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***  tlr4_dimer  ***

CA distance fluctuations for 2404022142352098212

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ASN 600 0.17 PRO 27 -0.00 PRO 144
ASN 600 0.16 CYS 28 -0.00 PRO 144
VAL 599 0.17 ILE 29 -0.00 PRO 144
PHE 570 0.19 GLU 30 -0.00 PRO 144
PHE 570 0.19 VAL 31 -0.01 THR 624
PHE 570 0.20 VAL 32 -0.01 THR 624
ALA 569 0.22 PRO 33 -0.00 PRO 144
ALA 569 0.20 ASN 34 -0.00 PRO 144
ALA 569 0.18 ILE 35 -0.00 THR 624
ALA 569 0.16 THR 36 -0.01 THR 624
ALA 569 0.16 TYR 37 -0.00 THR 624
PHE 570 0.14 GLN 38 -0.01 THR 624
PHE 570 0.13 CYS 39 -0.00 PRO 144
PHE 570 0.12 MET 40 -0.01 THR 624
PHE 570 0.11 ASP 41 -0.01 THR 624
ASN 600 0.13 GLN 42 -0.00 PRO 144
ASN 600 0.12 LYS 43 -0.00 PRO 144
GLN 596 0.12 LEU 44 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.11 SER 45 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.12 LYS 46 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.12 VAL 47 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.14 PRO 48 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.15 ASP 49 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.17 ASP 50 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.16 ILE 51 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.17 PRO 52 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.15 SER 53 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.16 SER 54 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.16 THR 55 -0.01 PRO 144
SER 545 0.14 LYS 56 -0.01 THR 624
SER 545 0.13 ASN 57 -0.01 THR 624
ALA 569 0.13 ILE 58 -0.01 THR 624
SER 545 0.12 ASP 59 -0.01 THR 624
ALA 569 0.11 LEU 60 -0.01 THR 624
ALA 569 0.10 SER 61 -0.01 ILE 560
PHE 570 0.09 PHE 62 -0.01 ILE 560
PHE 570 0.10 ASN 63 -0.01 THR 624
GLN 596 0.10 PRO 64 -0.00 PRO 144
GLN 596 0.10 LEU 65 -0.01 PRO 144
GLN 596 0.09 LYS 66 -0.01 ASN 192
GLN 596 0.09 ILE 67 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.09 LEU 68 -0.01 ASN 192
GLN 596 0.10 LYS 69 -0.01 ASN 192
GLN 596 0.09 SER 70 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.10 TYR 71 -0.01 ASN 192
GLN 596 0.11 SER 72 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.11 PHE 73 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.11 SER 74 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.13 ASN 75 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.13 PHE 76 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.12 SER 77 -0.01 PRO 144
SER 567 0.13 GLU 78 -0.01 PRO 144
SER 545 0.12 LEU 79 -0.01 PRO 144
GLN 521 0.11 GLN 80 -0.01 THR 624
GLN 521 0.11 TRP 81 -0.01 THR 624
SER 545 0.10 LEU 82 -0.01 ILE 560
SER 545 0.10 ASP 83 -0.01 ILE 560
ALA 569 0.09 LEU 84 -0.01 ILE 560
SER 545 0.08 SER 85 -0.02 ILE 560
ALA 569 0.08 ARG 86 -0.02 ILE 560
ALA 569 0.09 CYS 87 -0.01 ILE 560
ALA 569 0.08 GLU 88 -0.01 ILE 560
ALA 569 0.08 ILE 89 -0.01 ILE 560
GLN 596 0.07 GLU 90 -0.01 ASN 192
GLN 596 0.08 THR 91 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.08 ILE 92 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.08 GLU 93 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.08 ASP 94 -0.02 ASN 192
ALA 569 0.08 LYS 95 -0.01 ASN 192
ALA 569 0.09 ALA 96 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.09 TRP 97 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.09 HIS 98 -0.01 PRO 144
ALA 569 0.10 GLY 99 -0.01 PRO 144
SER 567 0.10 LEU 100 -0.01 PRO 144
SER 567 0.10 HIS 101 -0.01 TYR 169
SER 543 0.10 HIS 102 -0.01 ILE 560
SER 543 0.10 LEU 103 -0.01 ILE 560
THR 497 0.09 SER 104 -0.02 TRP 511
THR 497 0.09 ASN 105 -0.02 TRP 511
GLN 521 0.08 LEU 106 -0.02 ILE 560
GLN 521 0.08 ILE 107 -0.02 ILE 560
SER 545 0.07 LEU 108 -0.02 ILE 560
VAL 31 0.07 THR 109 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.07 GLY 110 -0.02 ILE 560
ALA 569 0.07 ASN 111 -0.02 ILE 560
VAL 31 0.06 PRO 112 -0.02 ILE 560
ALA 569 0.06 ILE 113 -0.01 ILE 560
VAL 31 0.06 GLN 114 -0.02 ILE 560
VAL 31 0.06 SER 115 -0.02 ASN 192
ALA 569 0.06 PHE 116 -0.02 ASN 192
ALA 569 0.06 SER 117 -0.02 ASN 192
SER 567 0.06 PRO 118 -0.02 ASN 192
SER 567 0.07 GLY 119 -0.02 ASN 192
SER 567 0.07 SER 120 -0.02 PRO 144
SER 567 0.07 PHE 121 -0.02 PRO 144
SER 567 0.07 SER 122 -0.01 TYR 169
SER 567 0.08 GLY 123 -0.01 TYR 169
SER 567 0.08 LEU 124 -0.01 TYR 169
SER 543 0.08 THR 125 -0.01 ILE 560
SER 543 0.08 SER 126 -0.01 TRP 511
ARG 519 0.08 LEU 127 -0.02 TRP 511
LEU 448 0.07 GLU 128 -0.02 TRP 511
LEU 448 0.07 ASN 129 -0.02 TRP 511
THR 497 0.06 LEU 130 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.06 VAL 131 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.06 ALA 132 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.06 VAL 133 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 GLU 134 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.06 THR 135 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.06 LYS 136 -0.02 GLY 512
VAL 31 0.06 LEU 137 -0.02 GLY 512
VAL 31 0.05 ALA 138 -0.02 GLY 512
VAL 31 0.05 SER 139 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 140 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 GLU 141 -0.02 ASP 193
VAL 31 0.05 SER 142 -0.02 ASN 192
VAL 31 0.05 PHE 143 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 PRO 144 -0.02 PHE 121
VAL 31 0.05 ILE 145 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 GLY 146 -0.02 TRP 511
SER 543 0.05 GLN 147 -0.02 TYR 169
SER 543 0.06 LEU 148 -0.02 TRP 511
ARG 519 0.05 ILE 149 -0.02 TRP 511
ARG 519 0.06 THR 150 -0.02 TRP 511
ARG 519 0.06 LEU 151 -0.02 TRP 511
GLN 423 0.06 LYS 152 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 LYS 153 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 LEU 154 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ASN 155 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 VAL 156 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ALA 157 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 HIS 158 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ASN 159 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 PHE 160 -0.03 GLY 512
VAL 31 0.05 ILE 161 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 HIS 162 -0.03 GLY 512
VAL 31 0.05 SER 163 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 CYS 164 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LYS 165 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 166 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 PRO 167 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 ALA 168 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 TYR 169 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 PHE 170 -0.02 TRP 511
VAL 31 0.05 SER 171 -0.02 TRP 511
ILE 29 0.05 ASN 172 -0.02 TRP 511
ILE 29 0.05 LEU 173 -0.02 TRP 511
ILE 29 0.05 THR 174 -0.02 TRP 511
ILE 29 0.05 ASN 175 -0.02 TRP 511
ILE 29 0.05 LEU 176 -0.03 TRP 511
ILE 29 0.05 VAL 177 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 HIS 178 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 VAL 179 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ASP 180 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 LEU 181 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 SER 182 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 TYR 183 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ASN 184 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 TYR 185 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ILE 186 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 GLN 187 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 THR 188 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ILE 189 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 THR 190 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 VAL 191 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ASN 192 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ASP 193 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 194 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 GLN 195 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 PHE 196 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 197 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 ARG 198 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 GLU 199 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 ASN 200 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 PRO 201 -0.03 TRP 511
ILE 29 0.04 GLN 202 -0.03 TRP 511
ILE 29 0.05 VAL 203 -0.03 TRP 511
ILE 29 0.05 ASN 204 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 205 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 SER 206 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 207 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.06 ASP 208 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.06 MET 209 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.06 SER 210 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.06 LEU 211 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.06 ASN 212 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.06 PRO 213 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.06 ILE 214 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 ASP 215 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 PHE 216 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.05 ILE 217 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 GLN 218 -0.03 TRP 511
ASP 298 0.05 ASP 219 -0.03 TRP 511
ASP 298 0.05 GLN 220 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ALA 221 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 PHE 222 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 GLN 223 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.04 GLY 224 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 ILE 225 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LYS 226 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 227 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 HIS 228 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 GLU 229 -0.03 TRP 511
VAL 31 0.05 LEU 230 -0.03 TRP 511
ASP 323 0.06 THR 231 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.06 LEU 232 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.06 ARG 233 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.06 GLY 234 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.06 ASN 235 -0.04 TRP 511
ASP 323 0.06 PHE 236 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.06 ASN 237 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.07 SER 238 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.07 SER 239 -0.04 PHE 438
ASP 323 0.07 ASN 240 -0.03 PHE 438
ASP 323 0.06 ILE 241 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 MET 242 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 LYS 243 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 THR 244 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 CYS 245 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 LEU 246 -0.03 PHE 461
ASP 298 0.06 GLN 247 -0.03 PHE 461
ASP 298 0.05 ASN 248 -0.03 PHE 461
ASP 298 0.05 LEU 249 -0.03 PHE 461
ASP 298 0.05 ALA 250 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 GLY 251 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 LEU 252 -0.03 TRP 511
SER 296 0.05 HIS 253 -0.03 PHE 461
VAL 31 0.05 VAL 254 -0.03 PHE 461
VAL 31 0.05 HIS 255 -0.03 PHE 461
VAL 31 0.05 ARG 256 -0.03 PHE 461
ASP 323 0.06 LEU 257 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.06 ILE 258 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.06 LEU 259 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.07 GLY 260 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.07 GLU 261 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.07 PHE 262 -0.05 PHE 461
ASP 323 0.07 LYS 263 -0.05 PHE 461
ASP 323 0.06 ASP 264 -0.05 ASP 462
ASP 323 0.06 GLU 265 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.07 ARG 266 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.07 ASN 267 -0.04 ASP 462
ASP 323 0.08 LEU 268 -0.04 PHE 438
ASP 323 0.08 GLU 269 -0.04 PHE 438
ASP 323 0.09 ILE 270 -0.04 PHE 438
ASP 323 0.08 PHE 271 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.09 GLU 272 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.08 PRO 273 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.07 SER 274 -0.03 GLU 437
ASP 323 0.07 ILE 275 -0.03 GLU 437
ASP 323 0.07 MET 276 -0.04 GLU 437
ASP 298 0.07 GLU 277 -0.03 GLU 437
ASP 298 0.06 GLY 278 -0.03 PHE 461
ASP 298 0.06 LEU 279 -0.03 GLU 437
SER 296 0.06 CYS 280 -0.03 GLU 437
SER 296 0.06 ASP 281 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 VAL 282 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 THR 283 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 ILE 284 -0.03 PHE 461
SER 296 0.05 ASP 285 -0.03 PHE 461
VAL 31 0.05 GLU 286 -0.03 PHE 461
TYR 320 0.06 PHE 287 -0.04 PHE 461
TYR 320 0.06 ARG 288 -0.04 PHE 461
ASP 323 0.07 LEU 289 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.07 THR 290 -0.05 GLU 437
ASP 323 0.07 TYR 291 -0.05 GLU 437
ASP 323 0.08 THR 292 -0.05 GLU 437
ASP 323 0.08 ASN 293 -0.05 PHE 438
ASP 323 0.09 ASP 294 -0.05 PHE 438
ASP 323 0.09 PHE 295 -0.05 GLU 437
ASP 323 0.10 SER 296 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.10 ASP 297 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.09 ASP 298 -0.04 GLU 437
ASP 323 0.08 ILE 299 -0.04 GLU 437
TYR 320 0.08 VAL 300 -0.04 GLU 437
SER 296 0.08 LYS 301 -0.04 GLU 437
SER 296 0.08 PHE 302 -0.03 GLU 437
SER 296 0.07 HIS 303 -0.03 GLU 437
SER 296 0.07 CYS 304 -0.03 GLU 437
SER 296 0.07 LEU 305 -0.03 GLU 437
SER 296 0.07 ALA 306 -0.03 GLU 437
SER 296 0.06 ASN 307 -0.03 GLU 437
SER 296 0.06 VAL 308 -0.03 GLU 437
VAL 31 0.05 SER 309 -0.03 PHE 461
VAL 31 0.06 ALA 310 -0.03 PHE 461
LYS 319 0.06 MET 311 -0.04 GLU 437
VAL 31 0.06 SER 312 -0.04 GLU 437
TYR 320 0.07 LEU 313 -0.05 GLU 437
VAL 31 0.07 ALA 314 -0.05 GLU 437
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PRO 27 0.11 PHE 620 -0.10 PRO 609
PRO 27 0.11 ASN 621 -0.10 PRO 609
PRO 27 0.10 ASN 622 -0.11 PRO 609
PRO 27 0.09 SER 623 -0.13 PRO 609
PRO 27 0.09 THR 624 -0.11 PRO 609
PRO 27 0.09 CYS 625 -0.10 PRO 609

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