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***  vegf  ***

CA distance fluctuations for 240125104642330507

---  normal mode 9  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLN 274 0.12 GLU 1 -0.08 GLU 154
GLN 274 0.11 VAL 2 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.10 VAL 3 -0.08 GLU 154
GLN 274 0.09 LYS 4 -0.09 GLU 154
GLN 274 0.08 PHE 5 -0.09 GLU 154
GLN 274 0.07 MET 6 -0.10 GLU 154
GLN 274 0.07 ASP 7 -0.11 GLU 154
GLN 274 0.07 VAL 8 -0.09 GLU 154
GLN 274 0.06 TYR 9 -0.09 GLU 154
GLN 274 0.05 GLN 10 -0.11 GLU 154
GLN 274 0.05 ARG 11 -0.11 GLU 154
GLN 274 0.04 SER 12 -0.09 GLU 154
GLN 274 0.04 TYR 13 -0.09 GLU 154
GLY 47 0.03 CYX 14 -0.08 GLU 154
GLU 91 0.03 HID 15 -0.08 GLU 154
GLN 178 0.04 PRO 16 -0.09 GLU 154
PRO 16 0.03 ILE 17 -0.09 GLU 154
LYS 288 0.04 GLU 18 -0.09 GLU 154
LYS 288 0.04 THR 19 -0.07 GLU 154
LYS 288 0.04 LEU 20 -0.05 GLU 154
GLU 179 0.07 VAL 21 -0.04 GLU 154
GLU 179 0.08 ASP 22 -0.04 VAL 57
GLU 179 0.07 ILE 23 -0.04 ARG 306
GLU 179 0.09 PHE 24 -0.04 THR 59
GLU 179 0.11 GLN 25 -0.05 THR 59
GLN 178 0.10 GLU 26 -0.06 ASP 29
GLU 179 0.09 TYR 27 -0.06 GLU 61
GLU 179 0.09 PRO 28 -0.07 ARG 306
GLU 179 0.09 ASP 29 -0.06 THR 59
ARG 153 0.07 GLU 30 -0.07 ARG 306
ARG 153 0.07 ILE 31 -0.07 ARG 306
ARG 153 0.06 GLU 32 -0.08 ARG 306
GLU 179 0.06 TYR 33 -0.06 ARG 306
GLU 179 0.06 ILE 34 -0.03 ARG 306
GLU 179 0.05 PHE 35 -0.03 ARG 306
GLU 179 0.04 LYS 36 -0.02 VAL 57
LYS 288 0.04 PRO 37 -0.02 VAL 57
GLU 179 0.05 SER 38 -0.03 VAL 57
GLU 179 0.05 CYX 39 -0.03 GLU 154
GLN 178 0.04 VAL 40 -0.04 GLU 154
LYS 288 0.04 PRO 41 -0.06 GLU 154
GLN 178 0.04 LEU 42 -0.08 GLU 154
GLN 178 0.05 MET 43 -0.09 GLU 154
GLN 178 0.07 ARG 44 -0.07 GLU 154
GLN 178 0.06 CYX 45 -0.06 GLU 154
GLN 178 0.06 GLY 46 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.04 GLY 47 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.04 CYX 48 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.03 CYX 49 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.04 ASN 50 -0.08 GLU 154
GLN 274 0.03 ASP 51 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.04 GLU 52 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.03 GLY 53 -0.04 GLU 154
LYS 95 0.03 LEU 54 -0.05 GLU 154
ILE 184 0.03 GLU 55 -0.04 GLU 154
PRO 181 0.04 CYX 56 -0.05 GLU 154
LYS 150 0.06 VAL 57 -0.05 ASP 29
LYS 150 0.06 PRO 58 -0.06 PRO 28
ASP 149 0.06 THR 59 -0.07 PRO 28
LYS 150 0.06 GLU 60 -0.06 PRO 28
LYS 150 0.07 GLU 61 -0.06 TYR 27
LYS 150 0.07 SER 62 -0.06 ARG 306
LYS 150 0.07 ASN 63 -0.09 GLU 154
LYS 150 0.05 ILE 64 -0.12 GLU 154
LYS 150 0.05 THR 65 -0.08 GLU 154
LYS 150 0.04 MET 66 -0.05 GLN 10
LYS 150 0.03 GLN 67 -0.05 GLN 10
GLN 178 0.04 ILE 68 -0.04 GLN 10
GLU 179 0.04 MET 69 -0.03 GLN 10
GLU 179 0.05 ARG 70 -0.04 ARG 306
GLU 179 0.04 ILE 71 -0.03 ARG 70
GLU 179 0.05 LYS 72 -0.04 ARG 306
LEU 238 0.05 PRO 73 -0.03 CYX 278
ASP 204 0.06 HIE 74 -0.04 CYX 278
GLU 179 0.04 GLN 75 -0.03 CYX 278
ARG 153 0.04 GLY 76 -0.03 CYX 278
ARG 153 0.03 GLN 77 -0.02 CYX 278
ARG 153 0.04 HIE 78 -0.03 ARG 306
LYS 150 0.03 ILE 79 -0.04 GLN 10
LYS 150 0.04 GLY 80 -0.04 ARG 306
LYS 150 0.05 GLU 81 -0.05 ARG 306
LYS 150 0.06 MET 82 -0.06 ARG 306
LYS 150 0.06 SER 83 -0.06 ARG 306
GLN 178 0.07 PHE 84 -0.07 GLU 154
GLN 178 0.08 LEU 85 -0.06 GLU 154
GLN 178 0.07 GLN 86 -0.08 GLU 154
GLN 178 0.06 HIE 87 -0.07 GLU 154
LYS 150 0.04 ASN 88 -0.07 GLN 10
LYS 150 0.04 LYS 89 -0.06 GLN 10
LYS 150 0.04 CYX 90 -0.05 GLU 154
ASP 149 0.04 GLU 91 -0.05 PRO 28
ASP 149 0.03 CYX 92 -0.05 PHE 116
ASP 149 0.04 ARG 93 -0.05 ASP 29
CYX 148 0.03 PRO 94 -0.04 VAL 210
THR 59 0.03 LYS 95 -0.05 VAL 210
THR 59 0.04 LYS 96 -0.06 VAL 210
GLU 61 0.02 ASP 97 -0.04 VAL 210
ALA 99 0.03 ARG 98 -0.04 PHE 116
ARG 98 0.03 ALA 99 -0.05 VAL 210
MET 6 0.02 ARG 100 -0.04 VAL 210
ILE 224 0.03 GLN 101 -0.04 ARG 306
ILE 224 0.03 GLU 102 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.03 ASN 103 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.05 PRO 104 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.06 CYX 105 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.07 GLY 106 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.08 PRO 107 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.07 CYX 108 -0.02 GLU 154
GLN 274 0.08 SER 109 -0.02 ILE 232
CYX 123 0.08 GLU 110 -0.03 THR 212
CYX 123 0.06 ARG 111 -0.03 PRO 211
GLN 274 0.05 ARG 112 -0.02 PRO 211
GLN 274 0.06 LYS 113 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.04 HIE 114 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.04 LEU 115 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.05 PHE 116 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.06 VAL 117 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.07 GLN 118 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.08 ASP 119 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.10 PRO 120 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.10 GLN 121 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.09 THR 122 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.08 CYX 123 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.07 LYS 124 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.06 CYX 125 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.04 SER 126 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.04 CYX 127 -0.05 GLU 154
GLY 229 0.03 LYS 128 -0.05 GLU 154
GLY 229 0.04 ASN 129 -0.04 GLU 154
GLY 229 0.03 THR 130 -0.03 GLU 154
GLY 229 0.02 ASP 131 -0.03 VAL 210
GLY 229 0.03 SER 132 -0.04 ARG 306
GLN 230 0.03 ARG 133 -0.05 ARG 306
GLY 229 0.02 CYX 134 -0.05 VAL 210
GLY 229 0.02 LYS 135 -0.04 VAL 210
GLN 230 0.03 ALA 136 -0.05 ARG 306
GLN 230 0.02 ARG 137 -0.06 LYS 249
SER 62 0.03 GLN 138 -0.06 LYS 249
GLU 61 0.04 LEU 139 -0.05 VAL 210
GLU 61 0.04 GLU 140 -0.05 VAL 210
GLU 61 0.04 LEU 141 -0.04 VAL 210
LEU 85 0.05 ASN 142 -0.04 VAL 210
CYX 123 0.04 GLU 143 -0.03 PRO 211
CYX 123 0.06 ARG 144 -0.03 PRO 211
PRO 28 0.05 THR 145 -0.04 PRO 211
LEU 85 0.04 CYX 146 -0.03 VAL 210
GLU 61 0.05 ARG 147 -0.04 VAL 210
GLU 61 0.06 CYX 148 -0.06 VAL 210
GLU 61 0.07 ASP 149 -0.06 VAL 210
LEU 85 0.07 LYS 150 -0.06 PRO 211
PRO 28 0.07 PRO 151 -0.05 THR 212
PRO 28 0.08 ARG 152 -0.05 THR 212
PRO 28 0.09 ARG 153 -0.05 THR 212
LYS 157 0.04 GLU 154 -0.12 ILE 64
LYS 150 0.04 VAL 155 -0.07 GLN 10
LYS 150 0.03 VAL 156 -0.07 ASP 7
GLU 154 0.04 LYS 157 -0.06 ASP 7
LYS 288 0.04 PHE 158 -0.05 ASP 7
LYS 288 0.05 MET 159 -0.06 ASN 241
LYS 288 0.05 ASP 160 -0.06 GLU 171
LYS 288 0.04 VAL 161 -0.05 GLU 171
LYS 288 0.05 TYR 162 -0.05 ASN 241
LYS 288 0.06 GLN 163 -0.07 ASN 241
LYS 288 0.06 ARG 164 -0.07 ILE 170
LYS 288 0.06 SER 165 -0.04 ASN 241
LYS 288 0.07 TYR 166 -0.05 LYS 242
LYS 288 0.08 CYX 167 -0.03 LYS 96
LYS 288 0.08 HIE 168 -0.06 ARG 164
LYS 288 0.08 PRO 169 -0.06 ARG 164
LYS 288 0.07 ILE 170 -0.07 ARG 164
SER 285 0.07 GLU 171 -0.08 GLU 154
SER 285 0.06 THR 172 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.06 LEU 173 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.06 VAL 174 -0.04 GLU 154
GLN 25 0.06 ASP 175 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.07 ILE 176 -0.03 GLU 154
GLN 25 0.08 PHE 177 -0.04 PRO 211
GLN 25 0.11 GLN 178 -0.06 PRO 211
GLN 25 0.11 GLU 179 -0.05 LEU 238
GLN 25 0.10 TYR 180 -0.06 PRO 181
GLN 25 0.10 PRO 181 -0.06 TYR 180
GLN 25 0.09 ASP 182 -0.05 TYR 180
GLN 274 0.08 GLU 183 -0.03 LEU 238
GLN 25 0.06 ILE 184 -0.03 PRO 211
GLN 274 0.06 GLU 185 -0.03 PRO 211
GLN 274 0.07 TYR 186 -0.03 GLU 154
GLN 274 0.06 ILE 187 -0.04 GLU 154
GLN 274 0.07 PHE 188 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.06 LYS 189 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.06 PRO 190 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.05 SER 191 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.06 CYX 192 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.07 VAL 193 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.07 PRO 194 -0.08 GLU 154
PRO 273 0.08 LEU 195 -0.07 GLU 154
SER 285 0.08 MET 196 -0.06 GLU 154
SER 285 0.08 ARG 197 -0.04 GLU 154
SER 285 0.08 CYX 198 -0.05 LYS 96
LYS 288 0.07 GLY 199 -0.04 LYS 96
LYS 288 0.06 GLY 200 -0.03 VAL 57
LYS 288 0.07 CYX 201 -0.03 ARG 137
LYS 288 0.08 CYX 202 -0.03 ARG 137
LYS 288 0.07 ASN 203 -0.03 ARG 137
LYS 288 0.08 ASP 204 -0.03 ARG 137
LYS 288 0.08 GLU 205 -0.04 ARG 137
LYS 288 0.10 GLY 206 -0.05 ARG 137
LYS 288 0.11 LEU 207 -0.05 ARG 137
CYX 209 0.10 GLU 208 -0.05 ARG 137
LYS 288 0.10 CYX 209 -0.05 LYS 96
LYS 249 0.13 VAL 210 -0.06 ASP 149
LYS 249 0.14 PRO 211 -0.06 LYS 150
LYS 249 0.14 THR 212 -0.06 LYS 150
LYS 249 0.14 GLU 213 -0.05 LYS 150
LYS 249 0.14 GLU 214 -0.05 ARG 153
LYS 249 0.14 SER 215 -0.05 ARG 153
LYS 249 0.13 ASN 216 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.12 ILE 217 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.11 THR 218 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.10 MET 219 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.09 GLN 220 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.08 ILE 221 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.07 MET 222 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.08 ARG 223 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.07 ILE 224 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.07 LYS 225 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.07 PRO 226 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.07 HIE 227 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.08 GLN 228 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.06 GLY 229 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.07 GLN 230 -0.07 GLU 154
GLN 274 0.08 HIE 231 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.09 ILE 232 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.10 GLY 233 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.11 GLU 234 -0.06 GLU 154
GLN 274 0.11 MET 235 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.12 SER 236 -0.05 GLU 154
GLN 274 0.12 PHE 237 -0.04 ARG 153
PRO 273 0.12 LEU 238 -0.05 GLU 179
LYS 249 0.11 GLN 239 -0.05 GLU 154
LYS 249 0.12 HIE 240 -0.05 ARG 164
LYS 249 0.10 ASN 241 -0.07 GLN 163
SER 285 0.10 LYS 242 -0.06 GLN 163
LYS 288 0.10 CYX 243 -0.05 LYS 150
LYS 288 0.11 GLU 244 -0.05 LYS 150
LYS 288 0.10 CYX 245 -0.04 ARG 137
LYS 288 0.13 ARG 246 -0.05 ASP 149
LYS 288 0.13 PRO 247 -0.05 ARG 137
SER 285 0.11 LYS 248 -0.05 ARG 137
SER 215 0.14 LYS 249 -0.06 ARG 137
SER 215 0.12 ASP 250 -0.05 ARG 137
ASP 284 0.14 ARG 251 -0.05 ARG 137
LYS 288 0.15 ALA 252 -0.05 PRO 273
LYS 288 0.16 ARG 253 -0.04 ARG 137
LYS 288 0.18 GLN 254 -0.05 PRO 273
LYS 288 0.21 GLU 255 -0.07 PRO 273
LYS 288 0.18 ASN 256 -0.05 PRO 273
LYS 288 0.14 PRO 257 -0.04 ARG 137
ASP 284 0.11 CYX 258 -0.05 ARG 137
LEU 238 0.08 GLY 259 -0.04 ARG 137
LEU 238 0.08 PRO 260 -0.04 ARG 137
LEU 238 0.07 CYX 261 -0.05 ARG 137
LEU 238 0.06 SER 262 -0.06 ARG 137
ARG 153 0.06 GLU 263 -0.08 ARG 300
LEU 238 0.06 ARG 264 -0.05 ARG 306
LEU 238 0.06 ARG 265 -0.04 ARG 137
LEU 238 0.07 LYS 266 -0.04 ARG 137
LEU 238 0.06 HIE 267 -0.06 GLU 263
ASN 216 0.07 LEU 268 -0.05 ARG 137
ASN 216 0.08 PHE 269 -0.05 ARG 137
ASN 216 0.08 VAL 270 -0.05 ARG 137
ASN 216 0.10 GLN 271 -0.04 ARG 137
ASN 216 0.11 ASP 272 -0.04 ARG 137
ASN 216 0.13 PRO 273 -0.07 GLU 255
ASN 216 0.13 GLN 274 -0.06 GLU 255
ASN 216 0.12 THR 275 -0.04 GLU 255
ASN 216 0.12 CYX 276 -0.04 GLU 255
ASN 216 0.11 LYS 277 -0.04 ARG 137
SER 215 0.10 CYX 278 -0.04 HIE 74
ASN 256 0.13 SER 279 -0.04 GLU 296
ASN 256 0.12 CYX 280 -0.04 ARG 137
ASN 256 0.08 LYS 281 -0.05 ARG 137
GLU 255 0.11 ASN 282 -0.05 ARG 137
GLU 255 0.13 THR 283 -0.04 ARG 137
GLU 255 0.19 ASP 284 -0.03 ARG 137
GLU 255 0.19 SER 285 -0.03 ARG 137
GLU 255 0.16 ARG 286 -0.04 ARG 137
GLU 255 0.17 CYX 287 -0.04 ARG 137
GLU 255 0.21 LYS 288 -0.03 ARG 137
GLU 255 0.18 ALA 289 -0.04 ARG 137
GLU 255 0.16 ARG 290 -0.05 ARG 137
GLU 255 0.18 GLN 291 -0.04 ARG 137
GLU 255 0.16 LEU 292 -0.05 GLU 263
GLU 255 0.16 GLU 293 -0.04 GLU 263
GLU 255 0.16 LEU 294 -0.04 GLU 263
GLU 255 0.11 ASN 295 -0.04 GLU 32
PRO 257 0.11 GLU 296 -0.04 SER 279
PRO 257 0.07 ARG 297 -0.03 GLU 32
PRO 257 0.07 THR 298 -0.05 GLU 263
ASN 256 0.10 CYX 299 -0.04 GLU 263
GLU 255 0.09 ARG 300 -0.08 GLU 263
GLU 255 0.12 CYX 301 -0.06 GLU 263
GLU 255 0.12 ASP 302 -0.07 GLU 263
GLU 255 0.13 LYS 303 -0.06 GLU 263
GLU 255 0.13 PRO 304 -0.06 GLU 32
GLU 255 0.11 ARG 305 -0.07 GLU 32
GLU 255 0.10 ARG 306 -0.08 GLU 32

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