 94 0.17 GLN 101 -0.08 ILE 224
ARG 98 0.12 GLU 102 -0.07 ILE 224
LEU 115 0.12 ASN 103 -0.06 GLN 101
GLN 274 0.09 PRO 104 -0.06 GLU 102
GLN 274 0.09 CYX 105 -0.06 GLU 102
GLN 274 0.07 GLY 106 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.05 PRO 107 -0.20 PRO 120
GLN 274 0.06 CYX 108 -0.21 CYX 123
GLY 106 0.05 SER 109 -0.29 CYX 123
GLN 274 0.04 GLU 110 -0.28 CYX 123
GLN 274 0.06 ARG 111 -0.20 CYX 123
GLN 274 0.07 ARG 112 -0.15 CYX 123
GLN 274 0.06 LYS 113 -0.09 CYX 123
CYX 92 0.10 HIE 114 -0.05 CYX 105
CYX 92 0.15 LEU 115 -0.07 ASN 129
ASP 51 0.16 PHE 116 -0.08 PRO 226
CYX 92 0.15 VAL 117 -0.07 GLU 110
CYX 92 0.10 GLN 118 -0.11 MET 235
CYX 92 0.08 ASP 119 -0.15 SER 109
CYX 125 0.05 PRO 120 -0.23 SER 109
CYX 127 0.06 GLN 121 -0.22 SER 109
CYX 127 0.08 THR 122 -0.23 SER 109
CYX 127 0.07 CYX 123 -0.29 SER 109
CYX 127 0.10 LYS 124 -0.20 GLU 110
CYX 92 0.10 CYX 125 -0.14 GLU 110
CYX 92 0.14 SER 126 -0.14 GLU 143
CYX 92 0.17 CYX 127 -0.13 GLU 143
CYX 92 0.18 LYS 128 -0.12 GLU 143
THR 59 0.17 ASN 129 -0.08 GLY 229
THR 59 0.12 THR 130 -0.09 GLU 143
THR 59 0.10 ASP 131 -0.05 GLY 229
THR 59 0.13 SER 132 -0.07 GLY 229
THR 59 0.13 ARG 133 -0.06 GLY 229
GLN 274 0.11 CYX 134 -0.05 GLY 229
THR 59 0.10 LYS 135 -0.05 GLY 229
THR 59 0.12 ALA 136 -0.06 GLY 229
GLN 274 0.12 ARG 137 -0.05 GLY 229
GLN 274 0.11 GLN 138 -0.04 GLY 229
GLN 274 0.11 LEU 139 -0.04 CYX 127
GLN 274 0.09 GLU 140 -0.06 CYX 127
GLN 274 0.08 LEU 141 -0.07 CYX 127
GLN 274 0.06 ASN 142 -0.11 CYX 123
GLN 274 0.05 GLU 143 -0.14 CYX 123
GLN 274 0.05 ARG 144 -0.21 CYX 123
GLN 274 0.06 THR 145 -0.17 CYX 123
GLN 274 0.07 CYX 146 -0.10 CYX 123
GLN 274 0.09 ARG 147 -0.09 CYX 123
GLN 274 0.10 CYX 148 -0.08 CYX 123
GLN 274 0.11 ASP 149 -0.10 CYX 123
GLN 274 0.09 LYS 150 -0.13 CYX 123
GLN 274 0.08 PRO 151 -0.17 CYX 123
GLN 274 0.08 ARG 152 -0.19 CYX 123
GLU 185 0.10 ARG 153 -0.21 CYX 123
SER 62 0.14 GLU 154 -0.08 ARG 306
LYS 128 0.11 VAL 155 -0.08 ARG 306
LYS 128 0.10 VAL 156 -0.06 ARG 306
LYS 128 0.08 LYS 157 -0.06 ASN 241
LYS 128 0.07 PHE 158 -0.06 ASN 241
LYS 128 0.06 MET 159 -0.08 ASN 241
LYS 128 0.07 ASP 160 -0.08 ASN 241
LYS 128 0.07 VAL 161 -0.07 ILE 170
LYS 128 0.06 TYR 162 -0.07 LYS 242
SER 285 0.06 GLN 163 -0.10 ASN 241
GLN 274 0.07 ARG 164 -0.11 ILE 170
GLN 274 0.08 SER 165 -0.08 PRO 120
GLN 274 0.07 TYR 166 -0.09 PRO 120
PRO 273 0.09 CYX 167 -0.10 PRO 120
GLN 274 0.10 HIE 168 -0.10 PRO 120
GLN 274 0.12 PRO 169 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.12 ILE 170 -0.11 ARG 164
GLN 274 0.12 GLU 171 -0.08 PRO 120
GLN 274 0.13 THR 172 -0.08 PRO 120
GLN 274 0.13 LEU 173 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.14 VAL 174 -0.10 PRO 120
GLN 274 0.14 ASP 175 -0.09 PRO 120
GLN 274 0.13 ILE 176 -0.12 PRO 120
GLN 274 0.13 PHE 177 -0.12 PRO 120
GLN 274 0.15 GLN 178 -0.13 PRO 120
GLN 274 0.14 GLU 179 -0.16 PRO 120
GLN 274 0.13 TYR 180 -0.19 PRO 120
GLN 274 0.12 PRO 181 -0.15 PRO 120
GLN 274 0.10 ASP 182 -0.19 PRO 120
GLN 274 0.11 GLU 183 -0.18 PRO 120
GLN 274 0.11 ILE 184 -0.13 PRO 120
ARG 153 0.10 GLU 185 -0.15 CYX 123
GLN 274 0.09 TYR 186 -0.14 PRO 120
GLN 274 0.10 ILE 187 -0.09 PRO 120
GLN 274 0.11 PHE 188 -0.09 PRO 120
GLN 274 0.11 LYS 189 -0.05 PRO 120
GLN 274 0.12 PRO 190 -0.05 PRO 120
GLN 274 0.12 SER 191 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.13 CYX 192 -0.08 PRO 120
GLN 274 0.13 VAL 193 -0.09 PRO 120
GLN 274 0.13 PRO 194 -0.08 PRO 120
GLN 274 0.14 LEU 195 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.13 MET 196 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.15 ARG 197 -0.12 PRO 120
GLN 274 0.15 CYX 198 -0.12 PRO 120
GLN 274 0.14 GLY 199 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.11 GLY 200 -0.09 PRO 120
PRO 273 0.10 CYX 201 -0.10 GLN 121
SER 285 0.08 CYX 202 -0.10 GLN 121
SER 285 0.07 ASN 203 -0.09 GLN 121
LYS 288 0.08 ASP 204 -0.10 GLN 121
SER 285 0.09 GLU 205 -0.10 GLN 121
SER 285 0.11 GLY 206 -0.12 GLN 121
SER 285 0.11 LEU 207 -0.13 GLN 121
PRO 273 0.13 GLU 208 -0.13 GLN 121
PRO 273 0.14 CYX 209 -0.14 GLN 121
PRO 273 0.16 VAL 210 -0.16 GLN 121
PRO 273 0.15 PRO 211 -0.16 GLN 121
LYS 249 0.14 THR 212 -0.17 GLN 121
GLN 274 0.13 GLU 213 -0.16 GLN 121
GLN 274 0.15 GLU 214 -0.17 GLN 121
GLN 274 0.14 SER 215 -0.17 GLN 121
GLN 274 0.14 ASN 216 -0.18 GLN 121
GLN 274 0.13 ILE 217 -0.15 PRO 120
GLN 274 0.13 THR 218 -0.16 PRO 120
GLN 274 0.12 MET 219 -0.13 PRO 120
GLN 274 0.11 GLN 220 -0.12 PRO 120
GLN 274 0.11 ILE 221 -0.11 PRO 120
GLN 274 0.10 MET 222 -0.07 PRO 120
GLN 274 0.09 ARG 223 -0.10 PRO 120
GLN 274 0.09 ILE 224 -0.08 GLN 101
GLN 274 0.07 LYS 225 -0.10 GLY 233
ASP 51 0.09 PRO 226 -0.08 GLY 233
ASP 51 0.13 HIE 227 -0.09 GLY 233
GLY 229 0.16 GLN 228 -0.09 GLY 233
GLN 228 0.16 GLY 229 -0.08 ASN 129
ASN 50 0.09 GLN 230 -0.07 GLN 101
GLN 274 0.08 HIE 231 -0.10 GLY 233
GLN 274 0.09 ILE 232 -0.09 PRO 120
GLN 274 0.10 GLY 233 -0.16 PRO 120
GLN 274 0.11 GLU 234 -0.17 PRO 120
GLN 274 0.12 MET 235 -0.20 PRO 120
GLN 274 0.13 SER 236 -0.19 PRO 120
GLN 274 0.15 PHE 237 -0.19 PRO 120
GLN 274 0.16 LEU 238 -0.18 PRO 120
GLN 274 0.15 GLN 239 -0.15 PRO 120
GLN 274 0.14 HIE 240 -0.14 GLN 121
GLN 274 0.12 ASN 241 -0.13 GLN 121
GLN 274 0.10 LYS 242 -0.13 GLN 121
GLN 274 0.11 CYX 243 -0.13 GLN 121
SER 285 0.10 GLU 244 -0.13 GLN 121
SER 285 0.10 CYX 245 -0.13 GLN 121
SER 285 0.13 ARG 246 -0.15 GLN 121
SER 285 0.14 PRO 247 -0.15 GLN 121
SER 285 0.14 LYS 248 -0.14 GLN 121
CYX 276 0.15 LYS 249 -0.15 GLN 121
CYX 276 0.15 ASP 250 -0.13 GLN 121
ASP 284 0.18 ARG 251 -0.13 GLN 121
SER 285 0.19 ALA 252 -0.14 GLN 121
LYS 288 0.17 ARG 253 -0.14 GLN 121
LYS 288 0.20 GLN 254 -0.14 GLN 121
LYS 288 0.23 GLU 255 -0.16 PRO 273
LYS 288 0.20 ASN 256 -0.12 PRO 273
LYS 288 0.15 PRO 257 -0.12 GLN 121
ASP 284 0.13 CYX 258 -0.11 GLN 121
ASP 284 0.09 GLY 259 -0.09 GLN 121
ASP 272 0.10 PRO 260 -0.08 GLN 121
ARG 137 0.08 CYX 261 -0.08 GLN 121
ARG 137 0.08 SER 262 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 GLU 263 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 ARG 264 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 ARG 265 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.07 LYS 266 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 HIE 267 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.07 LEU 268 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 PHE 269 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.08 VAL 270 -0.07 GLN 121
VAL 210 0.11 GLN 271 -0.07 GLN 121
VAL 210 0.13 ASP 272 -0.09 GLU 255
VAL 210 0.16 PRO 273 -0.16 GLU 255
LEU 238 0.16 GLN 274 -0.14 GLU 255
LEU 238 0.13 THR 275 -0.10 GLU 255
ASP 250 0.15 CYX 276 -0.12 GLU 255
ASP 250 0.12 LYS 277 -0.07 GLN 121
ASP 250 0.15 CYX 278 -0.07 GLN 121
ARG 251 0.15 SER 279 -0.07 GLN 121
ASN 256 0.12 CYX 280 -0.07 GLN 121
ARG 137 0.07 LYS 281 -0.07 GLN 121
GLU 255 0.11 ASN 282 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.13 THR 283 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.20 ASP 284 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.21 SER 285 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.17 ARG 286 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.19 CYX 287 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.23 LYS 288 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.20 ALA 289 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.18 ARG 290 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.20 GLN 291 -0.05 GLN 121
GLU 255 0.18 LEU 292 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.18 GLU 293 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.17 LEU 294 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.13 ASN 295 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.13 GLU 296 -0.07 GLN 121
GLU 255 0.08 ARG 297 -0.07 GLN 121
ASN 256 0.08 THR 298 -0.07 GLN 121
ASN 256 0.11 CYX 299 -0.07 GLN 121
GLU 255 0.10 ARG 300 -0.07 GLN 121
GLU 255 0.13 CYX 301 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.13 ASP 302 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.15 LYS 303 -0.06 GLN 121
GLU 255 0.14 PRO 304 -0.06 GLN 75
GLU 255 0.12 ARG 305 -0.07 GLU 32
GLU 255 0.10 ARG 306 -0.09 GLY 80

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