CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  vegf  ***

CA distance fluctuations for 240125104642330507

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLN 274 0.05 GLU 1 -0.04 GLN 163
GLN 274 0.06 VAL 2 -0.04 ASP 160
GLN 274 0.05 VAL 3 -0.04 ASP 160
GLN 274 0.05 LYS 4 -0.05 ASP 160
GLN 274 0.06 PHE 5 -0.05 ASP 160
GLN 274 0.05 MET 6 -0.05 ASP 160
GLN 274 0.04 ASP 7 -0.06 ASP 160
GLN 274 0.05 VAL 8 -0.05 ASP 160
GLN 274 0.06 TYR 9 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.04 GLN 10 -0.06 ASP 160
GLN 274 0.04 ARG 11 -0.06 ASP 160
GLN 274 0.05 SER 12 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.05 TYR 13 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.05 CYX 14 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.04 HID 15 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.03 PRO 16 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.03 ILE 17 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.03 GLU 18 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.03 THR 19 -0.02 GLU 154
GLN 178 0.05 LEU 20 -0.01 ASP 7
GLN 178 0.07 VAL 21 -0.02 CYX 209
GLN 178 0.09 ASP 22 -0.02 CYX 209
ASP 149 0.08 ILE 23 -0.02 CYX 209
LYS 150 0.10 PHE 24 -0.02 GLU 208
GLN 178 0.11 GLN 25 -0.03 CYX 209
ASP 149 0.09 GLU 26 -0.02 CYX 209
ASP 149 0.10 TYR 27 -0.02 CYX 209
ASP 149 0.12 PRO 28 -0.03 GLU 208
LYS 150 0.13 ASP 29 -0.03 GLU 208
LYS 150 0.11 GLU 30 -0.02 GLU 208
LYS 150 0.12 ILE 31 -0.02 LYS 249
LYS 150 0.10 GLU 32 -0.01 LYS 249
LYS 150 0.09 TYR 33 -0.01 LYS 249
LYS 150 0.09 ILE 34 -0.01 ASP 29
LYS 150 0.08 PHE 35 -0.01 PRO 28
LYS 150 0.06 LYS 36 -0.02 ASP 7
LYS 150 0.06 PRO 37 -0.02 ASP 7
GLN 178 0.07 SER 38 -0.01 PRO 28
GLN 178 0.07 CYX 39 -0.01 CYX 209
GLN 178 0.05 VAL 40 -0.02 ASP 7
GLN 178 0.03 PRO 41 -0.03 ARG 11
ASP 149 0.02 LEU 42 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.03 MET 43 -0.04 GLU 154
CYX 45 0.04 ARG 44 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.06 CYX 45 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.07 GLY 46 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.06 GLY 47 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.07 CYX 48 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.06 CYX 49 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.06 ASN 50 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.07 ASP 51 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.08 GLU 52 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.09 GLY 53 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 LEU 54 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.09 GLU 55 -0.02 GLU 154
GLN 25 0.08 CYX 56 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.09 VAL 57 -0.02 GLU 154
PRO 28 0.07 PRO 58 -0.03 GLU 154
PRO 28 0.05 THR 59 -0.03 GLU 154
PRO 28 0.03 GLU 60 -0.04 GLU 154
ASP 29 0.03 GLU 61 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.02 SER 62 -0.01 GLU 154
ASP 149 0.02 ASN 63 -0.02 ASN 88
ASP 149 0.02 ILE 64 -0.03 ASN 88
LYS 150 0.03 THR 65 -0.03 ASN 88
LYS 150 0.03 MET 66 -0.03 GLN 10
LYS 150 0.04 GLN 67 -0.04 GLN 10
LYS 150 0.05 ILE 68 -0.03 ASP 7
LYS 150 0.06 MET 69 -0.03 ASP 7
LYS 150 0.07 ARG 70 -0.02 PRO 73
LYS 150 0.08 ILE 71 -0.02 PRO 73
LYS 150 0.08 LYS 72 -0.02 GLU 296
LYS 150 0.09 PRO 73 -0.03 GLN 77
LYS 150 0.09 HIE 74 -0.04 GLN 77
LYS 150 0.08 GLN 75 -0.03 ARG 306
LYS 150 0.07 GLY 76 -0.04 GLN 77
LYS 150 0.07 GLN 77 -0.04 GLY 76
LYS 150 0.06 HIE 78 -0.03 GLY 76
LYS 150 0.05 ILE 79 -0.03 ARG 306
LYS 150 0.05 GLY 80 -0.03 ASP 7
LYS 150 0.04 GLU 81 -0.03 GLN 10
ASP 149 0.05 MET 82 -0.02 ASP 7
ASP 149 0.04 SER 83 -0.02 ASN 88
ASP 149 0.05 PHE 84 -0.01 VAL 210
VAL 57 0.04 LEU 85 -0.02 VAL 210
VAL 57 0.03 GLN 86 -0.02 GLU 154
ASP 29 0.03 HIE 87 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.02 ASN 88 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.03 LYS 89 -0.06 GLU 154
PRO 28 0.05 CYX 90 -0.04 GLU 154
PRO 28 0.06 GLU 91 -0.04 GLU 154
PRO 28 0.07 CYX 92 -0.04 GLU 154
PRO 28 0.09 ARG 93 -0.02 GLU 154
PRO 28 0.09 PRO 94 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 LYS 95 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 LYS 96 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.11 ASP 97 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.10 ARG 98 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ALA 99 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 ARG 100 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 GLN 101 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 GLU 102 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ASN 103 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 PRO 104 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 CYX 105 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.11 GLY 106 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.12 PRO 107 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.13 CYX 108 -0.02 ARG 153
GLN 274 0.14 SER 109 -0.02 ARG 153
GLN 274 0.14 GLU 110 -0.02 ARG 153
GLN 274 0.14 ARG 111 -0.01 ARG 153
GLN 274 0.13 ARG 112 -0.01 ARG 153
GLN 274 0.12 LYS 113 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 HIE 114 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 LEU 115 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.09 PHE 116 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.10 VAL 117 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.10 GLN 118 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ASP 119 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 PRO 120 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 GLN 121 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 THR 122 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 CYX 123 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 LYS 124 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 CYX 125 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 SER 126 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 CYX 127 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 LYS 128 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ASN 129 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 THR 130 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 ASP 131 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.11 SER 132 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.11 ARG 133 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.12 CYX 134 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.11 LYS 135 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.11 ALA 136 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.11 ARG 137 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.12 GLN 138 -0.00 TYR 13
GLN 274 0.13 LEU 139 -0.00 TYR 13
GLN 274 0.13 GLU 140 -0.00 TYR 13
GLN 274 0.14 LEU 141 -0.00 HID 15
GLN 274 0.15 ASN 142 -0.00 HID 15
GLN 274 0.14 GLU 143 -0.00 GLU 154
GLN 274 0.15 ARG 144 -0.01 ARG 153
GLN 274 0.15 THR 145 -0.01 ARG 153
GLN 274 0.14 CYX 146 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.14 ARG 147 -0.01 HID 15
GLN 274 0.14 CYX 148 -0.01 GLU 91
GLN 274 0.15 ASP 149 -0.01 PRO 94
GLN 274 0.17 LYS 150 -0.01 PRO 94
GLN 274 0.16 PRO 151 -0.01 PRO 94
GLN 274 0.17 ARG 152 -0.01 PRO 94
GLN 274 0.17 ARG 153 -0.02 CYX 108
VAL 155 0.01 GLU 154 -0.06 GLN 10
LYS 150 0.02 VAL 155 -0.05 GLN 10
LYS 150 0.02 VAL 156 -0.05 GLN 10
LYS 150 0.02 LYS 157 -0.05 GLN 10
LYS 150 0.03 PHE 158 -0.05 ASP 7
LYS 150 0.03 MET 159 -0.05 ASP 7
LYS 150 0.02 ASP 160 -0.06 GLN 10
LYS 150 0.03 VAL 161 -0.05 ASP 7
LYS 150 0.04 TYR 162 -0.04 ASP 7
LYS 150 0.03 GLN 163 -0.06 ASP 7
GLN 178 0.02 ARG 164 -0.05 ASP 7
GLN 178 0.04 SER 165 -0.03 ASP 7
GLN 178 0.04 TYR 166 -0.04 ASP 7
GLN 178 0.04 CYX 167 -0.02 ASP 7
CYX 198 0.04 HIE 168 -0.03 ASP 7
GLN 274 0.03 PRO 169 -0.02 ASP 7
GLN 274 0.03 ILE 170 -0.04 GLU 171
GLN 274 0.03 GLU 171 -0.05 ARG 164
GLN 274 0.05 THR 172 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.06 LEU 173 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 VAL 174 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.09 ASP 175 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ILE 176 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.12 PHE 177 -0.01 VAL 57
GLN 274 0.12 GLN 178 -0.01 VAL 57
GLN 274 0.13 GLU 179 -0.01 VAL 57
GLN 274 0.13 TYR 180 -0.01 VAL 57
GLN 274 0.14 PRO 181 -0.01 THR 59
GLN 274 0.15 ASP 182 -0.01 THR 59
GLN 274 0.13 GLU 183 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.13 ILE 184 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.13 GLU 185 -0.02 ARG 153
GLN 274 0.12 TYR 186 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.10 ILE 187 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.09 PHE 188 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 LYS 189 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.07 PRO 190 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.08 SER 191 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 CYX 192 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.07 VAL 193 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.05 PRO 194 -0.04 ASP 160
GLN 274 0.06 LEU 195 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.04 MET 196 -0.02 ARG 164
GLN 274 0.05 ARG 197 -0.01 GLU 154
GLU 208 0.05 CYX 198 -0.02 ARG 44
GLN 178 0.07 GLY 199 -0.02 CYX 243
GLN 178 0.06 GLY 200 -0.02 CYX 167
GLN 178 0.07 CYX 201 -0.02 CYX 167
GLN 178 0.06 CYX 202 -0.02 ASP 7
GLN 178 0.07 ASN 203 -0.02 ASP 7
LYS 150 0.07 ASP 204 -0.02 ASP 29
LYS 150 0.09 GLU 205 -0.02 ASP 29
LYS 150 0.09 GLY 206 -0.02 ASP 29
GLN 178 0.08 LEU 207 -0.02 ASP 29
GLN 178 0.09 GLU 208 -0.03 ASP 29
GLN 178 0.07 CYX 209 -0.03 GLN 25
GLU 179 0.06 VAL 210 -0.03 GLN 25
LYS 249 0.05 PRO 211 -0.01 GLN 25
LYS 249 0.03 THR 212 -0.01 GLN 25
LYS 249 0.03 GLU 213 -0.02 GLN 254
LYS 249 0.05 GLU 214 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.05 SER 215 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.07 ASN 216 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.06 ILE 217 -0.02 ASP 160
GLN 274 0.07 THR 218 -0.02 ASP 160
GLN 274 0.07 MET 219 -0.03 ASP 160
GLN 274 0.07 GLN 220 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 ILE 221 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 MET 222 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.09 ARG 223 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 ILE 224 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.10 LYS 225 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.10 PRO 226 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 HIE 227 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 GLN 228 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 GLY 229 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 GLN 230 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.08 HIE 231 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 ILE 232 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 GLY 233 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 GLU 234 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 MET 235 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.09 SER 236 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.09 PHE 237 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.08 LEU 238 -0.01 GLU 154
GLN 274 0.06 GLN 239 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.05 HIE 240 -0.01 CYX 243
GLN 274 0.03 ASN 241 -0.03 GLU 1
GLN 178 0.02 LYS 242 -0.03 GLN 254
GLN 178 0.03 CYX 243 -0.03 LYS 242
GLN 178 0.03 GLU 244 -0.03 LYS 242
GLN 178 0.05 CYX 245 -0.02 LYS 242
ARG 153 0.05 ARG 246 -0.02 ASP 29
ARG 153 0.07 PRO 247 -0.02 ASP 29
ARG 153 0.10 LYS 248 -0.03 ASP 29
ARG 153 0.11 LYS 249 -0.03 ASP 29
ARG 153 0.12 ASP 250 -0.02 ASP 29
ARG 153 0.11 ARG 251 -0.01 ASP 29
ARG 153 0.09 ALA 252 -0.02 PRO 273
LYS 150 0.07 ARG 253 -0.03 LYS 242
LYS 150 0.06 GLN 254 -0.03 LYS 242
LYS 150 0.07 GLU 255 -0.03 LYS 242
LYS 150 0.09 ASN 256 -0.02 LYS 242
LYS 150 0.09 PRO 257 -0.02 LYS 242
LYS 150 0.11 CYX 258 -0.01 ASP 29
LYS 150 0.12 GLY 259 -0.01 MET 159
LYS 150 0.14 PRO 260 -0.01 ASP 250
LYS 150 0.14 CYX 261 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.14 SER 262 -0.02 GLU 263
LYS 150 0.13 GLU 263 -0.02 SER 262
LYS 150 0.12 ARG 264 -0.01 LYS 72
LYS 150 0.12 ARG 265 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.12 LYS 266 -0.02 GLN 77
LYS 150 0.13 HIE 267 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.13 LEU 268 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.13 PHE 269 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.14 VAL 270 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.15 GLN 271 -0.01 GLU 255
ARG 153 0.16 ASP 272 -0.02 GLU 255
ARG 153 0.16 PRO 273 -0.02 GLU 255
ARG 153 0.17 GLN 274 -0.02 GLU 255
ARG 153 0.16 THR 275 -0.02 GLU 255
ARG 153 0.14 CYX 276 -0.03 GLU 255
ARG 153 0.14 LYS 277 -0.02 GLU 255
LYS 150 0.13 CYX 278 -0.02 GLU 255
LYS 150 0.12 SER 279 -0.02 MET 159
LYS 150 0.12 CYX 280 -0.02 MET 159
LYS 150 0.14 LYS 281 -0.01 GLN 77
LYS 150 0.13 ASN 282 -0.02 MET 159
LYS 150 0.12 THR 283 -0.02 MET 159
LYS 150 0.11 ASP 284 -0.02 MET 159
LYS 150 0.11 SER 285 -0.02 MET 159
LYS 150 0.11 ARG 286 -0.02 MET 159
LYS 150 0.11 CYX 287 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 LYS 288 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 ALA 289 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 ARG 290 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 GLN 291 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 LEU 292 -0.03 MET 159
LYS 150 0.09 GLU 293 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 LEU 294 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 ASN 295 -0.03 GLN 77
LYS 150 0.09 GLU 296 -0.03 GLN 77
LYS 150 0.10 ARG 297 -0.03 GLN 77
LYS 150 0.11 THR 298 -0.02 GLN 77
LYS 150 0.11 CYX 299 -0.02 GLN 77
LYS 150 0.11 ARG 300 -0.02 GLN 77
LYS 150 0.11 CYX 301 -0.02 MET 159
LYS 150 0.11 ASP 302 -0.03 MET 159
LYS 150 0.10 LYS 303 -0.03 MET 159
LYS 150 0.09 PRO 304 -0.04 MET 159
LYS 150 0.09 ARG 305 -0.03 MET 159
LYS 150 0.08 ARG 306 -0.04 MET 159

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.