***  tlr4_dimer  ***

CA distance fluctuations for 2404022142352098212

---  normal mode 8  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner). The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations. [HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase			ref	largest decrease
GLN 596		0.07	PRO 27	-0.06		GLY 463
GLN 596		0.07	CYS 28	-0.06		GLY 463
GLN 596		0.08	ILE 29	-0.07		GLY 463
GLN 596		0.08	GLU 30	-0.07		GLY 463
ALA 569		0.08	VAL 31	-0.07		GLY 463
ALA 569		0.08	VAL 32	-0.07		GLY 463
ALA 569		0.08	PRO 33	-0.06		GLY 463
SER 567		0.07	ASN 34	-0.06		GLY 463
SER 567		0.06	ILE 35	-0.06		GLY 463
ALA 569		0.07	THR 36	-0.06		GLY 463
ALA 569		0.07	TYR 37	-0.06		GLY 463
ALA 569		0.07	GLN 38	-0.07		GLY 463
GLN 596		0.06	CYS 39	-0.06		GLY 463
GLN 596		0.06	MET 40	-0.06		LEU 442
GLN 596		0.06	ASP 41	-0.07		MET 417
GLN 596		0.06	GLN 42	-0.06		GLY 467
GLN 596		0.06	LYS 43	-0.06		MET 417
GLN 596		0.06	LEU 44	-0.06		MET 417
GLN 596		0.05	SER 45	-0.05		MET 417
GLN 596		0.05	LYS 46	-0.05		MET 417
GLN 596		0.05	VAL 47	-0.05		GLY 467
GLN 596		0.05	PRO 48	-0.05		GLY 467
GLN 596		0.05	ASP 49	-0.05		GLY 463
GLN 596		0.06	ASP 50	-0.05		GLY 463
GLN 596		0.06	ILE 51	-0.06		GLY 463
SER 567		0.06	PRO 52	-0.05		GLY 463
SER 567		0.05	SER 53	-0.05		GLY 463
SER 567		0.05	SER 54	-0.05		GLY 463
SER 567		0.06	THR 55	-0.06		GLY 463
SER 567		0.05	LYS 56	-0.05		PHE 438
SER 567		0.05	ASN 57	-0.06		PHE 438
ALA 569		0.05	ILE 58	-0.06		PHE 438
ALA 569		0.05	ASP 59	-0.06		PHE 438
ALA 569		0.05	LEU 60	-0.06		MET 417
ALA 569		0.05	SER 61	-0.06		MET 417
GLN 596		0.05	PHE 62	-0.06		MET 417
GLN 596		0.05	ASN 63	-0.06		MET 417
GLN 596		0.05	PRO 64	-0.06		MET 417
GLN 596		0.05	LEU 65	-0.05		MET 417
GLN 596		0.04	LYS 66	-0.05		MET 417
GLN 596		0.04	ILE 67	-0.05		MET 417
ALA 569		0.04	LEU 68	-0.05		MET 417
SER 567		0.04	LYS 69	-0.05		MET 417
SER 567		0.03	SER 70	-0.04		MET 417
SER 567		0.04	TYR 71	-0.04		MET 417
SER 567		0.04	SER 72	-0.05		MET 417
SER 567		0.04	PHE 73	-0.05		GLY 463
SER 567		0.04	SER 74	-0.04		GLY 463
SER 567		0.04	ASN 75	-0.05		GLY 463
SER 567		0.04	PHE 76	-0.05		GLY 463
SER 567		0.04	SER 77	-0.05		GLY 463
SER 567		0.04	GLU 78	-0.05		GLY 463
SER 567		0.04	LEU 79	-0.05		PHE 438
SER 543		0.04	GLN 80	-0.05		PHE 438
SER 567		0.04	TRP 81	-0.05		PHE 438
SER 567		0.04	LEU 82	-0.05		PHE 438
ALA 569		0.04	ASP 83	-0.06		PHE 438
ALA 569		0.04	LEU 84	-0.06		MET 417
ALA 569		0.04	SER 85	-0.06		MET 417
GLN 596		0.04	ARG 86	-0.06		MET 417
GLN 596		0.04	CYS 87	-0.06		MET 417
GLN 596		0.04	GLU 88	-0.06		MET 417
GLN 596		0.04	ILE 89	-0.05		MET 417
GLN 596		0.03	GLU 90	-0.05		MET 417
GLN 596		0.03	THR 91	-0.05		MET 417
SER 567		0.03	ILE 92	-0.05		MET 417
SER 567		0.03	GLU 93	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	ASP 94	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	LYS 95	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	ALA 96	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	TRP 97	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	HIS 98	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	GLY 99	-0.04		GLY 463
SER 567		0.03	LEU 100	-0.04		PHE 438
SER 543		0.03	HIS 101	-0.04		PHE 438
SER 543		0.03	HIS 102	-0.05		PHE 438
SER 543		0.04	LEU 103	-0.05		PHE 438
ARG 519		0.03	SER 104	-0.05		PHE 438
SER 543		0.04	ASN 105	-0.05		PHE 438
SER 567		0.04	LEU 106	-0.05		MET 417
ALA 569		0.04	ILE 107	-0.05		MET 417
ALA 569		0.04	LEU 108	-0.05		MET 417
ALA 569		0.04	THR 109	-0.06		MET 417
ALA 569		0.04	GLY 110	-0.06		MET 417
ALA 569		0.04	ASN 111	-0.05		MET 417
GLN 596		0.03	PRO 112	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	ILE 113	-0.05		MET 417
GLN 596		0.03	GLN 114	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	SER 115	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	PHE 116	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	SER 117	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	PRO 118	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	GLY 119	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	SER 120	-0.04		MET 417
SER 567		0.03	PHE 121	-0.04		MET 417
SER 543		0.03	SER 122	-0.04		MET 417
SER 543		0.03	GLY 123	-0.04		MET 417
SER 543		0.03	LEU 124	-0.04		PHE 438
LYS 43		0.03	THR 125	-0.04		PHE 438
LYS 43		0.03	SER 126	-0.04		PHE 438
ARG 519		0.03	LEU 127	-0.04		PHE 438
LYS 43		0.03	GLU 128	-0.04		PHE 438
ARG 519		0.03	ASN 129	-0.05		PHE 438
SER 543		0.03	LEU 130	-0.05		MET 417
SER 567		0.03	VAL 131	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	ALA 132	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	VAL 133	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	GLU 134	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	THR 135	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	LYS 136	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	LEU 137	-0.05		MET 417
ALA 569		0.02	ALA 138	-0.04		GLY 418
SER 567		0.02	SER 139	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	LEU 140	-0.04		MET 417
LYS 43		0.02	GLU 141	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	SER 142	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	PHE 143	-0.04		MET 417
SER 567		0.02	PRO 144	-0.04		MET 417
LYS 43		0.02	ILE 145	-0.04		MET 417
LYS 43		0.02	GLY 146	-0.04		MET 417
LYS 43		0.02	GLN 147	-0.04		MET 417
LYS 43		0.03	LEU 148	-0.04		MET 417
LYS 43		0.03	ILE 149	-0.04		PHE 438
LYS 43		0.03	THR 150	-0.04		PHE 438
LYS 43		0.03	LEU 151	-0.04		PHE 438
ASP 41		0.03	LYS 152	-0.04		PHE 438
ASP 41		0.03	LYS 153	-0.04		MET 417
ARG 519		0.02	LEU 154	-0.04		MET 417
SER 543		0.02	ASN 155	-0.05		MET 417
SER 567		0.02	VAL 156	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	ALA 157	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	HIS 158	-0.05		MET 417
ALA 569		0.03	ASN 159	-0.05		MET 417
ALA 569		0.02	PHE 160	-0.05		GLY 418
ALA 569		0.02	ILE 161	-0.04		GLY 418
ALA 569		0.02	HIS 162	-0.04		GLY 418
ALA 569		0.02	SER 163	-0.04		GLY 418
ASP 41		0.02	CYS 164	-0.04		MET 417
ASP 41		0.02	LYS 165	-0.03		MET 417
ASP 41		0.02	LEU 166	-0.03		MET 417
LYS 43		0.02	PRO 167	-0.03		MET 417
LYS 43		0.02	ALA 168	-0.03		MET 417
LYS 43		0.02	TYR 169	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	PHE 170	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	SER 171	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	ASN 172	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	LEU 173	-0.04		MET 417
LYS 43		0.03	THR 174	-0.03		PHE 438
LYS 43		0.03	ASN 175	-0.04		PHE 438
ASP 41		0.03	LEU 176	-0.04		PHE 438
ASP 41		0.03	VAL 177	-0.04		PHE 438
ASP 41		0.03	HIS 178	-0.04		MET 417
ASP 41		0.02	VAL 179	-0.04		MET 417
SER 543		0.02	ASP 180	-0.05		MET 417
SER 545		0.02	LEU 181	-0.04		MET 417
ALA 569		0.02	SER 182	-0.05		MET 417
ALA 569		0.02	TYR 183	-0.05		MET 417
ALA 569		0.02	ASN 184	-0.05		GLY 418
ALA 569		0.02	TYR 185	-0.04		GLY 418
ALA 569		0.02	ILE 186	-0.04		SER 392
ALA 569		0.02	GLN 187	-0.04		SER 392
ASP 41		0.01	THR 188	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	ILE 189	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	THR 190	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	VAL 191	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	ASN 192	-0.03		MET 417
ASP 41		0.02	ASP 193	-0.03		MET 417
ASP 41		0.02	LEU 194	-0.03		MET 417
ASP 41		0.02	GLN 195	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	PHE 196	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	LEU 197	-0.03		MET 417
ARG 266		0.03	ARG 198	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	GLU 199	-0.03		MET 417
LYS 43		0.03	ASN 200	-0.03		MET 417
ARG 266		0.03	PRO 201	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	GLN 202	-0.03		PHE 438
ASP 41		0.03	VAL 203	-0.03		PHE 438
ASP 41		0.03	ASN 204	-0.03		PHE 438
ASP 41		0.03	LEU 205	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	SER 206	-0.04		MET 417
ASP 41		0.02	LEU 207	-0.04		MET 417
ASP 41		0.02	ASP 208	-0.04		MET 417
ASP 41		0.02	MET 209	-0.04		SER 392
ALA 569		0.02	SER 210	-0.05		SER 392
ALA 569		0.02	LEU 211	-0.05		SER 392
ALA 569		0.02	ASN 212	-0.05		SER 392
GLN 596		0.02	PRO 213	-0.04		SER 392
ALA 569		0.01	ILE 214	-0.04		SER 392
GLN 596		0.01	ASP 215	-0.04		PRO 349
ASP 41		0.01	PHE 216	-0.03		PRO 349
ASP 41		0.02	ILE 217	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	GLN 218	-0.03		PRO 349
ARG 266		0.02	ASP 219	-0.02		PRO 349
ARG 266		0.02	GLN 220	-0.02		SER 392
ARG 266		0.02	ALA 221	-0.03		SER 392
ARG 266		0.02	PHE 222	-0.03		SER 392
ARG 266		0.03	GLN 223	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	GLY 224	-0.02		MET 417
ARG 266		0.03	ILE 225	-0.03		MET 417
ARG 266		0.03	LYS 226	-0.03		MET 417
ASP 264		0.03	LEU 227	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	HIS 228	-0.03		MET 417
ASP 41		0.03	GLU 229	-0.03		MET 417
ASP 41		0.02	LEU 230	-0.04		SER 392
ASP 41		0.02	THR 231	-0.04		SER 392
ASP 41		0.02	LEU 232	-0.04		SER 392
ALA 569		0.02	ARG 233	-0.05		SER 392
ALA 569		0.02	GLY 234	-0.05		SER 392
ALA 569		0.02	ASN 235	-0.05		SER 392
ASN 600		0.01	PHE 236	-0.04		SER 392
ASN 600		0.02	ASN 237	-0.05		PRO 349
ASN 600		0.01	SER 238	-0.05		LYS 326
ASN 600		0.01	SER 239	-0.04		LYS 326
ASN 600		0.01	ASN 240	-0.04		LYS 326
ASN 600		0.01	ILE 241	-0.04		LYS 326
ASP 41		0.01	MET 242	-0.04		LYS 326
ASP 41		0.01	LYS 243	-0.03		LYS 326
ASP 264		0.01	THR 244	-0.03		LYS 326
ASP 41		0.02	CYS 245	-0.03		PRO 349
ASP 264		0.02	LEU 246	-0.03		SER 392
ARG 266		0.02	GLN 247	-0.03		LYS 326
ARG 266		0.02	ASN 248	-0.03		SER 392
ARG 266		0.02	LEU 249	-0.03		SER 392
ARG 266		0.03	ALA 250	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	GLY 251	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	LEU 252	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	HIS 253	-0.02		MET 417
ASP 264		0.03	VAL 254	-0.03		SER 392
ASP 264		0.03	HIS 255	-0.03		ALA 414
ASP 264		0.03	ARG 256	-0.03		SER 392
ASP 264		0.03	LEU 257	-0.03		SER 392
ASP 41		0.02	ILE 258	-0.04		SER 392
ASP 41		0.02	LEU 259	-0.04		SER 392
ASP 41		0.01	GLY 260	-0.05		SER 392
PHE 570		0.02	GLU 261	-0.06		SER 392
PHE 570		0.02	PHE 262	-0.06		SER 392
ASN 600		0.02	LYS 263	-0.07		SER 392
ASN 600		0.02	ASP 264	-0.07		SER 392
ASN 600		0.02	GLU 265	-0.06		SER 392
ASN 600		0.02	ARG 266	-0.06		SER 392
ASN 600		0.02	ASN 267	-0.06		SER 392
ASN 600		0.01	LEU 268	-0.05		PRO 349
ASN 600		0.01	GLU 269	-0.06		LYS 326
ASN 600		0.01	ILE 270	-0.05		LYS 326
ASN 600		0.01	PHE 271	-0.04		LYS 326
ASP 41		0.01	GLU 272	-0.04		LYS 326
ASP 264		0.02	PRO 273	-0.03		LYS 326
ASP 264		0.02	SER 274	-0.03		LYS 326
ASP 264		0.02	ILE 275	-0.03		LYS 326
ASP 264		0.02	MET 276	-0.03		LYS 326
ARG 266		0.02	GLU 277	-0.02		LYS 326
ARG 266		0.02	GLY 278	-0.02		LYS 326
ARG 266		0.03	LEU 279	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	CYS 280	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	ASP 281	-0.02		SER 392
ARG 266		0.03	VAL 282	-0.02		SER 392
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