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***  vegf  ***

CA distance fluctuations for 240125104642330507

---  normal mode 8  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
LYS 288 0.06 GLU 1 -0.04 ASP 29
LYS 288 0.05 VAL 2 -0.04 ASP 29
LYS 288 0.05 VAL 3 -0.04 GLN 25
LYS 288 0.05 LYS 4 -0.04 GLN 25
LYS 288 0.04 PHE 5 -0.04 GLN 25
GLU 154 0.05 MET 6 -0.03 GLN 25
GLU 154 0.06 ASP 7 -0.03 GLN 25
GLU 154 0.05 VAL 8 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.05 TYR 9 -0.03 GLN 25
GLU 154 0.06 GLN 10 -0.02 GLN 25
GLU 154 0.06 ARG 11 -0.03 GLN 25
GLN 274 0.07 SER 12 -0.03 GLN 25
GLN 274 0.07 TYR 13 -0.02 GLN 25
GLN 274 0.09 CYX 14 -0.02 ARG 306
GLN 274 0.08 HID 15 -0.02 ARG 306
GLN 274 0.08 PRO 16 -0.02 ARG 306
GLN 274 0.07 ILE 17 -0.02 GLN 25
GLN 274 0.07 GLU 18 -0.01 VAL 21
GLN 274 0.08 THR 19 -0.02 VAL 21
GLN 274 0.08 LEU 20 -0.03 VAL 21
GLN 274 0.10 VAL 21 -0.05 ARG 197
GLN 274 0.11 ASP 22 -0.06 ARG 197
GLN 274 0.11 ILE 23 -0.06 GLU 179
GLN 274 0.14 PHE 24 -0.08 GLU 179
GLN 274 0.16 GLN 25 -0.10 GLN 178
GLN 274 0.13 GLU 26 -0.08 GLN 178
GLN 274 0.14 TYR 27 -0.08 GLN 178
GLN 274 0.16 PRO 28 -0.09 GLN 178
GLN 274 0.15 ASP 29 -0.09 GLU 179
GLN 274 0.11 GLU 30 -0.08 ARG 306
GLN 274 0.10 ILE 31 -0.08 ARG 306
GLN 274 0.07 GLU 32 -0.09 ARG 306
ASP 272 0.06 TYR 33 -0.06 ARG 306
ASP 272 0.05 ILE 34 -0.03 CYX 209
GLN 274 0.05 PHE 35 -0.03 GLU 179
GLU 296 0.03 LYS 36 -0.03 ASN 256
GLU 296 0.04 PRO 37 -0.03 GLU 255
GLN 274 0.06 SER 38 -0.03 ILE 31
GLN 274 0.07 CYX 39 -0.03 ARG 197
GLN 274 0.06 VAL 40 -0.02 GLN 178
GLN 274 0.06 PRO 41 -0.01 ASN 88
GLN 274 0.08 LEU 42 -0.02 GLN 178
GLN 274 0.08 MET 43 -0.02 ARG 306
GLN 274 0.10 ARG 44 -0.03 GLN 178
GLN 274 0.11 CYX 45 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.10 GLY 46 -0.04 GLY 47
GLN 274 0.09 GLY 47 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.09 CYX 48 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.09 CYX 49 -0.03 GLN 25
GLN 274 0.08 ASN 50 -0.02 GLN 25
GLN 274 0.08 ASP 51 -0.02 GLN 25
GLN 274 0.09 GLU 52 -0.03 GLN 25
GLN 274 0.11 GLY 53 -0.03 PRO 28
GLN 274 0.11 LEU 54 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.12 GLU 55 -0.03 PRO 28
GLN 274 0.12 CYX 56 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.13 VAL 57 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.12 PRO 58 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.12 THR 59 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.11 GLU 60 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.11 GLU 61 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.10 SER 62 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.09 ASN 63 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.07 ILE 64 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.06 THR 65 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.05 MET 66 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.03 GLN 67 -0.04 GLU 255
GLN 274 0.04 ILE 68 -0.04 GLU 255
LYS 242 0.02 MET 69 -0.05 ASN 256
GLN 274 0.04 ARG 70 -0.04 ILE 71
GLY 76 0.02 ILE 71 -0.04 ARG 70
GLU 263 0.03 LYS 72 -0.03 CYX 278
ASP 204 0.06 PRO 73 -0.05 CYX 278
ASP 204 0.08 HIE 74 -0.07 GLN 75
ASP 204 0.04 GLN 75 -0.07 HIE 74
GLU 244 0.04 GLY 76 -0.06 CYX 278
LYS 242 0.03 GLN 77 -0.06 CYX 278
LYS 242 0.03 HIE 78 -0.05 ASN 256
LYS 242 0.03 ILE 79 -0.05 ASN 256
GLN 274 0.03 GLY 80 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.04 GLU 81 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.06 MET 82 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.08 SER 83 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.09 PHE 84 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.11 LEU 85 -0.05 GLN 178
GLN 274 0.10 GLN 86 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.10 HIE 87 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.09 ASN 88 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.09 LYS 89 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.11 CYX 90 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.11 GLU 91 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.11 CYX 92 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.13 ARG 93 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.13 PRO 94 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.14 LYS 95 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.15 LYS 96 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.14 ASP 97 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.12 ARG 98 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.13 ALA 99 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.14 ARG 100 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.12 GLN 101 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.12 GLU 102 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.11 ASN 103 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.11 PRO 104 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.09 CYX 105 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.09 GLY 106 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.09 PRO 107 -0.05 ASP 29
GLN 274 0.11 CYX 108 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.11 SER 109 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.13 GLU 110 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.13 ARG 111 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.12 ARG 112 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.11 LYS 113 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.10 HIE 114 -0.04 PRO 28
GLN 274 0.10 LEU 115 -0.03 PRO 28
GLN 274 0.08 PHE 116 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.08 VAL 117 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.08 GLN 118 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.08 ASP 119 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.08 PRO 120 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.07 GLN 121 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.08 THR 122 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.09 CYX 123 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.09 LYS 124 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.09 CYX 125 -0.03 PRO 28
GLN 274 0.10 SER 126 -0.03 PRO 28
GLN 274 0.09 CYX 127 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.10 LYS 128 -0.03 ARG 306
GLN 274 0.11 ASN 129 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.12 THR 130 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.13 ASP 131 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.13 SER 132 -0.04 ARG 306
GLN 274 0.14 ARG 133 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.15 CYX 134 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.14 LYS 135 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.14 ALA 136 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.15 ARG 137 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.16 GLN 138 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.16 LEU 139 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.16 GLU 140 -0.06 ARG 306
GLN 274 0.16 LEU 141 -0.05 ARG 306
GLN 274 0.16 ASN 142 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.14 GLU 143 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.14 ARG 144 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.15 THR 145 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.14 CYX 146 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.16 ARG 147 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.17 CYX 148 -0.06 PRO 28
GLN 274 0.18 ASP 149 -0.06 PRO 28
GLN 274 0.18 LYS 150 -0.07 PRO 28
GLN 274 0.16 PRO 151 -0.07 PRO 28
GLN 274 0.15 ARG 152 -0.07 PRO 28
GLN 274 0.15 ARG 153 -0.07 PRO 28
ASP 7 0.06 GLU 154 -0.04 ARG 306
ASP 7 0.04 VAL 155 -0.04 GLU 255
ASP 7 0.04 VAL 156 -0.04 GLU 255
ASN 241 0.04 LYS 157 -0.05 GLU 255
ASN 241 0.04 PHE 158 -0.06 GLU 255
ASN 241 0.05 MET 159 -0.07 GLU 255
ASN 241 0.05 ASP 160 -0.06 GLU 255
ILE 170 0.04 VAL 161 -0.04 GLU 255
LYS 242 0.04 TYR 162 -0.05 GLU 255
ASN 241 0.06 GLN 163 -0.06 GLN 254
ILE 170 0.07 ARG 164 -0.04 GLN 254
GLU 296 0.05 SER 165 -0.02 GLN 254
GLU 296 0.06 TYR 166 -0.03 GLN 254
LYS 288 0.07 CYX 167 -0.03 ILE 31
LYS 288 0.07 HIE 168 -0.03 ASP 29
LYS 288 0.07 PRO 169 -0.04 PHE 24
ARG 164 0.07 ILE 170 -0.04 GLN 25
ARG 164 0.06 GLU 171 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.06 THR 172 -0.06 GLN 25
GLN 274 0.07 LEU 173 -0.06 GLN 25
GLN 274 0.08 VAL 174 -0.08 GLN 25
GLN 274 0.10 ASP 175 -0.07 GLN 25
GLN 274 0.10 ILE 176 -0.07 GLN 25
GLN 274 0.12 PHE 177 -0.08 GLN 25
GLN 274 0.13 GLN 178 -0.10 GLN 25
GLN 274 0.11 GLU 179 -0.09 GLN 25
GLN 274 0.11 TYR 180 -0.08 ASP 29
GLN 274 0.14 PRO 181 -0.08 PRO 28
GLN 274 0.13 ASP 182 -0.08 PRO 28
GLN 274 0.11 GLU 183 -0.07 ASP 29
GLN 274 0.13 ILE 184 -0.06 PRO 28
GLN 274 0.12 GLU 185 -0.06 PRO 28
GLN 274 0.10 TYR 186 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.10 ILE 187 -0.05 PRO 28
GLN 274 0.08 PHE 188 -0.05 ASP 29
GLN 274 0.07 LYS 189 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.07 PRO 190 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.09 SER 191 -0.05 GLN 25
GLN 274 0.08 CYX 192 -0.06 GLN 25
GLN 274 0.06 VAL 193 -0.06 GLN 25
LYS 288 0.05 PRO 194 -0.05 GLN 25
LYS 288 0.06 LEU 195 -0.06 GLN 25
LYS 288 0.06 MET 196 -0.06 GLN 25
LYS 288 0.06 ARG 197 -0.07 GLN 25
LYS 288 0.07 CYX 198 -0.07 PHE 24
GLU 208 0.07 GLY 199 -0.06 PHE 24
GLU 208 0.07 GLY 200 -0.04 PHE 24
GLU 208 0.06 CYX 201 -0.04 ILE 31
GLU 296 0.08 CYX 202 -0.03 ILE 31
GLU 296 0.07 ASN 203 -0.03 ILE 31
GLU 296 0.09 ASP 204 -0.03 MET 159
GLU 296 0.08 GLU 205 -0.03 SER 262
GLN 25 0.08 GLY 206 -0.04 SER 262
LYS 288 0.09 LEU 207 -0.04 SER 262
GLY 200 0.07 GLU 208 -0.06 SER 262
LYS 288 0.07 CYX 209 -0.06 ILE 31
LYS 288 0.08 VAL 210 -0.06 SER 262
LYS 288 0.08 PRO 211 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.10 THR 212 -0.05 SER 262
LYS 288 0.09 GLU 213 -0.05 ASP 29
LYS 288 0.08 GLU 214 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.07 SER 215 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.07 ASN 216 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.06 ILE 217 -0.06 GLN 25
LYS 288 0.06 THR 218 -0.05 ASP 29
LYS 288 0.05 MET 219 -0.05 GLN 25
LYS 288 0.05 GLN 220 -0.04 GLN 25
GLN 274 0.05 ILE 221 -0.05 GLN 25
GLN 274 0.06 MET 222 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.07 ARG 223 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.07 ILE 224 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.07 LYS 225 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.08 PRO 226 -0.04 ASP 29
GLN 274 0.07 HIE 227 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.06 GLN 228 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.06 GLY 229 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.06 GLN 230 -0.03 ASP 29
GLN 274 0.05 HIE 231 -0.04 ASP 29
CYX 276 0.05 ILE 232 -0.04 ASP 29
CYX 276 0.05 GLY 233 -0.05 ASP 29
LYS 288 0.05 GLU 234 -0.05 ASP 29
LYS 288 0.05 MET 235 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.06 SER 236 -0.07 ASP 29
LYS 288 0.06 PHE 237 -0.07 GLN 25
LYS 288 0.06 LEU 238 -0.08 GLN 25
LYS 288 0.07 GLN 239 -0.07 GLN 25
LYS 288 0.07 HIE 240 -0.06 ASP 29
LYS 288 0.08 ASN 241 -0.04 ASP 29
LYS 288 0.09 LYS 242 -0.04 ASP 29
LYS 288 0.09 CYX 243 -0.04 ASP 29
LYS 288 0.10 GLU 244 -0.03 SER 262
LYS 288 0.10 CYX 245 -0.03 SER 262
LYS 288 0.11 ARG 246 -0.04 GLN 274
LYS 288 0.11 PRO 247 -0.04 GLN 274
GLN 178 0.09 LYS 248 -0.06 SER 262
LYS 150 0.12 LYS 249 -0.06 ASP 272
GLN 25 0.10 ASP 250 -0.06 SER 262
LYS 288 0.11 ARG 251 -0.12 PRO 273
LYS 288 0.14 ALA 252 -0.13 PRO 273
LYS 288 0.15 ARG 253 -0.09 PRO 273
LYS 288 0.19 GLN 254 -0.12 PRO 273
LYS 288 0.21 GLU 255 -0.13 PRO 273
LEU 294 0.18 ASN 256 -0.10 PRO 273
LEU 294 0.15 PRO 257 -0.06 MET 159
LEU 294 0.09 CYX 258 -0.04 GLN 77
PHE 24 0.10 GLY 259 -0.04 GLN 77
ASP 29 0.10 PRO 260 -0.05 CYX 261
ASP 272 0.08 CYX 261 -0.05 PRO 260
ASP 272 0.08 SER 262 -0.06 GLU 208
ASP 272 0.06 GLU 263 -0.06 ARG 306
ASP 272 0.07 ARG 264 -0.06 ARG 306
ASP 272 0.05 ARG 265 -0.03 ARG 306
PRO 257 0.07 LYS 266 -0.02 GLN 77
ASN 256 0.05 HIE 267 -0.05 PRO 260
ASN 256 0.07 LEU 268 -0.03 PRO 260
ASN 256 0.07 PHE 269 -0.03 GLN 77
ASP 29 0.08 VAL 270 -0.04 GLN 271
ASP 29 0.11 GLN 271 -0.04 ARG 251
ASP 29 0.14 ASP 272 -0.10 ARG 251
LYS 150 0.16 PRO 273 -0.13 GLU 255
LYS 150 0.18 GLN 274 -0.11 GLU 255
LYS 150 0.15 THR 275 -0.09 GLU 255
LYS 150 0.15 CYX 276 -0.10 GLU 255
LYS 150 0.11 LYS 277 -0.04 GLU 255
LYS 150 0.09 CYX 278 -0.06 HIE 74
ASN 256 0.11 SER 279 -0.06 GLU 296
ASN 256 0.12 CYX 280 -0.05 GLU 296
ASN 256 0.08 LYS 281 -0.02 GLU 296
GLU 255 0.11 ASN 282 -0.03 THR 275
GLU 255 0.11 THR 283 -0.05 THR 275
GLU 255 0.17 ASP 284 -0.05 GLU 296
GLU 255 0.17 SER 285 -0.05 THR 275
GLU 255 0.14 ARG 286 -0.04 THR 275
GLU 255 0.17 CYX 287 -0.03 GLN 75
GLU 255 0.21 LYS 288 -0.04 GLN 75
GLU 255 0.17 ALA 289 -0.03 THR 275
GLU 255 0.16 ARG 290 -0.03 THR 275
GLU 255 0.19 GLN 291 -0.03 GLU 32
GLU 255 0.18 LEU 292 -0.04 GLU 32
GLU 255 0.19 GLU 293 -0.05 GLU 32
GLU 255 0.19 LEU 294 -0.05 ASN 295
GLN 254 0.14 ASN 295 -0.05 LEU 294
GLN 254 0.15 GLU 296 -0.06 GLN 75
GLN 254 0.09 ARG 297 -0.05 SER 279
ASN 256 0.08 THR 298 -0.04 GLU 32
ASN 256 0.12 CYX 299 -0.03 CYX 280
GLU 255 0.11 ARG 300 -0.05 GLU 263
GLU 255 0.14 CYX 301 -0.04 GLU 32
GLU 255 0.14 ASP 302 -0.05 GLU 32
GLU 255 0.15 LYS 303 -0.05 GLU 32
GLN 254 0.16 PRO 304 -0.07 GLU 32
GLN 254 0.14 ARG 305 -0.08 GLU 32
GLN 254 0.13 ARG 306 -0.09 GLU 32

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