Outils
Virome+GV Clusters Explorer: This server is dedicated to viewing and searching the virome+GVDB protein clusters as described in Safi et al. 2025: Elucidating the interaction network of one of the largest icosahedral capsids in the virosphere
Hela Safi, Alain Schmitt, Alwena Tollec, Lucid Belmudes, Agathe M. G. Colmant, Olivier Poirot, Sebastien Santini, Matthieu Legendre, Yohann Coute, Hugo Bisio, Chantal Abergel
bioRxiv 2025.10.13.682015; doi: https://doi.org/10.1101/2025.10.13.682015
ACDtool: A web server extending the « Audic-Claverie » statistical test to the comparison of large count datasets
Un serveur web étendant le test statistique « Audic-Claverie » à la comparaison de grands jeux de données de comptage
Gbrowse giant viruses: A genome browser instance dedicated to giant viruses sequenced at the IGS Laboratory (UMR7256)/Gènes, Tracks « Protein Expression », séquences DNA et GC content…
Phylogeny.fr: A free, simple to use web service dedicated to reconstructing and analysing phylogenetic relationships between molecular sequences
Cette plate-forme permet à tout biologiste connecté à Internet d’effectuer des analyses phylogénétiques. Des méthodologies scientifiquement validées et compétitives sur le plan international sont mises au service de l’utilisateur sans qu’il ait à installer le moindre logiciel
Tandem Repeats: A collection of tandem repeats for different species
SERV: Estimation of the variability of Repeats based on their sequence
Estimation de la variabilité de Repeats basée sur leur séquence
Ressources documentaires
LIST OF KNOWN GIANT VIRUSES IN MARCH 2019: TableVirus Mars 2019
Outdated services
FusionDB: A database dedicated to the in-depth analysis of prokaryotic gene fusion events
Une base de données dédiée à l’analyse approfondie des événements de fusion de gènes procaryotes
Phydbac: (phylogenomic display of bacterial genes): An interactive tool for the annotation of bacterial genomes
Une ressource interactive pour l’annotation des génomes bactériens
CaspR: A web server dedicated to molecular replacement by homology modeling
Un serveur web dédié au remplacement moléculaire par modélisation d’homologie