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***  TLR4/MD2/Jor  ***

CA distance fluctuations for 2403031259171421164

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
THR 624 0.10 PRO 27 -0.07 LEU 618
THR 624 0.10 CYS 28 -0.08 LEU 618
THR 624 0.09 ILE 29 -0.09 LEU 618
THR 624 0.09 GLU 30 -0.10 GLU 602
THR 473 0.08 VAL 31 -0.13 GLU 602
THR 473 0.09 VAL 32 -0.12 GLU 602
THR 473 0.08 PRO 33 -0.10 LEU 618
THR 473 0.08 ASN 34 -0.09 LEU 618
TYR 449 0.07 ILE 35 -0.10 GLU 602
TYR 449 0.07 THR 36 -0.11 GLU 602
THR 624 0.08 TYR 37 -0.09 GLU 602
THR 624 0.08 GLN 38 -0.10 GLU 602
THR 624 0.08 CYS 39 -0.08 GLU 602
THR 624 0.08 MET 40 -0.09 GLU 602
THR 624 0.09 ASP 41 -0.08 GLU 602
THR 624 0.10 GLN 42 -0.07 LEU 618
THR 624 0.10 LYS 43 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 LEU 44 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 SER 45 -0.06 LEU 618
THR 624 0.08 LYS 46 -0.06 LEU 618
THR 624 0.08 VAL 47 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 PRO 48 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 ASP 49 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 ASP 50 -0.06 LEU 618
THR 624 0.09 ILE 51 -0.07 LEU 618
THR 624 0.08 PRO 52 -0.07 LEU 618
THR 624 0.07 SER 53 -0.07 LEU 618
THR 624 0.07 SER 54 -0.08 LEU 618
THR 624 0.07 THR 55 -0.08 LEU 618
HIS 424 0.06 LYS 56 -0.09 GLU 602
THR 624 0.06 ASN 57 -0.10 GLU 602
THR 624 0.07 ILE 58 -0.09 GLU 602
THR 624 0.07 ASP 59 -0.09 GLU 602
THR 624 0.08 LEU 60 -0.08 GLU 602
THR 624 0.07 SER 61 -0.08 GLU 602
THR 624 0.08 PHE 62 -0.08 GLU 602
THR 624 0.08 ASN 63 -0.07 GLU 602
THR 624 0.08 PRO 64 -0.06 LEU 618
THR 624 0.08 LEU 65 -0.06 LEU 618
THR 624 0.08 LYS 66 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 ILE 67 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 LEU 68 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 LYS 69 -0.05 LEU 618
THR 624 0.07 SER 70 -0.05 LEU 618
THR 624 0.07 TYR 71 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 SER 72 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 PHE 73 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 SER 74 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 ASN 75 -0.06 LEU 618
THR 624 0.07 PHE 76 -0.07 LEU 618
THR 624 0.06 SER 77 -0.07 LEU 618
THR 624 0.06 GLU 78 -0.08 LEU 618
THR 624 0.06 LEU 79 -0.08 GLU 602
ARG 400 0.05 GLN 80 -0.09 GLN 596
THR 624 0.05 TRP 81 -0.09 GLU 602
THR 624 0.06 LEU 82 -0.09 GLU 602
THR 624 0.06 ASP 83 -0.09 GLU 602
THR 624 0.07 LEU 84 -0.08 GLU 602
THR 624 0.06 SER 85 -0.08 GLU 602
THR 624 0.07 ARG 86 -0.08 GLU 602
THR 624 0.07 CYS 87 -0.07 GLU 602
THR 624 0.07 GLU 88 -0.06 GLU 602
THR 624 0.07 ILE 89 -0.06 GLU 602
THR 624 0.07 GLU 90 -0.06 GLU 602
THR 624 0.07 THR 91 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 ILE 92 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 GLU 93 -0.05 LEU 618
THR 624 0.06 ASP 94 -0.05 LEU 618
THR 624 0.06 LYS 95 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 ALA 96 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 TRP 97 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 HIS 98 -0.06 LEU 618
THR 624 0.06 GLY 99 -0.06 LEU 618
THR 624 0.05 LEU 100 -0.07 LEU 618
THR 624 0.05 HIS 101 -0.07 GLN 596
ARG 400 0.05 HIS 102 -0.08 GLN 596
THR 624 0.05 LEU 103 -0.08 GLN 596
TYR 375 0.04 SER 104 -0.09 GLN 596
THR 624 0.05 ASN 105 -0.09 GLU 602
THR 624 0.05 LEU 106 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 ILE 107 -0.09 GLU 602
THR 624 0.06 LEU 108 -0.08 GLU 602
THR 624 0.06 THR 109 -0.08 GLU 602
THR 624 0.06 GLY 110 -0.08 GLU 602
THR 624 0.06 ASN 111 -0.07 GLU 602
THR 624 0.06 PRO 112 -0.06 GLU 602
THR 624 0.06 ILE 113 -0.06 GLU 602
THR 624 0.06 GLN 114 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 SER 115 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 PHE 116 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 SER 117 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 PRO 118 -0.06 GLN 596
THR 624 0.05 GLY 119 -0.06 LEU 618
THR 624 0.05 SER 120 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 PHE 121 -0.06 GLU 602
THR 624 0.05 SER 122 -0.06 GLN 596
THR 624 0.05 GLY 123 -0.06 LEU 618
THR 624 0.05 LEU 124 -0.07 GLN 596
THR 624 0.04 THR 125 -0.07 GLN 596
THR 624 0.04 SER 126 -0.08 GLN 596
THR 624 0.04 LEU 127 -0.08 GLN 596
LYS 352 0.04 GLU 128 -0.09 GLN 596
THR 624 0.04 ASN 129 -0.09 GLN 596
THR 624 0.04 LEU 130 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 VAL 131 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 ALA 132 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 VAL 133 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 GLU 134 -0.07 GLU 602
THR 624 0.05 THR 135 -0.07 GLU 602
THR 624 0.05 LYS 136 -0.07 GLU 602
THR 624 0.05 LEU 137 -0.07 GLU 602
THR 624 0.05 ALA 138 -0.06 GLU 602
THR 624 0.04 SER 139 -0.06 GLU 602
THR 624 0.04 LEU 140 -0.07 GLU 602
THR 624 0.04 GLU 141 -0.06 GLN 596
THR 624 0.04 SER 142 -0.06 GLU 602
THR 624 0.04 PHE 143 -0.06 GLU 602
THR 624 0.04 PRO 144 -0.06 GLN 596
THR 624 0.04 ILE 145 -0.07 GLN 596
THR 624 0.04 GLY 146 -0.07 GLN 596
THR 624 0.04 GLN 147 -0.07 GLN 596
THR 624 0.04 LEU 148 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 ILE 149 -0.08 GLN 596
THR 624 0.03 THR 150 -0.09 GLN 596
THR 624 0.03 LEU 151 -0.09 GLN 596
GLN 331 0.03 LYS 152 -0.09 GLN 596
THR 624 0.03 LYS 153 -0.09 GLN 596
THR 624 0.04 LEU 154 -0.08 GLN 596
THR 624 0.04 ASN 155 -0.08 GLU 602
THR 624 0.04 VAL 156 -0.08 GLU 602
THR 624 0.04 ALA 157 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 HIS 158 -0.08 GLU 602
THR 624 0.05 ASN 159 -0.07 GLU 602
THR 624 0.05 PHE 160 -0.07 GLU 602
THR 624 0.04 ILE 161 -0.07 GLU 602
THR 624 0.04 HIS 162 -0.06 GLU 602
THR 624 0.04 SER 163 -0.06 GLU 602
THR 624 0.03 CYS 164 -0.07 GLU 602
THR 624 0.03 LYS 165 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 LEU 166 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 PRO 167 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 ALA 168 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 TYR 169 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 PHE 170 -0.07 GLN 596
THR 624 0.02 SER 171 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 ASN 172 -0.07 GLN 596
THR 624 0.03 LEU 173 -0.08 GLN 596
THR 624 0.02 THR 174 -0.08 GLN 596
GLN 331 0.03 ASN 175 -0.09 GLN 596
THR 624 0.03 LEU 176 -0.09 GLN 596
HIS 228 0.03 VAL 177 -0.09 GLN 596
THR 624 0.03 HIS 178 -0.09 GLN 596
THR 624 0.03 VAL 179 -0.08 GLN 596
THR 624 0.03 ASP 180 -0.08 GLU 602
THR 624 0.04 LEU 181 -0.08 GLU 602
THR 624 0.04 SER 182 -0.08 GLU 602
THR 624 0.04 TYR 183 -0.07 GLU 602
THR 624 0.04 ASN 184 -0.07 GLU 602
THR 624 0.04 TYR 185 -0.07 GLU 602
GLY 559 0.04 ILE 186 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 GLN 187 -0.06 GLU 602
TRP 511 0.03 THR 188 -0.06 GLU 602
TRP 511 0.03 ILE 189 -0.06 GLU 602
TRP 511 0.03 THR 190 -0.06 GLN 596
TRP 511 0.03 VAL 191 -0.06 GLN 596
TRP 511 0.03 ASN 192 -0.06 GLN 596
GLY 559 0.03 ASP 193 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 LEU 194 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 GLN 195 -0.07 GLN 596
THR 624 0.02 PHE 196 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 LEU 197 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 ARG 198 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 GLU 199 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 ASN 200 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 PRO 201 -0.07 GLN 596
ASP 323 0.02 GLN 202 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.02 VAL 203 -0.08 GLN 596
ASN 175 0.02 ASN 204 -0.09 GLN 596
VAL 177 0.02 LEU 205 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.02 SER 206 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.03 LEU 207 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.03 ASP 208 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.03 MET 209 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.04 SER 210 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.04 LEU 211 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 ASN 212 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 PRO 213 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 ILE 214 -0.06 GLU 602
TRP 511 0.04 ASP 215 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 PHE 216 -0.06 GLU 602
TRP 511 0.03 ILE 217 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 GLN 218 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 ASP 219 -0.06 GLN 596
GLY 512 0.02 GLN 220 -0.06 GLN 596
TRP 511 0.02 ALA 221 -0.06 GLN 596
TRP 511 0.02 PHE 222 -0.07 GLN 596
GLY 512 0.02 GLN 223 -0.06 GLN 596
GLY 512 0.02 GLY 224 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 ILE 225 -0.07 GLN 596
TRP 511 0.02 LYS 226 -0.07 GLN 596
VAL 177 0.02 LEU 227 -0.08 GLN 596
VAL 177 0.03 HIS 228 -0.08 GLN 596
GLU 128 0.03 GLU 229 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.02 LEU 230 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.03 THR 231 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.03 LEU 232 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.03 ARG 233 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 GLY 234 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 ASN 235 -0.07 GLU 602
GLY 512 0.04 PHE 236 -0.07 GLU 602
GLY 512 0.04 ASN 237 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.04 SER 238 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.04 SER 239 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 ASN 240 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 ILE 241 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 MET 242 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 LYS 243 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 THR 244 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 CYS 245 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 LEU 246 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 GLN 247 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 ASN 248 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.02 LEU 249 -0.06 GLN 596
GLY 512 0.02 ALA 250 -0.06 GLN 596
GLY 512 0.02 GLY 251 -0.06 GLN 596
GLY 512 0.02 LEU 252 -0.07 GLN 596
VAL 177 0.02 HIS 253 -0.07 GLN 596
VAL 177 0.02 VAL 254 -0.07 GLN 596
GLU 128 0.03 HIS 255 -0.08 GLN 596
SER 104 0.03 ARG 256 -0.08 GLN 596
TRP 511 0.02 LEU 257 -0.07 ASN 600
TRP 511 0.03 ILE 258 -0.08 ASN 600
TRP 511 0.03 LEU 259 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.03 GLY 260 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 GLU 261 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.04 PHE 262 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.05 LYS 263 -0.07 GLU 602
TRP 511 0.05 ASP 264 -0.08 GLU 602
TRP 511 0.04 GLU 265 -0.07 GLU 602
GLY 512 0.04 ARG 266 -0.07 GLU 602
ASN 58 0.04 ASN 267 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.04 LEU 268 -0.06 GLU 602
SER 120 0.04 GLU 269 -0.06 GLU 602
GLU 122 0.04 ILE 270 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 PHE 271 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 GLU 272 -0.06 GLU 602
SER 392 0.03 PRO 273 -0.06 ASN 600
GLY 512 0.03 SER 274 -0.05 GLU 602
GLY 512 0.03 ILE 275 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 MET 276 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 GLU 277 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 GLY 278 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.02 LEU 279 -0.06 GLU 602
LYS 326 0.03 CYS 280 -0.06 ASN 600
LYS 326 0.02 ASP 281 -0.06 GLN 596
LYS 326 0.02 VAL 282 -0.06 GLN 596
LYS 326 0.02 THR 283 -0.06 GLN 596
ILE 35 0.02 ILE 284 -0.07 GLN 596
SER 104 0.03 ASP 285 -0.07 GLN 596
ILE 35 0.03 GLU 286 -0.07 ASN 600
VAL 32 0.03 PHE 287 -0.07 ASN 600
VAL 32 0.03 ARG 288 -0.07 ASN 600
TRP 511 0.03 LEU 289 -0.07 ASN 600
TRP 511 0.03 THR 290 -0.07 ASN 600
TRP 511 0.04 TYR 291 -0.07 ASN 600
GLY 512 0.04 THR 292 -0.07 GLU 602
GLY 512 0.04 ASN 293 -0.07 GLU 602
GLY 512 0.04 ASP 294 -0.06 GLU 602
GLY 512 0.03 PHE 295 -0.06 ASN 600
SER 392 0.03 SER 296 -0.06 ASN 600
SER 392 0.04 ASP 297 -0.06 ASN 600
SER 392 0.04 ASP 298 -0.05 ASN 600
SER 392 0.03 ILE 299 -0.06 ASN 600
VAL 32 0.03 VAL 300 -0.06 ASN 600
LYS 326 0.04 LYS 301 -0.05 ASN 600
LYS 326 0.03 PHE 302 -0.05 ASN 600
LYS 326 0.03 HIS 303 -0.05 ASN 600
LYS 326 0.03 CYS 304 -0.06 ASN 600
VAL 32 0.03 LEU 305 -0.06 ASN 600
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GLY 512 0.04 CYS 338 -0.07 ASN 600
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VAL 32 0.05 SER 392 -0.07 GLY 56
VAL 32 0.05 ASP 393 -0.06 GLN 603
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VAL 31 0.06 PHE 406 -0.07 ASN 600
VAL 32 0.05 ASN 407 -0.06 ASN 600
VAL 32 0.05 GLY 408 -0.05 ASN 600
VAL 32 0.05 ALA 409 -0.05 GLN 603
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VAL 32 0.05 SER 413 -0.08 GLN 603
VAL 32 0.05 ALA 414 -0.08 GLN 603
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VAL 32 0.07 LEU 422 -0.05 GLN 603
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VAL 32 0.08 HIS 424 -0.05 VAL 599
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VAL 32 0.07 GLN 428 -0.06 ASN 600
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VAL 32 0.06 SER 430 -0.05 ASN 600
VAL 32 0.05 THR 431 -0.05 GLN 603
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PRO 33 0.05 PHE 438 -0.10 GLN 603
PRO 33 0.06 SER 439 -0.09 GLN 603
VAL 32 0.06 ALA 440 -0.08 GLN 603
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PRO 33 0.06 LEU 442 -0.07 GLN 603
VAL 32 0.06 SER 443 -0.07 GLN 603
VAL 32 0.07 LEU 444 -0.06 GLN 603
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VAL 32 0.07 LYS 446 -0.05 GLN 603
VAL 32 0.08 LEU 447 -0.05 GLN 603
VAL 32 0.08 LEU 448 -0.04 GLN 603
VAL 32 0.09 TYR 449 -0.04 GLN 603
VAL 32 0.08 LEU 450 -0.05 GLN 603
VAL 32 0.08 ASP 451 -0.05 VAL 599
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GLU 583 0.08 PHE 147 -0.10 GLN 603
GLU 583 0.08 CYS 148 -0.11 GLN 603
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