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***  TLR4/MD2/Jor  ***

CA distance fluctuations for 2403031259171421164

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLN 596 0.16 PRO 27 -0.06 ILE 560
GLN 596 0.15 CYS 28 -0.06 ILE 560
GLN 596 0.16 ILE 29 -0.06 TRP 511
ALA 569 0.17 GLU 30 -0.07 GLY 559
ALA 569 0.17 VAL 31 -0.07 TRP 511
ALA 569 0.17 VAL 32 -0.07 GLY 559
ALA 569 0.17 PRO 33 -0.07 THR 624
SER 567 0.15 ASN 34 -0.07 THR 624
SER 567 0.13 ILE 35 -0.06 THR 624
ALA 569 0.13 THR 36 -0.06 GLY 559
ALA 569 0.13 TYR 37 -0.06 GLY 559
ALA 569 0.13 GLN 38 -0.06 TRP 511
GLN 596 0.12 CYS 39 -0.05 ILE 560
GLN 596 0.12 MET 40 -0.05 TRP 511
GLN 596 0.12 ASP 41 -0.05 ILE 560
GLN 596 0.13 GLN 42 -0.05 ILE 560
GLN 596 0.12 LYS 43 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.11 LEU 44 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 SER 45 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 LYS 46 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 VAL 47 -0.05 ILE 560
GLN 596 0.12 PRO 48 -0.05 ILE 560
GLN 596 0.11 ASP 49 -0.05 THR 624
GLN 596 0.13 ASP 50 -0.05 ILE 560
ALA 569 0.13 ILE 51 -0.06 THR 624
SER 567 0.13 PRO 52 -0.06 THR 624
SER 567 0.11 SER 53 -0.06 THR 624
SER 567 0.12 SER 54 -0.06 THR 624
SER 567 0.12 THR 55 -0.06 THR 624
SER 543 0.10 LYS 56 -0.06 THR 624
SER 567 0.10 ASN 57 -0.06 THR 624
SER 567 0.10 ILE 58 -0.05 GLY 559
ALA 569 0.10 ASP 59 -0.05 TRP 511
ALA 569 0.10 LEU 60 -0.05 ILE 560
ALA 569 0.09 SER 61 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 PHE 62 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 ASN 63 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.10 PRO 64 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.09 LEU 65 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.08 LYS 66 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.07 ILE 67 -0.04 ILE 560
SER 567 0.07 LEU 68 -0.04 THR 624
SER 567 0.07 LYS 69 -0.04 THR 624
SER 567 0.07 SER 70 -0.04 THR 624
SER 567 0.07 TYR 71 -0.04 THR 624
SER 567 0.08 SER 72 -0.04 THR 624
SER 567 0.08 PHE 73 -0.05 THR 624
SER 567 0.08 SER 74 -0.05 THR 624
SER 567 0.09 ASN 75 -0.05 THR 624
SER 567 0.09 PHE 76 -0.05 THR 624
SER 543 0.08 SER 77 -0.05 THR 624
SER 543 0.09 GLU 78 -0.06 THR 624
SER 543 0.09 LEU 79 -0.05 THR 624
SER 543 0.08 GLN 80 -0.05 THR 624
SER 543 0.08 TRP 81 -0.05 THR 624
SER 567 0.08 LEU 82 -0.05 GLY 559
SER 567 0.08 ASP 83 -0.05 TRP 511
ALA 569 0.08 LEU 84 -0.04 GLY 559
ALA 569 0.08 SER 85 -0.04 TRP 511
GLN 596 0.08 ARG 86 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.08 CYS 87 -0.04 ILE 560
GLN 596 0.08 GLU 88 -0.03 ILE 560
GLN 596 0.07 ILE 89 -0.03 ILE 560
GLN 596 0.06 GLU 90 -0.03 ILE 560
GLN 596 0.06 THR 91 -0.03 THR 624
SER 567 0.06 ILE 92 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 GLU 93 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 ASP 94 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 LYS 95 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 ALA 96 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 TRP 97 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 HIS 98 -0.05 THR 624
SER 567 0.07 GLY 99 -0.05 THR 624
SER 543 0.07 LEU 100 -0.05 THR 624
ARG 519 0.06 HIS 101 -0.05 THR 624
ARG 519 0.07 HIS 102 -0.05 THR 624
ARG 519 0.07 LEU 103 -0.05 THR 624
ARG 519 0.06 SER 104 -0.05 THR 624
ARG 519 0.06 ASN 105 -0.05 THR 624
SER 543 0.06 LEU 106 -0.04 THR 624
SER 567 0.06 ILE 107 -0.04 TRP 511
SER 567 0.06 LEU 108 -0.04 GLY 559
ALA 569 0.06 THR 109 -0.04 TRP 511
ALA 569 0.06 GLY 110 -0.03 GLY 559
GLN 596 0.06 ASN 111 -0.03 ILE 560
GLN 596 0.06 PRO 112 -0.03 ILE 560
GLN 596 0.06 ILE 113 -0.03 THR 624
GLN 596 0.05 GLN 114 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 SER 115 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 PHE 116 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 SER 117 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 PRO 118 -0.04 THR 624
SER 567 0.04 GLY 119 -0.04 THR 624
SER 567 0.05 SER 120 -0.04 THR 624
SER 543 0.05 PHE 121 -0.04 THR 624
SER 543 0.05 SER 122 -0.04 THR 624
SER 543 0.05 GLY 123 -0.05 THR 624
ARG 519 0.05 LEU 124 -0.05 THR 624
ARG 519 0.05 THR 125 -0.05 THR 624
LYS 446 0.05 SER 126 -0.05 THR 624
ARG 519 0.05 LEU 127 -0.05 THR 624
ARG 400 0.05 GLU 128 -0.05 THR 624
ARG 400 0.05 ASN 129 -0.04 THR 624
ARG 519 0.05 LEU 130 -0.04 THR 624
SER 543 0.05 VAL 131 -0.04 TRP 511
SER 567 0.05 ALA 132 -0.04 THR 624
SER 567 0.05 VAL 133 -0.03 TRP 511
ALA 569 0.05 GLU 134 -0.03 GLY 559
ALA 569 0.05 THR 135 -0.03 THR 624
GLN 596 0.05 LYS 136 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 LEU 137 -0.03 THR 624
GLN 596 0.03 ALA 138 -0.03 THR 624
ASP 323 0.03 SER 139 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 LEU 140 -0.03 THR 624
ASP 323 0.03 GLU 141 -0.03 THR 624
ASP 323 0.03 SER 142 -0.03 THR 624
SER 567 0.03 PHE 143 -0.03 THR 624
SER 543 0.03 PRO 144 -0.04 THR 624
ASP 323 0.03 ILE 145 -0.04 THR 624
ASP 323 0.03 GLY 146 -0.04 THR 624
ASP 323 0.03 GLN 147 -0.04 THR 624
ASP 323 0.03 LEU 148 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 ILE 149 -0.04 THR 624
SER 398 0.04 THR 150 -0.05 THR 624
SER 398 0.04 LEU 151 -0.04 THR 624
SER 374 0.04 LYS 152 -0.04 THR 624
SER 374 0.04 LYS 153 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.04 LEU 154 -0.04 THR 624
SER 543 0.04 ASN 155 -0.04 TRP 511
SER 567 0.04 VAL 156 -0.03 THR 624
SER 567 0.04 ALA 157 -0.03 TRP 511
ALA 569 0.04 HIS 158 -0.03 THR 624
ALA 569 0.04 ASN 159 -0.03 THR 624
GLN 596 0.04 PHE 160 -0.03 THR 624
ASP 323 0.03 ILE 161 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 HIS 162 -0.02 THR 624
ASP 323 0.04 SER 163 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 CYS 164 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 LYS 165 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 LEU 166 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 PRO 167 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 ALA 168 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 TYR 169 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 PHE 170 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 SER 171 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 ASN 172 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 LEU 173 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 THR 174 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 ASN 175 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 LEU 176 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 VAL 177 -0.04 GLU 583
ASP 323 0.04 HIS 178 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.04 VAL 179 -0.04 THR 624
ASP 323 0.04 ASP 180 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.04 LEU 181 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 SER 182 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.04 TYR 183 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 ASN 184 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 TYR 185 -0.02 THR 624
ASP 323 0.04 ILE 186 -0.02 THR 624
LYS 326 0.04 GLN 187 -0.02 THR 624
LYS 326 0.04 THR 188 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 ILE 189 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 THR 190 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 VAL 191 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 ASN 192 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 ASP 193 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 LEU 194 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 GLN 195 -0.03 THR 624
ASP 323 0.04 PHE 196 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 LEU 197 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 ARG 198 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 GLU 199 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 ASN 200 -0.04 THR 624
ASP 323 0.05 PRO 201 -0.04 THR 624
ASP 323 0.05 GLN 202 -0.04 THR 624
ASP 323 0.05 VAL 203 -0.04 THR 624
ASP 323 0.05 ASN 204 -0.04 GLU 583
ASP 323 0.05 LEU 205 -0.04 GLU 583
ASP 323 0.05 SER 206 -0.04 GLU 583
ASP 323 0.05 LEU 207 -0.03 GLU 583
ASP 323 0.04 ASP 208 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.04 MET 209 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.04 SER 210 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.04 LEU 211 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.04 ASN 212 -0.02 THR 624
LYS 326 0.04 PRO 213 -0.02 THR 624
LYS 326 0.05 ILE 214 -0.02 THR 624
LYS 326 0.05 ASP 215 -0.02 THR 624
LYS 326 0.05 PHE 216 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 ILE 217 -0.02 THR 624
PRO 325 0.05 GLN 218 -0.02 THR 624
PRO 325 0.05 ASP 219 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 GLN 220 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 ALA 221 -0.02 THR 624
ASP 323 0.05 PHE 222 -0.03 THR 624
ASP 323 0.06 GLN 223 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 GLY 224 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 ILE 225 -0.03 THR 624
ASP 323 0.05 LYS 226 -0.03 GLU 583
ASP 323 0.05 LEU 227 -0.03 GLU 583
ASP 323 0.05 HIS 228 -0.04 ASP 483
ASP 323 0.05 GLU 229 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.05 LEU 230 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 THR 231 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 LEU 232 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 ARG 233 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.05 GLY 234 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.05 ASN 235 -0.02 THR 624
LYS 326 0.05 PHE 236 -0.02 THR 624
LYS 326 0.05 ASN 237 -0.01 THR 624
LYS 326 0.06 SER 238 -0.01 THR 624
LYS 326 0.07 SER 239 -0.01 THR 624
LYS 326 0.07 ASN 240 -0.01 PRO 325
LYS 326 0.06 ILE 241 -0.01 THR 624
LYS 326 0.06 MET 242 -0.02 THR 624
ASP 323 0.07 LYS 243 -0.01 THR 624
LYS 326 0.06 THR 244 -0.02 ASP 215
ASP 323 0.06 CYS 245 -0.02 THR 624
ASP 323 0.06 LEU 246 -0.02 GLU 583
ASP 323 0.06 GLN 247 -0.02 THR 624
ASP 323 0.06 ASN 248 -0.02 THR 624
ASP 323 0.06 LEU 249 -0.02 GLU 583
ASP 323 0.06 ALA 250 -0.02 GLU 583
ASP 323 0.06 GLY 251 -0.02 GLU 583
ASP 323 0.06 LEU 252 -0.03 GLU 583
ASP 323 0.06 HIS 253 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 VAL 254 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 HIS 255 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ARG 256 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 LEU 257 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ILE 258 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 LEU 259 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.06 GLY 260 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.05 GLU 261 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.04 PHE 262 -0.02 TRP 511
LYS 367 0.04 LYS 263 -0.02 TRP 511
ASN 600 0.04 ASP 264 -0.02 THR 115
ASP 347 0.04 GLU 265 -0.02 TRP 511
ASP 347 0.04 ARG 266 -0.02 ASN 293
LYS 326 0.05 ASN 267 -0.02 ASN 114
LYS 326 0.06 LEU 268 -0.01 ASN 114
LYS 326 0.07 GLU 269 -0.02 ASN 114
LYS 326 0.07 ILE 270 -0.01 ASN 114
ASP 323 0.08 PHE 271 -0.01 ILE 299
ASP 323 0.09 GLU 272 -0.02 PRO 325
ASP 323 0.09 PRO 273 -0.02 PHE 302
ASP 323 0.08 SER 274 -0.02 PRO 325
ASP 323 0.08 ILE 275 -0.01 ASP 483
ASP 323 0.08 MET 276 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.08 GLU 277 -0.02 CYS 304
ASP 323 0.07 GLY 278 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.07 LEU 279 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.07 CYS 280 -0.02 ASN 307
ASP 323 0.07 ASP 281 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.06 VAL 282 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.06 THR 283 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ILE 284 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ASP 285 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 GLU 286 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 PHE 287 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ARG 288 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 LEU 289 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.05 THR 290 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.05 TYR 291 -0.02 TRP 511
ASP 323 0.06 THR 292 -0.02 TRP 511
ASP 347 0.06 ASN 293 -0.02 ARG 266
ASP 347 0.07 ASP 294 -0.02 ARG 266
ASP 323 0.08 PHE 295 -0.01 SER 116
ASP 323 0.09 SER 296 -0.01 LEU 370
ASP 323 0.10 ASP 297 -0.02 LEU 370
ASP 323 0.10 ASP 298 -0.02 ASP 323
ASP 323 0.09 ILE 299 -0.01 GLU 272
ASP 323 0.09 VAL 300 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.10 LYS 301 -0.02 LEU 348
ASP 323 0.09 PHE 302 -0.02 PRO 273
ASP 323 0.09 HIS 303 -0.02 SER 372
ASP 323 0.08 CYS 304 -0.02 GLU 277
ASP 323 0.08 LEU 305 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.08 ALA 306 -0.03 LYS 329
ASP 323 0.07 ASN 307 -0.02 ASP 483
ASP 323 0.07 VAL 308 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 SER 309 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 ALA 310 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.07 MET 311 -0.03 ASP 483
ASP 323 0.06 SER 312 -0.03 ASP 483
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ASN 600 0.11 GLY 69 -0.02 GLY 512
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THR 614 0.09 SER 84 -0.06 ASN 492
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